MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium sp. MOTT36Y chromosome

Total Repeats: 139121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017904	TCG	2	6	189	194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873411
2	NC_017904	CTG	2	6	206	211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873411
3	NC_017904	AGC	2	6	221	226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873411
4	NC_017904	GCC	2	6	282	287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873411
5	NC_017904	CAG	2	6	296	301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873411
6	NC_017904	CGA	2	6	334	339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873411
7	NC_017904	CGG	2	6	363	368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873411
8	NC_017904	CGA	2	6	403	408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873411
9	NC_017904	CGC	2	6	409	414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873411
10	NC_017904	CGA	2	6	424	429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873411
11	NC_017904	CGC	2	6	520	525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873411
12	NC_017904	CCG	2	6	541	546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873411
13	NC_017904	TGC	2	6	684	689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873411
14	NC_017904	CGC	2	6	691	696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873411
15	NC_017904	GAA	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873411
16	NC_017904	TCA	2	6	771	776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873411
17	NC_017904	CGA	2	6	787	792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873411
18	NC_017904	CGACGT	2	12	823	834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387873411
19	NC_017904	GCT	2	6	835	840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873411
20	NC_017904	AAGG	2	8	869	876	50 %	0 %	50 %	0 %	387873411
21	NC_017904	AGG	2	6	882	887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387873411
22	NC_017904	TTC	2	6	890	895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387873411
23	NC_017904	CAA	2	6	922	927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873411
24	NC_017904	GCC	2	6	952	957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873411
25	NC_017904	AGC	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873411
26	NC_017904	GCC	2	6	1027	1032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873411
27	NC_017904	CGA	2	6	1096	1101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873411
28	NC_017904	CAG	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873411
29	NC_017904	CCA	2	6	1275	1280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873411
30	NC_017904	GCC	2	6	1286	1291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873411
31	NC_017904	CCG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873411
32	NC_017904	ACC	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873411
33	NC_017904	GGA	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387873411
34	NC_017904	ACCAC	2	10	1440	1449	40 %	0 %	0 %	60 %	387873411
35	NC_017904	GCG	2	6	1492	1497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873411
36	NC_017904	CAC	2	6	1525	1530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873411
37	NC_017904	CGA	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873412
38	NC_017904	GTGG	2	8	2174	2181	0 %	25 %	75 %	0 %	387873412
39	NC_017904	GAA	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873412
40	NC_017904	CGGTGC	2	12	2206	2217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387873412
41	NC_017904	TGC	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873412
42	NC_017904	CGA	2	6	2449	2454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873412
43	NC_017904	CCG	2	6	2512	2517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873412
44	NC_017904	CGA	2	6	2564	2569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873412
45	NC_017904	GTG	2	6	2619	2624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873412
46	NC_017904	GCC	2	6	2628	2633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873412
47	NC_017904	CGG	2	6	2674	2679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873412
48	NC_017904	GCC	2	6	2733	2738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873412
49	NC_017904	GCA	2	6	2836	2841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873412
50	NC_017904	GCT	2	6	2882	2887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873412
51	NC_017904	GCCG	2	8	2888	2895	0 %	0 %	50 %	50 %	387873412
52	NC_017904	CGA	2	6	2911	2916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873412
53	NC_017904	CGA	2	6	3029	3034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873412
54	NC_017904	GGCCG	2	10	3039	3048	0 %	0 %	60 %	40 %	387873412
55	NC_017904	AAG	2	6	3049	3054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873412
56	NC_017904	CGAT	2	8	3061	3068	25 %	25 %	25 %	25 %	387873412
57	NC_017904	TGC	2	6	3184	3189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873412
58	NC_017904	GAC	3	9	3201	3209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873412
59	NC_017904	CCGGG	2	10	3220	3229	0 %	0 %	60 %	40 %	387873412
60	NC_017904	CCGA	2	8	3246	3253	25 %	0 %	25 %	50 %	387873412
61	NC_017904	GCC	2	6	3486	3491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873413
62	NC_017904	ACG	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873413
63	NC_017904	GCGGG	2	10	3558	3567	0 %	0 %	80 %	20 %	387873413
64	NC_017904	GCA	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873413
65	NC_017904	CG	3	6	3630	3635	0 %	0 %	50 %	50 %	387873413
66	NC_017904	GTT	2	6	3638	3643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873413
67	NC_017904	GCG	2	6	3670	3675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873413
68	NC_017904	CGC	2	6	3690	3695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873413
69	NC_017904	CGA	2	6	3701	3706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873413
70	NC_017904	GCCG	3	12	3721	3732	0 %	0 %	50 %	50 %	387873413
71	NC_017904	GGC	2	6	3734	3739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873413
72	NC_017904	GC	3	6	3743	3748	0 %	0 %	50 %	50 %	387873413
73	NC_017904	GA	3	6	3756	3761	50 %	0 %	50 %	0 %	387873413
74	NC_017904	TGC	2	6	3763	3768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873413
75	NC_017904	GC	3	6	3802	3807	0 %	0 %	50 %	50 %	387873413
