MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021192	CCG	2	6	1018675	1018680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691521
15502	NC_021192	CGC	2	6	1018720	1018725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691521
15503	NC_021192	CA	3	6	1018743	1018748	50 %	0 %	0 %	50 %	494691521
15504	NC_021192	CGC	2	6	1018771	1018776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691521
15505	NC_021192	GC	3	6	1018813	1018818	0 %	0 %	50 %	50 %	494691521
15506	NC_021192	CGA	2	6	1018821	1018826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691521
15507	NC_021192	CAG	2	6	1018855	1018860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691521
15508	NC_021192	AGGG	2	8	1018917	1018924	25 %	0 %	75 %	0 %	494691521
15509	NC_021192	CAGGG	2	10	1019087	1019096	20 %	0 %	60 %	20 %	494691522
15510	NC_021192	CTG	2	6	1019111	1019116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691522
15511	NC_021192	CG	3	6	1019201	1019206	0 %	0 %	50 %	50 %	494691522
15512	NC_021192	ACTTCG	2	12	1019217	1019228	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	494691522
15513	NC_021192	CCGA	2	8	1019237	1019244	25 %	0 %	25 %	50 %	494691522
15514	NC_021192	TGA	2	6	1019265	1019270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691522
15515	NC_021192	CG	3	6	1019279	1019284	0 %	0 %	50 %	50 %	494691522
15516	NC_021192	CGC	2	6	1019539	1019544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691523
15517	NC_021192	GCCG	2	8	1019545	1019552	0 %	0 %	50 %	50 %	494691523
15518	NC_021192	TTTC	2	8	1019594	1019601	0 %	75 %	0 %	25 %	494691523
15519	NC_021192	TTC	2	6	1019610	1019615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691523
15520	NC_021192	GGC	2	6	1019616	1019621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691523
15521	NC_021192	GTTC	2	8	1019752	1019759	0 %	50 %	25 %	25 %	494691523
15522	NC_021192	GCCC	3	12	1019775	1019786	0 %	0 %	25 %	75 %	494691523
15523	NC_021192	GC	3	6	1019794	1019799	0 %	0 %	50 %	50 %	494691523
15524	NC_021192	CAT	2	6	1019850	1019855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691523
15525	NC_021192	CTC	2	6	1019941	1019946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691523
15526	NC_021192	GATG	2	8	1020054	1020061	25 %	25 %	50 %	0 %	494691523
15527	NC_021192	CGC	2	6	1020091	1020096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691523
15528	NC_021192	GAA	2	6	1020137	1020142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494691523
15529	NC_021192	GCCA	2	8	1020182	1020189	25 %	0 %	25 %	50 %	494691523
15530	NC_021192	CCGG	2	8	1020279	1020286	0 %	0 %	50 %	50 %	494691523
15531	NC_021192	ACC	2	6	1020366	1020371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691523
15532	NC_021192	CGGT	2	8	1020395	1020402	0 %	25 %	50 %	25 %	494691523
15533	NC_021192	GACACC	2	12	1020425	1020436	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	494691523
15534	NC_021192	GGT	2	6	1020472	1020477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691523
15535	NC_021192	ACA	2	6	1020498	1020503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691523
15536	NC_021192	CGCA	2	8	1020602	1020609	25 %	0 %	25 %	50 %	494691523
15537	NC_021192	CTT	2	6	1020621	1020626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691523
15538	NC_021192	TTCCAC	2	12	1020650	1020661	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	494691523
15539	NC_021192	GCG	2	6	1020670	1020675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691523
15540	NC_021192	GGC	2	6	1020717	1020722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691523
15541	NC_021192	CACC	2	8	1020809	1020816	25 %	0 %	0 %	75 %	494691523
15542	NC_021192	GCC	2	6	1020818	1020823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691523
15543	NC_021192	GCC	2	6	1020857	1020862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691523
15544	NC_021192	AGC	2	6	1020904	1020909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691523
15545	NC_021192	GT	3	6	1020924	1020929	0 %	50 %	50 %	0 %	494691523
15546	NC_021192	CGG	2	6	1022340	1022345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691524
15547	NC_021192	GCG	2	6	1022372	1022377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691524
15548	NC_021192	CAC	2	6	1022399	1022404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691524
15549	NC_021192	CCG	2	6	1022483	1022488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691524
15550	NC_021192	GC	4	8	1022513	1022520	0 %	0 %	50 %	50 %	494691524
15551	NC_021192	ACC	2	6	1022595	1022600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691524
15552	NC_021192	GC	3	6	1022627	1022632	0 %	0 %	50 %	50 %	494691524
