MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021192	GTC	2	6	609323	609328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691159
9002	NC_021192	CGG	2	6	609382	609387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691159
9003	NC_021192	CGG	2	6	609488	609493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691160
9004	NC_021192	CGG	2	6	609542	609547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691160
9005	NC_021192	GCG	2	6	609569	609574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691160
9006	NC_021192	GCC	3	9	609613	609621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691160
9007	NC_021192	GGC	2	6	609667	609672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691160
9008	NC_021192	TGGC	2	8	609690	609697	0 %	25 %	50 %	25 %	494691160
9009	NC_021192	TCG	2	6	609719	609724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691160
9010	NC_021192	CGG	2	6	609744	609749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691160
9011	NC_021192	TGA	5	15	609801	609815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691160
9012	NC_021192	CGA	2	6	609819	609824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691160
9013	NC_021192	GAGTTC	2	12	609851	609862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494691160
9014	NC_021192	CCA	2	6	609885	609890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691160
9015	NC_021192	TCG	2	6	609891	609896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691160
9016	NC_021192	GATCA	2	10	610253	610262	40 %	20 %	20 %	20 %	494691161
9017	NC_021192	CGT	2	6	610270	610275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691161
9018	NC_021192	CGC	2	6	610342	610347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691161
9019	NC_021192	AGG	2	6	610353	610358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691161
9020	NC_021192	GTG	2	6	610424	610429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691161
9021	NC_021192	CATGG	2	10	610447	610456	20 %	20 %	40 %	20 %	494691161
9022	NC_021192	TCG	2	6	610493	610498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691161
9023	NC_021192	CGC	2	6	610666	610671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691161
9024	NC_021192	GC	3	6	610670	610675	0 %	0 %	50 %	50 %	494691161
9025	NC_021192	CTG	2	6	610694	610699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691161
9026	NC_021192	CAC	2	6	610732	610737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691161
9027	NC_021192	TCG	2	6	610783	610788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691161
9028	NC_021192	GCCG	2	8	610804	610811	0 %	0 %	50 %	50 %	494691161
9029	NC_021192	GCT	2	6	610818	610823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691161
9030	NC_021192	GCC	2	6	610834	610839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691161
9031	NC_021192	GCC	2	6	610853	610858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691161
9032	NC_021192	GCG	2	6	610890	610895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691161
9033	NC_021192	CCG	2	6	610906	610911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691161
9034	NC_021192	TTC	2	6	610924	610929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691161
9035	NC_021192	CGCC	2	8	610970	610977	0 %	0 %	25 %	75 %	494691161
9036	NC_021192	GTACG	2	10	611013	611022	20 %	20 %	40 %	20 %	494691161
9037	NC_021192	CGG	3	9	611029	611037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691161
9038	NC_021192	AGCC	2	8	611067	611074	25 %	0 %	25 %	50 %	494691161
9039	NC_021192	AGCC	2	8	611120	611127	25 %	0 %	25 %	50 %	494691161
9040	NC_021192	CCA	2	6	611146	611151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691161
9041	NC_021192	TGG	2	6	611190	611195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691161
9042	NC_021192	GTC	2	6	611251	611256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691161
9043	NC_021192	GCA	2	6	611261	611266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691161
9044	NC_021192	CG	3	6	611298	611303	0 %	0 %	50 %	50 %	494691161
9045	NC_021192	CGG	2	6	611346	611351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691161
9046	NC_021192	CGG	2	6	611378	611383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691162
9047	NC_021192	GGC	2	6	611386	611391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691162
9048	NC_021192	GCT	2	6	611420	611425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691162
9049	NC_021192	TTGA	2	8	611428	611435	25 %	50 %	25 %	0 %	494691162
9050	NC_021192	GAT	2	6	611481	611486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691162
9051	NC_021192	GCC	2	6	612294	612299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691163
9052	NC_021192	GAC	2	6	612300	612305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691163
9053	NC_021192	GGCC	2	8	612344	612351	0 %	0 %	50 %	50 %	494691163
9054	NC_021192	GGCA	2	8	612401	612408	25 %	0 %	50 %	25 %	494691163
9055	NC_021192	GAC	2	6	612570	612575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691164
9056	NC_021192	GCG	2	6	612576	612581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691164
9057	NC_021192	CGC	2	6	612609	612614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691164
9058	NC_021192	GCG	2	6	612622	612627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691164
9059	NC_021192	GTG	2	6	612672	612677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691164
9060	NC_021192	GGC	2	6	612718	612723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691164
9061	NC_021192	CGGCG	2	10	612749	612758	0 %	0 %	60 %	40 %	494691164
9062	NC_021192	GCC	3	9	612762	612770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691164
9063	NC_021192	TCG	2	6	612799	612804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691164
9064	NC_021192	ATCGC	2	10	612810	612819	20 %	20 %	20 %	40 %	494691164
9065	NC_021192	CCG	2	6	612841	612846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691164
9066	NC_021192	CGC	2	6	612854	612859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691164
