MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390 plasmid pMyong2

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020276	TGT	2	6	81	86	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451770596
2	NC_020276	TGT	2	6	156	161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451770596
3	NC_020276	AC	3	6	484	489	50 %	0 %	0 %	50 %	451770597
4	NC_020276	GCC	2	6	507	512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
5	NC_020276	ACG	2	6	514	519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770597
6	NC_020276	CCG	2	6	524	529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
7	NC_020276	CAC	2	6	581	586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770597
8	NC_020276	CAA	2	6	587	592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770597
9	NC_020276	GCT	2	6	601	606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770597
10	NC_020276	CAG	2	6	656	661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770597
11	NC_020276	GCC	2	6	672	677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
12	NC_020276	CCGA	2	8	680	687	25 %	0 %	25 %	50 %	451770597
13	NC_020276	CGGC	2	8	694	701	0 %	0 %	50 %	50 %	451770597
14	NC_020276	CGC	2	6	734	739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
15	NC_020276	GCC	2	6	753	758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
16	NC_020276	CAG	2	6	763	768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770597
17	NC_020276	CGC	3	9	770	778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
18	NC_020276	TCA	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770597
19	NC_020276	CAC	2	6	920	925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770598
20	NC_020276	GCA	2	6	958	963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770598
21	NC_020276	CCGT	2	8	975	982	0 %	25 %	25 %	50 %	451770598
22	NC_020276	CG	3	6	989	994	0 %	0 %	50 %	50 %	451770598
23	NC_020276	CACGC	2	10	1002	1011	20 %	0 %	20 %	60 %	451770598
24	NC_020276	GC	3	6	1051	1056	0 %	0 %	50 %	50 %	451770598
25	NC_020276	GCT	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770598
26	NC_020276	CGC	2	6	1118	1123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770598
27	NC_020276	CTG	2	6	1140	1145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770598
28	NC_020276	GC	3	6	1160	1165	0 %	0 %	50 %	50 %	451770598
29	NC_020276	GTG	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770598
30	NC_020276	CGA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770598
31	NC_020276	AGC	2	6	1294	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770598
32	NC_020276	GCC	2	6	1306	1311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770598
33	NC_020276	CGC	2	6	1325	1330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770598
34	NC_020276	CAG	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770598
35	NC_020276	CGC	2	6	1397	1402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770598
36	NC_020276	CTC	2	6	1410	1415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451770598
37	NC_020276	ACC	2	6	1429	1434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770598
38	NC_020276	TCA	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770598
39	NC_020276	CCAC	2	8	1504	1511	25 %	0 %	0 %	75 %	451770598
40	NC_020276	CGC	2	6	1524	1529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770598
41	NC_020276	GAC	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770599
42	NC_020276	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	451770599
43	NC_020276	CCAC	2	8	1658	1665	25 %	0 %	0 %	75 %	451770599
44	NC_020276	TGC	2	6	1730	1735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770599
45	NC_020276	GCC	2	6	1750	1755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
46	NC_020276	CGC	2	6	1791	1796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
47	NC_020276	GCTGG	2	10	1822	1831	0 %	20 %	60 %	20 %	451770599
48	NC_020276	CGA	2	6	1883	1888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770599
49	NC_020276	ACC	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770599
50	NC_020276	TGA	2	6	1926	1931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770599
51	NC_020276	GTG	2	6	1959	1964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770599
52	NC_020276	GAA	2	6	2022	2027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451770599
53	NC_020276	ACTG	2	8	2040	2047	25 %	25 %	25 %	25 %	451770599
54	NC_020276	CCA	2	6	2118	2123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770599
55	NC_020276	CAA	2	6	2130	2135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770599
56	NC_020276	ATC	2	6	2170	2175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770599
57	NC_020276	GGT	2	6	2275	2280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770599
58	NC_020276	CGC	2	6	2391	2396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
59	NC_020276	CAT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770599
60	NC_020276	GC	3	6	2469	2474	0 %	0 %	50 %	50 %	451770599
61	NC_020276	CCG	2	6	2502	2507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
62	NC_020276	GCG	2	6	2508	2513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770599
63	NC_020276	GCC	2	6	2518	2523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
64	NC_020276	CCA	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770599
65	NC_020276	GC	3	6	2559	2564	0 %	0 %	50 %	50 %	451770599
66	NC_020276	ACC	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770599
