MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 47292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017856	GTT	2	6	197516	197521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129174
3502	NC_017856	TACGA	2	10	197605	197614	40 %	20 %	20 %	20 %	387129174
3503	NC_017856	A	6	6	197638	197643	100 %	0 %	0 %	0 %	387129174
3504	NC_017856	TGC	2	6	197686	197691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129174
3505	NC_017856	TAG	2	6	197701	197706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129174
3506	NC_017856	CG	3	6	197708	197713	0 %	0 %	50 %	50 %	387129174
3507	NC_017856	GCC	2	6	197731	197736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129174
3508	NC_017856	TGA	2	6	197942	197947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129175
3509	NC_017856	CAA	2	6	197956	197961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129175
3510	NC_017856	AAC	2	6	197993	197998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129175
3511	NC_017856	GGT	2	6	198027	198032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129175
3512	NC_017856	ATT	2	6	198040	198045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129175
3513	NC_017856	T	6	6	198044	198049	0 %	100 %	0 %	0 %	387129175
3514	NC_017856	CTTG	2	8	198054	198061	0 %	50 %	25 %	25 %	387129175
3515	NC_017856	GCGA	2	8	198170	198177	25 %	0 %	50 %	25 %	387129175
3516	NC_017856	TTG	2	6	198272	198277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129175
3517	NC_017856	CAT	2	6	198318	198323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129175
3518	NC_017856	TGA	2	6	198389	198394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129175
3519	NC_017856	ATT	2	6	198400	198405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129175
3520	NC_017856	GCC	2	6	198418	198423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129175
3521	NC_017856	G	6	6	198464	198469	0 %	0 %	100 %	0 %	387129175
3522	NC_017856	GGACT	2	10	198516	198525	20 %	20 %	40 %	20 %	387129175
3523	NC_017856	TATTT	2	10	198569	198578	20 %	80 %	0 %	0 %	387129175
3524	NC_017856	T	6	6	198606	198611	0 %	100 %	0 %	0 %	387129175
3525	NC_017856	CAA	2	6	198667	198672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129175
3526	NC_017856	ATG	2	6	198701	198706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129175
3527	NC_017856	CAG	2	6	198745	198750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129175
3528	NC_017856	TAT	2	6	198858	198863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129176
3529	NC_017856	ATTT	2	8	199169	199176	25 %	75 %	0 %	0 %	387129176
3530	NC_017856	AGC	2	6	199212	199217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129176
3531	NC_017856	TG	3	6	199225	199230	0 %	50 %	50 %	0 %	387129176
3532	NC_017856	CAA	2	6	199271	199276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129176
3533	NC_017856	ACG	2	6	199279	199284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129176
3534	NC_017856	ATG	2	6	199305	199310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129176
3535	NC_017856	AG	3	6	199322	199327	50 %	0 %	50 %	0 %	387129176
3536	NC_017856	ACA	2	6	199530	199535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129177
3537	NC_017856	CAA	2	6	199693	199698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129177
3538	NC_017856	TTTG	2	8	199863	199870	0 %	75 %	25 %	0 %	387129177
3539	NC_017856	TCCCCC	2	12	199882	199893	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	387129177
3540	NC_017856	A	7	7	200197	200203	100 %	0 %	0 %	0 %	387129178
3541	NC_017856	T	7	7	200262	200268	0 %	100 %	0 %	0 %	387129178
3542	NC_017856	TAAGAT	2	12	200296	200307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387129178
3543	NC_017856	GCC	2	6	200619	200624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129179
3544	NC_017856	CGA	2	6	200690	200695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129180
3545	NC_017856	GCG	2	6	200708	200713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129180
3546	NC_017856	TCT	2	6	200743	200748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129180
3547	NC_017856	A	6	6	200752	200757	100 %	0 %	0 %	0 %	387129180
3548	NC_017856	GTT	2	6	200795	200800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129180
3549	NC_017856	ACC	2	6	200959	200964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129180
3550	NC_017856	ACG	2	6	201036	201041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129180
3551	NC_017856	GC	3	6	201209	201214	0 %	0 %	50 %	50 %	387129180
3552	NC_017856	CCA	3	9	201250	201258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129180
3553	NC_017856	CAA	2	6	201384	201389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129180
3554	NC_017856	TGC	2	6	201421	201426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129180
3555	NC_017856	CAT	2	6	201461	201466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129180
3556	NC_017856	A	6	6	201623	201628	100 %	0 %	0 %	0 %	387129180
3557	NC_017856	ATTT	2	8	201640	201647	25 %	75 %	0 %	0 %	387129180
3558	NC_017856	AATG	2	8	201654	201661	50 %	25 %	25 %	0 %	387129181
