MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 62970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021081	GCG	2	6	346	351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881634
2	NC_021081	GGC	2	6	358	363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881634
3	NC_021081	CCG	2	6	426	431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881634
4	NC_021081	CGT	2	6	457	462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881634
5	NC_021081	AGCCGG	2	12	466	477	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	482881634
6	NC_021081	GCT	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881634
7	NC_021081	TGC	2	6	486	491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881634
8	NC_021081	GGTC	2	8	511	518	0 %	25 %	50 %	25 %	482881634
9	NC_021081	GCAA	2	8	576	583	50 %	0 %	25 %	25 %	482881634
10	NC_021081	CTT	2	6	614	619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881635
11	NC_021081	T	6	6	618	623	0 %	100 %	0 %	0 %	482881635
12	NC_021081	CCTGGC	2	12	624	635	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482881635
13	NC_021081	CCA	2	6	743	748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881635
14	NC_021081	CGG	2	6	821	826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881636
15	NC_021081	GTT	2	6	832	837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881636
16	NC_021081	CTG	2	6	841	846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881636
17	NC_021081	CTT	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881636
18	NC_021081	CCT	2	6	873	878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881636
19	NC_021081	GGC	2	6	913	918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881636
20	NC_021081	CTT	2	6	975	980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881636
21	NC_021081	T	6	6	979	984	0 %	100 %	0 %	0 %	482881636
22	NC_021081	GCT	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881636
23	NC_021081	TGGT	2	8	1052	1059	0 %	50 %	50 %	0 %	482881636
24	NC_021081	CCA	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881636
25	NC_021081	T	7	7	1190	1196	0 %	100 %	0 %	0 %	482881636
26	NC_021081	GTGG	2	8	1294	1301	0 %	25 %	75 %	0 %	482881636
27	NC_021081	GGC	2	6	1375	1380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881636
28	NC_021081	GGCCT	2	10	1484	1493	0 %	20 %	40 %	40 %	482881637
29	NC_021081	GTA	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881637
30	NC_021081	TCC	2	6	1539	1544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881637
31	NC_021081	TCC	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881637
32	NC_021081	CCA	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881637
33	NC_021081	C	6	6	1716	1721	0 %	0 %	0 %	100 %	482881637
34	NC_021081	GCA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881638
35	NC_021081	GCG	2	6	1792	1797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881638
36	NC_021081	CAC	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881638
37	NC_021081	TCGGCC	2	12	1870	1881	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482881638
38	NC_021081	TTCGGC	2	12	1896	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881638
39	NC_021081	CAG	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881638
40	NC_021081	GCC	2	6	1989	1994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881638
41	NC_021081	GCG	2	6	2012	2017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881638
42	NC_021081	GTT	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881638
43	NC_021081	TACGC	2	10	2093	2102	20 %	20 %	20 %	40 %	482881638
44	NC_021081	CCT	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881639
45	NC_021081	CCCG	2	8	2115	2122	0 %	0 %	25 %	75 %	482881639
46	NC_021081	CGG	2	6	2175	2180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881639
47	NC_021081	GCCC	2	8	2207	2214	0 %	0 %	25 %	75 %	482881639
48	NC_021081	GTG	2	6	2241	2246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881639
49	NC_021081	CTG	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881639
50	NC_021081	GGCCA	2	10	2295	2304	20 %	0 %	40 %	40 %	482881639
51	NC_021081	GTT	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881639
52	NC_021081	CCCG	2	8	2387	2394	0 %	0 %	25 %	75 %	482881639
53	NC_021081	GTA	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881639
54	NC_021081	TGG	3	9	2458	2466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881639
55	NC_021081	CCG	2	6	2473	2478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881639
56	NC_021081	GCC	2	6	2498	2503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881639
57	NC_021081	TAA	2	6	2521	2526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881639
58	NC_021081	CACCC	2	10	2540	2549	20 %	0 %	0 %	80 %	482881639
59	NC_021081	GGT	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881639
60	NC_021081	CTG	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881639
61	NC_021081	TCC	2	6	2814	2819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881639
62	NC_021081	GCC	2	6	2886	2891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881639
63	NC_021081	G	6	6	3121	3126	0 %	0 %	100 %	0 %	482881640
64	NC_021081	GTA	2	6	3170	3175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881640
65	NC_021081	GTA	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881640
66	NC_021081	CAC	2	6	3332	3337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881640
67	NC_021081	CAC	2	6	3377	3382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881640
68	NC_021081	CTGC	2	8	3404	3411	0 %	25 %	25 %	50 %	482881640
