MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 53702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_017857	TAG	2	6	2415946	2415951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128200
41503	NC_017857	TAT	2	6	2415967	2415972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128200
41504	NC_017857	TTTATC	2	12	2415998	2416009	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387128200
41505	NC_017857	CGA	2	6	2416032	2416037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128200
41506	NC_017857	GCA	2	6	2416077	2416082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128200
41507	NC_017857	GAG	2	6	2416125	2416130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387128200
41508	NC_017857	TCATT	2	10	2416147	2416156	20 %	60 %	0 %	20 %	387128200
41509	NC_017857	CTG	2	6	2416299	2416304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128201
41510	NC_017857	GGC	2	6	2416325	2416330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387128201
41511	NC_017857	TGC	3	9	2416411	2416419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128201
41512	NC_017857	TTG	2	6	2416461	2416466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128201
41513	NC_017857	CAT	2	6	2416511	2416516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128201
41514	NC_017857	CAG	2	6	2416554	2416559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128201
41515	NC_017857	T	6	6	2416640	2416645	0 %	100 %	0 %	0 %	387128201
41516	NC_017857	AG	3	6	2416698	2416703	50 %	0 %	50 %	0 %	387128201
41517	NC_017857	GGGAA	2	10	2416867	2416876	40 %	0 %	60 %	0 %	387128201
41518	NC_017857	TGT	2	6	2416891	2416896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128201
41519	NC_017857	T	7	7	2416940	2416946	0 %	100 %	0 %	0 %	387128201
41520	NC_017857	ACC	2	6	2417002	2417007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387128201
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41522	NC_017857	CGGCT	2	10	2417112	2417121	0 %	20 %	40 %	40 %	387128201
41523	NC_017857	TCAGC	2	10	2417144	2417153	20 %	20 %	20 %	40 %	387128201
41524	NC_017857	CAA	2	6	2417349	2417354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387128201
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41527	NC_017857	GCA	2	6	2417488	2417493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128201
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41529	NC_017857	CATAAC	2	12	2417748	2417759	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387128202
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41531	NC_017857	TGC	2	6	2417906	2417911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128202
41532	NC_017857	CAAT	2	8	2417913	2417920	50 %	25 %	0 %	25 %	387128202
41533	NC_017857	ATTGT	2	10	2417941	2417950	20 %	60 %	20 %	0 %	387128202
41534	NC_017857	AAGT	2	8	2417953	2417960	50 %	25 %	25 %	0 %	387128202
41535	NC_017857	GTT	2	6	2418046	2418051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128202
41536	NC_017857	GTA	2	6	2418061	2418066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387128202
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41538	NC_017857	CATC	2	8	2418103	2418110	25 %	25 %	0 %	50 %	387128202
41539	NC_017857	CAT	2	6	2418241	2418246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128202
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41541	NC_017857	TGT	2	6	2418357	2418362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128203
41542	NC_017857	ATC	2	6	2418365	2418370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128203
41543	NC_017857	TG	3	6	2418396	2418401	0 %	50 %	50 %	0 %	387128203
41544	NC_017857	GTG	2	6	2418497	2418502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387128203
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41546	NC_017857	TTAT	2	8	2418561	2418568	25 %	75 %	0 %	0 %	387128203
41547	NC_017857	AT	3	6	2418643	2418648	50 %	50 %	0 %	0 %	387128203
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41550	NC_017857	GATC	2	8	2418804	2418811	25 %	25 %	25 %	25 %	387128204
41551	NC_017857	CAG	2	6	2418895	2418900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387128204
41552	NC_017857	ATCA	2	8	2419024	2419031	50 %	25 %	0 %	25 %	387128204
41553	NC_017857	ATC	2	6	2419048	2419053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387128204
41554	NC_017857	CTG	2	6	2419091	2419096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128204
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41557	NC_017857	TTG	2	6	2419147	2419152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387128204
41558	NC_017857	TA	3	6	2419198	2419203	50 %	50 %	0 %	0 %	387128204
41559	NC_017857	CTG	2	6	2419223	2419228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128204
41560	NC_017857	CTG	2	6	2419317	2419322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128204
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41602	NC_017857	ATT	2	6	2421242	2421247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387128206
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41618	NC_017857	CTG	2	6	2422384	2422389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387128208
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