MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021192	CGT	2	6	860276	860281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691393
13002	NC_021192	GCT	2	6	860288	860293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691393
13003	NC_021192	GAC	2	6	860325	860330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691393
13004	NC_021192	CGG	2	6	860345	860350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691393
13005	NC_021192	CGC	2	6	860365	860370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691393
13006	NC_021192	ACA	2	6	860386	860391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691393
13007	NC_021192	GGT	2	6	860402	860407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691393
13008	NC_021192	TCG	2	6	860416	860421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691393
13009	NC_021192	CCGC	2	8	860494	860501	0 %	0 %	25 %	75 %	494691393
13010	NC_021192	CGG	2	6	860506	860511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691393
13011	NC_021192	GCC	2	6	860596	860601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691393
13012	NC_021192	GGC	2	6	860670	860675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691393
13013	NC_021192	CGT	2	6	860709	860714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691393
13014	NC_021192	TGC	2	6	860738	860743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691393
13015	NC_021192	CGA	2	6	860763	860768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691393
13016	NC_021192	GGT	2	6	860805	860810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691393
13017	NC_021192	GCC	2	6	861151	861156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691394
13018	NC_021192	CAT	2	6	861216	861221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691394
13019	NC_021192	GCC	2	6	861222	861227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691394
13020	NC_021192	TCA	2	6	861242	861247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691394
13021	NC_021192	GAT	2	6	861279	861284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691394
13022	NC_021192	CAC	2	6	861333	861338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691394
13023	NC_021192	TGCCGG	2	12	861369	861380	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	494691394
13024	NC_021192	CAC	3	9	861382	861390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691394
13025	NC_021192	CAT	2	6	861433	861438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691394
13026	NC_021192	CGG	2	6	861452	861457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691394
13027	NC_021192	GCC	2	6	861471	861476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691394
13028	NC_021192	GCC	2	6	861493	861498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691394
13029	NC_021192	GATC	2	8	861515	861522	25 %	25 %	25 %	25 %	494691394
13030	NC_021192	GC	3	6	861529	861534	0 %	0 %	50 %	50 %	494691394
13031	NC_021192	AC	3	6	861598	861603	50 %	0 %	0 %	50 %	494691394
13032	NC_021192	TGG	2	6	861751	861756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691394
13033	NC_021192	GCG	2	6	861811	861816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691394
13034	NC_021192	GTC	2	6	861819	861824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691394
13035	NC_021192	CCG	2	6	861837	861842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691394
13036	NC_021192	GCC	2	6	861846	861851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691394
13037	NC_021192	GGC	2	6	861869	861874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691394
13038	NC_021192	CTC	2	6	861892	861897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691394
13039	NC_021192	CGC	2	6	861907	861912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691394
13040	NC_021192	TCT	2	6	861915	861920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691394
13041	NC_021192	CGC	2	6	861928	861933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691394
13042	NC_021192	CCG	2	6	861977	861982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691394
13043	NC_021192	GC	3	6	864399	864404	0 %	0 %	50 %	50 %	494691395
13044	NC_021192	CGC	2	6	864458	864463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691395
13045	NC_021192	GCG	2	6	864515	864520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691395
13046	NC_021192	CCG	2	6	864609	864614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691395
13047	NC_021192	CCA	3	9	864636	864644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691395
13048	NC_021192	GCG	2	6	864645	864650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691395
13049	NC_021192	GCC	2	6	864695	864700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691395
13050	NC_021192	TCG	2	6	864713	864718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691395
13051	NC_021192	CCA	2	6	864735	864740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691395
13052	NC_021192	CGGC	2	8	864778	864785	0 %	0 %	50 %	50 %	494691395
13053	NC_021192	CGA	2	6	864802	864807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691395
13054	NC_021192	ACCGGG	2	12	864930	864941	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	494691395
13055	NC_021192	ACT	2	6	865014	865019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691395
13056	NC_021192	GGT	2	6	865132	865137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691395
13057	NC_021192	GCG	2	6	865144	865149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691395