69	NC_021081	GCC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881640
70	NC_021081	GGGC	2	8	3456	3463	0 %	0 %	75 %	25 %	482881640
71	NC_021081	CCT	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881640
72	NC_021081	CAG	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881641
73	NC_021081	CCA	2	6	3592	3597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881641
74	NC_021081	TTG	3	9	3615	3623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881641
75	NC_021081	CGC	2	6	3646	3651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881641
76	NC_021081	CAG	3	9	3659	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881641
77	NC_021081	GTG	3	9	3696	3704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881641
78	NC_021081	GTA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881641
79	NC_021081	CAC	2	6	3860	3865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881641
80	NC_021081	CGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881641
81	NC_021081	GCA	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881642
82	NC_021081	C	6	6	4141	4146	0 %	0 %	0 %	100 %	482881642
83	NC_021081	CGT	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881642
84	NC_021081	CGGG	2	8	4197	4204	0 %	0 %	75 %	25 %	482881642
85	NC_021081	CGT	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881642
86	NC_021081	C	6	6	4326	4331	0 %	0 %	0 %	100 %	482881642
87	NC_021081	C	6	6	4386	4391	0 %	0 %	0 %	100 %	482881642
88	NC_021081	C	6	6	4424	4429	0 %	0 %	0 %	100 %	482881642
89	NC_021081	GAA	2	6	4434	4439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881642
90	NC_021081	CCA	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881642
91	NC_021081	CAA	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881642
92	NC_021081	GC	3	6	4513	4518	0 %	0 %	50 %	50 %	482881642
93	NC_021081	GAA	2	6	4539	4544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881642
94	NC_021081	CTG	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881642
95	NC_021081	CGC	2	6	4558	4563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881642
96	NC_021081	CTT	2	6	4583	4588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881642
97	NC_021081	CCA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881642
98	NC_021081	CCCCGA	2	12	4707	4718	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	482881642
99	NC_021081	GTCT	2	8	4744	4751	0 %	50 %	25 %	25 %	482881642
100	NC_021081	CTTTTT	2	12	4791	4802	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	482881643
101	NC_021081	T	7	7	4798	4804	0 %	100 %	0 %	0 %	482881643
102	NC_021081	A	6	6	4834	4839	100 %	0 %	0 %	0 %	482881643
103	NC_021081	GGC	2	6	4873	4878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881643
104	NC_021081	T	6	6	4933	4938	0 %	100 %	0 %	0 %	482881643
105	NC_021081	AAGA	2	8	4991	4998	75 %	0 %	25 %	0 %	482881643
106	NC_021081	TGC	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881644
107	NC_021081	GGC	2	6	5423	5428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881644
108	NC_021081	GCCCT	2	10	5474	5483	0 %	20 %	20 %	60 %	482881644
109	NC_021081	GGC	2	6	5500	5505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881644
110	NC_021081	GTT	2	6	5552	5557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881644
111	NC_021081	CAC	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881644
112	NC_021081	CCT	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881645
113	NC_021081	CCA	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881645
114	NC_021081	CCG	2	6	5685	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881645
115	NC_021081	GTC	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881645
116	NC_021081	GTG	2	6	5848	5853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881645
117	NC_021081	TC	3	6	5899	5904	0 %	50 %	0 %	50 %	482881645
118	NC_021081	CCA	2	6	5961	5966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881645
119	NC_021081	TGAGGG	2	12	5976	5987	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	482881645
120	NC_021081	TCA	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881645
121	NC_021081	CAG	2	6	6124	6129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881646
122	NC_021081	CAG	2	6	6212	6217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881646
123	NC_021081	G	6	6	6230	6235	0 %	0 %	100 %	0 %	482881646
124	NC_021081	GGC	2	6	6287	6292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881646
125	NC_021081	GGGA	2	8	6332	6339	25 %	0 %	75 %	0 %	482881646
126	NC_021081	C	6	6	6354	6359	0 %	0 %	0 %	100 %	482881646
127	NC_021081	CTT	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881646
128	NC_021081	GATG	2	8	6467	6474	25 %	25 %	50 %	0 %	482881646
129	NC_021081	G	6	6	6482	6487	0 %	0 %	100 %	0 %	482881646
130	NC_021081	TCT	2	6	6519	6524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881646
131	NC_021081	GAT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881646
132	NC_021081	CCG	2	6	6580	6585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881646
133	NC_021081	CCG	2	6	6595	6600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881646
134	NC_021081	GTT	2	6	6616	6621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881646
135	NC_021081	CCT	2	6	6631	6636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881647
136	NC_021081	GCACC	2	10	6668	6677	20 %	0 %	20 %	60 %	482881647
137	NC_021081	GTTTTC	2	12	6768	6779	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	482881647
138	NC_021081	CCG	2	6	6782	6787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881647
