MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.02

Total Repeats: 1196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019760	AATT	2	8	462	469	50 %	50 %	0 %	0 %	428314741
2	NC_019760	G	9	9	509	517	0 %	0 %	100 %	0 %	428314741
3	NC_019760	TTG	2	6	668	673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314741
4	NC_019760	TCG	2	6	716	721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314741
5	NC_019760	TGT	2	6	780	785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314741
6	NC_019760	TTTA	2	8	1642	1649	25 %	75 %	0 %	0 %	428314742
7	NC_019760	CGGGT	2	10	1658	1667	0 %	20 %	60 %	20 %	428314742
8	NC_019760	TAA	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314742
9	NC_019760	TTC	2	6	1716	1721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314742
10	NC_019760	TAA	2	6	1742	1747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314742
11	NC_019760	CTTT	2	8	1790	1797	0 %	75 %	0 %	25 %	428314742
12	NC_019760	T	6	6	1808	1813	0 %	100 %	0 %	0 %	428314742
13	NC_019760	CTC	2	6	1952	1957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314742
14	NC_019760	TGGG	2	8	1963	1970	0 %	25 %	75 %	0 %	428314742
15	NC_019760	TAAT	2	8	1984	1991	50 %	50 %	0 %	0 %	428314742
16	NC_019760	CTT	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314742
17	NC_019760	TGC	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314742
18	NC_019760	CAT	2	6	2227	2232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314742
19	NC_019760	GAAG	2	8	2251	2258	50 %	0 %	50 %	0 %	428314742
20	NC_019760	GATA	2	8	2275	2282	50 %	25 %	25 %	0 %	428314742
21	NC_019760	TCA	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314742
22	NC_019760	TGGTT	2	10	2327	2336	0 %	60 %	40 %	0 %	428314742
23	NC_019760	T	6	6	2335	2340	0 %	100 %	0 %	0 %	428314742
24	NC_019760	TCA	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314743
25	NC_019760	TTG	2	6	2607	2612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314743
26	NC_019760	AAT	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314743
27	NC_019760	GCT	2	6	2654	2659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314743
28	NC_019760	GTT	2	6	2982	2987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314744
29	NC_019760	AATG	2	8	3022	3029	50 %	25 %	25 %	0 %	428314744
30	NC_019760	CTC	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314744
31	NC_019760	T	6	6	3107	3112	0 %	100 %	0 %	0 %	428314744
32	NC_019760	GAAC	2	8	3144	3151	50 %	0 %	25 %	25 %	428314744
33	NC_019760	CAG	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314744
34	NC_019760	TTC	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314744
35	NC_019760	CAG	2	6	3377	3382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314744
36	NC_019760	GCA	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314744
37	NC_019760	GCA	2	6	3421	3426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314744
38	NC_019760	GA	3	6	3438	3443	50 %	0 %	50 %	0 %	428314744
39	NC_019760	TGT	2	6	3460	3465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314744
40	NC_019760	AGC	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314744
41	NC_019760	TGC	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314744
42	NC_019760	TCT	2	6	3651	3656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314744
43	NC_019760	TTC	2	6	3671	3676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314744
44	NC_019760	CGG	2	6	3684	3689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314744
45	NC_019760	CAT	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314745
46	NC_019760	ACT	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314745
47	NC_019760	CCG	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314746
48	NC_019760	TCA	2	6	4591	4596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314746
49	NC_019760	CTG	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314746
50	NC_019760	CCG	2	6	4661	4666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314746
51	NC_019760	CCA	2	6	4772	4777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314746
52	NC_019760	ACC	3	9	4827	4835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314746
53	NC_019760	GTTT	2	8	4852	4859	0 %	75 %	25 %	0 %	428314746
54	NC_019760	TCGG	2	8	4874	4881	0 %	25 %	50 %	25 %	428314746
55	NC_019760	CTG	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314746
56	NC_019760	TAGA	2	8	4926	4933	50 %	25 %	25 %	0 %	428314746
57	NC_019760	CAA	2	6	5515	5520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314747
58	NC_019760	TGA	2	6	5550	5555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314747
59	NC_019760	CCA	2	6	5574	5579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314747
60	NC_019760	TCA	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314747
61	NC_019760	GCT	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314747
62	NC_019760	CCT	2	6	5609	5614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314747
63	NC_019760	CT	3	6	5650	5655	0 %	50 %	0 %	50 %	428314747
64	NC_019760	AAC	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314747
65	NC_019760	ATC	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314747
66	NC_019760	GTT	2	6	5687	5692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314747
67	NC_019760	CTT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314747
68	NC_019760	TCT	2	6	5811	5816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314747
69	NC_019760	GGC	2	6	5896	5901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314747
70	NC_019760	TTCT	2	8	5941	5948	0 %	75 %	0 %	25 %	428314747
