MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_021192	GCCC	2	8	3498155	3498162	0 %	0 %	25 %	75 %	494693593
52003	NC_021192	ATC	2	6	3498204	3498209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693593
52004	NC_021192	TGC	2	6	3498239	3498244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693593
52005	NC_021192	CGG	2	6	3498250	3498255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693593
52006	NC_021192	G	8	8	3498263	3498270	0 %	0 %	100 %	0 %	494693593
52007	NC_021192	CGC	2	6	3498275	3498280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693593
52008	NC_021192	ACCAC	2	10	3498321	3498330	40 %	0 %	0 %	60 %	494693593
52009	NC_021192	GC	3	6	3498351	3498356	0 %	0 %	50 %	50 %	494693593
52010	NC_021192	CCG	2	6	3498567	3498572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693594
52011	NC_021192	TCG	2	6	3498647	3498652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693594
52012	NC_021192	TCAG	2	8	3498653	3498660	25 %	25 %	25 %	25 %	494693594
52013	NC_021192	TCGGCA	2	12	3498683	3498694	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494693594
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52199	NC_021192	CGT	2	6	3511716	3511721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693605
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52204	NC_021192	CG	3	6	3511849	3511854	0 %	0 %	50 %	50 %	494693605
52205	NC_021192	GCC	2	6	3511876	3511881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693605
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52210	NC_021192	TGC	2	6	3511988	3511993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693605
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52214	NC_021192	TCGACG	2	12	3512063	3512074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494693605
52215	NC_021192	CCA	3	9	3512141	3512149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693605
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52219	NC_021192	TCGGCG	2	12	3517396	3517407	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	494693606
52220	NC_021192	GCG	2	6	3517453	3517458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693606
52221	NC_021192	GGC	2	6	3517478	3517483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693606
52222	NC_021192	GCG	2	6	3517492	3517497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693606
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52224	NC_021192	CAGCG	2	10	3517736	3517745	20 %	0 %	40 %	40 %	494693606
52225	NC_021192	TGA	2	6	3517774	3517779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494693606
52226	NC_021192	TCGA	2	8	3517802	3517809	25 %	25 %	25 %	25 %	494693606
52227	NC_021192	GC	4	8	3517825	3517832	0 %	0 %	50 %	50 %	494693606
52228	NC_021192	TGCG	2	8	3517902	3517909	0 %	25 %	50 %	25 %	494693606
52229	NC_021192	ACG	3	9	3517913	3517921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693606
52230	NC_021192	GA	3	6	3517923	3517928	50 %	0 %	50 %	0 %	494693607
52231	NC_021192	GTG	2	6	3518015	3518020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693607
52232	NC_021192	GGT	2	6	3518141	3518146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693607
52233	NC_021192	CGA	2	6	3518212	3518217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693607
52234	NC_021192	CCG	2	6	3518228	3518233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693607
52235	NC_021192	CCA	2	6	3518234	3518239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693607
52236	NC_021192	GGT	2	6	3518308	3518313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693607
52237	NC_021192	GCC	2	6	3518392	3518397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693607
52238	NC_021192	GGT	2	6	3518399	3518404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693607
52239	NC_021192	CCG	2	6	3518452	3518457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693607
52240	NC_021192	CCCGG	2	10	3518489	3518498	0 %	0 %	40 %	60 %	494693607
52241	NC_021192	CTG	3	9	3518508	3518516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693607
52242	NC_021192	AGGC	2	8	3518527	3518534	25 %	0 %	50 %	25 %	494693607
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52244	NC_021192	CTGG	2	8	3518591	3518598	0 %	25 %	50 %	25 %	494693607
52245	NC_021192	GAGC	2	8	3518599	3518606	25 %	0 %	50 %	25 %	494693607
52246	NC_021192	GCC	2	6	3518682	3518687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693607
52247	NC_021192	GAG	2	6	3518697	3518702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494693607
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52253	NC_021192	TCG	2	6	3518896	3518901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693608
52254	NC_021192	CCGG	2	8	3518959	3518966	0 %	0 %	50 %	50 %	494693608
52255	NC_021192	GTC	2	6	3520948	3520953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693609
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52262	NC_021192	TCCT	2	8	3521255	3521262	0 %	50 %	0 %	50 %	494693609
52263	NC_021192	GCG	2	6	3521263	3521268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693609
52264	NC_021192	GCT	2	6	3521313	3521318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693609
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52295	NC_021192	GGACC	2	10	3522795	3522804	20 %	0 %	40 %	40 %	494693610
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52302	NC_021192	GCGG	2	8	3523037	3523044	0 %	0 %	75 %	25 %	494693610
52303	NC_021192	GCG	2	6	3523068	3523073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693610
52304	NC_021192	GCG	3	9	3523121	3523129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693610
52305	NC_021192	CAG	2	6	3523252	3523257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693610
52306	NC_021192	CGG	2	6	3523310	3523315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693610
52307	NC_021192	GCG	2	6	3523381	3523386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693610
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52315	NC_021192	AGT	2	6	3523902	3523907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494693610
