MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosarcina mazei Tuc01

Total Repeats: 46094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020389	A	6	6	115	120	100 %	0 %	0 %	0 %	452208620
2	NC_020389	GAG	3	9	168	176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452208620
3	NC_020389	AAT	2	6	217	222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208620
4	NC_020389	TAA	2	6	225	230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208620
5	NC_020389	AGC	2	6	232	237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208620
6	NC_020389	TCAAT	2	10	249	258	40 %	40 %	0 %	20 %	452208620
7	NC_020389	GCA	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208620
8	NC_020389	GGA	2	6	347	352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452208620
9	NC_020389	CAG	2	6	394	399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208620
10	NC_020389	ATG	2	6	534	539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208620
11	NC_020389	CAG	2	6	582	587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208620
12	NC_020389	CAG	2	6	633	638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208620
13	NC_020389	GAT	2	6	641	646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208620
14	NC_020389	CAG	2	6	803	808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208620
15	NC_020389	ATT	2	6	831	836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452208620
16	NC_020389	GCA	3	9	899	907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208620
17	NC_020389	CTT	2	6	942	947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208620
18	NC_020389	ATA	2	6	977	982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208620
19	NC_020389	A	6	6	1041	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	452208620
20	NC_020389	CAGG	2	8	1123	1130	25 %	0 %	50 %	25 %	452208620
21	NC_020389	TAA	2	6	1201	1206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208620
22	NC_020389	GGC	2	6	1262	1267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452208620
23	NC_020389	TTG	2	6	1293	1298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452208620
24	NC_020389	AGGC	2	8	1355	1362	25 %	0 %	50 %	25 %	452208620
25	NC_020389	GAA	2	6	1382	1387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208620
26	NC_020389	TAA	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208620
27	NC_020389	ACA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208620
28	NC_020389	CTG	2	6	1572	1577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208620
29	NC_020389	CAA	2	6	1627	1632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208620
30	NC_020389	GCTG	2	8	1642	1649	0 %	25 %	50 %	25 %	452208620
31	NC_020389	GGGAC	2	10	1653	1662	20 %	0 %	60 %	20 %	452208620
32	NC_020389	TGGATG	2	12	1694	1705	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	452208620
33	NC_020389	ATTA	2	8	1712	1719	50 %	50 %	0 %	0 %	452208620
34	NC_020389	TGGAA	2	10	1800	1809	40 %	20 %	40 %	0 %	452208620
35	NC_020389	TCTG	2	8	2150	2157	0 %	50 %	25 %	25 %	452208621
36	NC_020389	ATT	2	6	2184	2189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452208621
37	NC_020389	TAT	2	6	2192	2197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452208621
38	NC_020389	GATG	2	8	2228	2235	25 %	25 %	50 %	0 %	452208621
39	NC_020389	CAGC	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	452208621
40	NC_020389	GTA	2	6	2316	2321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208621
41	NC_020389	GGGATG	2	12	2372	2383	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	452208621
42	NC_020389	GAT	2	6	2433	2438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208621
43	NC_020389	GAT	2	6	2517	2522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208621
44	NC_020389	ACGG	2	8	2532	2539	25 %	0 %	50 %	25 %	452208621
45	NC_020389	CCAGT	2	10	2675	2684	20 %	20 %	20 %	40 %	452208621
46	NC_020389	A	6	6	2733	2738	100 %	0 %	0 %	0 %	452208621
47	NC_020389	AGCC	2	8	2750	2757	25 %	0 %	25 %	50 %	452208621
48	NC_020389	ACA	2	6	2801	2806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208621
49	NC_020389	A	7	7	2856	2862	100 %	0 %	0 %	0 %	452208621
50	NC_020389	CTTC	2	8	2985	2992	0 %	50 %	0 %	50 %	452208621
51	NC_020389	TTCC	2	8	3011	3018	0 %	50 %	0 %	50 %	452208621
52	NC_020389	A	7	7	3039	3045	100 %	0 %	0 %	0 %	452208621
53	NC_020389	CAA	2	6	3068	3073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208621
