MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis 7199-99 complete genome

Total Repeats: 101663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020089	GAG	2	6	24274	24279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479053952
502	NC_020089	GCC	3	9	24326	24334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053952
503	NC_020089	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	479053952
504	NC_020089	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	479053952
505	NC_020089	CTC	2	6	24455	24460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479053952
506	NC_020089	CCG	2	6	24495	24500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053952
507	NC_020089	GCC	2	6	24512	24517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053952
508	NC_020089	GCC	2	6	24536	24541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053952
509	NC_020089	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	479053952
510	NC_020089	AGG	2	6	24605	24610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479053952
511	NC_020089	GCG	2	6	24625	24630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053952
512	NC_020089	C	6	6	24636	24641	0 %	0 %	0 %	100 %	479053952
513	NC_020089	CCTGGT	2	12	24667	24678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053952
514	NC_020089	GCC	2	6	24803	24808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053952
515	NC_020089	C	6	6	24824	24829	0 %	0 %	0 %	100 %	479053952
516	NC_020089	CCA	2	6	24861	24866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053952
517	NC_020089	GTC	2	6	24896	24901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053952
518	NC_020089	TCG	2	6	24909	24914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053952
519	NC_020089	GCCCCT	2	12	24919	24930	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	479053952
520	NC_020089	CGG	2	6	25025	25030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053952
521	NC_020089	CGA	2	6	25091	25096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053952
522	NC_020089	GAC	2	6	25109	25114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053952
523	NC_020089	ATG	2	6	25236	25241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479053952
524	NC_020089	GCC	2	6	25293	25298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053952
525	NC_020089	GCA	2	6	25306	25311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053952
526	NC_020089	GC	3	6	25902	25907	0 %	0 %	50 %	50 %	479053953
527	NC_020089	CGC	2	6	25925	25930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053953
528	NC_020089	TTG	2	6	25931	25936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053953
529	NC_020089	CGG	2	6	25957	25962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053953
530	NC_020089	CGG	2	6	25999	26004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053953
531	NC_020089	GCA	2	6	26031	26036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053953
532	NC_020089	CTT	2	6	26062	26067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479053953
533	NC_020089	GT	3	6	26136	26141	0 %	50 %	50 %	0 %	479053953
534	NC_020089	GTG	2	6	26181	26186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053953
535	NC_020089	GTC	2	6	26195	26200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053953
536	NC_020089	GCC	2	6	26208	26213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053953
537	NC_020089	AGC	2	6	26214	26219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053953
538	NC_020089	CGG	2	6	26287	26292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053953
539	NC_020089	CGG	2	6	26308	26313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053953
540	NC_020089	CGG	2	6	26341	26346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053953
541	NC_020089	CG	3	6	26370	26375	0 %	0 %	50 %	50 %	479053953
542	NC_020089	CGA	2	6	26386	26391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053953
543	NC_020089	CCA	2	6	26458	26463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053953
544	NC_020089	GCTC	2	8	26487	26494	0 %	25 %	25 %	50 %	479053953
545	NC_020089	CGG	2	6	26536	26541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053953
546	NC_020089	AGC	2	6	26622	26627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053953
547	NC_020089	TGA	2	6	26653	26658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479053953
548	NC_020089	GCG	2	6	26682	26687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053953
549	NC_020089	CCAA	2	8	26704	26711	50 %	0 %	0 %	50 %	479053953
550	NC_020089	GCC	2	6	26726	26731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053953
551	NC_020089	CAGC	2	8	26770	26777	25 %	0 %	25 %	50 %	479053953
552	NC_020089	CCG	2	6	26781	26786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053953
553	NC_020089	CAC	2	6	26858	26863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053953
554	NC_020089	CAC	2	6	27047	27052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053954
555	NC_020089	CAG	2	6	27095	27100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053954
556	NC_020089	CGC	2	6	27136	27141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053954
557	NC_020089	GCA	2	6	27154	27159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053954
558	NC_020089	CGT	2	6	27160	27165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053954
559	NC_020089	GCC	2	6	27200	27205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053954
560	NC_020089	GCT	2	6	27274	27279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053954
