MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 47292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_017856	CGG	2	6	2509485	2509490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387131439
44002	NC_017856	GCCA	2	8	2509502	2509509	25 %	0 %	25 %	50 %	387131439
44003	NC_017856	GAT	2	6	2509528	2509533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131439
44004	NC_017856	AGC	2	6	2509538	2509543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131439
44005	NC_017856	GTGAAA	2	12	2509568	2509579	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387131439
44006	NC_017856	TGA	2	6	2509688	2509693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131439
44007	NC_017856	TGC	2	6	2509701	2509706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131439
44008	NC_017856	ATGT	2	8	2509735	2509742	25 %	50 %	25 %	0 %	387131439
44009	NC_017856	AGTT	2	8	2509760	2509767	25 %	50 %	25 %	0 %	387131439
44010	NC_017856	TGATG	2	10	2509785	2509794	20 %	40 %	40 %	0 %	387131439
44011	NC_017856	GCT	2	6	2509978	2509983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131439
44012	NC_017856	ATG	2	6	2509984	2509989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131439
44013	NC_017856	CAG	2	6	2510072	2510077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131439
44014	NC_017856	A	7	7	2510178	2510184	100 %	0 %	0 %	0 %	387131440
44015	NC_017856	GTT	2	6	2510196	2510201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131440
44016	NC_017856	AGCG	2	8	2510286	2510293	25 %	0 %	50 %	25 %	387131440
44017	NC_017856	T	6	6	2510383	2510388	0 %	100 %	0 %	0 %	387131440
44018	NC_017856	GGC	2	6	2510426	2510431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387131440
44019	NC_017856	GCA	2	6	2510433	2510438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131440
44020	NC_017856	ATA	2	6	2510455	2510460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387131440
44021	NC_017856	GAT	2	6	2510481	2510486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131440
44022	NC_017856	CAT	2	6	2510546	2510551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131440
44023	NC_017856	GATG	2	8	2510675	2510682	25 %	25 %	50 %	0 %	387131440
44024	NC_017856	AGA	2	6	2510807	2510812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131440
44025	NC_017856	CTG	2	6	2510875	2510880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131440
44026	NC_017856	T	6	6	2510893	2510898	0 %	100 %	0 %	0 %	387131440
44027	NC_017856	A	6	6	2510935	2510940	100 %	0 %	0 %	0 %	387131440
44028	NC_017856	CACAG	2	10	2510945	2510954	40 %	0 %	20 %	40 %	387131440
44029	NC_017856	TCAGG	2	10	2511042	2511051	20 %	20 %	40 %	20 %	387131440
44030	NC_017856	GTG	2	6	2511114	2511119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131440
44031	NC_017856	TAA	2	6	2511192	2511197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387131440
44032	NC_017856	AGT	2	6	2511287	2511292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44033	NC_017856	TTTGG	2	10	2511299	2511308	0 %	60 %	40 %	0 %	387131441
44034	NC_017856	TGA	2	6	2511379	2511384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44035	NC_017856	GTT	2	6	2511401	2511406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131441
44036	NC_017856	TGA	2	6	2511627	2511632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44037	NC_017856	ATC	3	9	2511646	2511654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131441
44038	NC_017856	CAC	2	6	2511670	2511675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131441
44039	NC_017856	CTG	2	6	2511681	2511686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131441
44040	NC_017856	CCA	2	6	2511689	2511694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131441
44041	NC_017856	TCG	2	6	2511710	2511715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131441
44042	NC_017856	CCGC	2	8	2511722	2511729	0 %	0 %	25 %	75 %	387131441
44043	NC_017856	CAA	2	6	2511809	2511814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131441
44044	NC_017856	ACA	2	6	2511855	2511860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131441
44045	NC_017856	AGC	2	6	2511910	2511915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131441
44046	NC_017856	ATG	2	6	2511917	2511922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44047	NC_017856	AACGCA	2	12	2511955	2511966	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387131441
44048	NC_017856	AGA	2	6	2512048	2512053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131441
44049	NC_017856	CT	3	6	2512135	2512140	0 %	50 %	0 %	50 %	387131441
44050	NC_017856	TAA	2	6	2512186	2512191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387131441
44051	NC_017856	AGC	2	6	2512242	2512247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131441
44052	NC_017856	GGA	2	6	2512321	2512326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387131441
44053	NC_017856	CAC	2	6	2512780	2512785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131441
44054	NC_017856	TAATGC	2	12	2512792	2512803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387131441
44055	NC_017856	AAACGA	2	12	2512819	2512830	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387131441
44056	NC_017856	TGT	2	6	2512866	2512871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131441
44057	NC_017856	TGT	2	6	2512956	2512961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131441
44058	NC_017856	GGT	2	6	2512999	2513004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131441
44059	NC_017856	TGA	2	6	2513050	2513055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44060	NC_017856	CCA	2	6	2513132	2513137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131441
44061	NC_017856	TGA	2	6	2513149	2513154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44062	NC_017856	GTGG	2	8	2513155	2513162	0 %	25 %	75 %	0 %	387131441