3559	NC_017856	TGG	2	6	201727	201732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129181
3560	NC_017856	CAT	2	6	201860	201865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129181
3561	NC_017856	AAAGT	2	10	201967	201976	60 %	20 %	20 %	0 %	387129181
3562	NC_017856	T	6	6	202199	202204	0 %	100 %	0 %	0 %	387129181
3563	NC_017856	AATACC	2	12	202227	202238	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387129181
3564	NC_017856	GAACG	2	10	202262	202271	40 %	0 %	40 %	20 %	387129181
3565	NC_017856	TCA	2	6	202306	202311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129181
3566	NC_017856	T	6	6	202385	202390	0 %	100 %	0 %	0 %	387129182
3567	NC_017856	CTGA	2	8	202450	202457	25 %	25 %	25 %	25 %	387129182
3568	NC_017856	GTT	2	6	202540	202545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129182
3569	NC_017856	CTC	2	6	202637	202642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387129182
3570	NC_017856	ACC	2	6	202656	202661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129182
3571	NC_017856	CTA	2	6	202669	202674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129182
3572	NC_017856	T	6	6	202728	202733	0 %	100 %	0 %	0 %	387129182
3573	NC_017856	CTG	2	6	202754	202759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129182
3574	NC_017856	CGC	2	6	202766	202771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129182
3575	NC_017856	CATC	2	8	202885	202892	25 %	25 %	0 %	50 %	387129182
3576	NC_017856	AATC	2	8	202927	202934	50 %	25 %	0 %	25 %	387129182
3577	NC_017856	ATTG	2	8	203145	203152	25 %	50 %	25 %	0 %	387129183
3578	NC_017856	TTA	2	6	203191	203196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129183
3579	NC_017856	TAG	2	6	203219	203224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129183
3580	NC_017856	CTG	2	6	203291	203296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129184
3581	NC_017856	T	6	6	203362	203367	0 %	100 %	0 %	0 %	387129184
3582	NC_017856	T	6	6	203433	203438	0 %	100 %	0 %	0 %	387129184
3583	NC_017856	GCCC	2	8	203458	203465	0 %	0 %	25 %	75 %	387129184
3584	NC_017856	GCA	2	6	203486	203491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129184
3585	NC_017856	AAG	2	6	203521	203526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387129184
3586	NC_017856	T	6	6	203545	203550	0 %	100 %	0 %	0 %	387129184
3587	NC_017856	CAC	2	6	203573	203578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129184
3588	NC_017856	GT	3	6	203600	203605	0 %	50 %	50 %	0 %	387129184
3589	NC_017856	TGC	2	6	203625	203630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129184
3590	NC_017856	AGC	2	6	203631	203636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129184
3591	NC_017856	AGC	2	6	203742	203747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129184
3592	NC_017856	CTT	2	6	203783	203788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129184
3593	NC_017856	T	6	6	203808	203813	0 %	100 %	0 %	0 %	387129184
3594	NC_017856	TCA	2	6	203843	203848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129184
3595	NC_017856	CCA	2	6	203899	203904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129184
3596	NC_017856	ATG	2	6	203907	203912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129184
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3598	NC_017856	C	6	6	204150	204155	0 %	0 %	0 %	100 %	387129184
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3602	NC_017856	AAC	2	6	204293	204298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129184
3603	NC_017856	ATA	2	6	204304	204309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129184
3604	NC_017856	TGTGG	2	10	204362	204371	0 %	40 %	60 %	0 %	387129184
3605	NC_017856	CGG	3	9	204429	204437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129184
3606	NC_017856	TGC	2	6	204463	204468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129184
3607	NC_017856	CGGCG	2	10	204598	204607	0 %	0 %	60 %	40 %	387129184
3608	NC_017856	ATT	2	6	204630	204635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129184
3609	NC_017856	CGG	2	6	204717	204722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129184
3610	NC_017856	ACCA	2	8	204767	204774	50 %	0 %	0 %	50 %	387129184
3611	NC_017856	CGC	2	6	204778	204783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129184
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3613	NC_017856	CGA	2	6	204931	204936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129184
3614	NC_017856	T	6	6	204938	204943	0 %	100 %	0 %	0 %	387129184
3615	NC_017856	CGC	2	6	204970	204975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129184
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3618	NC_017856	CAT	2	6	205097	205102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129184
3619	NC_017856	ACG	2	6	205104	205109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129184
3620	NC_017856	T	7	7	205112	205118	0 %	100 %	0 %	0 %	387129184
3621	NC_017856	C	6	6	205156	205161	0 %	0 %	0 %	100 %	387129184
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3623	NC_017856	GAT	2	6	205326	205331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129184
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