76	NC_017904	TCGCC	2	10	3857	3866	0 %	20 %	20 %	60 %	387873413
77	NC_017904	CTG	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873413
78	NC_017904	CGC	2	6	4004	4009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873413
79	NC_017904	CGG	2	6	4022	4027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873413
80	NC_017904	GGTC	2	8	4109	4116	0 %	25 %	50 %	25 %	387873413
81	NC_017904	GAC	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873413
82	NC_017904	GCCA	2	8	4170	4177	25 %	0 %	25 %	50 %	387873413
83	NC_017904	CGC	2	6	4214	4219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873413
84	NC_017904	GCT	2	6	4226	4231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873413
85	NC_017904	GC	3	6	4232	4237	0 %	0 %	50 %	50 %	387873413
86	NC_017904	CGA	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873413
87	NC_017904	TTG	2	6	4257	4262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873413
88	NC_017904	CGA	2	6	4265	4270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873413
89	NC_017904	CCG	2	6	4348	4353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873413
90	NC_017904	GTC	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873413
91	NC_017904	CGG	2	6	4372	4377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873413
92	NC_017904	CCGG	2	8	4423	4430	0 %	0 %	50 %	50 %	387873413
93	NC_017904	GC	3	6	4442	4447	0 %	0 %	50 %	50 %	387873413
94	NC_017904	CGG	2	6	4483	4488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873414
95	NC_017904	GAG	2	6	4535	4540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387873414
96	NC_017904	GCG	3	9	4547	4555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873414
97	NC_017904	CG	4	8	4554	4561	0 %	0 %	50 %	50 %	387873414
98	NC_017904	CGGCCG	2	12	4576	4587	0 %	0 %	50 %	50 %	387873414
99	NC_017904	GCG	2	6	4624	4629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873414
100	NC_017904	GC	3	6	4685	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	387873414
101	NC_017904	GGT	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873414
102	NC_017904	CCA	2	6	4768	4773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873414
103	NC_017904	GAT	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873414
104	NC_017904	GTT	2	6	4876	4881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387873414
105	NC_017904	CGC	3	9	4891	4899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873414
106	NC_017904	GTG	2	6	4913	4918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873414
107	NC_017904	GCCG	2	8	4939	4946	0 %	0 %	50 %	50 %	387873414
108	NC_017904	CGT	2	6	4950	4955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873414
109	NC_017904	AGA	3	9	5279	5287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387873415
110	NC_017904	CAC	2	6	5395	5400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873415
111	NC_017904	GGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873415
112	NC_017904	CGA	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873415
113	NC_017904	CAA	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873415
114	NC_017904	CGA	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873415
115	NC_017904	CGT	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873415
116	NC_017904	CGG	2	6	5583	5588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873415
117	NC_017904	CGG	2	6	5595	5600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873415
118	NC_017904	CGGCGT	2	12	5637	5648	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387873415
119	NC_017904	GGT	2	6	5652	5657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387873415
120	NC_017904	CCA	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873415
121	NC_017904	CAC	2	6	5778	5783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873415
122	NC_017904	ACC	2	6	5818	5823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387873415
123	NC_017904	GC	3	6	5845	5850	0 %	0 %	50 %	50 %	387873415
124	NC_017904	CAA	2	6	5874	5879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873415
125	NC_017904	CGA	2	6	5901	5906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873415
126	NC_017904	GAG	2	6	5920	5925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387873415
127	NC_017904	CGA	2	6	5931	5936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873415
128	NC_017904	GTC	2	6	5938	5943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873415
129	NC_017904	CCG	2	6	5951	5956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873415
130	NC_017904	GGC	2	6	5982	5987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873415
131	NC_017904	GCACC	2	10	6015	6024	20 %	0 %	20 %	60 %	387873415
132	NC_017904	CGG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873415
133	NC_017904	CAG	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873415
134	NC_017904	CAT	2	6	6096	6101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387873415
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254	NC_017904	CGAGG	2	10	10250	10259	20 %	0 %	60 %	20 %	387873417
255	NC_017904	CG	3	6	10402	10407	0 %	0 %	50 %	50 %	387873417
256	NC_017904	CCGCA	2	10	10410	10419	20 %	0 %	20 %	60 %	387873417
257	NC_017904	GCCG	2	8	10461	10468	0 %	0 %	50 %	50 %	387873417
258	NC_017904	ACCGCG	2	12	10504	10515	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387873417
259	NC_017904	CGG	2	6	10527	10532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873417
260	NC_017904	CCG	2	6	10565	10570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387873417
261	NC_017904	GCT	2	6	10601	10606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873417
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263	NC_017904	GAT	2	6	10634	10639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387873417
264	NC_017904	CGG	2	6	10667	10672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873417
265	NC_017904	CTG	2	6	10713	10718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387873417
266	NC_017904	AAC	2	6	10719	10724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387873417
267	NC_017904	GCA	2	6	10732	10737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387873417
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280	NC_017904	GGC	2	6	11585	11590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387873418
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