44063	NC_017856	TTG	2	6	2513178	2513183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131441
44064	NC_017856	TGA	2	6	2513242	2513247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44065	NC_017856	CAT	2	6	2513254	2513259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131441
44066	NC_017856	AGC	2	6	2513265	2513270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131441
44067	NC_017856	AGA	2	6	2513290	2513295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131441
44068	NC_017856	TACT	2	8	2513316	2513323	25 %	50 %	0 %	25 %	387131441
44069	NC_017856	TGA	2	6	2513341	2513346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44070	NC_017856	GGA	2	6	2513356	2513361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387131441
44071	NC_017856	TAC	2	6	2513385	2513390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131441
44072	NC_017856	TGA	2	6	2513425	2513430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44073	NC_017856	AGTC	2	8	2513431	2513438	25 %	25 %	25 %	25 %	387131441
44074	NC_017856	ATTC	2	8	2513460	2513467	25 %	50 %	0 %	25 %	387131441
44075	NC_017856	TGA	2	6	2513473	2513478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
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44077	NC_017856	AGC	2	6	2513635	2513640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131441
44078	NC_017856	TGA	2	6	2513665	2513670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44079	NC_017856	ATG	2	6	2513715	2513720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
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44081	NC_017856	TGA	2	6	2513890	2513895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44082	NC_017856	GCG	2	6	2513921	2513926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387131441
44083	NC_017856	GAT	2	6	2513939	2513944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131441
44084	NC_017856	AAG	2	6	2513970	2513975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131441
44085	NC_017856	ACT	2	6	2514019	2514024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131441
44086	NC_017856	CGATA	2	10	2514025	2514034	40 %	20 %	20 %	20 %	387131441
44087	NC_017856	GA	3	6	2514039	2514044	50 %	0 %	50 %	0 %	387131441
44088	NC_017856	CAA	2	6	2514133	2514138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131442
44089	NC_017856	CAA	2	6	2514145	2514150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131442
44090	NC_017856	TGCA	2	8	2514215	2514222	25 %	25 %	25 %	25 %	387131442
44091	NC_017856	GTC	2	6	2514232	2514237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131442
44092	NC_017856	GC	3	6	2514253	2514258	0 %	0 %	50 %	50 %	387131442
44093	NC_017856	GCT	2	6	2514276	2514281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131442
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44095	NC_017856	TCA	3	9	2514420	2514428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131442
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44097	NC_017856	CAA	2	6	2514472	2514477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131442
44098	NC_017856	GCA	2	6	2514498	2514503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131442
44099	NC_017856	CCAAAT	2	12	2514564	2514575	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387131442
44100	NC_017856	CGTTGA	2	12	2514600	2514611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387131442
44101	NC_017856	CCA	2	6	2514685	2514690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131442
44102	NC_017856	GCC	2	6	2514730	2514735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387131442
44103	NC_017856	CGC	2	6	2514746	2514751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387131442
44104	NC_017856	ATT	2	6	2514759	2514764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387131442
44105	NC_017856	C	6	6	2514784	2514789	0 %	0 %	0 %	100 %	387131442
44106	NC_017856	CGC	2	6	2514904	2514909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387131443
44107	NC_017856	T	6	6	2514959	2514964	0 %	100 %	0 %	0 %	387131443
44108	NC_017856	ACC	2	6	2515023	2515028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131443
44109	NC_017856	CAT	2	6	2515038	2515043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131443
44110	NC_017856	TTGT	2	8	2515048	2515055	0 %	75 %	25 %	0 %	387131443
44111	NC_017856	ATTA	2	8	2515071	2515078	50 %	50 %	0 %	0 %	387131443
44112	NC_017856	TGC	2	6	2515230	2515235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131443
44113	NC_017856	CTGG	2	8	2515333	2515340	0 %	25 %	50 %	25 %	387131443
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44115	NC_017856	GTG	3	9	2515406	2515414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131443
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44343	NC_017856	TGGGA	2	10	2529542	2529551	20 %	20 %	60 %	0 %	387131459
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44349	NC_017856	CAT	2	6	2530204	2530209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131460
44350	NC_017856	AACA	2	8	2530263	2530270	75 %	0 %	0 %	25 %	387131460
44351	NC_017856	GCG	2	6	2530355	2530360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387131460
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44458	NC_017856	CCAGA	2	10	2536187	2536196	40 %	0 %	20 %	40 %	387131464
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44462	NC_017856	TGG	2	6	2536367	2536372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131464
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44464	NC_017856	CAT	2	6	2536474	2536479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131464
44465	NC_017856	GAT	2	6	2536493	2536498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131464
44466	NC_017856	TAA	2	6	2536582	2536587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387131464
44467	NC_017856	CAGT	2	8	2536593	2536600	25 %	25 %	25 %	25 %	387131464
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