MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosarcina mazei Tuc01

Total Repeats: 46094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020389	CCTG	2	8	239653	239660	0 %	25 %	25 %	50 %	452208829
3002	NC_020389	CCT	2	6	239689	239694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452208829
3003	NC_020389	TAC	2	6	239712	239717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208829
3004	NC_020389	TCC	2	6	239718	239723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452208829
3005	NC_020389	CGT	2	6	239810	239815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208829
3006	NC_020389	AGC	2	6	239840	239845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208829
3007	NC_020389	AAGG	2	8	239879	239886	50 %	0 %	50 %	0 %	452208829
3008	NC_020389	T	7	7	239963	239969	0 %	100 %	0 %	0 %	452208829
3009	NC_020389	CAA	2	6	240038	240043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208829
3010	NC_020389	TA	3	6	240054	240059	50 %	50 %	0 %	0 %	452208829
3011	NC_020389	AAT	2	6	240337	240342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208830
3012	NC_020389	T	6	6	240385	240390	0 %	100 %	0 %	0 %	452208830
3013	NC_020389	AGA	2	6	240391	240396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208830
3014	NC_020389	TCA	2	6	240434	240439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208830
3015	NC_020389	T	6	6	240459	240464	0 %	100 %	0 %	0 %	452208830
3016	NC_020389	AAT	2	6	240520	240525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208830
3017	NC_020389	TCT	2	6	240533	240538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208830
3018	NC_020389	TCA	2	6	240683	240688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208830
3019	NC_020389	ATT	2	6	240760	240765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452208830
3020	NC_020389	CAG	2	6	240810	240815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208830
3021	NC_020389	CAGGAG	2	12	240822	240833	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	452208830
3022	NC_020389	GAG	2	6	240873	240878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452208830
3023	NC_020389	TCT	2	6	240970	240975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208831
3024	NC_020389	AAT	2	6	241155	241160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208831
3025	NC_020389	GT	3	6	241216	241221	0 %	50 %	50 %	0 %	452208831
3026	NC_020389	ATC	2	6	241225	241230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208831
3027	NC_020389	GA	3	6	241251	241256	50 %	0 %	50 %	0 %	452208831
3028	NC_020389	CAG	2	6	241378	241383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208831
3029	NC_020389	TGC	2	6	241406	241411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208831
3030	NC_020389	TCA	2	6	241546	241551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208831
3031	NC_020389	AGT	2	6	241589	241594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208831
3032	NC_020389	TGC	2	6	241673	241678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208831
3033	NC_020389	TTC	2	6	241701	241706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208831
3034	NC_020389	TGA	2	6	241730	241735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208831
3035	NC_020389	TCT	2	6	241783	241788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208831
3036	NC_020389	GTAT	2	8	241830	241837	25 %	50 %	25 %	0 %	452208831
3037	NC_020389	GTA	2	6	241846	241851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208831
3038	NC_020389	ACA	2	6	241867	241872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208831
3039	NC_020389	CTGC	2	8	241942	241949	0 %	25 %	25 %	50 %	452208831
3040	NC_020389	CAGT	2	8	241951	241958	25 %	25 %	25 %	25 %	452208831
3041	NC_020389	CTT	2	6	242027	242032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208831
3042	NC_020389	TGA	2	6	242072	242077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208831
3043	NC_020389	CTC	2	6	242105	242110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452208831
3044	NC_020389	TTCTG	2	10	242131	242140	0 %	60 %	20 %	20 %	452208831
3045	NC_020389	CAA	2	6	242159	242164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208831
3046	NC_020389	GA	3	6	242174	242179	50 %	0 %	50 %	0 %	452208831
3047	NC_020389	ATT	2	6	242238	242243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452208831
3048	NC_020389	CAA	2	6	242258	242263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208831
3049	NC_020389	AAT	2	6	242347	242352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208831
3050	NC_020389	TA	3	6	242370	242375	50 %	50 %	0 %	0 %	452208831
3051	NC_020389	TCAAGG	2	12	242386	242397	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452208831
3052	NC_020389	TGT	2	6	242451	242456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452208831
3053	NC_020389	TCT	2	6	242470	242475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208831
3054	NC_020389	AG	4	8	242666	242673	50 %	0 %	50 %	0 %	452208831
3055	NC_020389	ACA	2	6	242719	242724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208831
3056	NC_020389	CAT	2	6	242864	242869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208831
3057	NC_020389	CAT	2	6	242975	242980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208831
3058	NC_020389	ACA	2	6	243013	243018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208831
3059	NC_020389	GCTCG	2	10	243063	243072	0 %	20 %	40 %	40 %	452208831
3060	NC_020389	CTG	2	6	243122	243127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208831
3061	NC_020389	CAG	2	6	243150	243155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208831