13058	NC_021192	TGC	2	6	865272	865277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691396
13059	NC_021192	CGG	2	6	865391	865396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691396
13060	NC_021192	GGC	2	6	865426	865431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691396
13061	NC_021192	GGC	2	6	865435	865440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691396
13062	NC_021192	GCGG	2	8	865448	865455	0 %	0 %	75 %	25 %	494691396
13063	NC_021192	CCA	2	6	865509	865514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691396
13064	NC_021192	CGG	2	6	865536	865541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691396
13065	NC_021192	GAT	3	9	865549	865557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691396
13066	NC_021192	CTG	2	6	865645	865650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691396
13067	NC_021192	GCG	2	6	865663	865668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691396
13068	NC_021192	GCG	2	6	865683	865688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691396
13069	NC_021192	CTT	2	6	865698	865703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691396
13070	NC_021192	ACG	2	6	865760	865765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691396
13071	NC_021192	TCA	2	6	865801	865806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691396
13072	NC_021192	CA	3	6	865811	865816	50 %	0 %	0 %	50 %	494691396
13073	NC_021192	CGATT	2	10	865817	865826	20 %	40 %	20 %	20 %	494691396
13074	NC_021192	GGCC	2	8	865830	865837	0 %	0 %	50 %	50 %	494691396
13075	NC_021192	TCG	2	6	865879	865884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691396
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13078	NC_021192	GTTGC	2	10	866029	866038	0 %	40 %	40 %	20 %	494691396
13079	NC_021192	CTT	2	6	866046	866051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691396
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13084	NC_021192	CTG	2	6	866281	866286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691397
13085	NC_021192	GCC	2	6	866296	866301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691397
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13089	NC_021192	CCG	3	9	866482	866490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691397
13090	NC_021192	CGT	2	6	866565	866570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691398
13091	NC_021192	CCGA	2	8	866595	866602	25 %	0 %	25 %	50 %	494691398
13092	NC_021192	CTAC	2	8	866638	866645	25 %	25 %	0 %	50 %	494691398
13093	NC_021192	TCG	2	6	866685	866690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691398
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13099	NC_021192	CGG	2	6	866832	866837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691398
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13101	NC_021192	GAT	2	6	866941	866946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691398
13102	NC_021192	CTG	2	6	866954	866959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691398
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13106	NC_021192	CGT	2	6	867141	867146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691398
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13115	NC_021192	TGTGG	2	10	867440	867449	0 %	40 %	60 %	0 %	494691398
13116	NC_021192	CG	3	6	867485	867490	0 %	0 %	50 %	50 %	494691398
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13118	NC_021192	CGG	2	6	867728	867733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691398
13119	NC_021192	TGG	2	6	867764	867769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691398
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13230	NC_021192	TTCG	2	8	879167	879174	0 %	50 %	25 %	25 %	494691408
13231	NC_021192	TTCC	2	8	879233	879240	0 %	50 %	0 %	50 %	494691408
13232	NC_021192	GGCG	2	8	879293	879300	0 %	0 %	75 %	25 %	494691408
13233	NC_021192	TGG	2	6	879316	879321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691408
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13235	NC_021192	CGG	2	6	879481	879486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691408
13236	NC_021192	CGA	2	6	879499	879504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691408
13237	NC_021192	CTTGC	2	10	879510	879519	0 %	40 %	20 %	40 %	494691408
13238	NC_021192	CGT	2	6	879601	879606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691408
13239	NC_021192	GTA	3	9	879623	879631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691408
13240	NC_021192	TGC	2	6	879680	879685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691408
13241	NC_021192	CGT	2	6	879686	879691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691408
13242	NC_021192	ACGA	2	8	879692	879699	50 %	0 %	25 %	25 %	494691408
13243	NC_021192	TTG	2	6	879759	879764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691408
13244	NC_021192	ATG	2	6	879806	879811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691408
13245	NC_021192	GAT	2	6	879820	879825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691408
13246	NC_021192	ACG	2	6	879845	879850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691408
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13248	NC_021192	CGA	2	6	879930	879935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691408
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13250	NC_021192	CTT	2	6	879981	879986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691408
13251	NC_021192	TGGG	2	8	879998	880005	0 %	25 %	75 %	0 %	494691408
13252	NC_021192	CAG	3	9	880009	880017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691408
