MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_021192	ATG	2	6	1095009	1095014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691574
16502	NC_021192	GCT	2	6	1095569	1095574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691575
16503	NC_021192	AAGTGG	2	12	1095581	1095592	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	494691575
16504	NC_021192	TCA	2	6	1095613	1095618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691575
16505	NC_021192	CAC	2	6	1095635	1095640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691575
16506	NC_021192	CGAG	2	8	1095682	1095689	25 %	0 %	50 %	25 %	494691575
16507	NC_021192	GTT	2	6	1095697	1095702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691575
16508	NC_021192	CGG	2	6	1095892	1095897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691575
16509	NC_021192	AAC	3	9	1095900	1095908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691575
16510	NC_021192	GCA	2	6	1096078	1096083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691575
16511	NC_021192	GGC	2	6	1096109	1096114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691575
16512	NC_021192	ATGA	2	8	1096188	1096195	50 %	25 %	25 %	0 %	494691575
16513	NC_021192	CAC	2	6	1096216	1096221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691575
16514	NC_021192	GGCGT	2	10	1096232	1096241	0 %	20 %	60 %	20 %	494691575
16515	NC_021192	AT	3	6	1096264	1096269	50 %	50 %	0 %	0 %	494691575
16516	NC_021192	CTG	2	6	1096271	1096276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691575
16517	NC_021192	TC	3	6	1096354	1096359	0 %	50 %	0 %	50 %	494691575
16518	NC_021192	G	6	6	1096411	1096416	0 %	0 %	100 %	0 %	494691576
16519	NC_021192	TCGC	2	8	1096555	1096562	0 %	25 %	25 %	50 %	494691576
16520	NC_021192	CCAA	2	8	1096572	1096579	50 %	0 %	0 %	50 %	494691576
16521	NC_021192	TGG	2	6	1096714	1096719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691576
16522	NC_021192	GTT	2	6	1096799	1096804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691576
16523	NC_021192	GCG	2	6	1097356	1097361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691577
16524	NC_021192	CTC	2	6	1097362	1097367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691577
16525	NC_021192	TGGTT	2	10	1097414	1097423	0 %	60 %	40 %	0 %	494691577
16526	NC_021192	CAA	2	6	1097461	1097466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691577
16527	NC_021192	GCT	2	6	1097574	1097579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691578
16528	NC_021192	ATCGCC	2	12	1097638	1097649	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	494691578
16529	NC_021192	TGA	2	6	1097654	1097659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691578
16530	NC_021192	CCG	2	6	1097764	1097769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691578
16531	NC_021192	ACA	2	6	1098038	1098043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691578
16532	NC_021192	GCC	2	6	1098053	1098058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691578
16533	NC_021192	TGA	2	6	1098187	1098192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691578
16534	NC_021192	T	7	7	1098209	1098215	0 %	100 %	0 %	0 %	494691578
16535	NC_021192	TACCAT	2	12	1098345	1098356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691578
16536	NC_021192	TGG	2	6	1098368	1098373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691578
16537	NC_021192	GGT	2	6	1098378	1098383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691578
16538	NC_021192	GC	3	6	1098404	1098409	0 %	0 %	50 %	50 %	494691578
16539	NC_021192	TGA	2	6	1098410	1098415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691578
16540	NC_021192	TTC	2	6	1098638	1098643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691578
16541	NC_021192	GGT	2	6	1098660	1098665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691578
16542	NC_021192	GCC	2	6	1098667	1098672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691578
16543	NC_021192	GGC	2	6	1098675	1098680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691578
16544	NC_021192	CTGACG	2	12	1098787	1098798	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691578
16545	NC_021192	TGG	2	6	1098800	1098805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691578
16546	NC_021192	TGG	3	9	1098811	1098819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691578
16547	NC_021192	CGAA	2	8	1098829	1098836	50 %	0 %	25 %	25 %	494691578
16548	NC_021192	GCTGTG	2	12	1098838	1098849	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	494691578
16549	NC_021192	TTG	2	6	1098854	1098859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691578
16550	NC_021192	GCC	2	6	1099316	1099321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691579
16551	NC_021192	GC	3	6	1099357	1099362	0 %	0 %	50 %	50 %	494691579
16552	NC_021192	ACT	3	9	1099381	1099389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691579
16553	NC_021192	TTG	2	6	1099612	1099617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691579
16554	NC_021192	TGG	2	6	1099625	1099630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691579
16555	NC_021192	GTC	2	6	1099646	1099651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691579
