MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140060008 complete genome

Total Repeats: 100207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019950	CGG	2	6	208012	208017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625272
4502	NC_019950	TGG	3	9	208118	208126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625273
4503	NC_019950	GCTGGC	2	12	208128	208139	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433625273
4504	NC_019950	TTG	2	6	208148	208153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625273
4505	NC_019950	AAC	2	6	208180	208185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625273
4506	NC_019950	GGT	2	6	208188	208193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625273
4507	NC_019950	CGGT	2	8	208256	208263	0 %	25 %	50 %	25 %	433625273
4508	NC_019950	TCGA	2	8	208264	208271	25 %	25 %	25 %	25 %	433625273
4509	NC_019950	TGCC	2	8	208334	208341	0 %	25 %	25 %	50 %	433625273
4510	NC_019950	TGG	2	6	208373	208378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625273
4511	NC_019950	GGT	2	6	208414	208419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625273
4512	NC_019950	CGA	2	6	208512	208517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625273
4513	NC_019950	AGC	2	6	208535	208540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625273
4514	NC_019950	CTT	2	6	208668	208673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625273
4515	NC_019950	GGT	2	6	208677	208682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625273
4516	NC_019950	GAC	2	6	208720	208725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625273
4517	NC_019950	TCG	2	6	208733	208738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625273
4518	NC_019950	CG	3	6	208836	208841	0 %	0 %	50 %	50 %	433625273
4519	NC_019950	AAT	2	6	208885	208890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433625273
4520	NC_019950	ACC	2	6	208903	208908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625273
4521	NC_019950	TGC	2	6	208913	208918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625273
4522	NC_019950	GGC	2	6	208971	208976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625273
4523	NC_019950	AC	3	6	209002	209007	50 %	0 %	0 %	50 %	433625273
4524	NC_019950	GTG	2	6	209014	209019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625273
4525	NC_019950	ACT	2	6	209162	209167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625273
4526	NC_019950	GCC	2	6	209244	209249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625273
4527	NC_019950	GTG	2	6	209332	209337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625273
4528	NC_019950	GGT	2	6	209416	209421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625273
4529	NC_019950	CGT	2	6	209438	209443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625273
4530	NC_019950	ACG	2	6	209480	209485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625273
4531	NC_019950	GCC	2	6	209499	209504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625273
4532	NC_019950	ACC	2	6	209535	209540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625273
4533	NC_019950	GCC	2	6	209541	209546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625273
4534	NC_019950	CGCCGG	2	12	209585	209596	0 %	0 %	50 %	50 %	433625273
4535	NC_019950	AGG	2	6	209622	209627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433625273
4536	NC_019950	ATG	2	6	209634	209639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433625273
4537	NC_019950	CGG	2	6	209759	209764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625274
4538	NC_019950	TGG	2	6	209845	209850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625274
4539	NC_019950	GATC	2	8	209866	209873	25 %	25 %	25 %	25 %	433625274
4540	NC_019950	CG	3	6	209874	209879	0 %	0 %	50 %	50 %	433625274
4541	NC_019950	GAA	2	6	209888	209893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625274
4542	NC_019950	ACGCTG	2	12	209904	209915	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433625274
4543	NC_019950	GAA	2	6	209921	209926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625274
4544	NC_019950	CTG	2	6	209976	209981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625274
4545	NC_019950	GCA	2	6	209987	209992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625274
4546	NC_019950	GCCGC	2	10	210003	210012	0 %	0 %	40 %	60 %	433625274
4547	NC_019950	CTC	2	6	210065	210070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625274
4548	NC_019950	CAC	2	6	210080	210085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625274
4549	NC_019950	TTG	2	6	210114	210119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625274
4550	NC_019950	CGG	3	9	210122	210130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625274
4551	NC_019950	CGGGC	2	10	210178	210187	0 %	0 %	60 %	40 %	433625274
4552	NC_019950	CGA	2	6	210230	210235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625274
4553	NC_019950	CCA	2	6	210277	210282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625274
4554	NC_019950	GTT	2	6	210287	210292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625274
4555	NC_019950	CGGT	2	8	210305	210312	0 %	25 %	50 %	25 %	433625274
4556	NC_019950	CCG	2	6	210345	210350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625274
4557	NC_019950	CCG	2	6	210424	210429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625274
4558	NC_019950	TGG	2	6	210523	210528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625274
4559	NC_019950	GACCT	2	10	210621	210630	20 %	20 %	20 %	40 %	433625274
4560	NC_019950	GC	3	6	210683	210688	0 %	0 %	50 %	50 %	433625274
4561	NC_019950	AC	3	6	210742	210747	50 %	0 %	0 %	50 %	433625274
4562	NC_019950	GGC	2	6	210768	210773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625274
4563	NC_019950	TCG	2	6	210861	210866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625275
4564	NC_019950	TAC	2	6	210878	210883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625275