15553	NC_021192	CAT	2	6	1022702	1022707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691524
15554	NC_021192	TCG	2	6	1022743	1022748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691524
15555	NC_021192	GCCG	2	8	1022760	1022767	0 %	0 %	50 %	50 %	494691524
15556	NC_021192	CGC	2	6	1022778	1022783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691524
15557	NC_021192	GTGC	2	8	1022843	1022850	0 %	25 %	50 %	25 %	494691524
15558	NC_021192	CGG	2	6	1022856	1022861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691524
15559	NC_021192	AGC	2	6	1022864	1022869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691524
15560	NC_021192	CCA	2	6	1022870	1022875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691524
15561	NC_021192	CAC	2	6	1022879	1022884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691524
15562	NC_021192	GCA	2	6	1022947	1022952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691524
15563	NC_021192	CGG	2	6	1022958	1022963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691524
15564	NC_021192	CGC	2	6	1023007	1023012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691524
15565	NC_021192	GCG	2	6	1023040	1023045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691524
15566	NC_021192	CCA	2	6	1023086	1023091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691524
15567	NC_021192	GCAAG	2	10	1023128	1023137	40 %	0 %	40 %	20 %	494691524
15568	NC_021192	ACC	2	6	1023282	1023287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691525
15569	NC_021192	ATC	2	6	1023320	1023325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691525
15570	NC_021192	CGG	2	6	1023332	1023337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691525
15571	NC_021192	AAACCC	2	12	1023385	1023396	50 %	0 %	0 %	50 %	494691525
15572	NC_021192	CGC	2	6	1023407	1023412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691525
15573	NC_021192	AC	3	6	1023430	1023435	50 %	0 %	0 %	50 %	494691525
15574	NC_021192	CAACGG	2	12	1023437	1023448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691525
15575	NC_021192	GTC	2	6	1023450	1023455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691525
15576	NC_021192	GCC	2	6	1023467	1023472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691525
15577	NC_021192	GATCGA	2	12	1023488	1023499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494691525
15578	NC_021192	GGC	2	6	1023521	1023526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691525
15579	NC_021192	CAT	2	6	1023532	1023537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691525
15580	NC_021192	TGCG	2	8	1023555	1023562	0 %	25 %	50 %	25 %	494691525
15581	NC_021192	GCC	2	6	1023652	1023657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691526
15582	NC_021192	CCG	2	6	1023722	1023727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691526
15583	NC_021192	CTC	2	6	1023772	1023777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691526
15584	NC_021192	GGC	2	6	1023784	1023789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691526
15585	NC_021192	CG	3	6	1023830	1023835	0 %	0 %	50 %	50 %	494691526
15586	NC_021192	GC	3	6	1023849	1023854	0 %	0 %	50 %	50 %	494691526
15587	NC_021192	TGC	2	6	1023882	1023887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691526
15588	NC_021192	GC	3	6	1023952	1023957	0 %	0 %	50 %	50 %	494691526
15589	NC_021192	ACG	2	6	1026157	1026162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691527
15590	NC_021192	GCG	2	6	1026201	1026206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691527
15591	NC_021192	ACC	2	6	1026288	1026293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691527
15592	NC_021192	GTA	2	6	1026303	1026308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691527
15593	NC_021192	TCA	2	6	1026371	1026376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691527
15594	NC_021192	TGT	2	6	1026383	1026388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691527
15595	NC_021192	CCAG	2	8	1026392	1026399	25 %	0 %	25 %	50 %	494691527
15596	NC_021192	TCG	2	6	1026723	1026728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691528
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15598	NC_021192	GCA	2	6	1026780	1026785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691528
15599	NC_021192	CGG	2	6	1026844	1026849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691528
15600	NC_021192	CCA	2	6	1026850	1026855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691528
15601	NC_021192	GGC	2	6	1026922	1026927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691528
15602	NC_021192	GCC	2	6	1026986	1026991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691529
