MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 100207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_019950	CGG	2	6	653612	653617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625649
15003	NC_019950	TGC	2	6	653627	653632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625650
15004	NC_019950	C	7	7	653632	653638	0 %	0 %	0 %	100 %	433625650
15005	NC_019950	CTG	2	6	653647	653652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625650
15006	NC_019950	TGG	2	6	653666	653671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625650
15007	NC_019950	CAC	2	6	653703	653708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625650
15008	NC_019950	CCGG	2	8	653734	653741	0 %	0 %	50 %	50 %	433625650
15009	NC_019950	GCC	3	9	653829	653837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625650
15010	NC_019950	GCCG	2	8	653874	653881	0 %	0 %	50 %	50 %	433625650
15011	NC_019950	GCC	3	9	653884	653892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625650
15012	NC_019950	CGA	2	6	653973	653978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625650
15013	NC_019950	CGG	2	6	654068	654073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625650
15014	NC_019950	CCG	2	6	654083	654088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625650
15015	NC_019950	AAC	2	6	654110	654115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625650
15016	NC_019950	CGG	2	6	654151	654156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625650
15017	NC_019950	CGC	2	6	654171	654176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625650
15018	NC_019950	CGA	2	6	654177	654182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625650
15019	NC_019950	GCC	2	6	654229	654234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625650
15020	NC_019950	GCT	2	6	654279	654284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625650
15021	NC_019950	CGCGG	2	10	654291	654300	0 %	0 %	60 %	40 %	433625650
15022	NC_019950	GGT	3	9	654312	654320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625650
15023	NC_019950	GC	3	6	654326	654331	0 %	0 %	50 %	50 %	433625650
15024	NC_019950	CCG	2	6	654338	654343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625650
15025	NC_019950	CGC	2	6	654351	654356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625650
15026	NC_019950	CCG	3	9	654365	654373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625650
15027	NC_019950	CGG	2	6	654414	654419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625650
15028	NC_019950	GCA	2	6	654448	654453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625650
15029	NC_019950	CCG	2	6	654523	654528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625650
15030	NC_019950	GCG	2	6	654531	654536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625650
15031	NC_019950	GTG	2	6	654540	654545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625650
15032	NC_019950	ACG	2	6	654610	654615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625651
15033	NC_019950	GGT	2	6	654635	654640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625651
15034	NC_019950	GCCG	2	8	654648	654655	0 %	0 %	50 %	50 %	433625651
15035	NC_019950	CGG	2	6	654656	654661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625651
15036	NC_019950	GGC	2	6	654704	654709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625651
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15039	NC_019950	TGG	2	6	654883	654888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625651
15040	NC_019950	CGG	2	6	654910	654915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625651
15041	NC_019950	GCC	2	6	654934	654939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625651
15042	NC_019950	CGCC	2	8	654947	654954	0 %	0 %	25 %	75 %	433625651
15043	NC_019950	CCAC	2	8	655005	655012	25 %	0 %	0 %	75 %	433625651
15044	NC_019950	ACG	2	6	655015	655020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625651
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15046	NC_019950	CGA	2	6	655220	655225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625651
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15048	NC_019950	CGC	2	6	655234	655239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625651
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15050	NC_019950	TTC	2	6	655359	655364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625651
15051	NC_019950	CGA	2	6	655435	655440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625652
15052	NC_019950	GC	3	6	655446	655451	0 %	0 %	50 %	50 %	433625652
15053	NC_019950	GTC	3	9	655452	655460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625652
15054	NC_019950	CGG	2	6	655475	655480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625652
15055	NC_019950	GTG	2	6	655491	655496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625652
15056	NC_019950	CCGG	2	8	655555	655562	0 %	0 %	50 %	50 %	433625652
15057	NC_019950	CCG	2	6	655594	655599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625652
15058	NC_019950	GC	3	6	655633	655638	0 %	0 %	50 %	50 %	433625652
15059	NC_019950	GT	4	8	655641	655648	0 %	50 %	50 %	0 %	433625652
15060	NC_019950	CCG	2	6	655666	655671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625652
15061	NC_019950	CGG	2	6	655687	655692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625652
