MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 101098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018078	CCG	2	6	161021	161026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430544
3502	NC_018078	GC	3	6	161149	161154	0 %	0 %	50 %	50 %	392430545
3503	NC_018078	CCGCA	2	10	161244	161253	20 %	0 %	20 %	60 %	392430545
3504	NC_018078	GTT	2	6	161265	161270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430545
3505	NC_018078	CGA	2	6	161273	161278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430545
3506	NC_018078	CCA	2	6	161286	161291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430545
3507	NC_018078	CGG	2	6	161301	161306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430545
3508	NC_018078	CGCGG	2	10	161323	161332	0 %	0 %	60 %	40 %	392430545
3509	NC_018078	CGG	2	6	161340	161345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430545
3510	NC_018078	GGC	2	6	161346	161351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430545
3511	NC_018078	CGC	2	6	161386	161391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430545
3512	NC_018078	CG	3	6	161452	161457	0 %	0 %	50 %	50 %	392430545
3513	NC_018078	TGA	2	6	161468	161473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430545
3514	NC_018078	GAA	2	6	161488	161493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430545
3515	NC_018078	GCC	2	6	161509	161514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430545
3516	NC_018078	CCA	2	6	161618	161623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430545
3517	NC_018078	CTA	2	6	161640	161645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430545
3518	NC_018078	CGGTT	2	10	161650	161659	0 %	40 %	40 %	20 %	392430545
3519	NC_018078	GCC	2	6	161697	161702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430545
3520	NC_018078	GCCGG	2	10	162111	162120	0 %	0 %	60 %	40 %	392430546
3521	NC_018078	CGG	2	6	162130	162135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430546
3522	NC_018078	TGG	2	6	162165	162170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430546
3523	NC_018078	GCC	2	6	162198	162203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430546
3524	NC_018078	GCGCG	2	10	162233	162242	0 %	0 %	60 %	40 %	392430546
3525	NC_018078	TGG	2	6	162340	162345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430546
3526	NC_018078	TCA	2	6	162373	162378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430546
3527	NC_018078	GGGT	2	8	162567	162574	0 %	25 %	75 %	0 %	392430546
3528	NC_018078	GAC	2	6	162600	162605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430546
3529	NC_018078	GGT	2	6	162661	162666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430546
3530	NC_018078	TGC	2	6	162691	162696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430546
3531	NC_018078	GCTG	2	8	162697	162704	0 %	25 %	50 %	25 %	392430546
3532	NC_018078	ACG	2	6	162718	162723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430546
3533	NC_018078	CTG	2	6	162786	162791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430546
3534	NC_018078	TCG	2	6	162856	162861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430546
3535	NC_018078	AGC	2	6	162862	162867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430546
3536	NC_018078	GTGC	2	8	162891	162898	0 %	25 %	50 %	25 %	392430546
3537	NC_018078	AGC	2	6	162919	162924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430546
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3539	NC_018078	CGA	2	6	162950	162955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430547
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3541	NC_018078	CAG	2	6	163092	163097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430547
3542	NC_018078	GCT	2	6	163106	163111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430547
3543	NC_018078	GCG	2	6	163138	163143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430547
3544	NC_018078	CCG	2	6	163184	163189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430547
3545	NC_018078	GCC	2	6	163267	163272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430547
3546	NC_018078	GGT	2	6	163398	163403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430547
3547	NC_018078	CGA	2	6	163475	163480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430547
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3549	NC_018078	CTG	2	6	163499	163504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430547
3550	NC_018078	GTC	2	6	163634	163639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430548
3551	NC_018078	CCG	2	6	163641	163646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430548
3552	NC_018078	CGG	2	6	163677	163682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430548
3553	NC_018078	GTT	2	6	163696	163701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430548
3554	NC_018078	GTG	2	6	163718	163723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430548
3555	NC_018078	GCT	2	6	163735	163740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430548
3556	NC_018078	GTG	2	6	163805	163810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430548
3557	NC_018078	CAGG	2	8	163831	163838	25 %	0 %	50 %	25 %	392430548
3558	NC_018078	CAG	2	6	163846	163851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430548
3559	NC_018078	GAG	2	6	163856	163861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430548
3560	NC_018078	CGA	2	6	163927	163932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430548
3561	NC_018078	CGG	3	9	163937	163945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430548
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3564	NC_018078	CAT	2	6	163999	164004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430548
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3569	NC_018078	CCG	2	6	164156	164161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430548
3570	NC_018078	GGC	2	6	164185	164190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430548
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3572	NC_018078	GGC	2	6	164250	164255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430548
3573	NC_018078	TGC	2	6	164343	164348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430548
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3579	NC_018078	GCT	2	6	164410	164415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430548
3580	NC_018078	GCC	2	6	164417	164422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430548
3581	NC_018078	CGG	2	6	164436	164441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430548
3582	NC_018078	CTGGG	2	10	164447	164456	0 %	20 %	60 %	20 %	392430548
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3585	NC_018078	GCG	2	6	164540	164545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430548
3586	NC_018078	TCG	2	6	164590	164595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430548
3587	NC_018078	TGG	2	6	164767	164772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430548
3588	NC_018078	CGC	2	6	164780	164785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430548
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3590	NC_018078	TGC	2	6	164826	164831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430548
3591	NC_018078	TGC	2	6	164838	164843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430548
3592	NC_018078	ACC	2	6	164861	164866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430548
3593	NC_018078	GAG	2	6	164895	164900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430548
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3596	NC_018078	GCCGG	2	10	165040	165049	0 %	0 %	60 %	40 %	392430549
3597	NC_018078	CCGG	2	8	165125	165132	0 %	0 %	50 %	50 %	392430549
3598	NC_018078	CAC	2	6	165145	165150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430549
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3601	NC_018078	GAA	3	9	165301	165309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430549
3602	NC_018078	CAG	2	6	165313	165318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430549
3603	NC_018078	GAT	2	6	165349	165354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430549
3604	NC_018078	GCGT	2	8	165368	165375	0 %	25 %	50 %	25 %	392430549
3605	NC_018078	CGC	2	6	165411	165416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430549
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3609	NC_018078	CG	3	6	165664	165669	0 %	0 %	50 %	50 %	392430550
3610	NC_018078	GCA	2	6	165686	165691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430550
3611	NC_018078	CGG	2	6	165724	165729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430550
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3981	NC_018078	GTC	2	6	181653	181658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430566
3982	NC_018078	TCA	2	6	181663	181668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430566
3983	NC_018078	GCA	2	6	181688	181693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430566
3984	NC_018078	CGG	2	6	181732	181737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430566
3985	NC_018078	GAC	2	6	181750	181755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430566
3986	NC_018078	CGGC	2	8	181801	181808	0 %	0 %	50 %	50 %	392430566
3987	NC_018078	GTC	2	6	181809	181814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430566
3988	NC_018078	GGC	2	6	181817	181822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430566
3989	NC_018078	GCC	2	6	181844	181849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430566
3990	NC_018078	TGCGGT	2	12	181860	181871	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392430566
3991	NC_018078	CCG	2	6	181932	181937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430567
3992	NC_018078	TCG	2	6	181997	182002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430567
3993	NC_018078	GTC	2	6	182059	182064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430567
3994	NC_018078	CGG	2	6	182073	182078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430567
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3999	NC_018078	ACG	2	6	182261	182266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430567
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