MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.07

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019762	AC	3	6	245	250	50 %	0 %	0 %	50 %	428314809
2	NC_019762	TAT	2	6	314	319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314809
3	NC_019762	GGA	2	6	369	374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314809
4	NC_019762	ACG	2	6	420	425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314809
5	NC_019762	GAT	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314809
6	NC_019762	GAC	2	6	477	482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314809
7	NC_019762	AGT	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314809
8	NC_019762	CAA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314810
9	NC_019762	CTCA	2	8	876	883	25 %	25 %	0 %	50 %	428314810
10	NC_019762	GCA	3	9	917	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314810
11	NC_019762	TGC	2	6	952	957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314810
12	NC_019762	TCTG	2	8	995	1002	0 %	50 %	25 %	25 %	428314810
13	NC_019762	TGC	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314810
14	NC_019762	GCTC	2	8	1180	1187	0 %	25 %	25 %	50 %	428314810
15	NC_019762	TC	4	8	1186	1193	0 %	50 %	0 %	50 %	428314810
16	NC_019762	ACT	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314810
17	NC_019762	GCA	2	6	1269	1274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314810
18	NC_019762	TTA	2	6	1435	1440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314810
19	NC_019762	GAA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314810
20	NC_019762	ACA	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314810
21	NC_019762	ACGA	2	8	1548	1555	50 %	0 %	25 %	25 %	428314810
22	NC_019762	GAT	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314810
23	NC_019762	AT	3	6	1690	1695	50 %	50 %	0 %	0 %	428314810
24	NC_019762	ATG	2	6	1762	1767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314810
25	NC_019762	AT	3	6	1784	1789	50 %	50 %	0 %	0 %	428314810
26	NC_019762	A	6	6	1809	1814	100 %	0 %	0 %	0 %	428314810
27	NC_019762	AT	3	6	1844	1849	50 %	50 %	0 %	0 %	428314810
28	NC_019762	AGGTA	2	10	1859	1868	40 %	20 %	40 %	0 %	428314810
29	NC_019762	AGA	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314810
30	NC_019762	AGG	2	6	1952	1957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314810
31	NC_019762	TTG	2	6	1990	1995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314810
32	NC_019762	GA	3	6	2018	2023	50 %	0 %	50 %	0 %	428314810
33	NC_019762	TGA	2	6	2054	2059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314810
34	NC_019762	AGG	2	6	2081	2086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314810
35	NC_019762	TA	3	6	2178	2183	50 %	50 %	0 %	0 %	428314810
36	NC_019762	ATT	2	6	2220	2225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314810
37	NC_019762	TCC	2	6	2429	2434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314810
38	NC_019762	GTAAGG	2	12	2451	2462	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428314810
39	NC_019762	TAATCG	2	12	2768	2779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428314810
40	NC_019762	TTGA	2	8	2846	2853	25 %	50 %	25 %	0 %	428314810
41	NC_019762	T	6	6	2944	2949	0 %	100 %	0 %	0 %	428314811
42	NC_019762	CTGG	2	8	2957	2964	0 %	25 %	50 %	25 %	428314811
43	NC_019762	A	6	6	2973	2978	100 %	0 %	0 %	0 %	428314811
44	NC_019762	CTCG	2	8	3039	3046	0 %	25 %	25 %	50 %	428314811
45	NC_019762	CGAT	2	8	3221	3228	25 %	25 %	25 %	25 %	428314811
46	NC_019762	GAA	2	6	3306	3311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314811
47	NC_019762	AGCC	2	8	3318	3325	25 %	0 %	25 %	50 %	428314811
48	NC_019762	GTT	2	6	3348	3353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314811
49	NC_019762	TAC	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314811
50	NC_019762	ATG	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314811
51	NC_019762	GTC	2	6	3586	3591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314811
52	NC_019762	AGG	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314811
53	NC_019762	TTC	2	6	3634	3639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314811
54	NC_019762	TGG	2	6	3678	3683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314811
55	NC_019762	AGT	2	6	3734	3739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314811
56	NC_019762	AAC	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314812
57	NC_019762	TTATCC	2	12	3868	3879	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428314812
58	NC_019762	T	6	6	3891	3896	0 %	100 %	0 %	0 %	428314812
59	NC_019762	TGA	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314812
60	NC_019762	TAAA	2	8	3923	3930	75 %	25 %	0 %	0 %	428314812
61	NC_019762	TGA	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314812
62	NC_019762	TA	3	6	4011	4016	50 %	50 %	0 %	0 %	428314812
63	NC_019762	TCGT	2	8	4020	4027	0 %	50 %	25 %	25 %	428314812
64	NC_019762	A	6	6	4059	4064	100 %	0 %	0 %	0 %	428314812
65	NC_019762	AAT	2	6	4127	4132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314812
