MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.01

Total Repeats: 12263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018022	TGGA	2	8	176847	176854	25 %	25 %	50 %	0 %	392405893
3502	NC_018022	CGA	2	6	176926	176931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405893
3503	NC_018022	CG	3	6	176973	176978	0 %	0 %	50 %	50 %	392405893
3504	NC_018022	CTT	2	6	176995	177000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405893
3505	NC_018022	CG	3	6	177035	177040	0 %	0 %	50 %	50 %	392405893
3506	NC_018022	GGT	2	6	177055	177060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405893
3507	NC_018022	CGCA	2	8	177085	177092	25 %	0 %	25 %	50 %	392405893
3508	NC_018022	CAG	2	6	177192	177197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405893
3509	NC_018022	GCA	2	6	177236	177241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405893
3510	NC_018022	T	6	6	177268	177273	0 %	100 %	0 %	0 %	392405893
3511	NC_018022	AG	3	6	177332	177337	50 %	0 %	50 %	0 %	392405894
3512	NC_018022	CTT	2	6	177351	177356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405894
3513	NC_018022	CTC	2	6	177364	177369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405894
3514	NC_018022	GC	3	6	177401	177406	0 %	0 %	50 %	50 %	392405894
3515	NC_018022	TCT	2	6	177413	177418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405894
3516	NC_018022	TCCG	2	8	177433	177440	0 %	25 %	25 %	50 %	392405894
3517	NC_018022	TCG	2	6	177443	177448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405894
3518	NC_018022	GAA	2	6	177504	177509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405894
3519	NC_018022	TCGTA	2	10	177572	177581	20 %	40 %	20 %	20 %	392405894
3520	NC_018022	CAT	2	6	177588	177593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405894
3521	NC_018022	AG	3	6	177718	177723	50 %	0 %	50 %	0 %	392405894
3522	NC_018022	TCG	2	6	177745	177750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405894
3523	NC_018022	AG	3	6	177759	177764	50 %	0 %	50 %	0 %	392405894
3524	NC_018022	GGA	2	6	177791	177796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405894
3525	NC_018022	TTG	2	6	177852	177857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405894
3526	NC_018022	GCA	2	6	177938	177943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405894
3527	NC_018022	GGCTG	2	10	178014	178023	0 %	20 %	60 %	20 %	392405894
3528	NC_018022	TCC	2	6	178114	178119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405894
3529	NC_018022	TAAT	2	8	178123	178130	50 %	50 %	0 %	0 %	392405894
3530	NC_018022	GAA	2	6	178179	178184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405894
3531	NC_018022	CGAC	2	8	178222	178229	25 %	0 %	25 %	50 %	392405894
3532	NC_018022	GCT	2	6	178239	178244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405894
3533	NC_018022	CTTA	2	8	178412	178419	25 %	50 %	0 %	25 %	392405894
3534	NC_018022	CAA	2	6	178461	178466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405894
3535	NC_018022	CGA	2	6	178469	178474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405894
3536	NC_018022	GC	3	6	178484	178489	0 %	0 %	50 %	50 %	392405894
3537	NC_018022	AGC	2	6	178549	178554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405894
3538	NC_018022	CAA	2	6	178674	178679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405894
3539	NC_018022	GAG	2	6	178707	178712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405894
3540	NC_018022	CGA	2	6	178735	178740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405894
3541	NC_018022	CGG	2	6	178744	178749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405894
3542	NC_018022	GGA	2	6	178757	178762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405894
3543	NC_018022	CTG	2	6	178773	178778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405894
3544	NC_018022	GC	4	8	178819	178826	0 %	0 %	50 %	50 %	392405894
3545	NC_018022	GGT	2	6	178873	178878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405894
3546	NC_018022	GACA	2	8	178880	178887	50 %	0 %	25 %	25 %	392405894
3547	NC_018022	GTC	2	6	178892	178897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405894
3548	NC_018022	TGA	2	6	179517	179522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405895
3549	NC_018022	CCG	2	6	179538	179543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3550	NC_018022	TACCTG	2	12	179552	179563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392405895
3551	NC_018022	GCC	2	6	179579	179584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3552	NC_018022	ACT	3	9	179619	179627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405895
3553	NC_018022	GAG	2	6	179720	179725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405895
3554	NC_018022	GC	3	6	179770	179775	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3555	NC_018022	GGGT	2	8	179784	179791	0 %	25 %	75 %	0 %	392405895
3556	NC_018022	CAGC	2	8	179845	179852	25 %	0 %	25 %	50 %	392405895
3557	NC_018022	GC	3	6	179851	179856	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3558	NC_018022	GCC	2	6	179862	179867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3559	NC_018022	CG	3	6	179908	179913	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3560	NC_018022	CCA	2	6	179970	179975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405895
3561	NC_018022	CG	3	6	179990	179995	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3562	NC_018022	GTT	2	6	180022	180027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405895
3563	NC_018022	GAG	2	6	180032	180037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405895
3564	NC_018022	GCC	2	6	180042	180047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3565	NC_018022	CGCC	3	12	180044	180055	0 %	0 %	25 %	75 %	392405895
3566	NC_018022	GAT	2	6	180056	180061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405895
3567	NC_018022	CG	3	6	180095	180100	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3568	NC_018022	ACC	2	6	180104	180109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405895
3569	NC_018022	AGC	2	6	180202	180207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405895
3570	NC_018022	GCG	2	6	180215	180220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405895
3571	NC_018022	CGC	2	6	180313	180318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3572	NC_018022	CACC	2	8	180325	180332	25 %	0 %	0 %	75 %	392405895
3573	NC_018022	CGC	2	6	180416	180421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3574	NC_018022	ACA	2	6	180480	180485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405895