71	NC_019760	CCA	2	6	6034	6039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314747
72	NC_019760	GT	3	6	6054	6059	0 %	50 %	50 %	0 %	428314747
73	NC_019760	CGG	2	6	6061	6066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314747
74	NC_019760	ACC	2	6	6122	6127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314747
75	NC_019760	AAG	3	9	6165	6173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314747
76	NC_019760	ACA	2	6	6180	6185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314747
77	NC_019760	CCT	2	6	6231	6236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314747
78	NC_019760	CAA	2	6	6238	6243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314747
79	NC_019760	CTT	2	6	6259	6264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314747
80	NC_019760	GCT	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314747
81	NC_019760	CTTCAA	2	12	6340	6351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314747
82	NC_019760	CAT	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314747
83	NC_019760	AGC	2	6	6484	6489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314747
84	NC_019760	AAT	2	6	6799	6804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314748
85	NC_019760	ATC	3	9	6814	6822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314748
86	NC_019760	ATC	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314748
87	NC_019760	ACG	2	6	6856	6861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314748
88	NC_019760	TTTC	2	8	6882	6889	0 %	75 %	0 %	25 %	428314748
89	NC_019760	TGA	2	6	6939	6944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314748
90	NC_019760	TTA	2	6	6947	6952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314748
91	NC_019760	TCA	2	6	7010	7015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314748
92	NC_019760	TTGT	2	8	7070	7077	0 %	75 %	25 %	0 %	428314749
93	NC_019760	ACG	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314749
94	NC_019760	TCA	2	6	7182	7187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314749
95	NC_019760	CAT	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314749
96	NC_019760	ACC	2	6	7227	7232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314749
97	NC_019760	ACT	2	6	7278	7283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314749
98	NC_019760	TTG	2	6	7364	7369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314750
99	NC_019760	GTA	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314750
100	NC_019760	CCA	2	6	7622	7627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314750
101	NC_019760	CAG	2	6	7657	7662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314750
102	NC_019760	TGA	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314750
103	NC_019760	GCGG	2	8	7832	7839	0 %	0 %	75 %	25 %	428314750
104	NC_019760	TC	3	6	7881	7886	0 %	50 %	0 %	50 %	428314750
105	NC_019760	TTC	2	6	7889	7894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314750
106	NC_019760	GCA	2	6	7914	7919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314750
107	NC_019760	GCTTTC	2	12	7940	7951	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428314750
108	NC_019760	TCC	2	6	7968	7973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314750
109	NC_019760	TCT	5	15	8019	8033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314750
110	NC_019760	A	7	7	8046	8052	100 %	0 %	0 %	0 %	428314750
111	NC_019760	CAG	3	9	8053	8061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314750
112	NC_019760	GTG	2	6	8065	8070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314750
113	NC_019760	GGTG	3	12	8067	8078	0 %	25 %	75 %	0 %	428314750
114	NC_019760	TGT	2	6	8081	8086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314750
115	NC_019760	T	6	6	8088	8093	0 %	100 %	0 %	0 %	428314750
116	NC_019760	T	6	6	8167	8172	0 %	100 %	0 %	0 %	428314750
117	NC_019760	T	6	6	8187	8192	0 %	100 %	0 %	0 %	428314750
118	NC_019760	ACA	2	6	8235	8240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314750
119	NC_019760	CATC	2	8	8429	8436	25 %	25 %	0 %	50 %	428314750
120	NC_019760	CGG	3	9	8467	8475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314750
121	NC_019760	GT	3	6	8500	8505	0 %	50 %	50 %	0 %	428314750
122	NC_019760	AACG	2	8	8506	8513	50 %	0 %	25 %	25 %	428314750
123	NC_019760	GTG	2	6	8517	8522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314750
124	NC_019760	TGGG	2	8	8820	8827	0 %	25 %	75 %	0 %	428314751
125	NC_019760	TACTG	2	10	8858	8867	20 %	40 %	20 %	20 %	428314751
126	NC_019760	TCC	2	6	8887	8892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314751
127	NC_019760	TCG	2	6	8929	8934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314751
128	NC_019760	GCT	2	6	8963	8968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314751
129	NC_019760	AAT	2	6	8972	8977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314751
130	NC_019760	CAG	2	6	9185	9190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314752
131	NC_019760	TGG	2	6	9369	9374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314752
132	NC_019760	CAT	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314752
133	NC_019760	AGT	2	6	9484	9489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314752
134	NC_019760	ACT	2	6	9495	9500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314752
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261	NC_019760	CCA	2	6	20595	20600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314758
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385	NC_019760	CT	3	6	28907	28912	0 %	50 %	0 %	50 %	428314763
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