MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 chromosome

Total Repeats: 143386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018027	ACC	2	6	613	618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413906
2	NC_018027	TCG	2	6	621	626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
3	NC_018027	AAC	2	6	635	640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392413906
4	NC_018027	GTC	2	6	641	646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
5	NC_018027	CGG	2	6	664	669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413906
6	NC_018027	GCA	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
7	NC_018027	GC	3	6	700	705	0 %	0 %	50 %	50 %	392413906
8	NC_018027	CGTC	2	8	718	725	0 %	25 %	25 %	50 %	392413906
9	NC_018027	GCT	2	6	751	756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
10	NC_018027	TCG	2	6	813	818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
11	NC_018027	GCC	2	6	828	833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
12	NC_018027	CGCC	2	8	879	886	0 %	0 %	25 %	75 %	392413906
13	NC_018027	CGA	2	6	892	897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
14	NC_018027	GAC	3	9	950	958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
15	NC_018027	CGA	3	9	961	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
16	NC_018027	GAG	2	6	992	997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413906
17	NC_018027	CG	3	6	1022	1027	0 %	0 %	50 %	50 %	392413906
18	NC_018027	TCGA	2	8	1037	1044	25 %	25 %	25 %	25 %	392413906
19	NC_018027	TCAACC	2	12	1059	1070	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	392413906
20	NC_018027	CGC	2	6	1123	1128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
21	NC_018027	CTG	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
22	NC_018027	CGG	2	6	1221	1226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413906
23	NC_018027	TCA	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392413906
24	NC_018027	CCG	2	6	1321	1326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
25	NC_018027	CG	3	6	1325	1330	0 %	0 %	50 %	50 %	392413906
26	NC_018027	TGC	2	6	1362	1367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
27	NC_018027	CGA	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
28	NC_018027	TTC	2	6	1418	1423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413906
29	NC_018027	CCGC	2	8	1477	1484	0 %	0 %	25 %	75 %	392413906
30	NC_018027	AAG	2	6	1592	1597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413906
31	NC_018027	CGA	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
32	NC_018027	TCGA	2	8	1727	1734	25 %	25 %	25 %	25 %	392413906
33	NC_018027	TGC	2	6	1755	1760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413906
34	NC_018027	GATCT	2	10	1763	1772	20 %	40 %	20 %	20 %	392413906
35	NC_018027	CCA	2	6	1779	1784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413906
36	NC_018027	GCC	2	6	1814	1819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
37	NC_018027	CCG	2	6	1821	1826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
38	NC_018027	CGA	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413906
39	NC_018027	CG	4	8	1872	1879	0 %	0 %	50 %	50 %	392413906
40	NC_018027	TC	3	6	1930	1935	0 %	50 %	0 %	50 %	392413906
41	NC_018027	GAA	2	6	1993	1998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413906
42	NC_018027	CGC	2	6	2021	2026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413906
43	NC_018027	CAC	2	6	2053	2058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413906
44	NC_018027	GC	3	6	2071	2076	0 %	0 %	50 %	50 %	392413906
45	NC_018027	CGA	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413907
46	NC_018027	GC	3	6	2754	2759	0 %	0 %	50 %	50 %	392413907
47	NC_018027	TGC	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
48	NC_018027	CTG	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
49	NC_018027	CGA	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413907
50	NC_018027	GGTCGC	2	12	3116	3127	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392413907
51	NC_018027	GCCG	2	8	3129	3136	0 %	0 %	50 %	50 %	392413907
52	NC_018027	GAC	2	6	3138	3143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413907
53	NC_018027	GCC	2	6	3201	3206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413907
54	NC_018027	ACCG	2	8	3207	3214	25 %	0 %	25 %	50 %	392413907
55	NC_018027	GGC	2	6	3305	3310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413907
56	NC_018027	AGG	2	6	3373	3378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413907
57	NC_018027	CTG	2	6	3381	3386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
58	NC_018027	GCA	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413907
59	NC_018027	GCT	2	6	3455	3460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
60	NC_018027	TGC	2	6	3580	3585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
61	NC_018027	CGGC	2	8	3592	3599	0 %	0 %	50 %	50 %	392413907
62	NC_018027	CGA	2	6	3602	3607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413907
63	NC_018027	GAG	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413907
64	NC_018027	CAC	2	6	3734	3739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413907
65	NC_018027	GCC	2	6	3745	3750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413907
66	NC_018027	CGG	2	6	3751	3756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413907
67	NC_018027	CCG	2	6	3766	3771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413907
68	NC_018027	TGC	2	6	3782	3787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413907
69	NC_018027	TGG	2	6	3797	3802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413907
70	NC_018027	GATCG	2	10	3865	3874	20 %	20 %	40 %	20 %	392413907
71	NC_018027	TCG	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413908
72	NC_018027	CGG	2	6	3957	3962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413908
73	NC_018027	GC	3	6	4031	4036	0 %	0 %	50 %	50 %	392413908
74	NC_018027	C	6	6	4043	4048	0 %	0 %	0 %	100 %	392413908
75	NC_018027	CGT	2	6	4050	4055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413908
76	NC_018027	TCG	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413908
77	NC_018027	CGG	2	6	4272	4277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413908
78	NC_018027	C	6	6	4327	4332	0 %	0 %	0 %	100 %	392413908
79	NC_018027	GGA	2	6	4341	4346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413908
80	NC_018027	TGA	2	6	4421	4426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413908
81	NC_018027	CTG	2	6	4450	4455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413908
82	NC_018027	GCC	2	6	4456	4461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413908
