MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021192	CCGG	2	8	28903	28910	0 %	0 %	50 %	50 %	494690689
502	NC_021192	CAA	2	6	28956	28961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690689
503	NC_021192	GTC	2	6	28966	28971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690689
504	NC_021192	CAA	2	6	29016	29021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690689
505	NC_021192	GGCAA	2	10	29149	29158	40 %	0 %	40 %	20 %	494690689
506	NC_021192	ACG	2	6	29160	29165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690689
507	NC_021192	GC	3	6	29208	29213	0 %	0 %	50 %	50 %	494690689
508	NC_021192	CGC	2	6	29792	29797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690690
509	NC_021192	AGC	2	6	29819	29824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690690
510	NC_021192	GTC	2	6	29868	29873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690690
511	NC_021192	CGATC	2	10	29964	29973	20 %	20 %	20 %	40 %	494690690
512	NC_021192	CCGG	2	8	29982	29989	0 %	0 %	50 %	50 %	494690690
513	NC_021192	CG	3	6	29990	29995	0 %	0 %	50 %	50 %	494690690
514	NC_021192	GGT	2	6	30041	30046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690690
515	NC_021192	GCC	2	6	30090	30095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690690
516	NC_021192	GTCG	2	8	30158	30165	0 %	25 %	50 %	25 %	494690690
517	NC_021192	GCG	2	6	30172	30177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690690
518	NC_021192	CAG	2	6	30198	30203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690690
519	NC_021192	CCT	2	6	30236	30241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494690690
520	NC_021192	GCT	3	9	30248	30256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690690
521	NC_021192	CGT	2	6	30325	30330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690690
522	NC_021192	TGG	2	6	30353	30358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690690
523	NC_021192	GC	3	6	30409	30414	0 %	0 %	50 %	50 %	494690690
524	NC_021192	CTG	2	6	30438	30443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690690
525	NC_021192	CGA	2	6	30479	30484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690690
526	NC_021192	AAG	2	6	30493	30498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690690
527	NC_021192	CGA	2	6	30551	30556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690690
528	NC_021192	CGA	2	6	30569	30574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690690
529	NC_021192	CGA	2	6	30616	30621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690690
530	NC_021192	CGC	2	6	30671	30676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690690
531	NC_021192	GGC	3	9	30686	30694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690690
532	NC_021192	CAA	2	6	30723	30728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690690
533	NC_021192	GT	3	6	30808	30813	0 %	50 %	50 %	0 %	494690690
534	NC_021192	GCCCTT	2	12	30824	30835	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	494690690
535	NC_021192	AT	3	6	30911	30916	50 %	50 %	0 %	0 %	494690690
536	NC_021192	GCG	2	6	30920	30925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690690
537	NC_021192	ACCGCG	2	12	30926	30937	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	494690690
538	NC_021192	ACCA	2	8	30961	30968	50 %	0 %	0 %	50 %	494690690
539	NC_021192	CGG	2	6	30972	30977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690690
540	NC_021192	CAA	2	6	31007	31012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690690
541	NC_021192	GAG	2	6	31013	31018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494690690
542	NC_021192	CAG	2	6	31083	31088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690690
543	NC_021192	CCG	2	6	31090	31095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690690
544	NC_021192	AGC	2	6	31285	31290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690691
545	NC_021192	CGAG	2	8	31292	31299	25 %	0 %	50 %	25 %	494690691
546	NC_021192	CAT	2	6	31322	31327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690691
547	NC_021192	GGC	2	6	31452	31457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690691
548	NC_021192	CCG	2	6	31502	31507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690691
549	NC_021192	GGC	2	6	31554	31559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690692
550	NC_021192	CGAC	2	8	31588	31595	25 %	0 %	25 %	50 %	494690692
551	NC_021192	GCT	2	6	31619	31624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690692
552	NC_021192	CCG	2	6	31637	31642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690692
553	NC_021192	GGC	2	6	31706	31711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690692
554	NC_021192	TCG	2	6	31766	31771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690692
555	NC_021192	TGC	3	9	31775	31783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690692
556	NC_021192	AC	3	6	31828	31833	50 %	0 %	0 %	50 %	494690692
557	NC_021192	CAC	2	6	31838	31843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690692
558	NC_021192	GAT	2	6	31867	31872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690693
559	NC_021192	GC	3	6	31914	31919	0 %	0 %	50 %	50 %	494690693
560	NC_021192	CTC	2	6	31970	31975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494690693
561	NC_021192	CAC	2	6	31985	31990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690693
562	NC_021192	ACG	2	6	32470	32475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690694
563	NC_021192	TTG	2	6	32542	32547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690694
564	NC_021192	ACG	2	6	32593	32598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690694
565	NC_021192	CGC	2	6	32652	32657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690694
566	NC_021192	ACG	2	6	32732	32737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690694
567	NC_021192	CGG	2	6	32768	32773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690694
568	NC_021192	GCC	3	9	32785	32793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690694
569	NC_021192	CCA	2	6	32834	32839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690694
570	NC_021192	TGT	2	6	32890	32895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690694
571	NC_021192	GCC	2	6	32898	32903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690694
572	NC_021192	TGG	2	6	33029	33034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690694
573	NC_021192	G	6	6	33033	33038	0 %	0 %	100 %	0 %	494690694
574	NC_021192	TCG	2	6	33109	33114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690694
575	NC_021192	TTC	2	6	33121	33126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494690694
