MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 47292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017856	TGA	2	6	138659	138664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129116
2502	NC_017856	TAA	2	6	138673	138678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129116
2503	NC_017856	AAT	2	6	138715	138720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129116
2504	NC_017856	CCT	2	6	138766	138771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387129117
2505	NC_017856	GCCG	2	8	138785	138792	0 %	0 %	50 %	50 %	387129117
2506	NC_017856	CAT	2	6	138832	138837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129117
2507	NC_017856	CA	3	6	138868	138873	50 %	0 %	0 %	50 %	387129117
2508	NC_017856	CTT	2	6	138889	138894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129117
2509	NC_017856	TCA	2	6	138918	138923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129117
2510	NC_017856	CAT	2	6	139006	139011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129117
2511	NC_017856	ACCAA	2	10	139154	139163	60 %	0 %	0 %	40 %	387129117
2512	NC_017856	GT	3	6	139237	139242	0 %	50 %	50 %	0 %	387129117
2513	NC_017856	CTT	2	6	139252	139257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129117
2514	NC_017856	CAT	2	6	139339	139344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129117
2515	NC_017856	GCC	2	6	139345	139350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129117
2516	NC_017856	CAT	2	6	139402	139407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129117
2517	NC_017856	CGT	2	6	139459	139464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129117
2518	NC_017856	TTC	2	6	139487	139492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129117
2519	NC_017856	TGA	2	6	139518	139523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129117
2520	NC_017856	GCC	2	6	139539	139544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129117
2521	NC_017856	ATGG	2	8	139622	139629	25 %	25 %	50 %	0 %	387129117
2522	NC_017856	ACTC	2	8	139637	139644	25 %	25 %	0 %	50 %	387129117
2523	NC_017856	TCAA	2	8	139659	139666	50 %	25 %	0 %	25 %	387129117
2524	NC_017856	AAT	2	6	139769	139774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129117
2525	NC_017856	TGA	2	6	139788	139793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129117
2526	NC_017856	C	7	7	139830	139836	0 %	0 %	0 %	100 %	387129117
2527	NC_017856	T	6	6	139855	139860	0 %	100 %	0 %	0 %	387129117
2528	NC_017856	CTT	2	6	139867	139872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129117
2529	NC_017856	TGA	2	6	139877	139882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129117
2530	NC_017856	AAT	2	6	139937	139942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129117
2531	NC_017856	AAT	2	6	139979	139984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129117
2532	NC_017856	CAGG	2	8	140047	140054	25 %	0 %	50 %	25 %	387129117
2533	NC_017856	CAT	2	6	140062	140067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129117
2534	NC_017856	AT	3	6	140103	140108	50 %	50 %	0 %	0 %	387129117
2535	NC_017856	CGG	2	6	140133	140138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129117
2536	NC_017856	ACG	2	6	140177	140182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129117
2537	NC_017856	GGC	2	6	140188	140193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129117
2538	NC_017856	ATC	2	6	140465	140470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129117
2539	NC_017856	TGAC	2	8	140560	140567	25 %	25 %	25 %	25 %	387129117
2540	NC_017856	A	8	8	140971	140978	100 %	0 %	0 %	0 %	387129118
2541	NC_017856	AAG	2	6	141013	141018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387129118
2542	NC_017856	GC	3	6	141038	141043	0 %	0 %	50 %	50 %	387129118
2543	NC_017856	GCC	2	6	141101	141106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129118
2544	NC_017856	TGGT	2	8	141154	141161	0 %	50 %	50 %	0 %	387129118
2545	NC_017856	GAA	2	6	141165	141170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387129118
2546	NC_017856	GCTG	2	8	141293	141300	0 %	25 %	50 %	25 %	387129118
2547	NC_017856	ACA	3	9	141320	141328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129118
2548	NC_017856	TAT	2	6	141344	141349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129118
2549	NC_017856	ACA	2	6	141419	141424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129118
2550	NC_017856	ATT	2	6	141488	141493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129118
2551	NC_017856	A	6	6	141572	141577	100 %	0 %	0 %	0 %	387129119
2552	NC_017856	TGA	2	6	141578	141583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129119
2553	NC_017856	CTG	2	6	141586	141591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129119
2554	NC_017856	CCA	2	6	141657	141662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129119
2555	NC_017856	AAAC	2	8	141718	141725	75 %	0 %	0 %	25 %	387129119
2556	NC_017856	TGC	2	6	141781	141786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129119
2557	NC_017856	TAAA	2	8	141843	141850	75 %	25 %	0 %	0 %	387129119
2558	NC_017856	TTG	2	6	142038	142043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129119