54	NC_020389	GAA	2	6	3234	3239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208621
55	NC_020389	AGGC	2	8	3354	3361	25 %	0 %	50 %	25 %	452208621
56	NC_020389	A	7	7	3389	3395	100 %	0 %	0 %	0 %	452208621
57	NC_020389	CAG	2	6	3479	3484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208621
58	NC_020389	GAT	2	6	3531	3536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208621
59	NC_020389	TGT	2	6	3569	3574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452208621
60	NC_020389	GGACAA	2	12	3799	3810	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	452208621
61	NC_020389	TA	3	6	4205	4210	50 %	50 %	0 %	0 %	452208622
62	NC_020389	CAGT	2	8	4221	4228	25 %	25 %	25 %	25 %	452208622
63	NC_020389	GAA	2	6	4250	4255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208622
64	NC_020389	CAT	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208622
65	NC_020389	AAAG	2	8	4370	4377	75 %	0 %	25 %	0 %	452208622
66	NC_020389	GAAT	2	8	4458	4465	50 %	25 %	25 %	0 %	452208622
67	NC_020389	CTGG	2	8	4531	4538	0 %	25 %	50 %	25 %	452208622
68	NC_020389	GGT	2	6	4575	4580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452208622
69	NC_020389	T	7	7	4630	4636	0 %	100 %	0 %	0 %	452208622
70	NC_020389	GGA	2	6	4865	4870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452208622
71	NC_020389	TTG	2	6	4878	4883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452208622
72	NC_020389	GCA	2	6	4916	4921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208622
73	NC_020389	AGC	2	6	4924	4929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208622
74	NC_020389	ATT	2	6	5015	5020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452208622
75	NC_020389	AGC	2	6	5046	5051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208622
76	NC_020389	AGG	2	6	5052	5057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452208622
77	NC_020389	CTG	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208623
78	NC_020389	AGA	2	6	5149	5154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208623
79	NC_020389	CTG	2	6	5157	5162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208623
80	NC_020389	TGC	2	6	5185	5190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208623
81	NC_020389	ATGA	2	8	5217	5224	50 %	25 %	25 %	0 %	452208623
82	NC_020389	GTACT	2	10	5377	5386	20 %	40 %	20 %	20 %	452208623
83	NC_020389	CTGG	2	8	5444	5451	0 %	25 %	50 %	25 %	452208623
84	NC_020389	TTTC	2	8	5460	5467	0 %	75 %	0 %	25 %	452208623
85	NC_020389	CTT	2	6	5478	5483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208623
86	NC_020389	GGA	3	9	5511	5519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452208623
87	NC_020389	CAGAG	2	10	5579	5588	40 %	0 %	40 %	20 %	452208623
88	NC_020389	AGC	2	6	5593	5598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208623
89	NC_020389	TGG	2	6	5649	5654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452208623
90	NC_020389	TGG	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452208623
91	NC_020389	AAT	2	6	5918	5923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208623
92	NC_020389	ATGA	2	8	5941	5948	50 %	25 %	25 %	0 %	452208623
93	NC_020389	AAT	2	6	6002	6007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208624
94	NC_020389	GAA	2	6	6011	6016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208624
95	NC_020389	TAAAAG	2	12	6039	6050	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452208624
96	NC_020389	TC	3	6	6052	6057	0 %	50 %	0 %	50 %	452208624
97	NC_020389	CAGA	2	8	6088	6095	50 %	0 %	25 %	25 %	452208624
98	NC_020389	TGT	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452208624
99	NC_020389	CTT	2	6	6185	6190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208624
100	NC_020389	CCT	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452208624
101	NC_020389	AGAA	2	8	6276	6283	75 %	0 %	25 %	0 %	452208624
102	NC_020389	GT	3	6	6370	6375	0 %	50 %	50 %	0 %	452208624
103	NC_020389	GGA	2	6	6376	6381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452208624
104	NC_020389	TGA	2	6	6396	6401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208624
105	NC_020389	AGA	2	6	6491	6496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208624
106	NC_020389	ACCC	2	8	6550	6557	25 %	0 %	0 %	75 %	452208624
107	NC_020389	TGGAT	2	10	6559	6568	20 %	40 %	40 %	0 %	452208624