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15066	NC_019950	GGC	2	6	655907	655912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625652
15067	NC_019950	GCCGG	2	10	656015	656024	0 %	0 %	60 %	40 %	433625652
15068	NC_019950	CTG	2	6	656026	656031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625652
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15071	NC_019950	GCT	2	6	656219	656224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625652
15072	NC_019950	GCCG	2	8	656251	656258	0 %	0 %	50 %	50 %	433625652
15073	NC_019950	TGC	2	6	656281	656286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625652
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15087	NC_019950	GACC	2	8	656986	656993	25 %	0 %	25 %	50 %	433625652
15088	NC_019950	GTC	2	6	657044	657049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625652
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15091	NC_019950	CTG	2	6	657104	657109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625653
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15100	NC_019950	CCGG	2	8	657485	657492	0 %	0 %	50 %	50 %	433625653
15101	NC_019950	GGT	2	6	657502	657507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625653
15102	NC_019950	CGC	4	12	657520	657531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625653
15103	NC_019950	CGT	2	6	657569	657574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625653
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15105	NC_019950	GT	4	8	657661	657668	0 %	50 %	50 %	0 %	433625654
15106	NC_019950	TCG	2	6	657685	657690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625654
15107	NC_019950	TCC	2	6	657700	657705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625654
15108	NC_019950	GGT	2	6	657731	657736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625654
15109	NC_019950	CGC	2	6	657796	657801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625654
15110	NC_019950	ACG	2	6	657829	657834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625654
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15115	NC_019950	GGT	2	6	658261	658266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625654
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15119	NC_019950	CGG	2	6	658571	658576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625654
15120	NC_019950	CGCAC	2	10	658597	658606	20 %	0 %	20 %	60 %	433625654
15121	NC_019950	GCT	2	6	658610	658615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625654
15122	NC_019950	GCC	2	6	658695	658700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625654
15123	NC_019950	GGT	2	6	658730	658735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625654
15124	NC_019950	GCT	2	6	658745	658750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625654
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15132	NC_019950	TCGG	2	8	659059	659066	0 %	25 %	50 %	25 %	433625655
15133	NC_019950	GCG	2	6	659074	659079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625655
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15143	NC_019950	GGT	2	6	659432	659437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625655
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15186	NC_019950	GCC	2	6	660949	660954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625658
15187	NC_019950	CGC	2	6	661057	661062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625658
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15190	NC_019950	GTA	2	6	661136	661141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625658
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15208	NC_019950	CGA	2	6	662017	662022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625659
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15222	NC_019950	CGGC	3	12	662463	662474	0 %	0 %	50 %	50 %	433625659
15223	NC_019950	TGGG	2	8	662475	662482	0 %	25 %	75 %	0 %	433625659
15224	NC_019950	CGA	2	6	662500	662505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625659
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15226	NC_019950	CGG	2	6	662530	662535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625659
15227	NC_019950	GTG	2	6	662537	662542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625659
15228	NC_019950	CGA	2	6	662563	662568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625659
15229	NC_019950	ATCGAC	2	12	662573	662584	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433625659
15230	NC_019950	AC	3	6	662638	662643	50 %	0 %	0 %	50 %	433625659
15231	NC_019950	GC	3	6	662695	662700	0 %	0 %	50 %	50 %	433625659
15232	NC_019950	CTG	2	6	662702	662707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625659
15233	NC_019950	GAC	2	6	662723	662728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625659
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15235	NC_019950	GGC	2	6	662866	662871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625659
15236	NC_019950	TGA	2	6	663004	663009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625660
15237	NC_019950	CTG	2	6	663045	663050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625660
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15239	NC_019950	GGC	2	6	663116	663121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625660
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