MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM03

Total Repeats: 3978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019959	GCG	2	6	63221	63226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1502	NC_019959	GGT	2	6	63263	63268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644763
1503	NC_019959	TGC	3	9	63314	63322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644763
1504	NC_019959	CGG	2	6	63378	63383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1505	NC_019959	GGATG	2	10	63466	63475	20 %	20 %	60 %	0 %	433644763
1506	NC_019959	CGA	2	6	63485	63490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644763
1507	NC_019959	ACCGCG	2	12	63538	63549	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644763
1508	NC_019959	GTTC	2	8	63564	63571	0 %	50 %	25 %	25 %	433644763
1509	NC_019959	GCG	2	6	63623	63628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1510	NC_019959	CGC	2	6	63657	63662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644763
1511	NC_019959	ATC	2	6	63685	63690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644763
1512	NC_019959	GTG	2	6	63691	63696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644763
1513	NC_019959	CGC	2	6	63768	63773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644763
1514	NC_019959	TGG	2	6	63803	63808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644763
1515	NC_019959	GCT	2	6	63819	63824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644763
1516	NC_019959	AGCA	2	8	63883	63890	50 %	0 %	25 %	25 %	433644763
1517	NC_019959	GAT	2	6	63960	63965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644763
1518	NC_019959	ACG	2	6	64031	64036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644763
1519	NC_019959	GAC	2	6	64057	64062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644763
1520	NC_019959	CGG	2	6	64121	64126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1521	NC_019959	GCT	2	6	64155	64160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644763
1522	NC_019959	TCG	2	6	64172	64177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644763
1523	NC_019959	GTG	2	6	64204	64209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644763
1524	NC_019959	GCC	2	6	64213	64218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644763
1525	NC_019959	CCG	2	6	64249	64254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644763
1526	NC_019959	CGG	2	6	64278	64283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1527	NC_019959	AACG	2	8	64404	64411	50 %	0 %	25 %	25 %	433644763
1528	NC_019959	GCC	2	6	64510	64515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644763
1529	NC_019959	CGG	3	9	64521	64529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1530	NC_019959	CGG	2	6	64536	64541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1531	NC_019959	GCC	2	6	64573	64578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644763
1532	NC_019959	TCG	2	6	64669	64674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644763
1533	NC_019959	AGC	2	6	64675	64680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644763
1534	NC_019959	CGG	2	6	64683	64688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1535	NC_019959	G	6	6	64687	64692	0 %	0 %	100 %	0 %	433644763
1536	NC_019959	CGG	2	6	64698	64703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1537	NC_019959	CGG	3	9	64716	64724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1538	NC_019959	GCG	2	6	64733	64738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1539	NC_019959	GGTG	2	8	64758	64765	0 %	25 %	75 %	0 %	433644763
1540	NC_019959	CGG	2	6	64773	64778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1541	NC_019959	GGC	2	6	64789	64794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1542	NC_019959	CGG	2	6	64953	64958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1543	NC_019959	CGG	2	6	64965	64970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644763
1544	NC_019959	GCC	2	6	64975	64980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644763
1545	NC_019959	CAG	2	6	64983	64988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644763
1546	NC_019959	GCC	2	6	65110	65115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644764
1547	NC_019959	GGC	2	6	65119	65124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644764
1548	NC_019959	CCCG	2	8	65130	65137	0 %	0 %	25 %	75 %	433644764
1549	NC_019959	CTGGC	2	10	65181	65190	0 %	20 %	40 %	40 %	433644764
1550	NC_019959	CAC	2	6	65193	65198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644764
1551	NC_019959	ACC	3	9	65214	65222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644764
1552	NC_019959	CACC	2	8	65248	65255	25 %	0 %	0 %	75 %	433644764
1553	NC_019959	CCAC	2	8	65274	65281	25 %	0 %	0 %	75 %	433644764
1554	NC_019959	CGAG	2	8	65302	65309	25 %	0 %	50 %	25 %	433644764
1555	NC_019959	GCT	2	6	65352	65357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644764
1556	NC_019959	CCA	2	6	65368	65373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644764
1557	NC_019959	GGCT	2	8	65403	65410	0 %	25 %	50 %	25 %	433644764
1558	NC_019959	GCT	2	6	65441	65446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644764
1559	NC_019959	CAG	2	6	65612	65617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644764
1560	NC_019959	CGC	2	6	65641	65646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644764
1561	NC_019959	CCCCG	2	10	65651	65660	0 %	0 %	20 %	80 %	433644764
1562	NC_019959	GCG	2	6	65680	65685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644764
1563	NC_019959	CCG	2	6	65812	65817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644765
1564	NC_019959	CGC	2	6	65827	65832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644765
1565	NC_019959	TTC	2	6	65852	65857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644765
1566	NC_019959	GTC	2	6	65873	65878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644765
