MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.01

Total Repeats: 12263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018022	CGC	2	6	311699	311704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405988
6002	NC_018022	CGA	2	6	311738	311743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405988
6003	NC_018022	CGC	2	6	311747	311752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405988
6004	NC_018022	CG	3	6	311898	311903	0 %	0 %	50 %	50 %	392405988
6005	NC_018022	CCGACT	2	12	311908	311919	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392405988
6006	NC_018022	CTAC	2	8	311933	311940	25 %	25 %	0 %	50 %	392405988
6007	NC_018022	ACAG	2	8	311959	311966	50 %	0 %	25 %	25 %	392405988
6008	NC_018022	CG	3	6	312011	312016	0 %	0 %	50 %	50 %	392405988
6009	NC_018022	CCAA	2	8	312070	312077	50 %	0 %	0 %	50 %	392405988
6010	NC_018022	CCG	2	6	312151	312156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405988
6011	NC_018022	CTC	2	6	312177	312182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405988
6012	NC_018022	CCA	2	6	312211	312216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405988
6013	NC_018022	TCG	2	6	312223	312228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405988
6014	NC_018022	TCCTGC	2	12	312241	312252	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	392405988
6015	NC_018022	GC	4	8	312251	312258	0 %	0 %	50 %	50 %	392405988
6016	NC_018022	CCTC	2	8	312307	312314	0 %	25 %	0 %	75 %	392405988
6017	NC_018022	TCA	2	6	312385	312390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405988
6018	NC_018022	TCG	2	6	312394	312399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405988
6019	NC_018022	ACA	2	6	312415	312420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405988
6020	NC_018022	TGC	2	6	312421	312426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405988
6021	NC_018022	GAA	2	6	312444	312449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405988
6022	NC_018022	CGG	2	6	312452	312457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405988
6023	NC_018022	TCA	2	6	312505	312510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405988
6024	NC_018022	CGC	2	6	312530	312535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405988
6025	NC_018022	CAT	2	6	312569	312574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405988
6026	NC_018022	TCA	2	6	312589	312594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405988
6027	NC_018022	GCT	2	6	312605	312610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405988
6028	NC_018022	TCG	2	6	312622	312627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405988
6029	NC_018022	TGG	2	6	312678	312683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405988
6030	NC_018022	ACA	2	6	312701	312706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392405988
6031	NC_018022	CTC	2	6	312711	312716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405988
6032	NC_018022	CGG	2	6	312727	312732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405988
6033	NC_018022	CGG	2	6	313177	313182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405989
6034	NC_018022	TGC	2	6	313197	313202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405989
6035	NC_018022	GGGTG	2	10	313295	313304	0 %	20 %	80 %	0 %	392405989
6036	NC_018022	AC	3	6	313315	313320	50 %	0 %	0 %	50 %	392405989
6037	NC_018022	GA	3	6	313321	313326	50 %	0 %	50 %	0 %	392405989
6038	NC_018022	CG	3	6	313333	313338	0 %	0 %	50 %	50 %	392405989
6039	NC_018022	TGT	2	6	313347	313352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392405989
6040	NC_018022	TCC	2	6	313362	313367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405989
6041	NC_018022	GTG	2	6	313377	313382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405989
6042	NC_018022	GC	3	6	313417	313422	0 %	0 %	50 %	50 %	392405989
6043	NC_018022	GCG	3	9	313435	313443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405989
6044	NC_018022	GAG	2	6	313526	313531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405989
6045	NC_018022	TGG	2	6	313557	313562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405989
6046	NC_018022	AGA	2	6	313563	313568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405989
6047	NC_018022	GCCGG	2	10	313634	313643	0 %	0 %	60 %	40 %	392405989
6048	NC_018022	GA	3	6	313798	313803	50 %	0 %	50 %	0 %	392405989
6049	NC_018022	CCT	2	6	313813	313818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405989
6050	NC_018022	CCG	2	6	313832	313837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405989
6051	NC_018022	GCG	2	6	313846	313851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405989
6052	NC_018022	CGA	2	6	313878	313883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405989
6053	NC_018022	GCCG	2	8	313896	313903	0 %	0 %	50 %	50 %	392405989
6054	NC_018022	CGC	2	6	313922	313927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405989
6055	NC_018022	TGC	2	6	313929	313934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405989
6056	NC_018022	CAC	2	6	313943	313948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405989
