MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_021192	CGA	2	6	3637366	3637371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693710
54003	NC_021192	TCG	2	6	3637383	3637388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693711
54004	NC_021192	CGG	2	6	3637392	3637397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693711
54005	NC_021192	ACG	2	6	3637443	3637448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693711
54006	NC_021192	TGT	2	6	3637622	3637627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494693712
54007	NC_021192	CG	3	6	3637645	3637650	0 %	0 %	50 %	50 %	494693712
54008	NC_021192	CGA	2	6	3637674	3637679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693712
54009	NC_021192	GC	3	6	3637732	3637737	0 %	0 %	50 %	50 %	494693712
54010	NC_021192	GGC	2	6	3637785	3637790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693712
54011	NC_021192	CACT	2	8	3637813	3637820	25 %	25 %	0 %	50 %	494693712
54012	NC_021192	CTA	2	6	3637861	3637866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693712
54013	NC_021192	GGT	2	6	3637871	3637876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693712
54014	NC_021192	CGA	2	6	3637978	3637983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693712
54015	NC_021192	TTGG	2	8	3638002	3638009	0 %	50 %	50 %	0 %	494693712
54016	NC_021192	AGG	2	6	3638067	3638072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494693712
54017	NC_021192	GCG	2	6	3638074	3638079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693712
54018	NC_021192	CCG	2	6	3638140	3638145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693712
54019	NC_021192	ACC	2	6	3638223	3638228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693712
54020	NC_021192	CGC	2	6	3638252	3638257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693712
54021	NC_021192	GGC	2	6	3638258	3638263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693712
54022	NC_021192	GCGCG	2	10	3638303	3638312	0 %	0 %	60 %	40 %	494693712
54023	NC_021192	GCT	2	6	3638333	3638338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693712
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54026	NC_021192	GC	3	6	3638402	3638407	0 %	0 %	50 %	50 %	494693712
54027	NC_021192	GC	3	6	3638491	3638496	0 %	0 %	50 %	50 %	494693712
54028	NC_021192	GTG	2	6	3638534	3638539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693712
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54030	NC_021192	GGT	2	6	3638616	3638621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693712
54031	NC_021192	GCT	2	6	3638670	3638675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693712
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54033	NC_021192	GC	3	6	3638699	3638704	0 %	0 %	50 %	50 %	494693712
54034	NC_021192	CTG	2	6	3638722	3638727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693712
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54041	NC_021192	TGC	2	6	3638852	3638857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693712
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54050	NC_021192	TCG	2	6	3639170	3639175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693712
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54053	NC_021192	CGA	2	6	3639298	3639303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693713
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54064	NC_021192	TTCA	2	8	3639660	3639667	25 %	50 %	0 %	25 %	494693713
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54106	NC_021192	CGTCGA	2	12	3641547	3641558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494693715
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54110	NC_021192	C	6	6	3641711	3641716	0 %	0 %	0 %	100 %	494693715
54111	NC_021192	CGA	2	6	3641950	3641955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693716
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54115	NC_021192	CA	3	6	3642085	3642090	50 %	0 %	0 %	50 %	494693716
54116	NC_021192	CGA	2	6	3642117	3642122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693716
54117	NC_021192	GGT	2	6	3642353	3642358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693717
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54120	NC_021192	TCA	2	6	3642468	3642473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693717
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54217	NC_021192	TCG	2	6	3648745	3648750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693722
54218	NC_021192	GCG	2	6	3648757	3648762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693722
54219	NC_021192	GCC	2	6	3648765	3648770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693722
54220	NC_021192	ATCCAG	2	12	3648804	3648815	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494693722
54221	NC_021192	GAAC	2	8	3648840	3648847	50 %	0 %	25 %	25 %	494693722
54222	NC_021192	CAG	2	6	3648939	3648944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693722
54223	NC_021192	CGCACC	2	12	3651304	3651315	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	494693723
54224	NC_021192	CGT	2	6	3651326	3651331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693723
54225	NC_021192	TCGG	2	8	3651402	3651409	0 %	25 %	50 %	25 %	494693723
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54227	NC_021192	GCC	2	6	3651523	3651528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693723