1567	NC_019959	CGC	2	6	65890	65895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644765
1568	NC_019959	CGG	3	9	65896	65904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644765
1569	NC_019959	TGA	2	6	65928	65933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644765
1570	NC_019959	CAG	3	9	65945	65953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644765
1571	NC_019959	CGT	2	6	65988	65993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644765
1572	NC_019959	CAA	2	6	66010	66015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644765
1573	NC_019959	CGC	2	6	66031	66036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644765
1574	NC_019959	ATC	2	6	66068	66073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644765
1575	NC_019959	TGCC	2	8	66132	66139	0 %	25 %	25 %	50 %	433644765
1576	NC_019959	ACC	2	6	66174	66179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644765
1577	NC_019959	CAT	2	6	66190	66195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644765
1578	NC_019959	CAG	2	6	66200	66205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644765
1579	NC_019959	GTG	2	6	66208	66213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644765
1580	NC_019959	TGA	2	6	66231	66236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644765
1581	NC_019959	CGG	2	6	66240	66245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644765
1582	NC_019959	TTC	2	6	66260	66265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644765
1583	NC_019959	CTG	2	6	66272	66277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644765
1584	NC_019959	GGC	2	6	66284	66289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644765
1585	NC_019959	GCC	2	6	66314	66319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644765
1586	NC_019959	CGA	2	6	66358	66363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644765
1587	NC_019959	CGC	3	9	66367	66375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644765
1588	NC_019959	CGG	2	6	66421	66426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644765
1589	NC_019959	ACCCG	2	10	66436	66445	20 %	0 %	20 %	60 %	433644765
1590	NC_019959	CGC	2	6	66453	66458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644765
1591	NC_019959	GAT	2	6	66467	66472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644765
1592	NC_019959	GCC	2	6	66473	66478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644765
1593	NC_019959	GGC	3	9	66479	66487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644765
1594	NC_019959	GCG	2	6	66498	66503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644765
1595	NC_019959	TCG	3	9	66504	66512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644765
1596	NC_019959	CCA	2	6	66522	66527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644765
1597	NC_019959	CCG	2	6	66555	66560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644765
1598	NC_019959	GCCCAG	2	12	66572	66583	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644765
1599	NC_019959	GCG	2	6	66606	66611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644765
1600	NC_019959	CGG	3	9	66631	66639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644765
1601	NC_019959	GCATC	2	10	66688	66697	20 %	20 %	20 %	40 %	433644765
1602	NC_019959	ACG	2	6	66706	66711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644765
1603	NC_019959	GTC	2	6	66821	66826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644765
1604	NC_019959	TCG	2	6	66897	66902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644765
1605	NC_019959	TCA	2	6	66903	66908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644765
1606	NC_019959	GCCGC	2	10	66974	66983	0 %	0 %	40 %	60 %	433644766
1607	NC_019959	TGG	2	6	66984	66989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644766
1608	NC_019959	CTG	2	6	67011	67016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644766
1609	NC_019959	GTC	2	6	67023	67028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644766
1610	NC_019959	GCA	2	6	67058	67063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644766
1611	NC_019959	ACA	2	6	67066	67071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644766
1612	NC_019959	CAG	2	6	67083	67088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644766
1613	NC_019959	CGA	2	6	67105	67110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644766
1614	NC_019959	CAC	2	6	67115	67120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644766
1615	NC_019959	CCG	2	6	67131	67136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644766
1616	NC_019959	CAT	2	6	67138	67143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644766
1617	NC_019959	CGA	2	6	67163	67168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644766
1618	NC_019959	ACC	2	6	67187	67192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644766
1619	NC_019959	CGC	2	6	67217	67222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644766
1620	NC_019959	CCA	2	6	67258	67263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644766
1621	NC_019959	CTGG	2	8	67295	67302	0 %	25 %	50 %	25 %	433644766
1622	NC_019959	ACG	3	9	67444	67452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644766
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1995	NC_019959	CCG	2	6	81227	81232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644779
1996	NC_019959	GCT	2	6	81282	81287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644779
1997	NC_019959	GTG	2	6	81316	81321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644779
1998	NC_019959	CGC	2	6	81347	81352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644779
1999	NC_019959	GGC	2	6	81378	81383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644779
2000	NC_019959	GTC	3	9	81400	81408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644779

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