66	NC_019762	GCT	3	9	4210	4218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314812
67	NC_019762	AATC	3	12	4229	4240	50 %	25 %	0 %	25 %	428314812
68	NC_019762	TAC	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314812
69	NC_019762	CTG	2	6	4322	4327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314812
70	NC_019762	CTT	2	6	4413	4418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314812
71	NC_019762	ACTA	2	8	4446	4453	50 %	25 %	0 %	25 %	428314812
72	NC_019762	TTG	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314812
73	NC_019762	AAG	2	6	4621	4626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314812
74	NC_019762	ACG	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314812
75	NC_019762	GATT	2	8	4812	4819	25 %	50 %	25 %	0 %	428314812
76	NC_019762	CAT	2	6	4823	4828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314812
77	NC_019762	TGA	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314812
78	NC_019762	ACT	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314812
79	NC_019762	CTTC	2	8	5012	5019	0 %	50 %	0 %	50 %	428314812
80	NC_019762	CA	3	6	5095	5100	50 %	0 %	0 %	50 %	428314813
81	NC_019762	CAA	2	6	5113	5118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314813
82	NC_019762	TGT	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314813
83	NC_019762	ATA	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314813
84	NC_019762	CTC	2	6	5203	5208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314813
85	NC_019762	CTC	3	9	5276	5284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314813
86	NC_019762	ACA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314813
87	NC_019762	ACTG	2	8	5345	5352	25 %	25 %	25 %	25 %	428314813
88	NC_019762	TTC	2	6	5381	5386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314813
89	NC_019762	TGT	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314813
90	NC_019762	TGC	2	6	5447	5452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314813
91	NC_019762	CAAT	2	8	5454	5461	50 %	25 %	0 %	25 %	428314813
92	NC_019762	CTT	2	6	5477	5482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314813
93	NC_019762	ATG	2	6	5504	5509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314813
94	NC_019762	TTG	2	6	5586	5591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314813
95	NC_019762	TTC	2	6	5720	5725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314813
96	NC_019762	CCGT	2	8	5847	5854	0 %	25 %	25 %	50 %	428314813
97	NC_019762	GAA	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314813
98	NC_019762	A	6	6	5942	5947	100 %	0 %	0 %	0 %	428314813
99	NC_019762	GAG	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314813
100	NC_019762	TGC	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314814
101	NC_019762	TCA	2	6	6427	6432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314814
102	NC_019762	AAGAA	2	10	6516	6525	80 %	0 %	20 %	0 %	428314814
103	NC_019762	ATG	2	6	6604	6609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
104	NC_019762	ATA	2	6	6718	6723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314815
105	NC_019762	AGA	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314815
106	NC_019762	AGA	2	6	6789	6794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314815
107	NC_019762	GGTG	2	8	6800	6807	0 %	25 %	75 %	0 %	428314815
108	NC_019762	CTC	2	6	6859	6864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314815
109	NC_019762	ATG	2	6	6893	6898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
110	NC_019762	CGC	2	6	6949	6954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314815
111	NC_019762	GCA	2	6	7131	7136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
112	NC_019762	CTG	2	6	7228	7233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314815
113	NC_019762	ATC	2	6	7279	7284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314815
114	NC_019762	GGAGT	2	10	7379	7388	20 %	20 %	60 %	0 %	428314815
115	NC_019762	A	6	6	7492	7497	100 %	0 %	0 %	0 %	428314815
116	NC_019762	CTG	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314815
117	NC_019762	CAG	2	6	7623	7628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
118	NC_019762	CCA	2	6	7678	7683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314815
119	NC_019762	CAC	2	6	7698	7703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314815
120	NC_019762	TGC	2	6	7709	7714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314815
121	NC_019762	GGT	2	6	7718	7723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314815
122	NC_019762	TTC	2	6	7747	7752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314815
123	NC_019762	CCA	2	6	7777	7782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314815
124	NC_019762	CGA	2	6	7812	7817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
125	NC_019762	ACA	2	6	7887	7892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314815
126	NC_019762	ATG	2	6	7907	7912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314815
127	NC_019762	CA	3	6	8394	8399	50 %	0 %	0 %	50 %	428314815
128	NC_019762	CTG	2	6	8485	8490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314815