4565	NC_019950	TGG	2	6	210900	210905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625275
4566	NC_019950	GGT	2	6	210947	210952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625275
4567	NC_019950	CCG	2	6	211005	211010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625275
4568	NC_019950	ACCG	2	8	211019	211026	25 %	0 %	25 %	50 %	433625275
4569	NC_019950	CGA	2	6	211276	211281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625275
4570	NC_019950	GGTG	2	8	211294	211301	0 %	25 %	75 %	0 %	433625275
4571	NC_019950	GGTT	2	8	211323	211330	0 %	50 %	50 %	0 %	433625275
4572	NC_019950	TCG	2	6	211347	211352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625275
4573	NC_019950	CAT	2	6	211387	211392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625275
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4575	NC_019950	GGC	2	6	211525	211530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625275
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4577	NC_019950	TTG	2	6	211652	211657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625275
4578	NC_019950	TCC	2	6	211662	211667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625275
4579	NC_019950	TGC	2	6	211714	211719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625275
4580	NC_019950	CCG	3	9	211751	211759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625275
4581	NC_019950	TTC	2	6	211773	211778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433625275
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4585	NC_019950	CCG	2	6	212100	212105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625275
4586	NC_019950	CCG	2	6	212126	212131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625275
4587	NC_019950	GCA	2	6	212182	212187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625275
4588	NC_019950	CGG	2	6	212226	212231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625275
4589	NC_019950	TGG	2	6	212256	212261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625275
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4591	NC_019950	GGC	2	6	212385	212390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625276
4592	NC_019950	CGG	2	6	212396	212401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625276
4593	NC_019950	GGC	2	6	212442	212447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625276
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4600	NC_019950	GGCT	2	8	212596	212603	0 %	25 %	50 %	25 %	433625276
4601	NC_019950	GCG	2	6	212614	212619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625276
4602	NC_019950	GCT	2	6	212622	212627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625276
4603	NC_019950	TTGCG	2	10	212663	212672	0 %	40 %	40 %	20 %	433625276
4604	NC_019950	CAAT	2	8	212689	212696	50 %	25 %	0 %	25 %	433625276
4605	NC_019950	CG	4	8	212697	212704	0 %	0 %	50 %	50 %	433625276
4606	NC_019950	TTGCG	2	10	212736	212745	0 %	40 %	40 %	20 %	433625276
4607	NC_019950	AGA	2	6	212789	212794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433625276
4608	NC_019950	CGT	2	6	212831	212836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625276
4609	NC_019950	TCG	2	6	212852	212857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625276
4610	NC_019950	GC	3	6	212901	212906	0 %	0 %	50 %	50 %	433625276
4611	NC_019950	CAA	3	9	212919	212927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625276
4612	NC_019950	GTCG	2	8	212934	212941	0 %	25 %	50 %	25 %	433625276
4613	NC_019950	GGT	3	9	213080	213088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625277
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4615	NC_019950	CGGG	2	8	213150	213157	0 %	0 %	75 %	25 %	433625277
4616	NC_019950	TGC	2	6	213175	213180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625277
4617	NC_019950	GTG	2	6	213192	213197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625277
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4619	NC_019950	GGT	2	6	213247	213252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625277
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4621	NC_019950	TGG	2	6	213424	213429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625277
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4982	NC_019950	CGC	2	6	229498	229503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
4983	NC_019950	AGC	2	6	229532	229537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625293
4984	NC_019950	TTG	2	6	229570	229575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433625293
4985	NC_019950	CGC	2	6	229579	229584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
4986	NC_019950	GCC	2	6	229592	229597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
4987	NC_019950	ATC	3	9	229644	229652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625293
4988	NC_019950	CCCG	2	8	229715	229722	0 %	0 %	25 %	75 %	433625293
4989	NC_019950	CGGC	2	8	229813	229820	0 %	0 %	50 %	50 %	433625293
4990	NC_019950	TGG	2	6	229852	229857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433625293
4991	NC_019950	CCG	2	6	229861	229866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433625293
4992	NC_019950	ACG	2	6	229867	229872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433625293
4993	NC_019950	CGT	2	6	229904	229909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625293
4994	NC_019950	CGG	2	6	229946	229951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433625293
4995	NC_019950	CCA	2	6	229952	229957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433625293
4996	NC_019950	CTA	2	6	229973	229978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433625293
4997	NC_019950	CTC	2	6	230012	230017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433625293
4998	NC_019950	ACA	2	6	230086	230091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433625293
4999	NC_019950	GC	3	6	230110	230115	0 %	0 %	50 %	50 %	433625293
5000	NC_019950	GTC	2	6	230223	230228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433625293

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