3062	NC_020389	AAT	2	6	243163	243168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208831
3063	NC_020389	TGAAA	2	10	243745	243754	60 %	20 %	20 %	0 %	452208832
3064	NC_020389	AG	3	6	243789	243794	50 %	0 %	50 %	0 %	452208832
3065	NC_020389	AAG	2	6	243834	243839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208832
3066	NC_020389	ACT	2	6	243899	243904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208832
3067	NC_020389	GAA	2	6	243917	243922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208832
3068	NC_020389	AGAA	2	8	243936	243943	75 %	0 %	25 %	0 %	452208832
3069	NC_020389	AGA	2	6	243958	243963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208832
3070	NC_020389	AACAG	2	10	244077	244086	60 %	0 %	20 %	20 %	452208832
3071	NC_020389	T	7	7	244144	244150	0 %	100 %	0 %	0 %	452208832
3072	NC_020389	AC	3	6	244174	244179	50 %	0 %	0 %	50 %	452208832
3073	NC_020389	CCT	2	6	244294	244299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452208832
3074	NC_020389	AGA	2	6	244345	244350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208832
3075	NC_020389	A	6	6	244357	244362	100 %	0 %	0 %	0 %	452208832
3076	NC_020389	A	6	6	244405	244410	100 %	0 %	0 %	0 %	452208832
3077	NC_020389	TAC	2	6	244411	244416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208832
3078	NC_020389	AGA	2	6	244429	244434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208832
3079	NC_020389	TTCCAT	2	12	244549	244560	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452208832
3080	NC_020389	A	6	6	244569	244574	100 %	0 %	0 %	0 %	452208832
3081	NC_020389	GA	3	6	244721	244726	50 %	0 %	50 %	0 %	452208832
3082	NC_020389	ATC	2	6	244822	244827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208832
3083	NC_020389	TTC	2	6	245011	245016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208833
3084	NC_020389	TTCC	2	8	245073	245080	0 %	50 %	0 %	50 %	452208833
3085	NC_020389	GAA	2	6	245082	245087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208833
3086	NC_020389	A	7	7	245096	245102	100 %	0 %	0 %	0 %	452208833
3087	NC_020389	CAGAT	2	10	247740	247749	40 %	20 %	20 %	20 %	452208834
3088	NC_020389	TGCC	2	8	247857	247864	0 %	25 %	25 %	50 %	452208834
3089	NC_020389	GAC	2	6	248002	248007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208834
3090	NC_020389	CAT	2	6	248010	248015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208834
3091	NC_020389	TGT	2	6	248077	248082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452208834
3092	NC_020389	GTC	2	6	248269	248274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208834
3093	NC_020389	CTT	2	6	248289	248294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208834
3094	NC_020389	CAT	2	6	248317	248322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208834
3095	NC_020389	CCT	2	6	248429	248434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452208834
3096	NC_020389	AAGG	2	8	248464	248471	50 %	0 %	50 %	0 %	452208834
3097	NC_020389	TCG	2	6	248513	248518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208834
3098	NC_020389	TC	3	6	248532	248537	0 %	50 %	0 %	50 %	452208835
3099	NC_020389	A	7	7	248565	248571	100 %	0 %	0 %	0 %	452208835
3100	NC_020389	AAAT	2	8	248587	248594	75 %	25 %	0 %	0 %	452208835
3101	NC_020389	C	6	6	248821	248826	0 %	0 %	0 %	100 %	452208836
3102	NC_020389	TAA	2	6	248829	248834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208836
3103	NC_020389	GCT	2	6	248891	248896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208836
3104	NC_020389	AT	3	6	248921	248926	50 %	50 %	0 %	0 %	452208836
3105	NC_020389	CAA	2	6	248955	248960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452208836
3106	NC_020389	GTT	2	6	248963	248968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452208836
3107	NC_020389	TTCC	2	8	248994	249001	0 %	50 %	0 %	50 %	452208836
3108	NC_020389	CAG	2	6	249168	249173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208836
3109	NC_020389	GAC	2	6	249238	249243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208836
3110	NC_020389	CAG	2	6	249279	249284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208836
3111	NC_020389	TAT	2	6	249372	249377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452208836
3112	NC_020389	CAG	2	6	249387	249392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208836
3113	NC_020389	TTC	2	6	249397	249402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208836
3114	NC_020389	TTTC	2	8	249617	249624	0 %	75 %	0 %	25 %	452208837
3115	NC_020389	CAAA	2	8	249675	249682	75 %	0 %	0 %	25 %	452208837
3116	NC_020389	ATC	2	6	249747	249752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208837
3117	NC_020389	AT	3	6	249786	249791	50 %	50 %	0 %	0 %	452208837
3118	NC_020389	GC	4	8	250106	250113	0 %	0 %	50 %	50 %	452208838
3119	NC_020389	AC	3	6	250144	250149	50 %	0 %	0 %	50 %	452208838
3120	NC_020389	A	6	6	250215	250220	100 %	0 %	0 %	0 %	452208838
3121	NC_020389	AAG	2	6	250244	250249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208838
3122	NC_020389	ATG	2	6	250253	250258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208838
3123	NC_020389	AGA	2	6	250553	250558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208839
3124	NC_020389	GAACCA	2	12	250593	250604	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452208839
3125	NC_020389	TTGC	2	8	250746	250753	0 %	50 %	25 %	25 %	452208840
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3233	NC_020389	AAGG	2	8	258059	258066	50 %	0 %	50 %	0 %	452208848
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3248	NC_020389	AGA	2	6	259026	259031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208848
