MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM03

Total Repeats: 3978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019959	GGTC	2	8	40965	40972	0 %	25 %	50 %	25 %	433644734
1002	NC_019959	TGG	2	6	40986	40991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644734
1003	NC_019959	TG	3	6	41039	41044	0 %	50 %	50 %	0 %	433644734
1004	NC_019959	CGA	2	6	41073	41078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644734
1005	NC_019959	GTG	2	6	41081	41086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644734
1006	NC_019959	GC	3	6	41098	41103	0 %	0 %	50 %	50 %	433644734
1007	NC_019959	GCG	2	6	41111	41116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644734
1008	NC_019959	GGC	2	6	41122	41127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644734
1009	NC_019959	GCGG	2	8	41149	41156	0 %	0 %	75 %	25 %	433644734
1010	NC_019959	GGC	2	6	41169	41174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644734
1011	NC_019959	CTG	2	6	41176	41181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644734
1012	NC_019959	CG	3	6	41218	41223	0 %	0 %	50 %	50 %	433644734
1013	NC_019959	GGT	2	6	41239	41244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644734
1014	NC_019959	GCG	2	6	41531	41536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644735
1015	NC_019959	AGC	2	6	41548	41553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644735
1016	NC_019959	CG	3	6	41665	41670	0 %	0 %	50 %	50 %	433644735
1017	NC_019959	GAT	2	6	41716	41721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644735
1018	NC_019959	GC	3	6	41728	41733	0 %	0 %	50 %	50 %	433644735
1019	NC_019959	GC	3	6	41739	41744	0 %	0 %	50 %	50 %	433644735
1020	NC_019959	CGG	3	9	41748	41756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644735
1021	NC_019959	GCT	2	6	41772	41777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644736
1022	NC_019959	TCA	2	6	41797	41802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644736
1023	NC_019959	GGC	2	6	41807	41812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644736
1024	NC_019959	CGG	2	6	41834	41839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644736
1025	NC_019959	GCA	2	6	41845	41850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644736
1026	NC_019959	G	6	6	41891	41896	0 %	0 %	100 %	0 %	433644736
1027	NC_019959	TCG	2	6	41912	41917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644736
1028	NC_019959	TCC	2	6	42219	42224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644737
1029	NC_019959	GCT	2	6	42225	42230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644737
1030	NC_019959	AG	3	6	42264	42269	50 %	0 %	50 %	0 %	433644737
1031	NC_019959	ACGC	2	8	42283	42290	25 %	0 %	25 %	50 %	433644737
1032	NC_019959	ACA	2	6	42291	42296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644737
1033	NC_019959	GGTG	2	8	42352	42359	0 %	25 %	75 %	0 %	433644737
1034	NC_019959	TCGA	2	8	42397	42404	25 %	25 %	25 %	25 %	433644737
1035	NC_019959	GCCG	2	8	42411	42418	0 %	0 %	50 %	50 %	433644737
1036	NC_019959	TGG	2	6	42499	42504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644737
1037	NC_019959	CGCCGA	2	12	42577	42588	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433644738
1038	NC_019959	GGT	2	6	42668	42673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644738
1039	NC_019959	TCT	2	6	42720	42725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644738
1040	NC_019959	GCG	2	6	42726	42731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644738
1041	NC_019959	CCG	2	6	42735	42740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644738
1042	NC_019959	CCA	2	6	42764	42769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644738
1043	NC_019959	CGG	2	6	42835	42840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644738
1044	NC_019959	GAT	2	6	42851	42856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644738
1045	NC_019959	CGA	2	6	42867	42872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644738
1046	NC_019959	CG	3	6	42878	42883	0 %	0 %	50 %	50 %	433644738
1047	NC_019959	CCGG	2	8	43822	43829	0 %	0 %	50 %	50 %	433644739
1048	NC_019959	CGGCG	2	10	43830	43839	0 %	0 %	60 %	40 %	433644739
1049	NC_019959	CAG	2	6	43960	43965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644739
1050	NC_019959	GGTTCG	2	12	43982	43993	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433644739
1051	NC_019959	GGC	2	6	44004	44009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644739
1052	NC_019959	GGT	2	6	44020	44025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644739
1053	NC_019959	CGG	2	6	44037	44042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644739
1054	NC_019959	GC	3	6	44090	44095	0 %	0 %	50 %	50 %	433644739
1055	NC_019959	GTC	2	6	44104	44109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644739
1056	NC_019959	TGA	2	6	44118	44123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644739
1057	NC_019959	GTGG	2	8	44134	44141	0 %	25 %	75 %	0 %	433644739
1058	NC_019959	CGG	2	6	44175	44180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644739
1059	NC_019959	GGT	2	6	44188	44193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644739
1060	NC_019959	GCC	2	6	44270	44275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644740
1061	NC_019959	GCC	2	6	44300	44305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644740
1062	NC_019959	GCC	2	6	44360	44365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644740
1063	NC_019959	TGG	2	6	44377	44382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644740
1064	NC_019959	GGC	3	9	44432	44440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644740
1065	NC_019959	GCTG	2	8	44455	44462	0 %	25 %	50 %	25 %	433644740
1066	NC_019959	GGC	2	6	44495	44500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644740
