MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021192	GGCG	2	8	983892	983899	0 %	0 %	75 %	25 %	494691496
15002	NC_021192	CGT	2	6	983904	983909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691496
15003	NC_021192	GCG	2	6	983920	983925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691496
15004	NC_021192	GGCC	2	8	983956	983963	0 %	0 %	50 %	50 %	494691496
15005	NC_021192	CCA	2	6	984045	984050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691496
15006	NC_021192	CA	3	6	984059	984064	50 %	0 %	0 %	50 %	494691496
15007	NC_021192	CCG	2	6	984120	984125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691496
15008	NC_021192	CCA	2	6	984157	984162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691496
15009	NC_021192	ACG	2	6	984233	984238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691496
15010	NC_021192	GCC	2	6	984308	984313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691496
15011	NC_021192	GCG	2	6	984386	984391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691496
15012	NC_021192	TTG	2	6	984418	984423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691496
15013	NC_021192	ACG	2	6	984448	984453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691496
15014	NC_021192	TCGG	2	8	984460	984467	0 %	25 %	50 %	25 %	494691496
15015	NC_021192	ACCGCG	2	12	984507	984518	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	494691496
15016	NC_021192	TCG	2	6	984538	984543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691496
15017	NC_021192	GGC	2	6	984552	984557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691496
15018	NC_021192	TCA	2	6	984586	984591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691496
15019	NC_021192	GGC	2	6	984678	984683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691496
15020	NC_021192	GCCG	2	8	984728	984735	0 %	0 %	50 %	50 %	494691496
15021	NC_021192	GTCGAT	2	12	987701	987712	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494691497
15022	NC_021192	GGA	2	6	987717	987722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691497
15023	NC_021192	TCACG	2	10	987774	987783	20 %	20 %	20 %	40 %	494691497
15024	NC_021192	CGG	2	6	987921	987926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691497
15025	NC_021192	CGAC	2	8	987951	987958	25 %	0 %	25 %	50 %	494691497
15026	NC_021192	GCT	2	6	988069	988074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691497
15027	NC_021192	G	6	6	988129	988134	0 %	0 %	100 %	0 %	494691497
15028	NC_021192	GT	3	6	988917	988922	0 %	50 %	50 %	0 %	494691498
15029	NC_021192	ACC	2	6	989465	989470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691499
15030	NC_021192	GAA	2	6	989567	989572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494691499
15031	NC_021192	TGC	2	6	989590	989595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691499
15032	NC_021192	GC	3	6	989599	989604	0 %	0 %	50 %	50 %	494691499
15033	NC_021192	CG	3	6	989659	989664	0 %	0 %	50 %	50 %	494691499
15034	NC_021192	CG	3	6	989796	989801	0 %	0 %	50 %	50 %	494691499
15035	NC_021192	GCT	2	6	990005	990010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691499
15036	NC_021192	GA	3	6	990022	990027	50 %	0 %	50 %	0 %	494691499
15037	NC_021192	CAG	2	6	990033	990038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691499
15038	NC_021192	GTT	2	6	990081	990086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691499
15039	NC_021192	ACCG	2	8	990127	990134	25 %	0 %	25 %	50 %	494691499
15040	NC_021192	TTG	2	6	990218	990223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691499
15041	NC_021192	AATCC	2	10	990257	990266	40 %	20 %	0 %	40 %	494691499
15042	NC_021192	ACC	2	6	990280	990285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691499
15043	NC_021192	CGG	2	6	990296	990301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691499
15044	NC_021192	TCG	2	6	990322	990327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691499
15045	NC_021192	CAC	2	6	990431	990436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691499
15046	NC_021192	CGGCA	2	10	990440	990449	20 %	0 %	40 %	40 %	494691499
15047	NC_021192	GCG	2	6	990511	990516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691499
15048	NC_021192	GTG	2	6	990545	990550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691499
15049	NC_021192	CA	3	6	990641	990646	50 %	0 %	0 %	50 %	494691499
15050	NC_021192	CGG	2	6	990703	990708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691499
15051	NC_021192	AAC	2	6	990748	990753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691499
15052	NC_021192	CGTGA	2	10	990771	990780	20 %	20 %	40 %	20 %	494691499
15053	NC_021192	CGG	2	6	990797	990802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691499
15054	NC_021192	ATG	2	6	990878	990883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691499
15055	NC_021192	GCC	2	6	992158	992163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691500
15056	NC_021192	CCG	2	6	992276	992281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691500
15057	NC_021192	CAG	2	6	992293	992298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691500
15058	NC_021192	GTG	2	6	992307	992312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691500
15059	NC_021192	CTCG	2	8	992340	992347	0 %	25 %	25 %	50 %	494691500
15060	NC_021192	ACCGAG	2	12	992365	992376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691500
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15063	NC_021192	CGGC	2	8	994964	994971	0 %	0 %	50 %	50 %	494691501
15064	NC_021192	CG	3	6	995021	995026	0 %	0 %	50 %	50 %	494691501
15065	NC_021192	GGC	2	6	995030	995035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691501
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15067	NC_021192	CCCGC	2	10	995139	995148	0 %	0 %	20 %	80 %	494691501
15068	NC_021192	TGCCG	2	10	995208	995217	0 %	20 %	40 %	40 %	494691501
15069	NC_021192	GT	3	6	995218	995223	0 %	50 %	50 %	0 %	494691501
15070	NC_021192	TCG	2	6	995232	995237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691501
15071	NC_021192	GCC	2	6	995279	995284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691501
15072	NC_021192	GTC	3	9	995319	995327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691501
15073	NC_021192	GC	3	6	995398	995403	0 %	0 %	50 %	50 %	494691501
15074	NC_021192	GGC	2	6	995406	995411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691501
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15076	NC_021192	GGTC	2	8	995531	995538	0 %	25 %	50 %	25 %	494691501
15077	NC_021192	CCGC	2	8	995579	995586	0 %	0 %	25 %	75 %	494691501
15078	NC_021192	TGCT	2	8	995652	995659	0 %	50 %	25 %	25 %	494691501
