MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 101780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018143	CGCA	2	8	136606	136613	25 %	0 %	25 %	50 %	397671896
3002	NC_018143	ATT	2	6	136617	136622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397671896
3003	NC_018143	TCG	2	6	136632	136637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671896
3004	NC_018143	TTG	2	6	136651	136656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671896
3005	NC_018143	GCG	2	6	136682	136687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671896
3006	NC_018143	GGC	2	6	136724	136729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671896
3007	NC_018143	CGT	2	6	136778	136783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671896
3008	NC_018143	CCG	2	6	136844	136849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671896
3009	NC_018143	TGATGC	2	12	136951	136962	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397671896
3010	NC_018143	CTT	2	6	137091	137096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671896
3011	NC_018143	CGA	2	6	137105	137110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671896
3012	NC_018143	ATC	2	6	137115	137120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671896
3013	NC_018143	GCA	2	6	137131	137136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671896
3014	NC_018143	GGC	2	6	137141	137146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671896
3015	NC_018143	CAA	2	6	137160	137165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671896
3016	NC_018143	ATT	2	6	137203	137208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397671896
3017	NC_018143	CTG	2	6	137333	137338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671897
3018	NC_018143	TG	3	6	137465	137470	0 %	50 %	50 %	0 %	397671897
3019	NC_018143	GGT	2	6	137476	137481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671897
3020	NC_018143	TCG	2	6	137575	137580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671897
3021	NC_018143	GTT	2	6	137743	137748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671897
3022	NC_018143	CGG	2	6	137766	137771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671897
3023	NC_018143	TCA	2	6	137994	137999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671898
3024	NC_018143	TACG	2	8	138020	138027	25 %	25 %	25 %	25 %	397671898
3025	NC_018143	GGC	2	6	138033	138038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671898
3026	NC_018143	GCG	2	6	138059	138064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671898
3027	NC_018143	GAA	2	6	138073	138078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671898
3028	NC_018143	CAG	2	6	138119	138124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671898
3029	NC_018143	TGA	2	6	138141	138146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671898
3030	NC_018143	CAC	2	6	138236	138241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671898
3031	NC_018143	GAC	2	6	138300	138305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671898
3032	NC_018143	CA	3	6	138369	138374	50 %	0 %	0 %	50 %	397671898
3033	NC_018143	CGC	2	6	138379	138384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671898
3034	NC_018143	TGC	2	6	138385	138390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671898
3035	NC_018143	G	6	6	138495	138500	0 %	0 %	100 %	0 %	397671898
3036	NC_018143	CGG	2	6	138552	138557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671899
3037	NC_018143	GAGAT	2	10	138659	138668	40 %	20 %	40 %	0 %	397671899
3038	NC_018143	TCGC	2	8	138675	138682	0 %	25 %	25 %	50 %	397671899
3039	NC_018143	TCGA	2	8	138709	138716	25 %	25 %	25 %	25 %	397671899
3040	NC_018143	TC	3	6	138727	138732	0 %	50 %	0 %	50 %	397671899
3041	NC_018143	GAA	2	6	138733	138738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671899
3042	NC_018143	CGG	2	6	138766	138771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671899
3043	NC_018143	GGT	2	6	138790	138795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671899
3044	NC_018143	CTC	2	6	138833	138838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397671899
3045	NC_018143	TCG	2	6	138856	138861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671899
3046	NC_018143	TGG	3	9	138869	138877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671899
3047	NC_018143	TCG	2	6	138910	138915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671899
3048	NC_018143	GGT	2	6	138979	138984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671899
3049	NC_018143	CGC	2	6	138999	139004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671899
3050	NC_018143	CGG	2	6	139011	139016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671899
3051	NC_018143	GTG	2	6	139054	139059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671899
3052	NC_018143	CGG	2	6	139075	139080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671899
3053	NC_018143	CTT	2	6	139108	139113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671899
3054	NC_018143	CGG	2	6	139122	139127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671899
3055	NC_018143	GTC	2	6	139140	139145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671899
3056	NC_018143	CAA	2	6	139162	139167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671899
