MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.03

Total Repeats: 1272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019740	GCC	2	6	249	254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314594
2	NC_019740	GCAG	2	8	412	419	25 %	0 %	50 %	25 %	428314594
3	NC_019740	CGG	2	6	517	522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314594
4	NC_019740	TCA	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314594
5	NC_019740	CGT	2	6	577	582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314594
6	NC_019740	CTTCA	2	10	649	658	20 %	40 %	0 %	40 %	428314594
7	NC_019740	CAT	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314594
8	NC_019740	GCGAT	2	10	849	858	20 %	20 %	40 %	20 %	428314595
9	NC_019740	TG	3	6	969	974	0 %	50 %	50 %	0 %	428314596
10	NC_019740	CGA	2	6	1055	1060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314596
11	NC_019740	TCT	2	6	1064	1069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314596
12	NC_019740	A	7	7	1084	1090	100 %	0 %	0 %	0 %	428314596
13	NC_019740	AAT	2	6	1149	1154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314596
14	NC_019740	TTG	2	6	1162	1167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314596
15	NC_019740	GCTGG	2	10	1244	1253	0 %	20 %	60 %	20 %	428314596
16	NC_019740	GA	3	6	1343	1348	50 %	0 %	50 %	0 %	428314596
17	NC_019740	CGG	2	6	1349	1354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314596
18	NC_019740	TTG	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314596
19	NC_019740	CTT	2	6	1410	1415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314596
20	NC_019740	ACCG	2	8	1729	1736	25 %	0 %	25 %	50 %	428314597
21	NC_019740	CAA	2	6	1784	1789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314597
22	NC_019740	G	6	6	1829	1834	0 %	0 %	100 %	0 %	428314597
23	NC_019740	TCC	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314598
24	NC_019740	GCA	2	6	2066	2071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314598
25	NC_019740	AGC	2	6	2080	2085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314598
26	NC_019740	CAG	2	6	2132	2137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314598
27	NC_019740	CAC	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314598
28	NC_019740	TTA	2	6	2237	2242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314598
29	NC_019740	TGAT	2	8	2375	2382	25 %	50 %	25 %	0 %	428314598
30	NC_019740	GGC	2	6	2389	2394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314598
31	NC_019740	GGC	2	6	2768	2773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314599
32	NC_019740	GAC	2	6	2781	2786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314599
33	NC_019740	AAC	2	6	2815	2820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314599
34	NC_019740	CGAT	2	8	2841	2848	25 %	25 %	25 %	25 %	428314599
35	NC_019740	AGC	2	6	2901	2906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314599
36	NC_019740	AGG	2	6	2937	2942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314599
37	NC_019740	TAA	2	6	2958	2963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314599
38	NC_019740	A	6	6	2962	2967	100 %	0 %	0 %	0 %	428314599
39	NC_019740	GGC	2	6	2975	2980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314599
40	NC_019740	GTG	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314600
41	NC_019740	CGC	2	6	3160	3165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314600
42	NC_019740	ATT	2	6	3171	3176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314600
43	NC_019740	CTC	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314601
44	NC_019740	CCG	4	12	3358	3369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314601
45	NC_019740	CGT	2	6	3407	3412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314601
46	NC_019740	CT	3	6	3470	3475	0 %	50 %	0 %	50 %	428314601
47	NC_019740	T	7	7	3483	3489	0 %	100 %	0 %	0 %	428314601
48	NC_019740	T	6	6	3530	3535	0 %	100 %	0 %	0 %	428314601
49	NC_019740	AAC	2	6	3573	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314602
50	NC_019740	TTGA	2	8	3613	3620	25 %	50 %	25 %	0 %	428314602
51	NC_019740	TAGT	2	8	3770	3777	25 %	50 %	25 %	0 %	428314602
52	NC_019740	TGG	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314602
53	NC_019740	AAT	2	6	3874	3879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314602
54	NC_019740	GAT	3	9	3916	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314602
55	NC_019740	GCTT	2	8	3953	3960	0 %	50 %	25 %	25 %	428314602
56	NC_019740	CTA	2	6	4032	4037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314602
57	NC_019740	GGT	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314602
58	NC_019740	TCA	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314603
59	NC_019740	CA	3	6	4423	4428	50 %	0 %	0 %	50 %	428314603
60	NC_019740	ATC	2	6	4466	4471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314603
61	NC_019740	CAA	2	6	4487	4492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314603