83	NC_018027	GCA	2	6	4533	4538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413908
84	NC_018027	GAG	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413908
85	NC_018027	CG	3	6	4680	4685	0 %	0 %	50 %	50 %	392413908
86	NC_018027	CGC	2	6	4728	4733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413908
87	NC_018027	CGG	2	6	4749	4754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413908
88	NC_018027	TCG	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
89	NC_018027	TCG	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
90	NC_018027	GC	3	6	4999	5004	0 %	0 %	50 %	50 %	392413909
91	NC_018027	GGT	2	6	5005	5010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413909
92	NC_018027	TCG	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
93	NC_018027	ACG	2	6	5028	5033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413909
94	NC_018027	CGGG	2	8	5068	5075	0 %	0 %	75 %	25 %	392413909
95	NC_018027	GC	3	6	5114	5119	0 %	0 %	50 %	50 %	392413909
96	NC_018027	TGC	2	6	5133	5138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
97	NC_018027	GC	3	6	5137	5142	0 %	0 %	50 %	50 %	392413909
98	NC_018027	GTT	2	6	5146	5151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392413909
99	NC_018027	CGA	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413909
100	NC_018027	CCA	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413909
101	NC_018027	CGC	2	6	5242	5247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413909
102	NC_018027	GGT	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413909
103	NC_018027	CGC	2	6	5395	5400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413909
104	NC_018027	CTG	2	6	5453	5458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
105	NC_018027	CGC	2	6	5476	5481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413909
106	NC_018027	GGT	2	6	5506	5511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392413909
107	NC_018027	GGC	2	6	5521	5526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413909
108	NC_018027	GCC	2	6	5558	5563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413909
109	NC_018027	GTCT	2	8	5612	5619	0 %	50 %	25 %	25 %	392413909
110	NC_018027	ACCGC	2	10	5626	5635	20 %	0 %	20 %	60 %	392413909
111	NC_018027	GAT	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392413909
112	NC_018027	GGC	2	6	5725	5730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413909
113	NC_018027	GC	3	6	5743	5748	0 %	0 %	50 %	50 %	392413909
114	NC_018027	GGAG	2	8	5749	5756	25 %	0 %	75 %	0 %	392413909
115	NC_018027	TGC	2	6	5769	5774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413909
116	NC_018027	CGA	2	6	5776	5781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413909
117	NC_018027	GCG	2	6	5806	5811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413909
118	NC_018027	GCG	2	6	5813	5818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413909
119	NC_018027	CGG	2	6	5862	5867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413909
120	NC_018027	ACG	2	6	5871	5876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413909
121	NC_018027	CGC	2	6	5883	5888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413909
122	NC_018027	CGTCG	2	10	5900	5909	0 %	20 %	40 %	40 %	392413909
123	NC_018027	CGA	3	9	5964	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413910
124	NC_018027	CCG	2	6	5984	5989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413910
125	NC_018027	CGC	2	6	5999	6004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413910
126	NC_018027	GCG	2	6	6042	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413910
127	NC_018027	GGA	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413910
128	NC_018027	GC	3	6	6061	6066	0 %	0 %	50 %	50 %	392413910
129	NC_018027	CGG	2	6	6124	6129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413910
130	NC_018027	CGG	3	9	6145	6153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413910
131	NC_018027	CGGGGC	2	12	6158	6169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413910
132	NC_018027	ACC	2	6	6173	6178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413910
133	NC_018027	CG	3	6	6239	6244	0 %	0 %	50 %	50 %	392413910
134	NC_018027	GC	3	6	6273	6278	0 %	0 %	50 %	50 %	392413910
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256	NC_018027	GCG	2	6	10983	10988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413912
257	NC_018027	GAC	2	6	11021	11026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413912
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259	NC_018027	TTC	2	6	11072	11077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392413912
260	NC_018027	GC	3	6	11138	11143	0 %	0 %	50 %	50 %	392413912
261	NC_018027	CTG	2	6	11162	11167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413912
262	NC_018027	GAG	2	6	11180	11185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392413912
263	NC_018027	GAA	2	6	11263	11268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392413912
264	NC_018027	CGG	2	6	11302	11307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413912
265	NC_018027	GCGACG	2	12	11328	11339	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392413912
266	NC_018027	GAC	2	6	11372	11377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413912
267	NC_018027	CTG	3	9	11378	11386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413912
268	NC_018027	CGA	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413912
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271	NC_018027	CTG	2	6	11498	11503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413912
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273	NC_018027	CTG	2	6	11534	11539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392413912
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301	NC_018027	CGG	2	6	12564	12569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413913
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380	NC_018027	CCG	2	6	15909	15914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392413918
381	NC_018027	TCC	2	6	15943	15948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392413918
382	NC_018027	CCA	2	6	15969	15974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392413918
383	NC_018027	GC	3	6	16021	16026	0 %	0 %	50 %	50 %	392413918
384	NC_018027	G	6	6	16087	16092	0 %	0 %	100 %	0 %	392413918
385	NC_018027	GAC	2	6	16125	16130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392413918
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499	NC_018027	GGTCG	2	10	20420	20429	0 %	20 %	60 %	20 %	392413923
500	NC_018027	CGG	2	6	20431	20436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392413923

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