MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium chubuense NBB4 plasmid pMYCCH.01

Total Repeats: 12263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018022	CGA	2	6	268030	268035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405965
5502	NC_018022	GC	3	6	268050	268055	0 %	0 %	50 %	50 %	392405965
5503	NC_018022	CACGC	2	10	268086	268095	20 %	0 %	20 %	60 %	392405965
5504	NC_018022	CGG	2	6	268104	268109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405965
5505	NC_018022	CGC	2	6	268195	268200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405965
5506	NC_018022	ACG	2	6	268209	268214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405965
5507	NC_018022	GC	3	6	268278	268283	0 %	0 %	50 %	50 %	392405965
5508	NC_018022	ACG	2	6	268323	268328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405965
5509	NC_018022	TGA	2	6	268362	268367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405965
5510	NC_018022	TC	3	6	268381	268386	0 %	50 %	0 %	50 %	392405965
5511	NC_018022	AGC	2	6	268392	268397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405965
5512	NC_018022	CGA	2	6	268522	268527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405965
5513	NC_018022	CCTC	2	8	268563	268570	0 %	25 %	0 %	75 %	392405965
5514	NC_018022	CAC	2	6	268597	268602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405965
5515	NC_018022	CTC	2	6	268612	268617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405965
5516	NC_018022	GCG	3	9	268634	268642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405965
5517	NC_018022	CTG	2	6	268643	268648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405965
5518	NC_018022	CGC	2	6	268717	268722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405965
5519	NC_018022	CCAC	2	8	268761	268768	25 %	0 %	0 %	75 %	392405965
5520	NC_018022	TGA	2	6	268848	268853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405965
5521	NC_018022	CGA	2	6	268876	268881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405965
5522	NC_018022	CGG	2	6	268897	268902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405965
5523	NC_018022	CGATCG	2	12	268905	268916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392405965
5524	NC_018022	GCTCG	2	10	268924	268933	0 %	20 %	40 %	40 %	392405965
5525	NC_018022	GGCG	2	8	269014	269021	0 %	0 %	75 %	25 %	392405965
5526	NC_018022	ATC	2	6	269039	269044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405965
5527	NC_018022	CTG	2	6	270779	270784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405966
5528	NC_018022	ACCG	2	8	270792	270799	25 %	0 %	25 %	50 %	392405966
5529	NC_018022	GAA	2	6	270805	270810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405966
5530	NC_018022	GCT	2	6	270826	270831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405966
5531	NC_018022	GGC	2	6	270832	270837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405966
5532	NC_018022	CGA	2	6	270868	270873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405966
5533	NC_018022	CGA	2	6	270943	270948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405966
5534	NC_018022	CCG	2	6	270981	270986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405966
5535	NC_018022	CGG	2	6	271032	271037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405966
5536	NC_018022	CGG	3	9	271054	271062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405966
5537	NC_018022	GGC	2	6	271072	271077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405966
5538	NC_018022	CGG	2	6	271156	271161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405966
5539	NC_018022	ATC	2	6	271172	271177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405966
5540	NC_018022	CAAGGC	2	12	271189	271200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405966
5541	NC_018022	CCG	2	6	271233	271238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405966
5542	NC_018022	CGC	2	6	271363	271368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405966
5543	NC_018022	AGGG	2	8	271454	271461	25 %	0 %	75 %	0 %	392405966
5544	NC_018022	CTG	2	6	271527	271532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405967
5545	NC_018022	CGA	2	6	271562	271567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405967
5546	NC_018022	CTG	2	6	271575	271580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405967
5547	NC_018022	CGC	3	9	271589	271597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405967
5548	NC_018022	TTC	2	6	271599	271604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405967
5549	NC_018022	CAG	3	9	271644	271652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405967
5550	NC_018022	CGG	4	12	271721	271732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405967
5551	NC_018022	CCTACG	2	12	271774	271785	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392405967
5552	NC_018022	CAC	2	6	271955	271960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405967
5553	NC_018022	CGA	2	6	271976	271981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405967
5554	NC_018022	TCA	2	6	271987	271992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405967
5555	NC_018022	GTG	2	6	272037	272042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392405967
5556	NC_018022	TCG	2	6	272044	272049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405967
5557	NC_018022	GCCG	2	8	272186	272193	0 %	0 %	50 %	50 %	392405967
5558	NC_018022	CGG	2	6	272204	272209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405967
5559	NC_018022	AGC	2	6	272242	272247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405967
5560	NC_018022	GCC	2	6	272298	272303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405967
5561	NC_018022	GTC	2	6	272304	272309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405967
5562	NC_018022	GCT	2	6	272354	272359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405967
5563	NC_018022	CGG	2	6	272546	272551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405967
5564	NC_018022	ATG	2	6	272562	272567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405967
5565	NC_018022	CG	3	6	272579	272584	0 %	0 %	50 %	50 %	392405967
5566	NC_018022	CGC	2	6	272591	272596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405967
5567	NC_018022	AGA	2	6	272608	272613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405967
5568	NC_018022	CGG	2	6	272618	272623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405967
5569	NC_018022	AGC	2	6	272712	272717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405968
5570	NC_018022	CCG	2	6	272821	272826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405968