16556	NC_021192	GAC	2	6	1099667	1099672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691579
16557	NC_021192	GTC	2	6	1099950	1099955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691579
16558	NC_021192	CGCA	2	8	1100038	1100045	25 %	0 %	25 %	50 %	494691580
16559	NC_021192	CTC	2	6	1100111	1100116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691580
16560	NC_021192	GGC	2	6	1100135	1100140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691580
16561	NC_021192	GCA	2	6	1100179	1100184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691580
16562	NC_021192	GTC	2	6	1100207	1100212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691580
16563	NC_021192	CG	4	8	1100267	1100274	0 %	0 %	50 %	50 %	494691580
16564	NC_021192	ATG	2	6	1100348	1100353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691580
16565	NC_021192	CG	3	6	1100355	1100360	0 %	0 %	50 %	50 %	494691580
16566	NC_021192	GCA	2	6	1100372	1100377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691580
16567	NC_021192	GC	3	6	1100395	1100400	0 %	0 %	50 %	50 %	494691580
16568	NC_021192	TCT	2	6	1100478	1100483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691581
16569	NC_021192	GCGGGG	2	12	1100512	1100523	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	494691581
16570	NC_021192	CG	3	6	1100532	1100537	0 %	0 %	50 %	50 %	494691581
16571	NC_021192	CGA	2	6	1100573	1100578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691581
16572	NC_021192	GTT	2	6	1100658	1100663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691581
16573	NC_021192	GT	3	6	1100672	1100677	0 %	50 %	50 %	0 %	494691581
16574	NC_021192	GCC	2	6	1100846	1100851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691581
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16576	NC_021192	CGT	2	6	1100941	1100946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691581
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16581	NC_021192	GTCAG	2	10	1101431	1101440	20 %	20 %	40 %	20 %	494691582
16582	NC_021192	GTG	2	6	1101461	1101466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691582
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16585	NC_021192	GGC	2	6	1103019	1103024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691583
16586	NC_021192	GGT	2	6	1103076	1103081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691583
16587	NC_021192	GTG	2	6	1103190	1103195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691583
16588	NC_021192	CTGGGA	2	12	1103208	1103219	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	494691583
16589	NC_021192	TG	3	6	1103231	1103236	0 %	50 %	50 %	0 %	494691583
16590	NC_021192	CGA	2	6	1103251	1103256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691583
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16596	NC_021192	TG	3	6	1103355	1103360	0 %	50 %	50 %	0 %	494691583
16597	NC_021192	GC	3	6	1103372	1103377	0 %	0 %	50 %	50 %	494691583
16598	NC_021192	GAG	2	6	1103378	1103383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691583
16599	NC_021192	CGA	2	6	1103437	1103442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691583
16600	NC_021192	GCG	2	6	1103510	1103515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691584
16601	NC_021192	GCCG	2	8	1103516	1103523	0 %	0 %	50 %	50 %	494691584
16602	NC_021192	CGC	2	6	1103558	1103563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691584
16603	NC_021192	GCT	2	6	1103611	1103616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691584
16604	NC_021192	GTC	3	9	1103642	1103650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691584
16605	NC_021192	CGGG	2	8	1103682	1103689	0 %	0 %	75 %	25 %	494691584
16606	NC_021192	GAC	2	6	1103726	1103731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691584
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16608	NC_021192	TGGT	2	8	1103753	1103760	0 %	50 %	50 %	0 %	494691584
16609	NC_021192	CGA	2	6	1103794	1103799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691584
16610	NC_021192	ACGG	2	8	1103806	1103813	25 %	0 %	50 %	25 %	494691584
16611	NC_021192	GGCG	2	8	1103855	1103862	0 %	0 %	75 %	25 %	494691584
16612	NC_021192	GGA	2	6	1103876	1103881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691584
16613	NC_021192	GCA	2	6	1103882	1103887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691584
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16616	NC_021192	GCG	2	6	1104308	1104313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691585
16617	NC_021192	CGA	2	6	1104320	1104325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691585
16618	NC_021192	GC	3	6	1104350	1104355	0 %	0 %	50 %	50 %	494691585
16619	NC_021192	ATC	2	6	1104363	1104368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691585
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16656	NC_021192	CGA	2	6	1106276	1106281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691587
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16658	NC_021192	CGA	2	6	1106339	1106344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691587