9067	NC_021192	CTT	2	6	612911	612916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691164
9068	NC_021192	CGT	2	6	613182	613187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691165
9069	NC_021192	ACG	2	6	613194	613199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691165
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9072	NC_021192	CGA	2	6	613256	613261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691165
9073	NC_021192	GCAGA	2	10	613263	613272	40 %	0 %	40 %	20 %	494691165
9074	NC_021192	GCG	2	6	613286	613291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691165
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9079	NC_021192	TCT	2	6	613421	613426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691165
9080	NC_021192	GCC	2	6	613448	613453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691165
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9086	NC_021192	GCTG	2	8	613830	613837	0 %	25 %	50 %	25 %	494691166
9087	NC_021192	GGT	2	6	613851	613856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691166
9088	NC_021192	GAG	3	9	613869	613877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691166
9089	NC_021192	GTCGG	2	10	613880	613889	0 %	20 %	60 %	20 %	494691166
9090	NC_021192	CTG	2	6	613943	613948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691166
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9092	NC_021192	CTGGT	2	10	613974	613983	0 %	40 %	40 %	20 %	494691167
9093	NC_021192	TG	3	6	614000	614005	0 %	50 %	50 %	0 %	494691167
9094	NC_021192	GGC	2	6	614038	614043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691167
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9098	NC_021192	CGT	2	6	614077	614082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691167
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9102	NC_021192	GCT	3	9	614212	614220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691167
9103	NC_021192	TCG	2	6	614244	614249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691167
9104	NC_021192	CTGGGG	2	12	614474	614485	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	494691168
9105	NC_021192	GTTCG	2	10	614506	614515	0 %	40 %	40 %	20 %	494691168
9106	NC_021192	GCTG	2	8	614538	614545	0 %	25 %	50 %	25 %	494691168
9107	NC_021192	CGG	2	6	614575	614580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691168
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9110	NC_021192	ACG	2	6	614628	614633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691168
9111	NC_021192	TCGTG	2	10	614634	614643	0 %	40 %	40 %	20 %	494691168
9112	NC_021192	GC	3	6	614710	614715	0 %	0 %	50 %	50 %	494691168
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9115	NC_021192	CTG	2	6	614797	614802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691168
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9120	NC_021192	CGC	2	6	615009	615014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691168
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9122	NC_021192	CGC	2	6	615072	615077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691168
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9226	NC_021192	GC	3	6	622474	622479	0 %	0 %	50 %	50 %	494691173
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9230	NC_021192	GTC	2	6	622598	622603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691173
9231	NC_021192	AGT	2	6	622627	622632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691173
9232	NC_021192	CCA	2	6	622694	622699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691173
9233	NC_021192	CG	3	6	622776	622781	0 %	0 %	50 %	50 %	494691173
9234	NC_021192	CCA	2	6	622807	622812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691173
9235	NC_021192	CAA	2	6	622832	622837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691173
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9237	NC_021192	T	7	7	622872	622878	0 %	100 %	0 %	0 %	494691173
9238	NC_021192	CTT	2	6	622881	622886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691173
9239	NC_021192	ACG	2	6	622968	622973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691173
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9241	NC_021192	GCCGT	2	10	623020	623029	0 %	20 %	40 %	40 %	494691173
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9354	NC_021192	CCAG	2	8	627349	627356	25 %	0 %	25 %	50 %	494691177
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9483	NC_021192	GCG	2	6	633153	633158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691182
9484	NC_021192	CGT	2	6	633169	633174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691182
9485	NC_021192	TCT	2	6	633222	633227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691182
9486	NC_021192	CGT	2	6	633231	633236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691182
9487	NC_021192	GCCGA	2	10	633266	633275	20 %	0 %	40 %	40 %	494691182
9488	NC_021192	CG	3	6	633321	633326	0 %	0 %	50 %	50 %	494691182
9489	NC_021192	CCAG	2	8	633339	633346	25 %	0 %	25 %	50 %	494691182
9490	NC_021192	CAG	2	6	633373	633378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691182
9491	NC_021192	CGGC	2	8	633390	633397	0 %	0 %	50 %	50 %	494691182
9492	NC_021192	CGG	2	6	633447	633452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691182
9493	NC_021192	CGA	2	6	633465	633470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691182
9494	NC_021192	GCC	2	6	633472	633477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691182
9495	NC_021192	CCG	2	6	633542	633547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691182
9496	NC_021192	GCC	2	6	633614	633619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691182
9497	NC_021192	CGG	2	6	633621	633626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691182
9498	NC_021192	GCTACC	2	12	633668	633679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	494691182
9499	NC_021192	ACG	2	6	633770	633775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691182
9500	NC_021192	AAC	2	6	633791	633796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691183

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