6057	NC_018022	CGA	2	6	313966	313971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405989
6058	NC_018022	GCC	2	6	313983	313988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405989
6059	NC_018022	GGC	2	6	313990	313995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405989
6060	NC_018022	CCG	2	6	314037	314042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405989
6061	NC_018022	TCG	2	6	314061	314066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405989
6062	NC_018022	CGA	2	6	314134	314139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405989
6063	NC_018022	GGT	2	6	314147	314152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405989
6064	NC_018022	TGTGGC	2	12	314157	314168	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392405989
6065	NC_018022	AACG	2	8	314228	314235	50 %	0 %	25 %	25 %	392405989
6066	NC_018022	TGG	2	6	314259	314264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405989
6067	NC_018022	CA	3	6	314285	314290	50 %	0 %	0 %	50 %	392405989
6068	NC_018022	GCT	3	9	314311	314319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405989
6069	NC_018022	CG	3	6	314333	314338	0 %	0 %	50 %	50 %	392405989
6070	NC_018022	TGA	2	6	314364	314369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405989
6071	NC_018022	CAG	2	6	314372	314377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405989
6072	NC_018022	GCT	2	6	314386	314391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405989
6073	NC_018022	TGC	2	6	314560	314565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405989
6074	NC_018022	GCC	2	6	314782	314787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405990
6075	NC_018022	TCA	2	6	314855	314860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405990
6076	NC_018022	CGGAC	2	10	314955	314964	20 %	0 %	40 %	40 %	392405990
6077	NC_018022	GTG	2	6	314992	314997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405990
6078	NC_018022	GCT	2	6	315003	315008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405990
6079	NC_018022	ACG	2	6	315034	315039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405990
6080	NC_018022	CGC	2	6	315150	315155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405990
6081	NC_018022	CG	3	6	315169	315174	0 %	0 %	50 %	50 %	392405990
6082	NC_018022	CG	3	6	315177	315182	0 %	0 %	50 %	50 %	392405990
6083	NC_018022	CGG	2	6	315234	315239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405990
6084	NC_018022	GGA	2	6	315372	315377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405990
6085	NC_018022	CGT	2	6	315381	315386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405990
6086	NC_018022	CTG	2	6	315397	315402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405990
6087	NC_018022	GCG	2	6	315501	315506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405990
6088	NC_018022	CG	3	6	315505	315510	0 %	0 %	50 %	50 %	392405990
6089	NC_018022	CGG	2	6	315570	315575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405990
6090	NC_018022	CG	3	6	315603	315608	0 %	0 %	50 %	50 %	392405990
6091	NC_018022	GCA	2	6	315626	315631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405990
6092	NC_018022	CGG	2	6	315684	315689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405990
6093	NC_018022	GCG	2	6	315783	315788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405990
6094	NC_018022	CCG	2	6	315863	315868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405990
6095	NC_018022	CGC	2	6	315873	315878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405990
6096	NC_018022	ACG	2	6	315905	315910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405990
6097	NC_018022	GCC	3	9	315966	315974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405990
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6099	NC_018022	CGA	2	6	315984	315989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405990
6100	NC_018022	GCT	2	6	316047	316052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405990
6101	NC_018022	CG	3	6	316055	316060	0 %	0 %	50 %	50 %	392405990
6102	NC_018022	CCT	2	6	316079	316084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405990
6103	NC_018022	CAC	2	6	316176	316181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405990
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6105	NC_018022	CAC	2	6	316329	316334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405990
6106	NC_018022	TGC	3	9	316370	316378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405990
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6108	NC_018022	TGC	2	6	316465	316470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405991
6109	NC_018022	ACC	2	6	316482	316487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405991
6110	NC_018022	CGA	2	6	316517	316522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405991
6111	NC_018022	GCA	2	6	316552	316557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405991
6112	NC_018022	CGA	2	6	316592	316597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405991
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6116	NC_018022	GCTG	2	8	316838	316845	0 %	25 %	50 %	25 %	392405991