15603	NC_021192	GGGC	2	8	1026997	1027004	0 %	0 %	75 %	25 %	494691529
15604	NC_021192	CG	3	6	1027028	1027033	0 %	0 %	50 %	50 %	494691529
15605	NC_021192	GCG	3	9	1027104	1027112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691529
15606	NC_021192	ACAT	2	8	1027169	1027176	50 %	25 %	0 %	25 %	494691529
15607	NC_021192	GCA	2	6	1027211	1027216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691529
15608	NC_021192	CAGGC	2	10	1027238	1027247	20 %	0 %	40 %	40 %	494691529
15609	NC_021192	GCA	3	9	1027263	1027271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691529
15610	NC_021192	CGA	2	6	1027347	1027352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691529
15611	NC_021192	GC	4	8	1027466	1027473	0 %	0 %	50 %	50 %	494691529
15612	NC_021192	ACG	2	6	1027826	1027831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691530
15613	NC_021192	GACTGC	2	12	1027868	1027879	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691530
15614	NC_021192	CAT	2	6	1027885	1027890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691530
15615	NC_021192	CCG	2	6	1027938	1027943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691530
15616	NC_021192	CCG	2	6	1027978	1027983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691530
15617	NC_021192	GTG	2	6	1028041	1028046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691530
15618	NC_021192	TCG	2	6	1028074	1028079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691530
15619	NC_021192	GGC	2	6	1028082	1028087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691530
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15732	NC_021192	GT	3	6	1038603	1038608	0 %	50 %	50 %	0 %	494691534
15733	NC_021192	GCG	2	6	1038663	1038668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691534
15734	NC_021192	TGG	2	6	1038729	1038734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691534
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15849	NC_021192	GAT	2	6	1047264	1047269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691539
15850	NC_021192	GAG	2	6	1047313	1047318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691539
15851	NC_021192	CGC	2	6	1047333	1047338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691539
15852	NC_021192	GCG	2	6	1047375	1047380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691539
15853	NC_021192	GTC	2	6	1047403	1047408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691539
15854	NC_021192	GAC	2	6	1047426	1047431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691539
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15860	NC_021192	GC	3	6	1049515	1049520	0 %	0 %	50 %	50 %	494691540
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15951	NC_021192	GC	3	6	1058108	1058113	0 %	0 %	50 %	50 %	494691544
15952	NC_021192	CGGC	2	8	1058169	1058176	0 %	0 %	50 %	50 %	494691544
15953	NC_021192	GCC	2	6	1058178	1058183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691544
15954	NC_021192	GTGG	2	8	1058228	1058235	0 %	25 %	75 %	0 %	494691544
15955	NC_021192	GC	3	6	1058255	1058260	0 %	0 %	50 %	50 %	494691544
15956	NC_021192	TTC	2	6	1058274	1058279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691544
15957	NC_021192	GAC	2	6	1058356	1058361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691544
15958	NC_021192	CCT	2	6	1058378	1058383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691544
15959	NC_021192	GCA	2	6	1058423	1058428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691544
15960	NC_021192	GCG	3	9	1058433	1058441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691544
15961	NC_021192	CCCGAC	2	12	1058485	1058496	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	494691544
15962	NC_021192	CCG	2	6	1058610	1058615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691544
15963	NC_021192	GCT	2	6	1058617	1058622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691544
15964	NC_021192	GCG	2	6	1058658	1058663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691544
15965	NC_021192	CGT	2	6	1058683	1058688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691544
15966	NC_021192	GCC	2	6	1058696	1058701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691544
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15984	NC_021192	GCT	2	6	1060062	1060067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691548
15985	NC_021192	CG	3	6	1060217	1060222	0 %	0 %	50 %	50 %	494691548
15986	NC_021192	GTC	2	6	1060250	1060255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691548
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16000	NC_021192	CGCGG	2	10	1063419	1063428	0 %	0 %	60 %	40 %	494691549

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