108	NC_020389	TGC	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208624
109	NC_020389	T	6	6	6858	6863	0 %	100 %	0 %	0 %	452208624
110	NC_020389	A	6	6	6877	6882	100 %	0 %	0 %	0 %	452208624
111	NC_020389	GGA	2	6	6929	6934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452208624
112	NC_020389	AAT	2	6	6947	6952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208624
113	NC_020389	A	8	8	6987	6994	100 %	0 %	0 %	0 %	452208625
114	NC_020389	GTCT	2	8	7018	7025	0 %	50 %	25 %	25 %	452208625
115	NC_020389	AAG	2	6	7028	7033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208625
116	NC_020389	CTGG	2	8	7095	7102	0 %	25 %	50 %	25 %	452208625
117	NC_020389	A	7	7	7286	7292	100 %	0 %	0 %	0 %	452208625
118	NC_020389	GGCT	2	8	7293	7300	0 %	25 %	50 %	25 %	452208625
119	NC_020389	GAG	2	6	7327	7332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452208625
120	NC_020389	AG	3	6	7463	7468	50 %	0 %	50 %	0 %	452208625
121	NC_020389	A	7	7	7498	7504	100 %	0 %	0 %	0 %	452208625
122	NC_020389	TGT	2	6	7529	7534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452208625
123	NC_020389	CTG	2	6	7656	7661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208626
124	NC_020389	ACCCT	2	10	7673	7682	20 %	20 %	0 %	60 %	452208626
125	NC_020389	TCA	2	6	7720	7725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208626
126	NC_020389	CCTGC	2	10	7759	7768	0 %	20 %	20 %	60 %	452208626
127	NC_020389	CTG	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208626
128	NC_020389	TATTGC	2	12	7971	7982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452208626
129	NC_020389	AGCA	2	8	8097	8104	50 %	0 %	25 %	25 %	452208626
130	NC_020389	CACCAG	2	12	8109	8120	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	452208626
131	NC_020389	AAT	2	6	8130	8135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208626
132	NC_020389	CAG	2	6	8141	8146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208626
133	NC_020389	TGC	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208626
134	NC_020389	GGGA	2	8	8184	8191	25 %	0 %	75 %	0 %	452208626
135	NC_020389	GGC	2	6	8350	8355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452208626
136	NC_020389	GCAA	2	8	8407	8414	50 %	0 %	25 %	25 %	452208626
137	NC_020389	TAA	2	6	8447	8452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208626
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139	NC_020389	TTG	2	6	8534	8539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452208626
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145	NC_020389	AGG	2	6	8796	8801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452208626
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156	NC_020389	TAA	2	6	10989	10994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208627
157	NC_020389	CTGTA	2	10	11043	11052	20 %	40 %	20 %	20 %	452208627
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246	NC_020389	AAT	2	6	22073	22078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208643
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250	NC_020389	CCT	2	6	22216	22221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452208643
251	NC_020389	TGT	2	6	22333	22338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452208643
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253	NC_020389	AG	3	6	22365	22370	50 %	0 %	50 %	0 %	452208643
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259	NC_020389	CCA	2	6	22788	22793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452208643
260	NC_020389	CTT	2	6	23183	23188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208644
261	NC_020389	TCA	2	6	23201	23206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208644
262	NC_020389	GA	3	6	23272	23277	50 %	0 %	50 %	0 %	452208644
263	NC_020389	TAC	2	6	23281	23286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208644
264	NC_020389	CTT	2	6	23291	23296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208644
265	NC_020389	CTT	3	9	23412	23420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208644
266	NC_020389	AAC	2	6	23485	23490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208644
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271	NC_020389	AT	3	6	23697	23702	50 %	50 %	0 %	0 %	452208644
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301	NC_020389	GA	3	6	26158	26163	50 %	0 %	50 %	0 %	452208648
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