MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 100207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_019950	ACG	2	6	530786	530791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625526
12003	NC_019950	CCGGGT	2	12	530850	530861	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433625526
12004	NC_019950	CGG	2	6	530929	530934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625527
12005	NC_019950	CG	3	6	530937	530942	0 %	0 %	50 %	50 %	433625527
12006	NC_019950	CG	3	6	530949	530954	0 %	0 %	50 %	50 %	433625527
12007	NC_019950	GTC	2	6	530970	530975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625527
12008	NC_019950	GCTG	2	8	531005	531012	0 %	25 %	50 %	25 %	433625527
12009	NC_019950	GAT	3	9	531045	531053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625527
12010	NC_019950	CAA	2	6	531063	531068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625527
12011	NC_019950	GCC	2	6	531088	531093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625527
12012	NC_019950	CAG	2	6	531114	531119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625527
12013	NC_019950	GGC	2	6	531120	531125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625527
12014	NC_019950	GGT	2	6	531136	531141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625527
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12016	NC_019950	CGCC	2	8	531290	531297	0 %	0 %	25 %	75 %	433625527
12017	NC_019950	CGA	2	6	531311	531316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625527
12018	NC_019950	CGT	2	6	531347	531352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625527
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12021	NC_019950	ACCG	2	8	531420	531427	25 %	0 %	25 %	50 %	433625527
12022	NC_019950	ACA	2	6	531437	531442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625527
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12026	NC_019950	AGGT	2	8	531801	531808	25 %	25 %	50 %	0 %	433625528
12027	NC_019950	CA	3	6	531882	531887	50 %	0 %	0 %	50 %	433625528
12028	NC_019950	GCG	2	6	531890	531895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625528
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12039	NC_019950	CGG	2	6	532315	532320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625528
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12042	NC_019950	CGGGG	2	10	532396	532405	0 %	0 %	80 %	20 %	433625528
12043	NC_019950	ACG	2	6	532524	532529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625529
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12049	NC_019950	GC	3	6	532771	532776	0 %	0 %	50 %	50 %	433625529
12050	NC_019950	CCCG	2	8	532819	532826	0 %	0 %	25 %	75 %	433625529
12051	NC_019950	ACC	2	6	532920	532925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625529
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12053	NC_019950	TGA	2	6	532957	532962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625529
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12120	NC_019950	ACC	2	6	535924	535929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625531
12121	NC_019950	TCG	2	6	535931	535936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625531
12122	NC_019950	GGT	2	6	536056	536061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625531
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12135	NC_019950	GCGG	2	8	536739	536746	0 %	0 %	75 %	25 %	433625532
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12143	NC_019950	CACG	2	8	537196	537203	25 %	0 %	25 %	50 %	433625533
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12218	NC_019950	CCA	2	6	540896	540901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625537
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12220	NC_019950	CAG	2	6	540915	540920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625537
12221	NC_019950	GCG	2	6	540941	540946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625537
12222	NC_019950	CCA	2	6	540978	540983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625537
12223	NC_019950	AGT	2	6	541001	541006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625537
12224	NC_019950	ATG	2	6	541042	541047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625537
12225	NC_019950	AAC	2	6	541213	541218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625537
12226	NC_019950	AGG	2	6	541222	541227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625537
12227	NC_019950	GCA	2	6	541277	541282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625537
12228	NC_019950	TCC	2	6	541300	541305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625537
12229	NC_019950	AGC	3	9	541372	541380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625537
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12231	NC_019950	CGACGG	2	12	541421	541432	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433625537
12232	NC_019950	CGA	2	6	541433	541438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625537
12233	NC_019950	CGA	2	6	541460	541465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625537
12234	NC_019950	GCG	2	6	541482	541487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625537
12235	NC_019950	CAC	2	6	541512	541517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625537
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12237	NC_019950	G	6	6	541563	541568	0 %	0 %	100 %	0 %	433625538
12238	NC_019950	TCG	2	6	541668	541673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625538
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12344	NC_019950	GAT	2	6	545682	545687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625541
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12346	NC_019950	GC	3	6	545731	545736	0 %	0 %	50 %	50 %	433625541
12347	NC_019950	GTC	2	6	545781	545786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625541
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12357	NC_019950	GA	3	6	546524	546529	50 %	0 %	50 %	0 %	433625541
12358	NC_019950	TTGG	2	8	546555	546562	0 %	50 %	50 %	0 %	433625541
12359	NC_019950	GGTA	2	8	546577	546584	25 %	25 %	50 %	0 %	433625541
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12467	NC_019950	GCAA	2	8	550937	550944	50 %	0 %	25 %	25 %	433625544
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12472	NC_019950	CCGA	2	8	551161	551168	25 %	0 %	25 %	50 %	433625545
12473	NC_019950	CAC	2	6	551284	551289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625545
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