15079	NC_021192	GTC	2	6	995673	995678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691502
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15081	NC_021192	TTGACC	2	12	995710	995721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	494691502
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15084	NC_021192	CG	3	6	995808	995813	0 %	0 %	50 %	50 %	494691502
15085	NC_021192	ACCGT	2	10	995855	995864	20 %	20 %	20 %	40 %	494691502
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15091	NC_021192	CGGCG	2	10	996301	996310	0 %	0 %	60 %	40 %	494691503
15092	NC_021192	CGC	2	6	996316	996321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691503
15093	NC_021192	TGCGC	2	10	996326	996335	0 %	20 %	40 %	40 %	494691503
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15098	NC_021192	GCCCG	2	10	996579	996588	0 %	0 %	40 %	60 %	494691503
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15103	NC_021192	CG	3	6	996740	996745	0 %	0 %	50 %	50 %	494691503
15104	NC_021192	GCG	2	6	996820	996825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691503
15105	NC_021192	TGC	3	9	996830	996838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691503
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15121	NC_021192	GGCA	2	8	997649	997656	25 %	0 %	50 %	25 %	494691504
15122	NC_021192	ACG	2	6	997742	997747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691504
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15126	NC_021192	TCG	2	6	998015	998020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691504
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15238	NC_021192	GC	3	6	1005161	1005166	0 %	0 %	50 %	50 %	494691509
15239	NC_021192	GCGG	2	8	1005197	1005204	0 %	0 %	75 %	25 %	494691509
15240	NC_021192	CTGG	2	8	1005235	1005242	0 %	25 %	50 %	25 %	494691509
15241	NC_021192	CGC	2	6	1005314	1005319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691509
15242	NC_021192	TC	3	6	1005326	1005331	0 %	50 %	0 %	50 %	494691509
15243	NC_021192	GTG	2	6	1005459	1005464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691509
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15248	NC_021192	GCAA	2	8	1005644	1005651	50 %	0 %	25 %	25 %	494691509
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15252	NC_021192	TAC	2	6	1005900	1005905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691509
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15261	NC_021192	GTC	2	6	1006349	1006354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691511
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15269	NC_021192	GCCG	2	8	1006606	1006613	0 %	0 %	50 %	50 %	494691511
15270	NC_021192	CTG	2	6	1006616	1006621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691511
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15353	NC_021192	GCT	2	6	1010626	1010631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691515
15354	NC_021192	GGT	2	6	1010632	1010637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691515
15355	NC_021192	GGCG	2	8	1010647	1010654	0 %	0 %	75 %	25 %	494691515
15356	NC_021192	GTC	2	6	1010690	1010695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691515
15357	NC_021192	GCT	2	6	1010698	1010703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691515
15358	NC_021192	TAC	2	6	1010726	1010731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691515
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15362	NC_021192	GTG	2	6	1010863	1010868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691515
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15364	NC_021192	GGCT	2	8	1010915	1010922	0 %	25 %	50 %	25 %	494691515
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15382	NC_021192	TCC	2	6	1011931	1011936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691515
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15423	NC_021192	G	6	6	1014223	1014228	0 %	0 %	100 %	0 %	494691516
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15468	NC_021192	ACT	2	6	1015879	1015884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691517
15469	NC_021192	TGT	2	6	1015888	1015893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691517
15470	NC_021192	CGG	2	6	1015945	1015950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691517
15471	NC_021192	TGA	2	6	1016201	1016206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691517
15472	NC_021192	CGT	2	6	1016268	1016273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691517
15473	NC_021192	TCG	2	6	1016327	1016332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691517
15474	NC_021192	TCG	2	6	1016339	1016344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691517
15475	NC_021192	GTG	2	6	1016350	1016355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691517
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15477	NC_021192	CGG	2	6	1016756	1016761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691518
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15480	NC_021192	GGT	2	6	1017001	1017006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691519
15481	NC_021192	GCC	2	6	1017058	1017063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691519
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15484	NC_021192	TGC	2	6	1017164	1017169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691520
15485	NC_021192	ACG	2	6	1017188	1017193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691520
15486	NC_021192	TCT	2	6	1017214	1017219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691520
15487	NC_021192	TGG	2	6	1017227	1017232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691520
15488	NC_021192	CG	3	6	1017265	1017270	0 %	0 %	50 %	50 %	494691520
15489	NC_021192	GACG	2	8	1017282	1017289	25 %	0 %	50 %	25 %	494691520
15490	NC_021192	TGC	2	6	1017312	1017317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691520
15491	NC_021192	GTT	2	6	1017370	1017375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691520
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15494	NC_021192	TTC	3	9	1017503	1017511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691520
15495	NC_021192	CGT	2	6	1017516	1017521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691520
15496	NC_021192	GC	3	6	1018556	1018561	0 %	0 %	50 %	50 %	494691521
15497	NC_021192	TCG	2	6	1018588	1018593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691521
15498	NC_021192	TGC	2	6	1018594	1018599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691521
15499	NC_021192	GCG	2	6	1018640	1018645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691521
15500	NC_021192	CG	4	8	1018654	1018661	0 %	0 %	50 %	50 %	494691521

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