MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021192	CTG	2	6	92548	92553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690750
1502	NC_021192	GCGCC	2	10	92585	92594	0 %	0 %	40 %	60 %	494690750
1503	NC_021192	GTG	2	6	92620	92625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690750
1504	NC_021192	GGC	2	6	92631	92636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690750
1505	NC_021192	TGC	2	6	92657	92662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690750
1506	NC_021192	CTG	2	6	92716	92721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690750
1507	NC_021192	CTG	2	6	92734	92739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690750
1508	NC_021192	CCG	2	6	92756	92761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690750
1509	NC_021192	CTT	2	6	92766	92771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494690750
1510	NC_021192	CGC	2	6	92833	92838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690750
1511	NC_021192	GCT	2	6	92903	92908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690750
1512	NC_021192	GC	4	8	93013	93020	0 %	0 %	50 %	50 %	494690750
1513	NC_021192	GCT	2	6	93034	93039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690750
1514	NC_021192	CG	3	6	93044	93049	0 %	0 %	50 %	50 %	494690750
1515	NC_021192	GCT	2	6	93109	93114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690750
1516	NC_021192	CCG	2	6	93120	93125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690750
1517	NC_021192	GGT	2	6	93160	93165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690750
1518	NC_021192	GCCG	2	8	93199	93206	0 %	0 %	50 %	50 %	494690750
1519	NC_021192	GGT	2	6	93214	93219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690750
1520	NC_021192	TGA	2	6	93237	93242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690750
1521	NC_021192	GCC	2	6	93269	93274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690750
1522	NC_021192	CCG	2	6	93324	93329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690750
1523	NC_021192	TCG	2	6	93342	93347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690750
1524	NC_021192	CCGG	2	8	93402	93409	0 %	0 %	50 %	50 %	494690750
1525	NC_021192	TGA	2	6	93464	93469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690750
1526	NC_021192	TGC	2	6	93476	93481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690750
1527	NC_021192	CGC	2	6	93504	93509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690751
1528	NC_021192	CCT	2	6	93518	93523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494690751
1529	NC_021192	ACG	2	6	93544	93549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690751
1530	NC_021192	ACG	2	6	93574	93579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690751
1531	NC_021192	CTG	2	6	93646	93651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690751
1532	NC_021192	GGT	2	6	93669	93674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690751
1533	NC_021192	TCG	2	6	93680	93685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690751
1534	NC_021192	TCG	2	6	93695	93700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690751
1535	NC_021192	GACG	2	8	93761	93768	25 %	0 %	50 %	25 %	494690751
1536	NC_021192	CAA	2	6	93835	93840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690751
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1538	NC_021192	TGG	2	6	93894	93899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690751
1539	NC_021192	CGC	2	6	93905	93910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690751
1540	NC_021192	GTG	2	6	93944	93949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690751
1541	NC_021192	TCGG	2	8	93956	93963	0 %	25 %	50 %	25 %	494690751
1542	NC_021192	CTT	2	6	93976	93981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494690751
1543	NC_021192	TGC	2	6	93990	93995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690751
1544	NC_021192	CGC	2	6	94003	94008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690751
1545	NC_021192	GCT	2	6	94025	94030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690751
1546	NC_021192	GC	3	6	94035	94040	0 %	0 %	50 %	50 %	494690751
1547	NC_021192	CGC	2	6	94065	94070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690751
1548	NC_021192	CGG	2	6	94101	94106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690751
1549	NC_021192	TGC	2	6	94109	94114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690751
1550	NC_021192	CTGG	2	8	94158	94165	0 %	25 %	50 %	25 %	494690751
1551	NC_021192	TGC	2	6	94217	94222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690752
1552	NC_021192	GCT	2	6	94302	94307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690752
1553	NC_021192	GCT	2	6	94326	94331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690752
1554	NC_021192	TGCTGA	2	12	94340	94351	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494690752
1555	NC_021192	TCG	2	6	94387	94392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690752
1556	NC_021192	GATCGC	2	12	94410	94421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494690752
1557	NC_021192	GCC	2	6	94426	94431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690752
1558	NC_021192	GCT	3	9	94454	94462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690752
1559	NC_021192	GGCG	2	8	94505	94512	0 %	0 %	75 %	25 %	494690752
1560	NC_021192	GCTTG	2	10	94619	94628	0 %	40 %	40 %	20 %	494690752
1561	NC_021192	CCG	2	6	94629	94634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690752
1562	NC_021192	CG	3	6	94664	94669	0 %	0 %	50 %	50 %	494690752
1563	NC_021192	GCG	2	6	94707	94712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690752
1564	NC_021192	CTG	3	9	94713	94721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690752
1565	NC_021192	TGC	2	6	94765	94770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690752
1566	NC_021192	CGG	3	9	94819	94827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690753
1567	NC_021192	TGG	2	6	94834	94839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690753
1568	NC_021192	TCG	2	6	94843	94848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690753
1569	NC_021192	CGG	2	6	94852	94857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690753
1570	NC_021192	CGC	2	6	94901	94906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690753
1571	NC_021192	TGA	2	6	94926	94931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690753
1572	NC_021192	GCTG	2	8	94938	94945	0 %	25 %	50 %	25 %	494690753
1573	NC_021192	AAC	2	6	94986	94991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690753
1574	NC_021192	ACG	3	9	95031	95039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690753
1575	NC_021192	CGTGT	2	10	95051	95060	0 %	40 %	40 %	20 %	494690753