5571	NC_018022	GCC	2	6	272862	272867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405968
5572	NC_018022	CGA	2	6	272876	272881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405968
5573	NC_018022	GCC	2	6	272907	272912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405968
5574	NC_018022	GTC	2	6	273018	273023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405968
5575	NC_018022	CGT	2	6	273050	273055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405968
5576	NC_018022	CGG	2	6	273095	273100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405968
5577	NC_018022	GCG	2	6	273106	273111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405968
5578	NC_018022	CCT	2	6	273124	273129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392405968
5579	NC_018022	GGC	2	6	273134	273139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405968
5580	NC_018022	GGC	2	6	273161	273166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405968
5581	NC_018022	GGC	2	6	273183	273188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405968
5582	NC_018022	CGT	2	6	273226	273231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405968
5583	NC_018022	GCT	2	6	273278	273283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405968
5584	NC_018022	CCG	2	6	273354	273359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405968
5585	NC_018022	CAC	2	6	275783	275788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405969
5586	NC_018022	GC	4	8	275836	275843	0 %	0 %	50 %	50 %	392405969
5587	NC_018022	CCG	2	6	275852	275857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405969
5588	NC_018022	ACC	2	6	275878	275883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405969
5589	NC_018022	CGA	2	6	275915	275920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405969
5590	NC_018022	CGC	2	6	275939	275944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405969
5591	NC_018022	CGCC	2	8	275954	275961	0 %	0 %	25 %	75 %	392405969
5592	NC_018022	GC	5	10	275996	276005	0 %	0 %	50 %	50 %	392405969
5593	NC_018022	CCG	2	6	276019	276024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405969
5594	NC_018022	GCCG	2	8	276056	276063	0 %	0 %	50 %	50 %	392405969
5595	NC_018022	CGA	2	6	276074	276079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405969
5596	NC_018022	CAACCA	2	12	276110	276121	50 %	0 %	0 %	50 %	392405969
5597	NC_018022	GAGC	2	8	276128	276135	25 %	0 %	50 %	25 %	392405969
5598	NC_018022	GAT	2	6	276137	276142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405969
5599	NC_018022	CGG	2	6	276190	276195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405969
5600	NC_018022	GAG	2	6	276213	276218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405969
5601	NC_018022	TCACC	2	10	276290	276299	20 %	20 %	0 %	60 %	392405969
5602	NC_018022	TGC	3	9	276469	276477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405969
5603	NC_018022	CG	3	6	276520	276525	0 %	0 %	50 %	50 %	392405969
5604	NC_018022	ACG	2	6	276619	276624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405969
5605	NC_018022	ACG	2	6	276676	276681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405969
5606	NC_018022	TGA	2	6	276751	276756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392405969
5607	NC_018022	AGA	2	6	276784	276789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392405969
5608	NC_018022	GAG	2	6	276810	276815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392405969
5609	NC_018022	ACC	2	6	276858	276863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405969
5610	NC_018022	TCG	2	6	276913	276918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405969
5611	NC_018022	TCA	2	6	277003	277008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405969
5612	NC_018022	CGC	2	6	277019	277024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405969
5613	NC_018022	CGC	2	6	277028	277033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405969
5614	NC_018022	CGA	2	6	277070	277075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405969
5615	NC_018022	CCGC	2	8	277144	277151	0 %	0 %	25 %	75 %	392405969
5616	NC_018022	ACG	2	6	277159	277164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405969
5617	NC_018022	CGC	2	6	277175	277180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405969
5618	NC_018022	ACG	2	6	277246	277251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405969
5619	NC_018022	G	6	6	277305	277310	0 %	0 %	100 %	0 %	392405969
5620	NC_018022	ACG	2	6	277588	277593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405970
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5623	NC_018022	GC	3	6	277667	277672	0 %	0 %	50 %	50 %	392405970
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5981	NC_018022	ACG	2	6	310927	310932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405988
5982	NC_018022	CCAG	2	8	310947	310954	25 %	0 %	25 %	50 %	392405988
5983	NC_018022	GCT	2	6	310979	310984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405988
5984	NC_018022	TCA	2	6	311011	311016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405988
5985	NC_018022	GTC	2	6	311028	311033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405988
5986	NC_018022	CGA	2	6	311078	311083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405988
5987	NC_018022	GCG	2	6	311110	311115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405988
5988	NC_018022	CTGGC	2	10	311172	311181	0 %	20 %	40 %	40 %	392405988
5989	NC_018022	CGG	2	6	311282	311287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405988
5990	NC_018022	CAG	2	6	311359	311364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392405988
5991	NC_018022	ACT	2	6	311390	311395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392405988
5992	NC_018022	GCC	2	6	311421	311426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405988
5993	NC_018022	CCGGCC	2	12	311443	311454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405988
5994	NC_018022	AGCA	2	8	311470	311477	50 %	0 %	25 %	25 %	392405988
5995	NC_018022	TCG	2	6	311506	311511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392405988
5996	NC_018022	ACC	2	6	311586	311591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405988
5997	NC_018022	CGG	2	6	311600	311605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392405988
5998	NC_018022	TTC	2	6	311607	311612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392405988
5999	NC_018022	CGC	2	6	311621	311626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392405988
6000	NC_018022	CCA	2	6	311650	311655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392405988

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