1067	NC_019959	CGA	2	6	44521	44526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644740
1068	NC_019959	GTGG	2	8	44558	44565	0 %	25 %	75 %	0 %	433644740
1069	NC_019959	GAT	2	6	44567	44572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644740
1070	NC_019959	CGG	2	6	44608	44613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644740
1071	NC_019959	GCAGCT	2	12	44617	44628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644740
1072	NC_019959	CGG	2	6	44641	44646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644740
1073	NC_019959	CGG	2	6	44659	44664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644740
1074	NC_019959	TGG	2	6	44686	44691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644740
1075	NC_019959	CGT	2	6	44869	44874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644741
1076	NC_019959	GAG	2	6	44876	44881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433644741
1077	NC_019959	GTC	2	6	45008	45013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644741
1078	NC_019959	GCCC	2	8	45105	45112	0 %	0 %	25 %	75 %	433644742
1079	NC_019959	GAC	2	6	45127	45132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644742
1080	NC_019959	TGC	3	9	45153	45161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644742
1081	NC_019959	CAG	2	6	45163	45168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644742
1082	NC_019959	ACG	2	6	45197	45202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644742
1083	NC_019959	AGC	2	6	45240	45245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644742
1084	NC_019959	GGC	2	6	45246	45251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644742
1085	NC_019959	TCG	2	6	45257	45262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644742
1086	NC_019959	GAC	2	6	45305	45310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644742
1087	NC_019959	GCG	2	6	45345	45350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644743
1088	NC_019959	GCT	2	6	45386	45391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644743
1089	NC_019959	GCT	2	6	45449	45454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644743
1090	NC_019959	ACT	2	6	45470	45475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644743
1091	NC_019959	TCG	2	6	45502	45507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644743
1092	NC_019959	GCG	2	6	45534	45539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644743
1093	NC_019959	ACG	2	6	45583	45588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644743
1094	NC_019959	CGC	2	6	45593	45598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644743
1095	NC_019959	AGC	2	6	45601	45606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644743
1096	NC_019959	CGA	2	6	45644	45649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644743
1097	NC_019959	GC	3	6	45658	45663	0 %	0 %	50 %	50 %	433644743
1098	NC_019959	TCG	2	6	45756	45761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644744
1099	NC_019959	CTG	2	6	45797	45802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644744
1100	NC_019959	CAG	2	6	45806	45811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644744
1101	NC_019959	CCG	2	6	45826	45831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644744
1102	NC_019959	GAA	2	6	45962	45967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644744
1103	NC_019959	GCA	2	6	45997	46002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644744
1104	NC_019959	CAG	2	6	46065	46070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644744
1105	NC_019959	ATC	2	6	46115	46120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644744
1106	NC_019959	TCG	2	6	46170	46175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644744
1107	NC_019959	TCG	2	6	46215	46220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644744
1108	NC_019959	TGC	2	6	46230	46235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644744
1109	NC_019959	TGA	2	6	46249	46254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644744
1110	NC_019959	GCC	2	6	46280	46285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644744
1111	NC_019959	GGC	2	6	46295	46300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644744
1112	NC_019959	GCGG	2	8	46301	46308	0 %	0 %	75 %	25 %	433644744
1113	NC_019959	GCC	2	6	46347	46352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644744
1114	NC_019959	GCC	2	6	46445	46450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644744
1115	NC_019959	ATC	2	6	46488	46493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644744
1116	NC_019959	GTC	2	6	46595	46600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644744
1117	NC_019959	GCC	2	6	46606	46611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644744
1118	NC_019959	TCGCG	2	10	46621	46630	0 %	20 %	40 %	40 %	433644744
1119	NC_019959	CCA	2	6	46649	46654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644744
1120	NC_019959	GCA	2	6	46669	46674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644744
1121	NC_019959	CGG	2	6	46711	46716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644744
1122	NC_019959	TCG	3	9	46722	46730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644744
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1124	NC_019959	ACG	2	6	46956	46961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644744
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1496	NC_019959	CAC	3	9	62932	62940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644762
1497	NC_019959	GCC	3	9	62960	62968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644762
1498	NC_019959	CCGC	2	8	63087	63094	0 %	0 %	25 %	75 %	433644762
1499	NC_019959	CGA	2	6	63115	63120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644762
1500	NC_019959	CGG	2	6	63156	63161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644762

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