MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 44995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_020833	CAAG	2	8	2512802	2512809	50 %	0 %	25 %	25 %	472335085
42502	NC_020833	ATC	2	6	2512816	2512821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335085
42503	NC_020833	CCA	2	6	2512832	2512837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335085
42504	NC_020833	TAC	2	6	2512859	2512864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335085
42505	NC_020833	CAA	2	6	2512875	2512880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335085
42506	NC_020833	AAT	2	6	2512938	2512943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335085
42507	NC_020833	ATG	2	6	2512996	2513001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335085
42508	NC_020833	GCA	2	6	2513002	2513007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335085
42509	NC_020833	ATTT	2	8	2513231	2513238	25 %	75 %	0 %	0 %	472335086
42510	NC_020833	ATTG	2	8	2513306	2513313	25 %	50 %	25 %	0 %	472335086
42511	NC_020833	GAC	2	6	2513319	2513324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335086
42512	NC_020833	ATG	2	6	2513374	2513379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335086
42513	NC_020833	A	6	6	2513434	2513439	100 %	0 %	0 %	0 %	472335086
42514	NC_020833	GAA	2	6	2513471	2513476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335086
42515	NC_020833	CAA	2	6	2513565	2513570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335086
42516	NC_020833	GCAG	2	8	2513633	2513640	25 %	0 %	50 %	25 %	472335086
42517	NC_020833	TATTGA	2	12	2513660	2513671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472335086
42518	NC_020833	GGT	2	6	2513687	2513692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335086
42519	NC_020833	AC	3	6	2513785	2513790	50 %	0 %	0 %	50 %	472335087
42520	NC_020833	TGT	2	6	2513835	2513840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335087
42521	NC_020833	AGC	2	6	2513862	2513867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335087
42522	NC_020833	GGC	2	6	2513873	2513878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335087
42523	NC_020833	TGA	2	6	2513905	2513910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335087
42524	NC_020833	CTG	2	6	2513975	2513980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335087
42525	NC_020833	AAT	2	6	2514012	2514017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335087
42526	NC_020833	A	6	6	2514046	2514051	100 %	0 %	0 %	0 %	472335087
42527	NC_020833	AGA	2	6	2514113	2514118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335087
42528	NC_020833	AGT	2	6	2514128	2514133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335087
42529	NC_020833	TG	3	6	2514139	2514144	0 %	50 %	50 %	0 %	472335087
42530	NC_020833	ACC	2	6	2514228	2514233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335087
42531	NC_020833	TTG	2	6	2514306	2514311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335088
42532	NC_020833	CGC	2	6	2514323	2514328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472335088
42533	NC_020833	GTG	2	6	2514390	2514395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335088
42534	NC_020833	GATAA	2	10	2514403	2514412	60 %	20 %	20 %	0 %	472335088
42535	NC_020833	AGC	2	6	2514433	2514438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335088
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42537	NC_020833	GA	3	6	2514604	2514609	50 %	0 %	50 %	0 %	472335088
42538	NC_020833	TAC	2	6	2514873	2514878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335089
42539	NC_020833	T	6	6	2514914	2514919	0 %	100 %	0 %	0 %	472335089
42540	NC_020833	CA	3	6	2514957	2514962	50 %	0 %	0 %	50 %	472335089
42541	NC_020833	AT	3	6	2515002	2515007	50 %	50 %	0 %	0 %	472335089
42542	NC_020833	GAT	2	6	2515105	2515110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335089
42543	NC_020833	TTC	2	6	2515217	2515222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472335089
42544	NC_020833	CGG	2	6	2515232	2515237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335089
42545	NC_020833	ATT	2	6	2515268	2515273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335089
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42548	NC_020833	GAA	2	6	2515335	2515340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335089
42549	NC_020833	GA	3	6	2515351	2515356	50 %	0 %	50 %	0 %	472335089
42550	NC_020833	GTT	2	6	2515399	2515404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335089
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42552	NC_020833	TGAA	2	8	2515544	2515551	50 %	25 %	25 %	0 %	472335089
42553	NC_020833	T	6	6	2515614	2515619	0 %	100 %	0 %	0 %	472335089
42554	NC_020833	TGC	2	6	2515706	2515711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335089
42555	NC_020833	AAGG	2	8	2515744	2515751	50 %	0 %	50 %	0 %	472335089
42556	NC_020833	AAT	2	6	2515853	2515858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335089
42557	NC_020833	ATC	2	6	2515904	2515909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335089
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42563	NC_020833	TGA	2	6	2516442	2516447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335090
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42568	NC_020833	AAG	2	6	2516700	2516705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335091
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42589	NC_020833	CTG	2	6	2517641	2517646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335092
42590	NC_020833	GAC	2	6	2517665	2517670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335092
42591	NC_020833	ATG	2	6	2517746	2517751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335092
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42597	NC_020833	GATT	2	8	2517852	2517859	25 %	50 %	25 %	0 %	472335092
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42601	NC_020833	ACG	2	6	2518185	2518190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335092
42602	NC_020833	ACG	2	6	2518261	2518266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335093
42603	NC_020833	T	6	6	2518267	2518272	0 %	100 %	0 %	0 %	472335093
42604	NC_020833	GAC	2	6	2518278	2518283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335093
42605	NC_020833	CTG	2	6	2518335	2518340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472335093
42606	NC_020833	TTG	2	6	2518356	2518361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335093
42607	NC_020833	GCA	2	6	2518445	2518450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335093
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42612	NC_020833	T	6	6	2518664	2518669	0 %	100 %	0 %	0 %	472335094
42613	NC_020833	ACG	2	6	2518739	2518744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335094
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42729	NC_020833	CACCCA	2	12	2523832	2523843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335104
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