67	NC_020276	CCA	2	6	2597	2602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770599
68	NC_020276	CCGC	2	8	2654	2661	0 %	0 %	25 %	75 %	451770599
69	NC_020276	GC	3	6	2691	2696	0 %	0 %	50 %	50 %	451770599
70	NC_020276	CG	3	6	2711	2716	0 %	0 %	50 %	50 %	451770599
71	NC_020276	GCC	2	6	2747	2752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
72	NC_020276	GGT	2	6	2804	2809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770599
73	NC_020276	CCAG	2	8	2816	2823	25 %	0 %	25 %	50 %	451770599
74	NC_020276	CGAT	2	8	2903	2910	25 %	25 %	25 %	25 %	451770599
75	NC_020276	CGC	2	6	2937	2942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
76	NC_020276	CCGC	2	8	2981	2988	0 %	0 %	25 %	75 %	451770599
77	NC_020276	CGC	3	9	3022	3030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
78	NC_020276	CAG	2	6	3080	3085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770599
79	NC_020276	CTG	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770599
80	NC_020276	TGC	2	6	3183	3188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770600
81	NC_020276	TCC	2	6	3201	3206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451770600
82	NC_020276	CG	3	6	3217	3222	0 %	0 %	50 %	50 %	451770600
83	NC_020276	CG	3	6	3278	3283	0 %	0 %	50 %	50 %	451770600
84	NC_020276	GC	3	6	3531	3536	0 %	0 %	50 %	50 %	451770601
85	NC_020276	CGG	2	6	3581	3586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770601
86	NC_020276	CGC	2	6	3595	3600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
87	NC_020276	CGC	2	6	3623	3628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
88	NC_020276	CCGG	2	8	3678	3685	0 %	0 %	50 %	50 %	451770601
89	NC_020276	CTG	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770601
90	NC_020276	AGGT	2	8	3732	3739	25 %	25 %	50 %	0 %	451770601
91	NC_020276	CCG	2	6	3759	3764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
92	NC_020276	CCA	3	9	3765	3773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770601
93	NC_020276	CGA	2	6	3785	3790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770601
94	NC_020276	GCC	2	6	3800	3805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
95	NC_020276	TCCACC	2	12	3818	3829	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	451770601
96	NC_020276	CGGA	2	8	3850	3857	25 %	0 %	50 %	25 %	451770601
97	NC_020276	CCACCG	2	12	3858	3869	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451770601
98	NC_020276	CGCT	2	8	3874	3881	0 %	25 %	25 %	50 %	451770601
99	NC_020276	GCG	3	9	3904	3912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770601
100	NC_020276	TCG	3	9	3936	3944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770601
101	NC_020276	CGCC	2	8	4011	4018	0 %	0 %	25 %	75 %	451770601
102	NC_020276	CGC	2	6	4025	4030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
103	NC_020276	CCG	2	6	4035	4040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
104	NC_020276	GGC	2	6	4052	4057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770601
105	NC_020276	CCG	2	6	4085	4090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
106	NC_020276	GAA	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451770601
107	NC_020276	TGA	2	6	4150	4155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770601
108	NC_020276	GCC	2	6	4160	4165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
109	NC_020276	ACG	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770601
110	NC_020276	GAC	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770601
111	NC_020276	CGC	2	6	4232	4237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
112	NC_020276	CCA	2	6	4287	4292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770601
113	NC_020276	CACC	2	8	4300	4307	25 %	0 %	0 %	75 %	451770601
114	NC_020276	CGGC	2	8	4315	4322	0 %	0 %	50 %	50 %	451770601
115	NC_020276	ACA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770602
116	NC_020276	CAC	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770602
117	NC_020276	CGT	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770602
118	NC_020276	GCC	2	6	4494	4499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770602
119	NC_020276	GAC	2	6	4586	4591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770602
120	NC_020276	TCG	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770603
121	NC_020276	CTGT	2	8	4665	4672	0 %	50 %	25 %	25 %	451770603
122	NC_020276	AGC	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770603
123	NC_020276	TCG	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770603
124	NC_020276	TGGTGC	2	12	4713	4724	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	451770603
125	NC_020276	GC	3	6	4742	4747	0 %	0 %	50 %	50 %	451770603
126	NC_020276	CGG	2	6	4754	4759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770603
127	NC_020276	CG	3	6	4760	4765	0 %	0 %	50 %	50 %	451770603
128	NC_020276	TTC	2	6	4772	4777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451770603
129	NC_020276	CAG	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770603
130	NC_020276	GCG	2	6	4805	4810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770603
131	NC_020276	ACC	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770603
132	NC_020276	TCG	2	6	4886	4891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770603
133	NC_020276	CGG	2	6	4959	4964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770603
134	NC_020276	CCG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770603