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3250	NC_020389	AGT	2	6	259166	259171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208848
3251	NC_020389	T	6	6	259209	259214	0 %	100 %	0 %	0 %	452208848
3252	NC_020389	GAA	2	6	259391	259396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208848
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3259	NC_020389	ATC	2	6	259629	259634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208848
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3262	NC_020389	AT	3	6	259796	259801	50 %	50 %	0 %	0 %	452208848
3263	NC_020389	CAT	2	6	259805	259810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208848
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3277	NC_020389	CTTC	2	8	260423	260430	0 %	50 %	0 %	50 %	452208848
3278	NC_020389	A	6	6	260442	260447	100 %	0 %	0 %	0 %	452208848
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3320	NC_020389	ATG	2	6	263825	263830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208851
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3322	NC_020389	CTT	2	6	263865	263870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208851
3323	NC_020389	GA	4	8	263872	263879	50 %	0 %	50 %	0 %	452208851
3324	NC_020389	TTTC	2	8	263901	263908	0 %	75 %	0 %	25 %	452208851
3325	NC_020389	T	6	6	263916	263921	0 %	100 %	0 %	0 %	452208851
3326	NC_020389	T	6	6	263925	263930	0 %	100 %	0 %	0 %	452208851
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3330	NC_020389	CTG	2	6	264317	264322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208852
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3332	NC_020389	TGG	2	6	264366	264371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452208852
3333	NC_020389	GAA	2	6	264401	264406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208852
3334	NC_020389	GAAA	2	8	264513	264520	75 %	0 %	25 %	0 %	452208852
3335	NC_020389	GAT	2	6	264610	264615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208852
3336	NC_020389	GAA	2	6	264825	264830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208852
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3339	NC_020389	GAACGT	2	12	264934	264945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452208852
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3342	NC_020389	TCC	2	6	265156	265161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452208853
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3345	NC_020389	TGG	2	6	265252	265257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452208853
3346	NC_020389	T	7	7	265305	265311	0 %	100 %	0 %	0 %	452208853
3347	NC_020389	GCT	2	6	265523	265528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208853
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3350	NC_020389	GAC	2	6	265772	265777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208853
3351	NC_020389	CAC	2	6	265793	265798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452208853
3352	NC_020389	AC	3	6	265802	265807	50 %	0 %	0 %	50 %	452208853
3353	NC_020389	TGA	2	6	265815	265820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208853
3354	NC_020389	T	6	6	265843	265848	0 %	100 %	0 %	0 %	452208853
3355	NC_020389	AAT	2	6	266147	266152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208854
3356	NC_020389	A	8	8	266226	266233	100 %	0 %	0 %	0 %	452208854
3357	NC_020389	A	6	6	266242	266247	100 %	0 %	0 %	0 %	452208854
3358	NC_020389	GAAAAA	2	12	266284	266295	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452208854
3359	NC_020389	A	6	6	266314	266319	100 %	0 %	0 %	0 %	452208854
3360	NC_020389	GA	3	6	266327	266332	50 %	0 %	50 %	0 %	452208854
3361	NC_020389	A	6	6	266337	266342	100 %	0 %	0 %	0 %	452208854
3362	NC_020389	TCA	2	6	266432	266437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452208854
3363	NC_020389	CAGA	2	8	266459	266466	50 %	0 %	25 %	25 %	452208854
3364	NC_020389	TTC	2	6	266491	266496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208854
3365	NC_020389	CTCGA	2	10	266543	266552	20 %	20 %	20 %	40 %	452208854
3366	NC_020389	ATA	2	6	266633	266638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452208854
3367	NC_020389	ATG	2	6	266660	266665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452208854
3368	NC_020389	CCT	2	6	266733	266738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452208855
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3370	NC_020389	TCT	2	6	266786	266791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452208855
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3483	NC_020389	GGTT	2	8	273991	273998	0 %	50 %	50 %	0 %	452208862
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3491	NC_020389	GCT	2	6	274605	274610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452208862
3492	NC_020389	GCA	2	6	274623	274628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208862
3493	NC_020389	GCCT	2	8	274729	274736	0 %	25 %	25 %	50 %	452208862
3494	NC_020389	GAC	2	6	274783	274788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208862
3495	NC_020389	AAG	2	6	274874	274879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452208862
3496	NC_020389	ACC	2	6	274887	274892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452208862
3497	NC_020389	TGAAA	2	10	275057	275066	60 %	20 %	20 %	0 %	452208862
3498	NC_020389	AGC	2	6	275133	275138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452208862
3499	NC_020389	GCCC	2	8	275236	275243	0 %	0 %	25 %	75 %	452208862
3500	NC_020389	CGGA	2	8	275344	275351	25 %	0 %	50 %	25 %	452208862

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