2559	NC_017856	GTT	2	6	142047	142052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129119
2560	NC_017856	GTCA	2	8	142183	142190	25 %	25 %	25 %	25 %	387129120
2561	NC_017856	TTG	2	6	142193	142198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129120
2562	NC_017856	GCC	2	6	142207	142212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129120
2563	NC_017856	CGGATA	2	12	142242	142253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387129120
2564	NC_017856	AAAT	2	8	142290	142297	75 %	25 %	0 %	0 %	387129120
2565	NC_017856	GT	3	6	142391	142396	0 %	50 %	50 %	0 %	387129120
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2569	NC_017856	ATG	2	6	142449	142454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129120
2570	NC_017856	A	6	6	142519	142524	100 %	0 %	0 %	0 %	387129120
2571	NC_017856	AAT	2	6	142532	142537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129120
2572	NC_017856	GGTCT	2	10	142594	142603	0 %	40 %	40 %	20 %	387129120
2573	NC_017856	TGA	2	6	142623	142628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129120
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2575	NC_017856	CAAT	2	8	142795	142802	50 %	25 %	0 %	25 %	387129120
2576	NC_017856	GTT	2	6	142816	142821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129120
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2579	NC_017856	CAT	2	6	142940	142945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129120
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2581	NC_017856	GCA	2	6	143119	143124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129121
2582	NC_017856	GCA	2	6	143223	143228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129121
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2586	NC_017856	CAT	2	6	143497	143502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129121
2587	NC_017856	ACG	2	6	143510	143515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129121
2588	NC_017856	T	6	6	143551	143556	0 %	100 %	0 %	0 %	387129121
2589	NC_017856	TGC	2	6	143578	143583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129121
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2592	NC_017856	ATC	2	6	143711	143716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129121
2593	NC_017856	CAA	2	6	143722	143727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129121
2594	NC_017856	GAT	2	6	143731	143736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129121
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2597	NC_017856	TAA	2	6	143915	143920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129121
2598	NC_017856	CTG	2	6	143921	143926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129121
2599	NC_017856	TC	3	6	144008	144013	0 %	50 %	0 %	50 %	387129121
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2602	NC_017856	ATG	2	6	144212	144217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129121
2603	NC_017856	TCA	2	6	144232	144237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129121
2604	NC_017856	A	6	6	144277	144282	100 %	0 %	0 %	0 %	387129121
2605	NC_017856	AATA	2	8	144410	144417	75 %	25 %	0 %	0 %	387129121
2606	NC_017856	A	6	6	144426	144431	100 %	0 %	0 %	0 %	387129121
2607	NC_017856	AAC	2	6	144459	144464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129121
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2609	NC_017856	A	7	7	144544	144550	100 %	0 %	0 %	0 %	387129121
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2619	NC_017856	TGG	2	6	145079	145084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129121
2620	NC_017856	CGC	2	6	145085	145090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129121
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2622	NC_017856	CAAG	2	8	145175	145182	50 %	0 %	25 %	25 %	387129121
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2984	NC_017856	TTG	2	6	167548	167553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129142
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2987	NC_017856	CGC	2	6	167812	167817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129142
2988	NC_017856	TAA	2	6	167839	167844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129142
2989	NC_017856	GCG	2	6	167928	167933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129142
2990	NC_017856	CTGG	2	8	167947	167954	0 %	25 %	50 %	25 %	387129142
2991	NC_017856	TTG	2	6	168008	168013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129142
2992	NC_017856	CTG	2	6	168016	168021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129142
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2994	NC_017856	TAA	2	6	168136	168141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129142
2995	NC_017856	A	6	6	168187	168192	100 %	0 %	0 %	0 %	387129142
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2998	NC_017856	AGGC	2	8	168313	168320	25 %	0 %	50 %	25 %	387129142
2999	NC_017856	AGC	2	6	168368	168373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129142
3000	NC_017856	ACCA	2	8	168377	168384	50 %	0 %	0 %	50 %	387129142

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