MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021192	TCG	2	6	1252272	1252277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691723
19002	NC_021192	CGG	2	6	1252297	1252302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691723
19003	NC_021192	TCG	2	6	1252320	1252325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691723
19004	NC_021192	CACG	2	8	1252373	1252380	25 %	0 %	25 %	50 %	494691723
19005	NC_021192	CGG	2	6	1252510	1252515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691723
19006	NC_021192	GAA	2	6	1252557	1252562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494691723
19007	NC_021192	TCG	2	6	1252697	1252702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691723
19008	NC_021192	TCG	2	6	1252767	1252772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691723
19009	NC_021192	GCG	2	6	1252782	1252787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691724
19010	NC_021192	CG	3	6	1252799	1252804	0 %	0 %	50 %	50 %	494691724
19011	NC_021192	TGGC	2	8	1252808	1252815	0 %	25 %	50 %	25 %	494691724
19012	NC_021192	GCG	2	6	1252816	1252821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691724
19013	NC_021192	GGC	2	6	1252825	1252830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691724
19014	NC_021192	CGA	2	6	1252854	1252859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691724
19015	NC_021192	GC	3	6	1252870	1252875	0 %	0 %	50 %	50 %	494691724
19016	NC_021192	GGC	2	6	1252924	1252929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691724
19017	NC_021192	GAC	2	6	1252934	1252939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691724
19018	NC_021192	TCG	2	6	1252946	1252951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691724
19019	NC_021192	CGT	2	6	1252959	1252964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691724
19020	NC_021192	CG	3	6	1252982	1252987	0 %	0 %	50 %	50 %	494691724
19021	NC_021192	ACG	2	6	1252991	1252996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691724
19022	NC_021192	GCCA	2	8	1253024	1253031	25 %	0 %	25 %	50 %	494691724
19023	NC_021192	ACG	2	6	1253097	1253102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691724
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19027	NC_021192	CGA	2	6	1253193	1253198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691724
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19030	NC_021192	GGGC	2	8	1253403	1253410	0 %	0 %	75 %	25 %	494691724
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19032	NC_021192	TCG	2	6	1253444	1253449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691724
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19036	NC_021192	CAG	3	9	1253563	1253571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691724
19037	NC_021192	GAT	2	6	1253587	1253592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691724
19038	NC_021192	GGTAGT	2	12	1253697	1253708	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	494691724
19039	NC_021192	GCG	2	6	1253736	1253741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691724
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19042	NC_021192	AGC	2	6	1253825	1253830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691724
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19046	NC_021192	CGCGG	2	10	1254003	1254012	0 %	0 %	60 %	40 %	494691724
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19050	NC_021192	CCGAT	2	10	1254119	1254128	20 %	20 %	20 %	40 %	494691724
19051	NC_021192	CGGC	2	8	1254457	1254464	0 %	0 %	50 %	50 %	494691725
19052	NC_021192	CGGC	2	8	1254471	1254478	0 %	0 %	50 %	50 %	494691725
19053	NC_021192	CGC	2	6	1254516	1254521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691725
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19055	NC_021192	CGC	2	6	1254584	1254589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691725
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19099	NC_021192	TGG	2	6	1257986	1257991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691726
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19102	NC_021192	ACG	2	6	1258316	1258321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691727
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19104	NC_021192	CGA	2	6	1258334	1258339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691727
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19113	NC_021192	GC	3	6	1258721	1258726	0 %	0 %	50 %	50 %	494691727
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19115	NC_021192	CG	3	6	1258768	1258773	0 %	0 %	50 %	50 %	494691727
19116	NC_021192	CGG	3	9	1258779	1258787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691727
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19217	NC_021192	GCC	2	6	1263747	1263752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691730
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19222	NC_021192	CGA	2	6	1263922	1263927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691730
19223	NC_021192	CG	4	8	1263950	1263957	0 %	0 %	50 %	50 %	494691730
19224	NC_021192	CGA	2	6	1263979	1263984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691730
19225	NC_021192	GCC	2	6	1263986	1263991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691730
19226	NC_021192	GTC	2	6	1264037	1264042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691730
19227	NC_021192	CCGGCA	2	12	1264053	1264064	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	494691730
19228	NC_021192	TGC	2	6	1264155	1264160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691730
19229	NC_021192	ACCGA	2	10	1264187	1264196	40 %	0 %	20 %	40 %	494691730
19230	NC_021192	TGA	2	6	1264783	1264788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691732
19231	NC_021192	GTC	2	6	1264802	1264807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691732
19232	NC_021192	GCC	2	6	1264832	1264837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691732
19233	NC_021192	CGGT	2	8	1264886	1264893	0 %	25 %	50 %	25 %	494691732
19234	NC_021192	TGC	2	6	1264898	1264903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691732
19235	NC_021192	TGG	2	6	1264911	1264916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691732