62	NC_019740	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314603
63	NC_019740	CCA	2	6	4666	4671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314603
64	NC_019740	T	6	6	4681	4686	0 %	100 %	0 %	0 %	428314603
65	NC_019740	T	7	7	4689	4695	0 %	100 %	0 %	0 %	428314603
66	NC_019740	CGCTAA	2	12	4733	4744	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428314603
67	NC_019740	GAT	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314603
68	NC_019740	TA	3	6	4798	4803	50 %	50 %	0 %	0 %	428314603
69	NC_019740	AGC	2	6	4806	4811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314603
70	NC_019740	ACC	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314603
71	NC_019740	TGT	2	6	4989	4994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314603
72	NC_019740	AG	4	8	5072	5079	50 %	0 %	50 %	0 %	428314603
73	NC_019740	ATG	2	6	5083	5088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314603
74	NC_019740	TAA	2	6	5120	5125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314603
75	NC_019740	T	6	6	5198	5203	0 %	100 %	0 %	0 %	428314603
76	NC_019740	ATTGG	2	10	5208	5217	20 %	40 %	40 %	0 %	428314603
77	NC_019740	GGA	2	6	5251	5256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314603
78	NC_019740	AATT	2	8	5315	5322	50 %	50 %	0 %	0 %	428314603
79	NC_019740	TGA	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314603
80	NC_019740	AGCTAA	2	12	5360	5371	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428314603
81	NC_019740	TC	3	6	5421	5426	0 %	50 %	0 %	50 %	428314603
82	NC_019740	TGA	2	6	5441	5446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314603
83	NC_019740	TTG	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314603
84	NC_019740	CTT	2	6	5527	5532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314603
85	NC_019740	TTG	2	6	5639	5644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314603
86	NC_019740	ACT	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314603
87	NC_019740	AGG	2	6	5710	5715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314603
88	NC_019740	GAG	2	6	5736	5741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314603
89	NC_019740	TTTTCC	2	12	5781	5792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314603
90	NC_019740	TAAA	2	8	5870	5877	75 %	25 %	0 %	0 %	428314603
91	NC_019740	GAAC	2	8	5892	5899	50 %	0 %	25 %	25 %	428314603
92	NC_019740	CCA	2	6	5904	5909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314603
93	NC_019740	ATA	2	6	5918	5923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314603
94	NC_019740	TAA	2	6	5988	5993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314603
95	NC_019740	TTG	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314603
96	NC_019740	TTG	2	6	6080	6085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314603
97	NC_019740	GGC	2	6	6233	6238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314603
98	NC_019740	CAG	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314603
99	NC_019740	CTT	2	6	6250	6255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314603
100	NC_019740	GAG	2	6	6306	6311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314603
101	NC_019740	AGT	2	6	6363	6368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314603
102	NC_019740	T	6	6	6492	6497	0 %	100 %	0 %	0 %	428314603
103	NC_019740	AGCG	2	8	6541	6548	25 %	0 %	50 %	25 %	428314603
104	NC_019740	TGG	2	6	6570	6575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314603
105	NC_019740	CCG	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314603
106	NC_019740	TGA	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314603
107	NC_019740	AG	3	6	6681	6686	50 %	0 %	50 %	0 %	428314603
108	NC_019740	TCG	2	6	6699	6704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314603
109	NC_019740	TTC	2	6	6780	6785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314603
110	NC_019740	TCT	2	6	6843	6848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314603
111	NC_019740	TCT	2	6	6858	6863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314603
112	NC_019740	AAAT	2	8	6869	6876	75 %	25 %	0 %	0 %	428314603
113	NC_019740	CGG	2	6	6934	6939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314603
114	NC_019740	AAT	2	6	6947	6952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314603
115	NC_019740	TTC	2	6	6965	6970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314603
116	NC_019740	TTTG	2	8	6994	7001	0 %	75 %	25 %	0 %	428314603
117	NC_019740	TGC	2	6	7019	7024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314603
118	NC_019740	TTG	2	6	7041	7046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314603
119	NC_019740	A	6	6	7115	7120	100 %	0 %	0 %	0 %	428314603
120	NC_019740	GTG	2	6	7158	7163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314603
121	NC_019740	AGG	2	6	7185	7190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314603
122	NC_019740	GGA	2	6	7195	7200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314603