576	NC_021192	GGC	2	6	33140	33145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690694
577	NC_021192	TGA	2	6	33268	33273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690695
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579	NC_021192	CGA	2	6	33332	33337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690695
580	NC_021192	CGG	2	6	33365	33370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690695
581	NC_021192	CG	3	6	33537	33542	0 %	0 %	50 %	50 %	494690695
582	NC_021192	CGA	2	6	36670	36675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690696
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584	NC_021192	CGC	2	6	36706	36711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690696
585	NC_021192	CTGG	2	8	36791	36798	0 %	25 %	50 %	25 %	494690696
586	NC_021192	TGCC	2	8	36826	36833	0 %	25 %	25 %	50 %	494690696
587	NC_021192	GCC	3	9	36848	36856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690696
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590	NC_021192	CGG	2	6	37030	37035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690697
591	NC_021192	CGG	2	6	37059	37064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690697
592	NC_021192	GCA	2	6	37090	37095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690697
593	NC_021192	CG	5	10	37170	37179	0 %	0 %	50 %	50 %	494690697
594	NC_021192	GCAT	2	8	37183	37190	25 %	25 %	25 %	25 %	494690697
595	NC_021192	C	6	6	37191	37196	0 %	0 %	0 %	100 %	494690697
596	NC_021192	TCCTG	2	10	37262	37271	0 %	40 %	20 %	40 %	494690697
597	NC_021192	GTCCA	2	10	39188	39197	20 %	20 %	20 %	40 %	494690698
598	NC_021192	CGC	2	6	39235	39240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690698
599	NC_021192	CAG	2	6	39289	39294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690698
600	NC_021192	GCC	2	6	39306	39311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690698
601	NC_021192	GCC	2	6	39356	39361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690698
602	NC_021192	CGT	2	6	39375	39380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690698
603	NC_021192	CGA	2	6	39381	39386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690698
604	NC_021192	CCGG	2	8	39389	39396	0 %	0 %	50 %	50 %	494690698
605	NC_021192	CGG	3	9	39405	39413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690698
606	NC_021192	TCA	2	6	39414	39419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690698
607	NC_021192	TCG	2	6	39437	39442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690698
608	NC_021192	CCG	2	6	39447	39452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690698
609	NC_021192	CAG	2	6	39475	39480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690698
610	NC_021192	CCA	2	6	39555	39560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690698
611	NC_021192	GTC	2	6	39571	39576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690698
612	NC_021192	CAC	2	6	39622	39627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690698
613	NC_021192	TCG	2	6	39644	39649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690698
614	NC_021192	CGA	2	6	39701	39706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690698
615	NC_021192	CAC	2	6	39714	39719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690698
616	NC_021192	CGT	2	6	39869	39874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690698
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619	NC_021192	CGG	2	6	39974	39979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690699
620	NC_021192	GGC	2	6	39996	40001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690699
621	NC_021192	GAA	2	6	40100	40105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690699
622	NC_021192	CAG	2	6	40106	40111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690699
623	NC_021192	C	6	6	40124	40129	0 %	0 %	0 %	100 %	494690699
624	NC_021192	CAG	2	6	40169	40174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690699
625	NC_021192	ACC	2	6	40188	40193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690699
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627	NC_021192	GC	3	6	40251	40256	0 %	0 %	50 %	50 %	494690699
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754	NC_021192	CGG	2	6	46241	46246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690703
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880	NC_021192	CAT	2	6	53842	53847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690712
881	NC_021192	CGG	2	6	53877	53882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690712
882	NC_021192	AGC	2	6	53913	53918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690712
883	NC_021192	GTT	2	6	53938	53943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690712
884	NC_021192	CGG	2	6	53955	53960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690712
885	NC_021192	CGG	2	6	53977	53982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690712
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901	NC_021192	GCTCAA	2	12	54602	54613	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494690712
902	NC_021192	CAA	2	6	54717	54722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690712
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919	NC_021192	CGC	3	9	55393	55401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690712
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955	NC_021192	CG	4	8	58920	58927	0 %	0 %	50 %	50 %	494690715
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962	NC_021192	GTT	2	6	59326	59331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690716
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988	NC_021192	G	7	7	61099	61105	0 %	0 %	100 %	0 %	494690718
989	NC_021192	CAGC	2	8	61166	61173	25 %	0 %	25 %	50 %	494690718
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991	NC_021192	CCA	2	6	61252	61257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690718
992	NC_021192	GC	3	6	61265	61270	0 %	0 %	50 %	50 %	494690718
993	NC_021192	TGG	2	6	61356	61361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690718
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996	NC_021192	ATG	2	6	61589	61594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690718
997	NC_021192	GTC	2	6	61601	61606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690718
998	NC_021192	CGG	2	6	61672	61677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690718
999	NC_021192	CGA	2	6	61699	61704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690718
1000	NC_021192	CGT	2	6	61725	61730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690718

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