MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv chromosome

Total Repeats: 101780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018143	TGG	2	6	23962	23967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671800
502	NC_018143	AC	3	6	24028	24033	50 %	0 %	0 %	50 %	397671800
503	NC_018143	GAT	2	6	24074	24079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671800
504	NC_018143	CGT	2	6	24118	24123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671800
505	NC_018143	CGG	2	6	24148	24153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671800
506	NC_018143	GCC	2	6	24161	24166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671800
507	NC_018143	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	397671800
508	NC_018143	CGTAGT	2	12	24229	24240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397671800
509	NC_018143	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	397671800
510	NC_018143	GAG	2	6	24274	24279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397671800
511	NC_018143	GCC	3	9	24326	24334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671800
512	NC_018143	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	397671800
513	NC_018143	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	397671800
514	NC_018143	CTC	2	6	24455	24460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397671800
515	NC_018143	CCG	2	6	24495	24500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671800
516	NC_018143	GCC	2	6	24512	24517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671800
517	NC_018143	GCC	2	6	24536	24541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671800
518	NC_018143	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	397671800
519	NC_018143	AGG	2	6	24605	24610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397671800
520	NC_018143	GCG	2	6	24625	24630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671800
521	NC_018143	C	6	6	24636	24641	0 %	0 %	0 %	100 %	397671800
522	NC_018143	CCTGGT	2	12	24667	24678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671800
523	NC_018143	GCC	2	6	24821	24826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671800
524	NC_018143	C	6	6	24842	24847	0 %	0 %	0 %	100 %	397671800
525	NC_018143	CCA	2	6	24879	24884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671800
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527	NC_018143	TCG	2	6	24927	24932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671800
528	NC_018143	GCCCCT	2	12	24937	24948	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	397671800
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530	NC_018143	CGA	2	6	25109	25114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671800
531	NC_018143	GAC	2	6	25127	25132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671800
532	NC_018143	ATG	2	6	25254	25259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671800
533	NC_018143	GCC	2	6	25311	25316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671800
534	NC_018143	GCA	2	6	25324	25329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671800
535	NC_018143	GC	3	6	25920	25925	0 %	0 %	50 %	50 %	397671801
536	NC_018143	CGC	2	6	25943	25948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671801
537	NC_018143	TTG	2	6	25949	25954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397671801
538	NC_018143	CGG	2	6	25975	25980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671801
539	NC_018143	CGG	2	6	26017	26022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671801
540	NC_018143	GCA	2	6	26049	26054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671801
541	NC_018143	CTT	2	6	26080	26085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397671801
542	NC_018143	GT	3	6	26154	26159	0 %	50 %	50 %	0 %	397671801
543	NC_018143	GTG	2	6	26199	26204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397671801
544	NC_018143	GTC	2	6	26213	26218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671801
545	NC_018143	GCC	2	6	26226	26231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671801
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547	NC_018143	CGG	2	6	26305	26310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671801
548	NC_018143	CGG	2	6	26326	26331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671801
549	NC_018143	CGG	2	6	26359	26364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671801
550	NC_018143	CG	3	6	26388	26393	0 %	0 %	50 %	50 %	397671801
551	NC_018143	CGA	2	6	26404	26409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671801
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553	NC_018143	GCTC	2	8	26505	26512	0 %	25 %	25 %	50 %	397671801
554	NC_018143	CGG	2	6	26554	26559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671801
555	NC_018143	AGC	2	6	26640	26645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671801
556	NC_018143	TGA	2	6	26671	26676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397671801
557	NC_018143	GCG	2	6	26700	26705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671801
558	NC_018143	CCAA	2	8	26722	26729	50 %	0 %	0 %	50 %	397671801
559	NC_018143	GCC	2	6	26744	26749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671801
560	NC_018143	CAGC	2	8	26788	26795	25 %	0 %	25 %	50 %	397671801
561	NC_018143	CCG	2	6	26799	26804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671801
562	NC_018143	CAC	2	6	26876	26881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671801
563	NC_018143	CAC	2	6	27065	27070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671802
564	NC_018143	CAG	2	6	27113	27118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671802
565	NC_018143	CGC	2	6	27154	27159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671802
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568	NC_018143	GCC	2	6	27218	27223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671802
569	NC_018143	GCT	2	6	27292	27297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671802
570	NC_018143	GCG	2	6	27369	27374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671802
571	NC_018143	CGT	2	6	27385	27390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671802
572	NC_018143	CGGC	2	8	27608	27615	0 %	0 %	50 %	50 %	397671803
573	NC_018143	GGC	2	6	27666	27671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671803
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575	NC_018143	GCC	2	6	27771	27776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671803
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583	NC_018143	CCGG	2	8	28094	28101	0 %	0 %	50 %	50 %	397671803
584	NC_018143	CG	3	6	28133	28138	0 %	0 %	50 %	50 %	397671803
585	NC_018143	GC	3	6	28139	28144	0 %	0 %	50 %	50 %	397671803
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589	NC_018143	GC	3	6	28292	28297	0 %	0 %	50 %	50 %	397671803
590	NC_018143	TCG	2	6	28316	28321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671803
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592	NC_018143	GCA	2	6	28356	28361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671803
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595	NC_018143	CTG	2	6	28464	28469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671804
596	NC_018143	GGC	2	6	28538	28543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671804
597	NC_018143	CTG	2	6	28552	28557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671804
598	NC_018143	TCA	2	6	28585	28590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397671804
599	NC_018143	CGG	2	6	28620	28625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671804
600	NC_018143	CGA	2	6	28643	28648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671804
601	NC_018143	GCTC	2	8	28650	28657	0 %	25 %	25 %	50 %	397671804
602	NC_018143	ACC	2	6	28662	28667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671804
603	NC_018143	CGT	2	6	28710	28715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671804
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605	NC_018143	CGA	2	6	28758	28763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671804
606	NC_018143	ACG	2	6	28769	28774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671804
607	NC_018143	GGC	2	6	28781	28786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397671804
608	NC_018143	TGCG	2	8	28789	28796	0 %	25 %	50 %	25 %	397671804
609	NC_018143	CGC	2	6	28886	28891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671804
610	NC_018143	CAC	2	6	29003	29008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397671804
611	NC_018143	CCGG	2	8	29054	29061	0 %	0 %	50 %	50 %	397671804
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613	NC_018143	GTC	2	6	29118	29123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671804
614	NC_018143	CAA	2	6	29168	29173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397671804
615	NC_018143	GGCAA	2	10	29301	29310	40 %	0 %	40 %	20 %	397671805
616	NC_018143	ACG	2	6	29312	29317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671805
617	NC_018143	GC	3	6	29360	29365	0 %	0 %	50 %	50 %	397671805
618	NC_018143	CGTC	2	8	29385	29392	0 %	25 %	25 %	50 %	397671805
619	NC_018143	CG	3	6	29422	29427	0 %	0 %	50 %	50 %	397671805
620	NC_018143	GGATCA	2	12	29433	29444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397671805
621	NC_018143	AGC	2	6	29501	29506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397671805
622	NC_018143	GTC	2	6	29521	29526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397671805
623	NC_018143	GCC	3	9	29527	29535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671805
624	NC_018143	CACG	2	8	29745	29752	25 %	0 %	25 %	50 %	397671806
625	NC_018143	ACCG	2	8	29826	29833	25 %	0 %	25 %	50 %	397671806
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627	NC_018143	CGC	2	6	29955	29960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397671806
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