123	NC_019740	AGC	2	6	7245	7250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314603
124	NC_019740	GTTG	2	8	7267	7274	0 %	50 %	50 %	0 %	428314603
125	NC_019740	GTT	2	6	7276	7281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314603
126	NC_019740	CT	3	6	7301	7306	0 %	50 %	0 %	50 %	428314603
127	NC_019740	T	6	6	7318	7323	0 %	100 %	0 %	0 %	428314603
128	NC_019740	GTC	2	6	7364	7369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314603
129	NC_019740	TTC	3	9	7412	7420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314603
130	NC_019740	CCG	2	6	7465	7470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314603
131	NC_019740	GTTTT	2	10	7490	7499	0 %	80 %	20 %	0 %	428314603
132	NC_019740	CGG	2	6	7554	7559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314603
133	NC_019740	GCGTT	2	10	7605	7614	0 %	40 %	40 %	20 %	428314603
134	NC_019740	ACTG	2	8	7643	7650	25 %	25 %	25 %	25 %	428314603
135	NC_019740	TTC	2	6	7655	7660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314603
136	NC_019740	TTC	2	6	7670	7675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314603
137	NC_019740	TGC	2	6	7676	7681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314603
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139	NC_019740	GAA	2	6	7778	7783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314603
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145	NC_019740	CTT	2	6	8952	8957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314604
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261	NC_019740	GA	3	6	18074	18079	50 %	0 %	50 %	0 %	428314611
262	NC_019740	TAA	2	6	18097	18102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314611
263	NC_019740	AGAA	2	8	18111	18118	75 %	0 %	25 %	0 %	428314611
264	NC_019740	C	6	6	18129	18134	0 %	0 %	0 %	100 %	428314611
265	NC_019740	GTT	2	6	18136	18141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314611
266	NC_019740	TCA	2	6	18190	18195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314611
267	NC_019740	GGAG	2	8	18200	18207	25 %	0 %	75 %	0 %	428314611
268	NC_019740	CCA	2	6	18323	18328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314611
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270	NC_019740	T	6	6	18375	18380	0 %	100 %	0 %	0 %	428314611
271	NC_019740	CA	3	6	18585	18590	50 %	0 %	0 %	50 %	428314612
272	NC_019740	CTTGA	2	10	18630	18639	20 %	40 %	20 %	20 %	428314612
273	NC_019740	TAA	2	6	18868	18873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314612
274	NC_019740	CCCAA	2	10	18890	18899	40 %	0 %	0 %	60 %	428314612
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278	NC_019740	T	6	6	19015	19020	0 %	100 %	0 %	0 %	428314612
279	NC_019740	TTCA	2	8	19107	19114	25 %	50 %	0 %	25 %	428314612
280	NC_019740	GCT	2	6	19265	19270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314613
281	NC_019740	GT	3	6	19291	19296	0 %	50 %	50 %	0 %	428314613
282	NC_019740	CAA	2	6	19512	19517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314613
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294	NC_019740	TGGG	2	8	20176	20183	0 %	25 %	75 %	0 %	428314613
295	NC_019740	AACT	2	8	20190	20197	50 %	25 %	0 %	25 %	428314613
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298	NC_019740	AGA	2	6	20514	20519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314614
299	NC_019740	TGC	2	6	20529	20534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314614
300	NC_019740	TTG	2	6	20537	20542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314614
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384	NC_019740	AATA	2	8	25634	25641	75 %	25 %	0 %	0 %	428314621
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391	NC_019740	TAA	2	6	26092	26097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314621
392	NC_019740	GAT	2	6	26102	26107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314621
393	NC_019740	TCA	2	6	26111	26116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314621
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396	NC_019740	TCT	2	6	26222	26227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314621
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399	NC_019740	ATC	3	9	26455	26463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314621
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405	NC_019740	AATTC	2	10	26795	26804	40 %	40 %	0 %	20 %	428314621
406	NC_019740	T	6	6	26816	26821	0 %	100 %	0 %	0 %	428314622
407	NC_019740	CAAC	2	8	26883	26890	50 %	0 %	0 %	50 %	428314622
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423	NC_019740	TCC	2	6	27880	27885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314623
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432	NC_019740	CAG	2	6	28333	28338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314623
433	NC_019740	TAA	2	6	28359	28364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314623
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