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52318	NC_021192	GAC	2	6	3523999	3524004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693610
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52320	NC_021192	GCT	2	6	3524029	3524034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693610
52321	NC_021192	TCC	2	6	3524073	3524078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494693610
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52325	NC_021192	GC	3	6	3524201	3524206	0 %	0 %	50 %	50 %	494693611
52326	NC_021192	ACC	2	6	3524237	3524242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693611
52327	NC_021192	GC	3	6	3524243	3524248	0 %	0 %	50 %	50 %	494693611
52328	NC_021192	CGA	2	6	3524254	3524259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693611
52329	NC_021192	TCA	2	6	3524264	3524269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693611
52330	NC_021192	CGCC	2	8	3524294	3524301	0 %	0 %	25 %	75 %	494693611
52331	NC_021192	AGC	2	6	3524376	3524381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693611
52332	NC_021192	CAG	2	6	3524388	3524393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693611
52333	NC_021192	GCAA	2	8	3524430	3524437	50 %	0 %	25 %	25 %	494693611
52334	NC_021192	CAAGC	2	10	3524447	3524456	40 %	0 %	20 %	40 %	494693611
52335	NC_021192	GCT	2	6	3524602	3524607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693611
52336	NC_021192	CGATG	2	10	3524727	3524736	20 %	20 %	40 %	20 %	494693611
52337	NC_021192	CAGC	2	8	3524754	3524761	25 %	0 %	25 %	50 %	494693611
52338	NC_021192	TCGCC	2	10	3524843	3524852	0 %	20 %	20 %	60 %	494693611
52339	NC_021192	CG	3	6	3524900	3524905	0 %	0 %	50 %	50 %	494693611
52340	NC_021192	TCT	2	6	3524911	3524916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494693611
52341	NC_021192	CTG	2	6	3525053	3525058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693612
52342	NC_021192	CAC	2	6	3525102	3525107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693612
52343	NC_021192	TCA	2	6	3525129	3525134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693612
52344	NC_021192	C	8	8	3525157	3525164	0 %	0 %	0 %	100 %	494693612
52345	NC_021192	GCG	2	6	3525202	3525207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693612
52346	NC_021192	GAC	2	6	3525248	3525253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693612
52347	NC_021192	CGA	2	6	3525271	3525276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693612
52348	NC_021192	CGC	2	6	3525340	3525345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693612
52349	NC_021192	GACT	2	8	3525355	3525362	25 %	25 %	25 %	25 %	494693612
52350	NC_021192	CGT	2	6	3525369	3525374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693612
52351	NC_021192	TCA	2	6	3525392	3525397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693612
52352	NC_021192	TGC	2	6	3525400	3525405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693612
52353	NC_021192	CTT	2	6	3525434	3525439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494693612
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52363	NC_021192	GTT	2	6	3525914	3525919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494693613
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52465	NC_021192	TGC	3	9	3533039	3533047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693620
52466	NC_021192	CAT	2	6	3533064	3533069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693620
52467	NC_021192	ACG	2	6	3535322	3535327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693621
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52469	NC_021192	TGC	2	6	3535367	3535372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693621
52470	NC_021192	GCG	3	9	3535390	3535398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693621
52471	NC_021192	ACC	2	6	3535420	3535425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693621
52472	NC_021192	CAC	2	6	3535456	3535461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693621
52473	NC_021192	CCG	2	6	3535477	3535482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693621
52474	NC_021192	CGA	2	6	3535548	3535553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693621
52475	NC_021192	GTC	2	6	3535561	3535566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693621
52476	NC_021192	CCA	2	6	3535574	3535579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693621
52477	NC_021192	GCT	2	6	3535594	3535599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693621
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52479	NC_021192	ACG	2	6	3535629	3535634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693621
52480	NC_021192	ACCGGT	2	12	3535639	3535650	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494693621
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52482	NC_021192	CGT	2	6	3535675	3535680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693621
52483	NC_021192	GCA	2	6	3535702	3535707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693621
52484	NC_021192	GTC	2	6	3535712	3535717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693621
52485	NC_021192	GC	3	6	3535788	3535793	0 %	0 %	50 %	50 %	494693621
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52487	NC_021192	GCC	2	6	3535819	3535824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693621
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52491	NC_021192	CCA	2	6	3535943	3535948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693621
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52493	NC_021192	CG	3	6	3535994	3535999	0 %	0 %	50 %	50 %	494693621
52494	NC_021192	GC	3	6	3536095	3536100	0 %	0 %	50 %	50 %	494693621
52495	NC_021192	CGCC	2	8	3536117	3536124	0 %	0 %	25 %	75 %	494693621
52496	NC_021192	GC	3	6	3536125	3536130	0 %	0 %	50 %	50 %	494693621
52497	NC_021192	CAGC	2	8	3536144	3536151	25 %	0 %	25 %	50 %	494693621
52498	NC_021192	CGG	2	6	3536159	3536164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693621
52499	NC_021192	AGCGA	2	10	3536185	3536194	40 %	0 %	40 %	20 %	494693621
52500	NC_021192	GTGA	2	8	3536199	3536206	25 %	25 %	50 %	0 %	494693621

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