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19237	NC_021192	CGC	2	6	1265140	1265145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691733
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19243	NC_021192	GAC	2	6	1265583	1265588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691734
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19261	NC_021192	TGGG	2	8	1266477	1266484	0 %	25 %	75 %	0 %	494691735
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19265	NC_021192	CGT	2	6	1266619	1266624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691735
19266	NC_021192	TGT	2	6	1266720	1266725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691735
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19287	NC_021192	TAGCTA	2	12	1268169	1268180	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	494691738
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19332	NC_021192	TCGAC	2	10	1273298	1273307	20 %	20 %	20 %	40 %	494691741
19333	NC_021192	TCG	2	6	1273327	1273332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691741
19334	NC_021192	CGG	3	9	1273345	1273353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691741
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19337	NC_021192	TGC	2	6	1273540	1273545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691741
19338	NC_021192	GGGTC	2	10	1273577	1273586	0 %	20 %	60 %	20 %	494691741
19339	NC_021192	TCG	2	6	1273637	1273642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691741
19340	NC_021192	GCC	2	6	1273712	1273717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691741
19341	NC_021192	CGT	2	6	1273740	1273745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691741
19342	NC_021192	CGT	2	6	1273761	1273766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691741
19343	NC_021192	TCT	2	6	1273797	1273802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691741
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19345	NC_021192	CGC	2	6	1273954	1273959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691741
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19449	NC_021192	ACCTGG	2	12	1281121	1281132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691749
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19453	NC_021192	GCCG	2	8	1281421	1281428	0 %	0 %	50 %	50 %	494691750
19454	NC_021192	GGA	2	6	1281479	1281484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691750
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19456	NC_021192	CAT	2	6	1281496	1281501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691750
19457	NC_021192	GCG	2	6	1281504	1281509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691750
19458	NC_021192	GCT	2	6	1281559	1281564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691750
19459	NC_021192	CGG	3	9	1281592	1281600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691750
19460	NC_021192	CGATGG	2	12	1281654	1281665	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	494691750
19461	NC_021192	GCC	2	6	1281681	1281686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691750
19462	NC_021192	CGT	2	6	1281704	1281709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691750
19463	NC_021192	ACG	2	6	1281740	1281745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691750
19464	NC_021192	CTG	2	6	1281814	1281819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691751
19465	NC_021192	CGA	2	6	1281888	1281893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691751
19466	NC_021192	CGC	2	6	1281900	1281905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691751
19467	NC_021192	AAC	2	6	1281935	1281940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691751
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19469	NC_021192	CTG	2	6	1282064	1282069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691751
19470	NC_021192	TGTGG	2	10	1282126	1282135	0 %	40 %	60 %	0 %	494691752
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19472	NC_021192	CGA	2	6	1282197	1282202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691752
19473	NC_021192	CGC	2	6	1282228	1282233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691752
19474	NC_021192	CGAT	2	8	1282302	1282309	25 %	25 %	25 %	25 %	494691752
19475	NC_021192	CCG	2	6	1282310	1282315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691752
19476	NC_021192	CGC	2	6	1282345	1282350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691752
19477	NC_021192	CG	3	6	1282354	1282359	0 %	0 %	50 %	50 %	494691752
19478	NC_021192	GCA	2	6	1282423	1282428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691752
19479	NC_021192	TGGC	2	8	1282475	1282482	0 %	25 %	50 %	25 %	494691752
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19481	NC_021192	TGG	2	6	1282530	1282535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691752
19482	NC_021192	ACC	2	6	1282604	1282609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691752
19483	NC_021192	TGA	2	6	1282668	1282673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691753
19484	NC_021192	GTC	2	6	1282692	1282697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691754
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19489	NC_021192	GAA	2	6	1283019	1283024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494691755
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19491	NC_021192	GACC	2	8	1283095	1283102	25 %	0 %	25 %	50 %	494691755
19492	NC_021192	CGC	2	6	1283137	1283142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691755
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19494	NC_021192	CGA	2	6	1283212	1283217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691755
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19497	NC_021192	CGG	2	6	1283408	1283413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691755
19498	NC_021192	CGCGTT	2	12	1283480	1283491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691755
19499	NC_021192	GTG	2	6	1283535	1283540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691755
19500	NC_021192	CGC	3	9	1283541	1283549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691755

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