13253	NC_021192	GCC	2	6	880055	880060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691408
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13255	NC_021192	ACC	2	6	880110	880115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691408
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13260	NC_021192	CCGG	2	8	880249	880256	0 %	0 %	50 %	50 %	494691408
13261	NC_021192	TGA	2	6	880290	880295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691408
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13282	NC_021192	GCGT	2	8	881644	881651	0 %	25 %	50 %	25 %	494691410
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13290	NC_021192	GTC	2	6	883252	883257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691411
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13292	NC_021192	CG	4	8	883326	883333	0 %	0 %	50 %	50 %	494691411
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13295	NC_021192	CGA	2	6	883422	883427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691411
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13300	NC_021192	CCA	2	6	883663	883668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691411
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13303	NC_021192	GGT	2	6	883771	883776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691412
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13311	NC_021192	CG	3	6	885153	885158	0 %	0 %	50 %	50 %	494691413
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13327	NC_021192	CGAT	2	8	885623	885630	25 %	25 %	25 %	25 %	494691414
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13329	NC_021192	CCAC	2	8	885678	885685	25 %	0 %	0 %	75 %	494691414
13330	NC_021192	GTT	2	6	885709	885714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691414
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13337	NC_021192	CG	4	8	885892	885899	0 %	0 %	50 %	50 %	494691414
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13343	NC_021192	GCC	2	6	886073	886078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691415
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13350	NC_021192	AC	3	6	886354	886359	50 %	0 %	0 %	50 %	494691415
13351	NC_021192	CGAC	2	8	886421	886428	25 %	0 %	25 %	50 %	494691415
13352	NC_021192	CGG	2	6	886433	886438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691415
13353	NC_021192	CGC	2	6	886540	886545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691415
13354	NC_021192	ATG	2	6	886590	886595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691415
13355	NC_021192	CAG	2	6	886673	886678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691415
13356	NC_021192	AG	3	6	886677	886682	50 %	0 %	50 %	0 %	494691415
13357	NC_021192	GTCC	2	8	886697	886704	0 %	25 %	25 %	50 %	494691415
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13359	NC_021192	CGA	2	6	886856	886861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691416
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13474	NC_021192	CGG	2	6	892401	892406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691422
13475	NC_021192	GGT	2	6	892423	892428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691422
13476	NC_021192	CGA	2	6	892447	892452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691422
13477	NC_021192	CGA	2	6	892525	892530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691422
13478	NC_021192	ACC	2	6	892566	892571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691422
13479	NC_021192	GCC	2	6	892582	892587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691422
13480	NC_021192	GCT	2	6	892612	892617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691422
13481	NC_021192	TGC	2	6	892768	892773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691422
13482	NC_021192	CGG	2	6	892786	892791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691422
13483	NC_021192	GAG	2	6	892821	892826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691422
13484	NC_021192	TG	3	6	892843	892848	0 %	50 %	50 %	0 %	494691422
13485	NC_021192	CGT	2	6	892880	892885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691422
13486	NC_021192	TGCG	2	8	892945	892952	0 %	25 %	50 %	25 %	494691422
13487	NC_021192	GCC	2	6	893012	893017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691422
13488	NC_021192	CGA	2	6	893118	893123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691422
13489	NC_021192	GCC	2	6	893134	893139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691422
13490	NC_021192	GGCTG	2	10	893160	893169	0 %	20 %	60 %	20 %	494691422
13491	NC_021192	GCG	4	12	893180	893191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691422
13492	NC_021192	ACG	2	6	893207	893212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691422
13493	NC_021192	CTGG	2	8	893272	893279	0 %	25 %	50 %	25 %	494691422
13494	NC_021192	GGC	2	6	893294	893299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691422
13495	NC_021192	GAG	2	6	893312	893317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691422
13496	NC_021192	TCGG	3	12	893361	893372	0 %	25 %	50 %	25 %	494691422
13497	NC_021192	CG	5	10	893422	893431	0 %	0 %	50 %	50 %	494691422
13498	NC_021192	TGGC	2	8	893492	893499	0 %	25 %	50 %	25 %	494691422
13499	NC_021192	GCA	2	6	893519	893524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691423
13500	NC_021192	GCT	2	6	893527	893532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691423

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