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16682	NC_021192	TGA	2	6	1107345	1107350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691587
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16730	NC_021192	CGCC	2	8	1111823	1111830	0 %	0 %	25 %	75 %	494691592
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16732	NC_021192	GCC	2	6	1111915	1111920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691592
16733	NC_021192	GGC	2	6	1111956	1111961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691592
16734	NC_021192	TGT	2	6	1112010	1112015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691592
16735	NC_021192	CAC	2	6	1112063	1112068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691592
16736	NC_021192	AGC	2	6	1112080	1112085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691592
16737	NC_021192	GAC	2	6	1112087	1112092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691592
16738	NC_021192	CGT	2	6	1112109	1112114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691592
16739	NC_021192	AGA	2	6	1112200	1112205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494691592
16740	NC_021192	ACC	2	6	1112268	1112273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691592
16741	NC_021192	C	7	7	1112303	1112309	0 %	0 %	0 %	100 %	494691592
16742	NC_021192	GCCA	2	8	1112330	1112337	25 %	0 %	25 %	50 %	494691592
16743	NC_021192	CGC	2	6	1112388	1112393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691592
16744	NC_021192	GGT	2	6	1112475	1112480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691592
16745	NC_021192	GTGGAA	2	12	1112509	1112520	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	494691592
16746	NC_021192	AGCG	2	8	1112543	1112550	25 %	0 %	50 %	25 %	494691592
16747	NC_021192	AAC	2	6	1112569	1112574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691592
16748	NC_021192	CGAC	2	8	1112582	1112589	25 %	0 %	25 %	50 %	494691592
16749	NC_021192	GACC	2	8	1112595	1112602	25 %	0 %	25 %	50 %	494691592
16750	NC_021192	CGAT	2	8	1112609	1112616	25 %	25 %	25 %	25 %	494691592
16751	NC_021192	ACG	2	6	1114348	1114353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691593
16752	NC_021192	TGC	2	6	1114357	1114362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691593
16753	NC_021192	CGG	2	6	1114368	1114373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691593
16754	NC_021192	CGG	2	6	1114379	1114384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691593
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16756	NC_021192	CGG	2	6	1114530	1114535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691593
16757	NC_021192	GGCC	2	8	1114559	1114566	0 %	0 %	50 %	50 %	494691593
16758	NC_021192	CAGC	2	8	1114586	1114593	25 %	0 %	25 %	50 %	494691593
16759	NC_021192	CGG	2	6	1114629	1114634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691593
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16761	NC_021192	GCC	2	6	1114645	1114650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691593
16762	NC_021192	CAGC	2	8	1114667	1114674	25 %	0 %	25 %	50 %	494691593
16763	NC_021192	GCC	2	6	1114717	1114722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691593
16764	NC_021192	TCG	2	6	1114793	1114798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691594
16765	NC_021192	CGGCCG	2	12	1114805	1114816	0 %	0 %	50 %	50 %	494691594
16766	NC_021192	GGTC	2	8	1114829	1114836	0 %	25 %	50 %	25 %	494691594
16767	NC_021192	AC	3	6	1114841	1114846	50 %	0 %	0 %	50 %	494691594
16768	NC_021192	CGG	2	6	1114880	1114885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691594
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16770	NC_021192	GGGC	2	8	1114928	1114935	0 %	0 %	75 %	25 %	494691594
16771	NC_021192	GCC	3	9	1114957	1114965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691594
16772	NC_021192	GCA	3	9	1114979	1114987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691594
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16777	NC_021192	GATGCC	2	12	1115202	1115213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691595
16778	NC_021192	GATGCC	2	12	1115217	1115228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691595
16779	NC_021192	GGGCC	2	10	1115291	1115300	0 %	0 %	60 %	40 %	494691595
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16784	NC_021192	CTG	2	6	1115511	1115516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691595
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16796	NC_021192	CGG	2	6	1116827	1116832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691597
16797	NC_021192	CGT	2	6	1116844	1116849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691597
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16830	NC_021192	CGG	2	6	1119030	1119035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691599
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16832	NC_021192	TGC	2	6	1121003	1121008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691600
16833	NC_021192	GC	3	6	1121018	1121023	0 %	0 %	50 %	50 %	494691600
16834	NC_021192	TCG	2	6	1121050	1121055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691600
16835	NC_021192	GT	3	6	1121075	1121080	0 %	50 %	50 %	0 %	494691600