129	NC_019762	CAT	2	6	8496	8501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314815
130	NC_019762	CTA	2	6	8507	8512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314815
131	NC_019762	ACG	3	9	8531	8539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
132	NC_019762	GCA	2	6	8559	8564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
133	NC_019762	CAGC	2	8	8582	8589	25 %	0 %	25 %	50 %	428314815
134	NC_019762	AGGGC	2	10	8603	8612	20 %	0 %	60 %	20 %	428314815
135	NC_019762	TAT	2	6	8683	8688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314815
136	NC_019762	CTC	2	6	8701	8706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314815
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142	NC_019762	CAG	2	6	8869	8874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314815
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144	NC_019762	GA	4	8	8964	8971	50 %	0 %	50 %	0 %	428314815
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152	NC_019762	GTTC	2	8	9622	9629	0 %	50 %	25 %	25 %	428314815
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159	NC_019762	T	6	6	10230	10235	0 %	100 %	0 %	0 %	428314815
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261	NC_019762	GTT	2	6	16896	16901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314819
262	NC_019762	A	6	6	16949	16954	100 %	0 %	0 %	0 %	428314819
263	NC_019762	CTC	2	6	17575	17580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314820
264	NC_019762	GCTGA	2	10	17696	17705	20 %	20 %	40 %	20 %	428314820
265	NC_019762	GCT	2	6	17715	17720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314820
266	NC_019762	AGG	2	6	17765	17770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314820
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268	NC_019762	TTTG	2	8	17808	17815	0 %	75 %	25 %	0 %	428314820
269	NC_019762	CTC	2	6	17827	17832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314820
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271	NC_019762	GATG	2	8	17993	18000	25 %	25 %	50 %	0 %	428314820
272	NC_019762	TTC	2	6	18001	18006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314820
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276	NC_019762	AGG	2	6	18169	18174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314820
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279	NC_019762	G	6	6	18222	18227	0 %	0 %	100 %	0 %	428314820
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302	NC_019762	ATC	2	6	19678	19683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314820
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362	NC_019762	GGCT	2	8	23913	23920	0 %	25 %	50 %	25 %	428314824
363	NC_019762	GA	3	6	23974	23979	50 %	0 %	50 %	0 %	428314824
364	NC_019762	GGCAG	2	10	24041	24050	20 %	0 %	60 %	20 %	428314824
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368	NC_019762	CT	3	6	24186	24191	0 %	50 %	0 %	50 %	428314824
369	NC_019762	GCCA	2	8	24213	24220	25 %	0 %	25 %	50 %	428314824
370	NC_019762	T	8	8	24339	24346	0 %	100 %	0 %	0 %	428314825
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376	NC_019762	GGTTT	2	10	24782	24791	0 %	60 %	40 %	0 %	428314825
377	NC_019762	GAC	2	6	24911	24916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314825
378	NC_019762	GA	3	6	25017	25022	50 %	0 %	50 %	0 %	428314825
379	NC_019762	GTT	2	6	25030	25035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314825
380	NC_019762	CGA	2	6	25045	25050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314825
381	NC_019762	GA	3	6	25049	25054	50 %	0 %	50 %	0 %	428314825
382	NC_019762	GCG	2	6	25079	25084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314825
383	NC_019762	GGA	2	6	25145	25150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314825
384	NC_019762	TTGAT	2	10	25179	25188	20 %	60 %	20 %	0 %	428314825
385	NC_019762	GAG	2	6	25195	25200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314825
386	NC_019762	TTC	2	6	25207	25212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314825
387	NC_019762	CAA	2	6	25318	25323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314826
388	NC_019762	CGT	2	6	25420	25425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314826
389	NC_019762	CAT	2	6	25427	25432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314826
390	NC_019762	AGC	2	6	25559	25564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314826
391	NC_019762	AGG	2	6	25598	25603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314826
392	NC_019762	CTT	2	6	25651	25656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314826
393	NC_019762	ACG	2	6	25683	25688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314826
394	NC_019762	GCT	2	6	25722	25727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314826
395	NC_019762	TGT	2	6	25738	25743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314826
396	NC_019762	CT	3	6	25873	25878	0 %	50 %	0 %	50 %	428314826
397	NC_019762	TTGA	2	8	25943	25950	25 %	50 %	25 %	0 %	428314826

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.