3575	NC_018022	TCG	2	6	180528	180533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405895
3576	NC_018022	CG	3	6	180540	180545	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3577	NC_018022	GCGG	2	8	180556	180563	0 %	0 %	75 %	25 %	392405895
3578	NC_018022	CGG	2	6	180585	180590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405895
3579	NC_018022	GGT	2	6	180603	180608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405895
3580	NC_018022	GC	3	6	180616	180621	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3581	NC_018022	GCC	2	6	180638	180643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3582	NC_018022	ATC	2	6	180698	180703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405895
3583	NC_018022	CAG	2	6	180713	180718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405895
3584	NC_018022	CG	3	6	180732	180737	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3585	NC_018022	AGC	2	6	180768	180773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405895
3586	NC_018022	CAC	2	6	180812	180817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405895
3587	NC_018022	CCGCA	2	10	180849	180858	20 %	0 %	20 %	60 %	392405895
3588	NC_018022	ACC	2	6	180860	180865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405895
3589	NC_018022	CGA	2	6	180883	180888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405895
3590	NC_018022	TCGCG	2	10	180897	180906	0 %	20 %	40 %	40 %	392405895
3591	NC_018022	CCA	2	6	180958	180963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405895
3592	NC_018022	GC	3	6	180967	180972	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3593	NC_018022	ACG	2	6	180999	181004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405895
3594	NC_018022	CGCCGA	2	12	181084	181095	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392405895
3595	NC_018022	CGC	2	6	181121	181126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3596	NC_018022	CCG	2	6	181144	181149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3597	NC_018022	GCG	2	6	181244	181249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405895
3598	NC_018022	G	7	7	181282	181288	0 %	0 %	100 %	0 %	392405895
3599	NC_018022	CCGG	2	8	181367	181374	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3600	NC_018022	GGC	2	6	181396	181401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405895
3601	NC_018022	GGC	2	6	181427	181432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405895
3602	NC_018022	CCG	2	6	181455	181460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3603	NC_018022	GGA	2	6	181480	181485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405895
3604	NC_018022	CGA	2	6	181606	181611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405895
3605	NC_018022	GCC	2	6	181622	181627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3606	NC_018022	CTC	2	6	181708	181713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405895
3607	NC_018022	CGGC	2	8	181719	181726	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3608	NC_018022	GTG	2	6	181778	181783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405895
3609	NC_018022	CGCC	2	8	181794	181801	0 %	0 %	25 %	75 %	392405895
3610	NC_018022	CCGG	2	8	181838	181845	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3611	NC_018022	CGA	2	6	181888	181893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405895
3612	NC_018022	CCG	3	9	181896	181904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3613	NC_018022	GC	3	6	181924	181929	0 %	0 %	50 %	50 %	392405895
3614	NC_018022	GCC	2	6	181937	181942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405895
3615	NC_018022	CCA	2	6	181968	181973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405895
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3617	NC_018022	TCGCC	2	10	182014	182023	0 %	20 %	20 %	60 %	392405895
3618	NC_018022	AAC	2	6	182111	182116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405895
3619	NC_018022	CGG	2	6	182117	182122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405895
3620	NC_018022	CCTG	2	8	182182	182189	0 %	25 %	25 %	50 %	392405895
3621	NC_018022	GGC	2	6	182192	182197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405895
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3623	NC_018022	CCA	2	6	182283	182288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405895
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3775	NC_018022	TGC	2	6	189437	189442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405898
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3851	NC_018022	GCAGC	2	10	194106	194115	20 %	0 %	40 %	40 %	392405903
3852	NC_018022	CGC	2	6	194175	194180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405903
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3857	NC_018022	C	6	6	194381	194386	0 %	0 %	0 %	100 %	392405903
3858	NC_018022	ACACAG	2	12	194406	194417	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	392405903
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3985	NC_018022	TGA	2	6	199504	199509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405907
3986	NC_018022	GAT	2	6	199524	199529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405907
3987	NC_018022	CG	3	6	199555	199560	0 %	0 %	50 %	50 %	392405907
3988	NC_018022	GTC	2	6	199599	199604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405907
3989	NC_018022	TCG	2	6	199681	199686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405907
3990	NC_018022	CGC	2	6	199698	199703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405907
3991	NC_018022	AGC	2	6	199735	199740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405907
3992	NC_018022	GCA	2	6	199814	199819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405907
3993	NC_018022	CGG	2	6	199898	199903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405907
3994	NC_018022	CCT	2	6	199916	199921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405907
3995	NC_018022	GGT	2	6	199977	199982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405907
3996	NC_018022	CGTG	2	8	200021	200028	0 %	25 %	50 %	25 %	392405907
3997	NC_018022	GCC	2	6	200052	200057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405907
3998	NC_018022	GCA	2	6	200060	200065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405907
3999	NC_018022	TTC	2	6	200140	200145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405907
4000	NC_018022	CGG	2	6	200149	200154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405907

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