139	NC_021081	CCT	2	6	6963	6968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881648
140	NC_021081	GGC	2	6	7011	7016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881648
141	NC_021081	TGG	2	6	7088	7093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881648
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143	NC_021081	TGGC	2	8	7148	7155	0 %	25 %	50 %	25 %	482881648
144	NC_021081	GAAG	2	8	7163	7170	50 %	0 %	50 %	0 %	482881648
145	NC_021081	T	6	6	7299	7304	0 %	100 %	0 %	0 %	482881648
146	NC_021081	CTTT	2	8	7586	7593	0 %	75 %	0 %	25 %	482881649
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153	NC_021081	CGG	2	6	7914	7919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881650
154	NC_021081	CAC	2	6	7950	7955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881650
155	NC_021081	GGC	2	6	7975	7980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881650
156	NC_021081	GGTG	2	8	8104	8111	0 %	25 %	75 %	0 %	482881650
157	NC_021081	GTG	2	6	8117	8122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881650
158	NC_021081	TTC	2	6	8152	8157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881650
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161	NC_021081	TGC	2	6	8414	8419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881651
162	NC_021081	GGTT	2	8	8432	8439	0 %	50 %	50 %	0 %	482881651
163	NC_021081	TTTGG	2	10	8444	8453	0 %	60 %	40 %	0 %	482881651
164	NC_021081	CTG	2	6	8455	8460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881651
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166	NC_021081	CCTG	2	8	8539	8546	0 %	25 %	25 %	50 %	482881651
167	NC_021081	CTG	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881651
168	NC_021081	TCT	2	6	8681	8686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881651
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176	NC_021081	TGCT	2	8	8900	8907	0 %	50 %	25 %	25 %	482881652
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251	NC_021081	TTTG	2	8	12376	12383	0 %	75 %	25 %	0 %	482881655
252	NC_021081	T	6	6	12421	12426	0 %	100 %	0 %	0 %	482881655
253	NC_021081	CGC	2	6	12465	12470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881655
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257	NC_021081	CCA	2	6	12624	12629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881655
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261	NC_021081	CGG	2	6	12783	12788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881655
262	NC_021081	C	6	6	12801	12806	0 %	0 %	0 %	100 %	482881655
263	NC_021081	GCC	2	6	12817	12822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881655
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265	NC_021081	GCC	2	6	12887	12892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881655
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391	NC_021081	GGC	2	6	17876	17881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881662
392	NC_021081	CCA	2	6	17902	17907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881662
393	NC_021081	GCA	2	6	17929	17934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881662
394	NC_021081	GGGT	2	8	17983	17990	0 %	25 %	75 %	0 %	482881662
395	NC_021081	G	6	6	18002	18007	0 %	0 %	100 %	0 %	482881662
396	NC_021081	CAGGTG	2	12	18049	18060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482881662
397	NC_021081	TTG	2	6	18186	18191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881662
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399	NC_021081	G	6	6	18200	18205	0 %	0 %	100 %	0 %	482881662
400	NC_021081	G	7	7	18229	18235	0 %	0 %	100 %	0 %	482881662
401	NC_021081	GGCT	2	8	18238	18245	0 %	25 %	50 %	25 %	482881662
402	NC_021081	CTC	2	6	18287	18292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881662
403	NC_021081	G	8	8	18417	18424	0 %	0 %	100 %	0 %	482881662
404	NC_021081	TCGAGG	2	12	18435	18446	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482881662
405	NC_021081	GGT	2	6	18486	18491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881662
406	NC_021081	G	7	7	18492	18498	0 %	0 %	100 %	0 %	482881662
407	NC_021081	GTC	2	6	18521	18526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881662
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409	NC_021081	GCCTGG	2	12	18555	18566	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482881662
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411	NC_021081	GTGG	2	8	18612	18619	0 %	25 %	75 %	0 %	482881662
412	NC_021081	ACC	2	6	18675	18680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881662
413	NC_021081	TTC	2	6	18728	18733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881662
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421	NC_021081	CTGG	2	8	19100	19107	0 %	25 %	50 %	25 %	482881663
422	NC_021081	GGC	2	6	19237	19242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881663
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430	NC_021081	GTG	2	6	19662	19667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881663
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437	NC_021081	CGG	2	6	19856	19861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881663
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498	NC_021081	GGTG	2	8	23172	23179	0 %	25 %	75 %	0 %	482881666
499	NC_021081	ACCGCC	2	12	23227	23238	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	482881666
500	NC_021081	CAG	2	6	23352	23357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881666

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