54228	NC_021192	CATC	2	8	3651571	3651578	25 %	25 %	0 %	50 %	494693723
54229	NC_021192	CGT	2	6	3651580	3651585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693723
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54348	NC_021192	CGA	2	6	3660245	3660250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693731
54349	NC_021192	CGC	2	6	3660259	3660264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693731
54350	NC_021192	GTG	2	6	3660276	3660281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693732
54351	NC_021192	GTG	2	6	3660291	3660296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693732
54352	NC_021192	TCG	2	6	3660297	3660302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693732
54353	NC_021192	TGGC	2	8	3660366	3660373	0 %	25 %	50 %	25 %	494693732
54354	NC_021192	GC	4	8	3660372	3660379	0 %	0 %	50 %	50 %	494693732
54355	NC_021192	TGG	2	6	3660499	3660504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693732
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54384	NC_021192	GCCC	2	8	3664645	3664652	0 %	0 %	25 %	75 %	494693736
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54423	NC_021192	CATCG	2	10	3666805	3666814	20 %	20 %	20 %	40 %	494693739
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54431	NC_021192	AACC	2	8	3667218	3667225	50 %	0 %	0 %	50 %	494693739
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54434	NC_021192	GCG	2	6	3667363	3667368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693739
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54448	NC_021192	GCA	2	6	3667876	3667881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693739
54449	NC_021192	CGG	2	6	3667893	3667898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693739
54450	NC_021192	AGC	2	6	3667944	3667949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693739
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54452	NC_021192	CAC	2	6	3668110	3668115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693740
54453	NC_021192	TCG	2	6	3668123	3668128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693740
54454	NC_021192	CACC	2	8	3668142	3668149	25 %	0 %	0 %	75 %	494693740
54455	NC_021192	GCT	2	6	3668180	3668185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693740
54456	NC_021192	GCA	2	6	3668205	3668210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693740
54457	NC_021192	TCG	2	6	3668246	3668251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693740
54458	NC_021192	AGCC	2	8	3668269	3668276	25 %	0 %	25 %	50 %	494693740
54459	NC_021192	CA	3	6	3668289	3668294	50 %	0 %	0 %	50 %	494693740
54460	NC_021192	CG	3	6	3668422	3668427	0 %	0 %	50 %	50 %	494693740
54461	NC_021192	GGC	3	9	3668428	3668436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693740
54462	NC_021192	GCG	2	6	3668497	3668502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693740
54463	NC_021192	CGA	2	6	3668503	3668508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693740
54464	NC_021192	TCT	2	6	3668512	3668517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494693740
54465	NC_021192	CGC	2	6	3668540	3668545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693740
54466	NC_021192	TGC	2	6	3668548	3668553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693740
54467	NC_021192	TCG	2	6	3668605	3668610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693740
54468	NC_021192	CGC	2	6	3668633	3668638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693740
54469	NC_021192	TGT	2	6	3668719	3668724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494693740
54470	NC_021192	ATC	2	6	3668727	3668732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693740
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54473	NC_021192	CCAG	2	8	3668837	3668844	25 %	0 %	25 %	50 %	494693740
54474	NC_021192	CAC	2	6	3668862	3668867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693740
54475	NC_021192	GGC	2	6	3668868	3668873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693740
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54483	NC_021192	TCG	2	6	3669311	3669316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693741
54484	NC_021192	G	6	6	3669327	3669332	0 %	0 %	100 %	0 %	494693741
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54489	NC_021192	GC	3	6	3669415	3669420	0 %	0 %	50 %	50 %	494693741
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54492	NC_021192	CGG	2	6	3669706	3669711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693742
54493	NC_021192	ACG	2	6	3669815	3669820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693742
54494	NC_021192	TTC	2	6	3669826	3669831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494693742
54495	NC_021192	CGT	2	6	3669947	3669952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693742
54496	NC_021192	CGG	2	6	3669962	3669967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693742
54497	NC_021192	CA	3	6	3670000	3670005	50 %	0 %	0 %	50 %	494693742
54498	NC_021192	CGGCAT	2	12	3670019	3670030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494693742
54499	NC_021192	GGA	2	6	3670055	3670060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494693742
54500	NC_021192	GCG	2	6	3670129	3670134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693742

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