3057	NC_018143	GTC	2	6	139174	139179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671899
3058	NC_018143	GACGCG	2	12	139186	139197	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397671899
3059	NC_018143	CACT	2	8	139206	139213	25 %	25 %	0 %	50 %	397671899
3060	NC_018143	TCT	2	6	139245	139250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671899
3061	NC_018143	GTG	2	6	139252	139257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671899
3062	NC_018143	ATG	2	6	139423	139428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671899
3063	NC_018143	CGCA	2	8	139458	139465	25 %	0 %	25 %	50 %	397671899
3064	NC_018143	GGA	2	6	139483	139488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397671899
3065	NC_018143	TG	3	6	139616	139621	0 %	50 %	50 %	0 %	397671899
3066	NC_018143	CGA	2	6	139637	139642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671899
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3068	NC_018143	TGT	2	6	139977	139982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671900
3069	NC_018143	CGA	2	6	140003	140008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671900
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3071	NC_018143	GCT	2	6	140025	140030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671900
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3074	NC_018143	CGC	2	6	140408	140413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671901
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3080	NC_018143	CACC	2	8	140730	140737	25 %	0 %	0 %	75 %	397671901
3081	NC_018143	CGGCG	2	10	140813	140822	0 %	0 %	60 %	40 %	397671901
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3091	NC_018143	ACG	2	6	141504	141509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671902
3092	NC_018143	GGCT	2	8	141574	141581	0 %	25 %	50 %	25 %	397671902
3093	NC_018143	TGA	2	6	141656	141661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671902
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3100	NC_018143	CG	3	6	141975	141980	0 %	0 %	50 %	50 %	397671902
3101	NC_018143	GC	3	6	142075	142080	0 %	0 %	50 %	50 %	397671902
3102	NC_018143	GGCGCT	2	12	142082	142093	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397671902
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3104	NC_018143	CGCTG	2	10	142153	142162	0 %	20 %	40 %	40 %	397671903
3105	NC_018143	GCC	2	6	142306	142311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671903
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3110	NC_018143	GAC	2	6	142447	142452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671903
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3114	NC_018143	GAT	3	9	142752	142760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671903
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3119	NC_018143	TAG	2	6	143005	143010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671903
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3121	NC_018143	CAC	2	6	143038	143043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671903
3122	NC_018143	AGCCGC	2	12	143071	143082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397671903
3123	NC_018143	GCA	2	6	143103	143108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671903
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3126	NC_018143	AGT	2	6	143276	143281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671903
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3236	NC_018143	GCC	2	6	147665	147670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671905
3237	NC_018143	C	6	6	147669	147674	0 %	0 %	0 %	100 %	397671905
3238	NC_018143	CCA	2	6	147682	147687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671905
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3362	NC_018143	TTC	2	6	152490	152495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671911
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3481	NC_018143	GAA	2	6	157587	157592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397671914
3482	NC_018143	GTCG	2	8	157859	157866	0 %	25 %	50 %	25 %	397671915
3483	NC_018143	GCC	3	9	157875	157883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671915
3484	NC_018143	CAC	2	6	158015	158020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671915
3485	NC_018143	GTGC	2	8	158160	158167	0 %	25 %	50 %	25 %	397671915
3486	NC_018143	CGA	2	6	158227	158232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671915
3487	NC_018143	GTCGAG	2	12	158235	158246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397671915
3488	NC_018143	GT	3	6	158264	158269	0 %	50 %	50 %	0 %	397671915
3489	NC_018143	GCCA	2	8	158347	158354	25 %	0 %	25 %	50 %	397671916
3490	NC_018143	GC	4	8	158366	158373	0 %	0 %	50 %	50 %	397671916
3491	NC_018143	CGG	2	6	158434	158439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671916
3492	NC_018143	CAT	2	6	158502	158507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671916
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3494	NC_018143	GC	3	6	158540	158545	0 %	0 %	50 %	50 %	397671916
3495	NC_018143	ACG	2	6	158569	158574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671916
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