6117	NC_018022	CGT	2	6	316910	316915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405991
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6119	NC_018022	GCG	2	6	316952	316957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405991
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6121	NC_018022	CTG	2	6	317010	317015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405991
6122	NC_018022	CGC	2	6	317018	317023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405991
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6241	NC_018022	GTG	2	6	321412	321417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405995
6242	NC_018022	ACG	2	6	321484	321489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405995
6243	NC_018022	GACGTA	2	12	321507	321518	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	392405995
6244	NC_018022	GCC	2	6	321544	321549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405995
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6246	NC_018022	TCG	2	6	321580	321585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405995
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6342	NC_018022	CGGCG	2	10	325376	325385	0 %	0 %	60 %	40 %	392406000
6343	NC_018022	GTC	2	6	325407	325412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406000
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6345	NC_018022	CGT	2	6	325463	325468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406000
6346	NC_018022	GGGC	2	8	325505	325512	0 %	0 %	75 %	25 %	392406000
6347	NC_018022	GCA	2	6	325514	325519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406000
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6351	NC_018022	CCCGGA	2	12	325740	325751	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392406001
6352	NC_018022	TGC	2	6	325822	325827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406001
6353	NC_018022	CCG	2	6	325916	325921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406002
6354	NC_018022	GCG	2	6	325929	325934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406002
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6357	NC_018022	TGC	3	9	326053	326061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406002
6358	NC_018022	TGG	2	6	326113	326118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392406002
6359	NC_018022	GC	3	6	326130	326135	0 %	0 %	50 %	50 %	392406002
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6361	NC_018022	GTT	2	6	326222	326227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392406002
6362	NC_018022	GCC	2	6	326235	326240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406002
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6365	NC_018022	GCT	3	9	326417	326425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406002
6366	NC_018022	CTG	2	6	326439	326444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406002
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6479	NC_018022	TGC	2	6	334965	334970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406010
6480	NC_018022	CGA	2	6	335010	335015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406010
6481	NC_018022	TGC	3	9	335068	335076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406010
6482	NC_018022	TGA	2	6	335088	335093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406010
6483	NC_018022	CAG	2	6	335095	335100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406010
6484	NC_018022	GAT	2	6	335155	335160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406010
6485	NC_018022	GCC	3	9	335167	335175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406010
6486	NC_018022	CGA	3	9	335202	335210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406010
6487	NC_018022	CGG	2	6	335214	335219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406010
6488	NC_018022	GCG	2	6	335239	335244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406010
6489	NC_018022	GCA	2	6	335301	335306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406010
6490	NC_018022	CGG	2	6	335316	335321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406010
6491	NC_018022	ATC	2	6	335324	335329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392406010
6492	NC_018022	CTG	2	6	335356	335361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392406010
6493	NC_018022	CGG	3	9	335409	335417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406010
6494	NC_018022	GGC	2	6	335425	335430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392406010
6495	NC_018022	CACC	2	8	335472	335479	25 %	0 %	0 %	75 %	392406010
6496	NC_018022	GAC	2	6	335497	335502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392406010
6497	NC_018022	CCG	4	12	335576	335587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406010
6498	NC_018022	GAT	2	6	335608	335613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406010
6499	NC_018022	AGT	2	6	335624	335629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392406010
6500	NC_018022	GCC	2	6	335732	335737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392406011

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