16836	NC_021192	GCT	2	6	1121093	1121098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691600
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16839	NC_021192	CGAA	2	8	1121230	1121237	50 %	0 %	25 %	25 %	494691600
16840	NC_021192	CTGC	2	8	1121243	1121250	0 %	25 %	25 %	50 %	494691600
16841	NC_021192	GCTG	2	8	1121267	1121274	0 %	25 %	50 %	25 %	494691600
16842	NC_021192	TCA	2	6	1121308	1121313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691600
16843	NC_021192	GC	3	6	1121364	1121369	0 %	0 %	50 %	50 %	494691600
16844	NC_021192	CG	3	6	1121388	1121393	0 %	0 %	50 %	50 %	494691600
16845	NC_021192	GGT	2	6	1121495	1121500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691600
16846	NC_021192	TCA	2	6	1121552	1121557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691600
16847	NC_021192	GCT	3	9	1121594	1121602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691600
16848	NC_021192	CGC	2	6	1121633	1121638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691600
16849	NC_021192	TCG	2	6	1121713	1121718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691600
16850	NC_021192	CGA	2	6	1121738	1121743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691600
16851	NC_021192	CGA	2	6	1121747	1121752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691600
16852	NC_021192	CGGC	2	8	1121764	1121771	0 %	0 %	50 %	50 %	494691600
16853	NC_021192	TGC	2	6	1121800	1121805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691600
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16857	NC_021192	GTC	2	6	1121973	1121978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691600
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16872	NC_021192	GC	3	6	1122649	1122654	0 %	0 %	50 %	50 %	494691603
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16883	NC_021192	GGT	2	6	1123017	1123022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691603
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16958	NC_021192	CCA	2	6	1127004	1127009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691606
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16962	NC_021192	GAT	2	6	1127098	1127103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691606
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16964	NC_021192	AGC	2	6	1127169	1127174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691606
16965	NC_021192	TG	3	6	1127243	1127248	0 %	50 %	50 %	0 %	494691606
16966	NC_021192	CG	3	6	1127269	1127274	0 %	0 %	50 %	50 %	494691606
16967	NC_021192	CTC	2	6	1127462	1127467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691606
16968	NC_021192	CAC	2	6	1127482	1127487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691606
16969	NC_021192	GCCTCG	2	12	1127618	1127629	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	494691607
16970	NC_021192	CGA	2	6	1127685	1127690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691607
16971	NC_021192	CGA	3	9	1127703	1127711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691607
16972	NC_021192	GCG	2	6	1127758	1127763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691607
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16975	NC_021192	CCG	2	6	1127949	1127954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691607
16976	NC_021192	CG	3	6	1129577	1129582	0 %	0 %	50 %	50 %	494691608
16977	NC_021192	TCTTG	2	10	1129608	1129617	0 %	60 %	20 %	20 %	494691608
16978	NC_021192	CGG	2	6	1129644	1129649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691608
16979	NC_021192	CG	3	6	1129807	1129812	0 %	0 %	50 %	50 %	494691608
16980	NC_021192	CGGC	2	8	1129873	1129880	0 %	0 %	50 %	50 %	494691608
16981	NC_021192	TG	3	6	1130045	1130050	0 %	50 %	50 %	0 %	494691609
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16983	NC_021192	CCG	2	6	1130150	1130155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691609
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16988	NC_021192	CGT	2	6	1130306	1130311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691609
16989	NC_021192	GGTGCC	2	12	1130391	1130402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	494691609
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16991	NC_021192	CGA	2	6	1130423	1130428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691609
16992	NC_021192	GACGTC	2	12	1130660	1130671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691610
16993	NC_021192	GGT	2	6	1130678	1130683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691610
16994	NC_021192	CGA	2	6	1130691	1130696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691610
16995	NC_021192	CCA	2	6	1130724	1130729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691610
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16997	NC_021192	TTG	2	6	1130776	1130781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691610
16998	NC_021192	CCA	2	6	1130789	1130794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691610
16999	NC_021192	GTC	2	6	1130802	1130807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691610
17000	NC_021192	TGGC	2	8	1130812	1130819	0 %	25 %	50 %	25 %	494691610

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