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1578	NC_021192	AGATC	2	10	95130	95139	40 %	20 %	20 %	20 %	494690753
1579	NC_021192	CCG	2	6	95227	95232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690753
1580	NC_021192	GCC	2	6	95490	95495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690753
1581	NC_021192	GCG	2	6	95532	95537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690753
1582	NC_021192	TCG	2	6	95634	95639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690753
1583	NC_021192	CCTG	2	8	97186	97193	0 %	25 %	25 %	50 %	494690754
1584	NC_021192	GCGA	2	8	97230	97237	25 %	0 %	50 %	25 %	494690754
1585	NC_021192	CCG	2	6	97243	97248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690754
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1588	NC_021192	GTGC	2	8	97337	97344	0 %	25 %	50 %	25 %	494690754
1589	NC_021192	GCG	2	6	97357	97362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690754
1590	NC_021192	GCTG	2	8	97370	97377	0 %	25 %	50 %	25 %	494690754
1591	NC_021192	GGCT	2	8	97381	97388	0 %	25 %	50 %	25 %	494690754
1592	NC_021192	GCTG	2	8	97474	97481	0 %	25 %	50 %	25 %	494690754
1593	NC_021192	CAT	2	6	97490	97495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690754
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1596	NC_021192	GCC	2	6	97740	97745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690754
1597	NC_021192	CTG	2	6	97786	97791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690754
1598	NC_021192	GCT	2	6	97812	97817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690754
1599	NC_021192	CGGCG	2	10	98701	98710	0 %	0 %	60 %	40 %	494690755
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1601	NC_021192	GC	3	6	98730	98735	0 %	0 %	50 %	50 %	494690755
1602	NC_021192	CGGCG	2	10	98827	98836	0 %	0 %	60 %	40 %	494690755
1603	NC_021192	GCC	2	6	98847	98852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690755
1604	NC_021192	CGA	2	6	98891	98896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690755
1605	NC_021192	ACCG	2	8	98945	98952	25 %	0 %	25 %	50 %	494690755
1606	NC_021192	TGC	2	6	99003	99008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690755
1607	NC_021192	GC	3	6	99007	99012	0 %	0 %	50 %	50 %	494690755
1608	NC_021192	GTT	2	6	99066	99071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690755
1609	NC_021192	CG	4	8	99115	99122	0 %	0 %	50 %	50 %	494690755
1610	NC_021192	GCC	2	6	99140	99145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690755
1611	NC_021192	CAG	2	6	99264	99269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690755
1612	NC_021192	CGC	2	6	99324	99329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690755
1613	NC_021192	GCT	2	6	99366	99371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690755
1614	NC_021192	CGAT	2	8	99375	99382	25 %	25 %	25 %	25 %	494690755
1615	NC_021192	G	8	8	99417	99424	0 %	0 %	100 %	0 %	494690755
1616	NC_021192	GTC	2	6	99464	99469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690755
1617	NC_021192	CG	3	6	99821	99826	0 %	0 %	50 %	50 %	494690756
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1620	NC_021192	TGC	2	6	99918	99923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690756
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1622	NC_021192	CCG	2	6	99954	99959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690756
1623	NC_021192	GGC	2	6	99977	99982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690756
1624	NC_021192	GGTGA	2	10	99986	99995	20 %	20 %	60 %	0 %	494690756
1625	NC_021192	GCC	3	9	100021	100029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690756
1626	NC_021192	GAG	2	6	100064	100069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494690756
1627	NC_021192	TGCG	2	8	100152	100159	0 %	25 %	50 %	25 %	494690757
1628	NC_021192	CAA	2	6	100182	100187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690757
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1631	NC_021192	GCT	2	6	100365	100370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690757
1632	NC_021192	CGC	2	6	100386	100391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690757
1633	NC_021192	TGCC	2	8	100439	100446	0 %	25 %	25 %	50 %	494690757
1634	NC_021192	GC	3	6	100478	100483	0 %	0 %	50 %	50 %	494690757
1635	NC_021192	GCG	2	6	100507	100512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690757
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1637	NC_021192	CGC	2	6	100554	100559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690757
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1640	NC_021192	GCT	2	6	100665	100670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690757
1641	NC_021192	TATT	2	8	100683	100690	25 %	75 %	0 %	0 %	494690757
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1645	NC_021192	GTC	4	12	103201	103212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690758
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1648	NC_021192	G	6	6	103278	103283	0 %	0 %	100 %	0 %	494690758
1649	NC_021192	GGT	2	6	103319	103324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690758
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1654	NC_021192	GTG	3	9	103692	103700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690758
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1986	NC_021192	GCG	2	6	133524	133529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690774
1987	NC_021192	GCT	2	6	133530	133535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690774
1988	NC_021192	GCGAT	2	10	133614	133623	20 %	20 %	40 %	20 %	494690774
1989	NC_021192	CGC	2	6	133624	133629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690774
1990	NC_021192	GTT	2	6	133654	133659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690774
1991	NC_021192	GGA	2	6	133731	133736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494690774
1992	NC_021192	GGC	2	6	133788	133793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690774
1993	NC_021192	GTTCG	2	10	133831	133840	0 %	40 %	40 %	20 %	494690774
1994	NC_021192	CCG	2	6	133883	133888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690774
1995	NC_021192	CGG	2	6	133904	133909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690774
1996	NC_021192	CTG	2	6	133984	133989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690774
1997	NC_021192	GTG	2	6	134019	134024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690774
1998	NC_021192	CGG	2	6	134047	134052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690774
1999	NC_021192	GGCCC	2	10	134319	134328	0 %	0 %	40 %	60 %	494690775
2000	NC_021192	GGT	2	6	134354	134359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690775

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