135	NC_020276	GGTA	2	8	5012	5019	25 %	25 %	50 %	0 %	451770603
136	NC_020276	CACC	2	8	5026	5033	25 %	0 %	0 %	75 %	451770603
137	NC_020276	GCC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770603
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139	NC_020276	CGGC	2	8	5124	5131	0 %	0 %	50 %	50 %	451770603
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266	NC_020276	GTC	2	6	9977	9982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770608
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270	NC_020276	CA	4	8	10250	10257	50 %	0 %	0 %	50 %	451770608
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379	NC_020276	C	7	7	15225	15231	0 %	0 %	0 %	100 %	451770614
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381	NC_020276	TGG	2	6	15270	15275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770614
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385	NC_020276	GC	3	6	15401	15406	0 %	0 %	50 %	50 %	451770614
386	NC_020276	CCA	2	6	15444	15449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770614
387	NC_020276	CGAC	2	8	15505	15512	25 %	0 %	25 %	50 %	451770614
388	NC_020276	CCG	2	6	15528	15533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770614
389	NC_020276	CGCC	2	8	15550	15557	0 %	0 %	25 %	75 %	451770614
390	NC_020276	TCG	2	6	15612	15617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770614
391	NC_020276	CGA	2	6	15727	15732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770614
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393	NC_020276	CGC	2	6	15748	15753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770614
394	NC_020276	TCA	2	6	15849	15854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770614
395	NC_020276	GGT	2	6	15942	15947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770615
396	NC_020276	GTG	2	6	15991	15996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770615
397	NC_020276	ATG	2	6	16009	16014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770615
398	NC_020276	GCA	2	6	16064	16069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770615
399	NC_020276	GTG	2	6	16081	16086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770615
400	NC_020276	GTC	2	6	16134	16139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770615
401	NC_020276	GAC	2	6	16143	16148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770615
402	NC_020276	GTC	2	6	16268	16273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770616
403	NC_020276	GGC	2	6	16289	16294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770616
404	NC_020276	CGG	2	6	16321	16326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770616
405	NC_020276	GC	3	6	16338	16343	0 %	0 %	50 %	50 %	451770616
406	NC_020276	GGT	2	6	16399	16404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770616
407	NC_020276	GAC	2	6	16541	16546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770617
408	NC_020276	GAA	2	6	16556	16561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451770617
409	NC_020276	GACG	2	8	16568	16575	25 %	0 %	50 %	25 %	451770617
410	NC_020276	CG	3	6	16611	16616	0 %	0 %	50 %	50 %	451770617
411	NC_020276	GCG	2	6	16620	16625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770617
412	NC_020276	GCCG	2	8	16652	16659	0 %	0 %	50 %	50 %	451770617
413	NC_020276	GAT	2	6	16810	16815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770618
414	NC_020276	TGG	2	6	16863	16868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770618
415	NC_020276	GAC	2	6	16891	16896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770618
416	NC_020276	TGT	2	6	17028	17033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451770618
417	NC_020276	GGC	2	6	17065	17070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770618
418	NC_020276	TGC	2	6	17078	17083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770618
419	NC_020276	GTC	2	6	17137	17142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770618
420	NC_020276	GGT	2	6	17145	17150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770618
421	NC_020276	TGG	2	6	17187	17192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770618
422	NC_020276	CG	3	6	17202	17207	0 %	0 %	50 %	50 %	451770618
423	NC_020276	GCC	2	6	17215	17220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770618
424	NC_020276	GT	3	6	17243	17248	0 %	50 %	50 %	0 %	451770618
425	NC_020276	CGC	2	6	17382	17387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770618
426	NC_020276	CGGC	2	8	17455	17462	0 %	0 %	50 %	50 %	451770619
427	NC_020276	GTC	2	6	17463	17468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770619
428	NC_020276	CGG	2	6	17569	17574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770619
429	NC_020276	CGG	2	6	17669	17674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770620
430	NC_020276	CGG	2	6	17683	17688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770620
431	NC_020276	TGGTG	2	10	17689	17698	0 %	40 %	60 %	0 %	451770620
432	NC_020276	CATGTG	2	12	17707	17718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451770620
433	NC_020276	ACA	2	6	17930	17935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770621
434	NC_020276	ACA	2	6	17983	17988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770621
435	NC_020276	ACA	2	6	18005	18010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770621

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.