561	NC_020089	GCG	2	6	27351	27356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053954
562	NC_020089	CGT	2	6	27367	27372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053954
563	NC_020089	CGGC	2	8	27590	27597	0 %	0 %	50 %	50 %	479053955
564	NC_020089	GGC	2	6	27648	27653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053955
565	NC_020089	CA	3	6	27710	27715	50 %	0 %	0 %	50 %	479053955
566	NC_020089	GCC	2	6	27753	27758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053955
567	NC_020089	CGC	2	6	27783	27788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053955
568	NC_020089	CGC	2	6	27819	27824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053955
569	NC_020089	CCG	2	6	27849	27854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053955
570	NC_020089	GTC	2	6	27865	27870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053955
571	NC_020089	CGA	2	6	27959	27964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053955
572	NC_020089	TC	3	6	27990	27995	0 %	50 %	0 %	50 %	479053955
573	NC_020089	GCC	2	6	28030	28035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053955
574	NC_020089	CCGG	2	8	28076	28083	0 %	0 %	50 %	50 %	479053955
575	NC_020089	CG	3	6	28115	28120	0 %	0 %	50 %	50 %	479053955
576	NC_020089	GC	3	6	28121	28126	0 %	0 %	50 %	50 %	479053955
577	NC_020089	GTC	2	6	28182	28187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053955
578	NC_020089	TCGGCG	2	12	28217	28228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	479053955
579	NC_020089	CGA	2	6	28230	28235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053955
580	NC_020089	GC	3	6	28274	28279	0 %	0 %	50 %	50 %	479053955
581	NC_020089	TCG	2	6	28298	28303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053955
582	NC_020089	ACG	2	6	28322	28327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053955
583	NC_020089	GCA	2	6	28338	28343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053955
584	NC_020089	TCA	2	6	28379	28384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479053956
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587	NC_020089	GGC	2	6	28520	28525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053956
588	NC_020089	CTG	2	6	28534	28539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053956
589	NC_020089	TCA	2	6	28567	28572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479053956
590	NC_020089	CGG	2	6	28602	28607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053956
591	NC_020089	CGA	2	6	28625	28630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053956
592	NC_020089	GCTC	2	8	28632	28639	0 %	25 %	25 %	50 %	479053956
593	NC_020089	ACC	2	6	28644	28649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053956
594	NC_020089	CGT	2	6	28692	28697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053956
595	NC_020089	GC	4	8	28709	28716	0 %	0 %	50 %	50 %	479053956
596	NC_020089	CGA	2	6	28740	28745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053956
597	NC_020089	ACG	2	6	28751	28756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053956
598	NC_020089	GGC	2	6	28763	28768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053956
599	NC_020089	TGCG	2	8	28771	28778	0 %	25 %	50 %	25 %	479053956
600	NC_020089	CGC	2	6	28868	28873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053956
601	NC_020089	CAC	2	6	28985	28990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053956
602	NC_020089	CCGG	2	8	29036	29043	0 %	0 %	50 %	50 %	479053956
603	NC_020089	CAA	2	6	29090	29095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479053956
604	NC_020089	GTC	2	6	29100	29105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053956
605	NC_020089	CAA	2	6	29150	29155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479053956
606	NC_020089	GGCAA	2	10	29283	29292	40 %	0 %	40 %	20 %	479053957
607	NC_020089	ACG	2	6	29294	29299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053957
608	NC_020089	GC	3	6	29342	29347	0 %	0 %	50 %	50 %	479053957
609	NC_020089	CGTC	2	8	29367	29374	0 %	25 %	25 %	50 %	479053957
610	NC_020089	CG	3	6	29404	29409	0 %	0 %	50 %	50 %	479053957
611	NC_020089	GGATCA	2	12	29415	29426	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	479053957
612	NC_020089	AGC	2	6	29482	29487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053957
613	NC_020089	CACG	2	8	29726	29733	25 %	0 %	25 %	50 %	479053958
614	NC_020089	ACCG	2	8	29807	29814	25 %	0 %	25 %	50 %	479053958
615	NC_020089	GGT	2	6	29825	29830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053958
616	NC_020089	CGC	2	6	29936	29941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053958
617	NC_020089	AGC	2	6	29963	29968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053958
618	NC_020089	GTC	2	6	30012	30017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053958
619	NC_020089	CGATC	2	10	30108	30117	20 %	20 %	20 %	40 %	479053958
620	NC_020089	CCGG	2	8	30126	30133	0 %	0 %	50 %	50 %	479053958
621	NC_020089	CG	3	6	30134	30139	0 %	0 %	50 %	50 %	479053958
622	NC_020089	GGT	2	6	30185	30190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053958
623	NC_020089	GCC	2	6	30234	30239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053958
624	NC_020089	GTCG	2	8	30302	30309	0 %	25 %	50 %	25 %	479053958
625	NC_020089	GCG	2	6	30316	30321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053958
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627	NC_020089	CCT	2	6	30380	30385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479053958
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