MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 47292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017856	CAAA	2	8	53406	53413	75 %	0 %	0 %	25 %	387129036
1003	NC_017856	A	6	6	53411	53416	100 %	0 %	0 %	0 %	387129036
1004	NC_017856	CTG	2	6	53418	53423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129036
1005	NC_017856	T	6	6	53450	53455	0 %	100 %	0 %	0 %	387129036
1006	NC_017856	CCA	2	6	53614	53619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129037
1007	NC_017856	ATTG	2	8	53731	53738	25 %	50 %	25 %	0 %	387129037
1008	NC_017856	TAT	2	6	53868	53873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129037
1009	NC_017856	A	6	6	53955	53960	100 %	0 %	0 %	0 %	387129037
1010	NC_017856	GTG	2	6	54019	54024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129037
1011	NC_017856	ATTC	2	8	54055	54062	25 %	50 %	0 %	25 %	387129037
1012	NC_017856	TGG	2	6	54072	54077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129037
1013	NC_017856	TCTGCT	2	12	54082	54093	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387129037
1014	NC_017856	CTG	2	6	54137	54142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129037
1015	NC_017856	TGG	2	6	54286	54291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129037
1016	NC_017856	ATG	2	6	54293	54298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129037
1017	NC_017856	CTGCC	2	10	54321	54330	0 %	20 %	20 %	60 %	387129037
1018	NC_017856	TA	3	6	54365	54370	50 %	50 %	0 %	0 %	387129037
1019	NC_017856	CAG	2	6	54413	54418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129037
1020	NC_017856	TCAG	2	8	54465	54472	25 %	25 %	25 %	25 %	387129037
1021	NC_017856	T	6	6	54638	54643	0 %	100 %	0 %	0 %	387129037
1022	NC_017856	TCG	2	6	54806	54811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129037
1023	NC_017856	TGG	2	6	54817	54822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129037
1024	NC_017856	AAACGG	2	12	54824	54835	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387129037
1025	NC_017856	GC	3	6	54836	54841	0 %	0 %	50 %	50 %	387129037
1026	NC_017856	GTCACC	2	12	54865	54876	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387129037
1027	NC_017856	TGT	2	6	54921	54926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129037
1028	NC_017856	GAA	2	6	54940	54945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387129037
1029	NC_017856	CCAT	2	8	54994	55001	25 %	25 %	0 %	50 %	387129037
1030	NC_017856	GAT	2	6	55021	55026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129037
1031	NC_017856	CTGG	2	8	55075	55082	0 %	25 %	50 %	25 %	387129037
1032	NC_017856	TGA	2	6	55098	55103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129037
1033	NC_017856	TGA	2	6	55134	55139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129037
1034	NC_017856	CGT	2	6	55272	55277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129037
1035	NC_017856	TGG	2	6	55299	55304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129037
1036	NC_017856	TGA	2	6	55308	55313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129037
1037	NC_017856	CAG	2	6	55322	55327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129037
1038	NC_017856	GAAT	2	8	55491	55498	50 %	25 %	25 %	0 %	387129037
1039	NC_017856	TTG	2	6	55504	55509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129037
1040	NC_017856	TTC	2	6	55609	55614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129038
1041	NC_017856	CAAT	2	8	55640	55647	50 %	25 %	0 %	25 %	387129038
1042	NC_017856	GGT	2	6	55648	55653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129038
1043	NC_017856	CCA	2	6	55729	55734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129038
1044	NC_017856	AGC	2	6	55769	55774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129038
1045	NC_017856	GTC	2	6	55775	55780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129038
1046	NC_017856	CAG	2	6	55781	55786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129038
1047	NC_017856	AGA	2	6	55815	55820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387129038
1048	NC_017856	AAC	2	6	55850	55855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129038
1049	NC_017856	CGG	3	9	55912	55920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129038
1050	NC_017856	ATG	2	6	55944	55949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129038
1051	NC_017856	TTA	2	6	55965	55970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129039
1052	NC_017856	GAT	2	6	55971	55976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129039
1053	NC_017856	GTG	2	6	56062	56067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129039
1054	NC_017856	TC	3	6	56102	56107	0 %	50 %	0 %	50 %	387129039
1055	NC_017856	GCA	3	9	56118	56126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129039
1056	NC_017856	TAT	2	6	56158	56163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129039
1057	NC_017856	CAA	2	6	56205	56210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129039
1058	NC_017856	TCA	2	6	56273	56278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129039
1059	NC_017856	TCAG	2	8	56419	56426	25 %	25 %	25 %	25 %	387129040
1060	NC_017856	CAGC	2	8	56455	56462	25 %	0 %	25 %	50 %	387129040
1061	NC_017856	TTC	2	6	56490	56495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129040
1062	NC_017856	TAA	2	6	56507	56512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129040
1063	NC_017856	AATC	2	8	56573	56580	50 %	25 %	0 %	25 %	387129040
1064	NC_017856	AAC	2	6	56593	56598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129040
1065	NC_017856	TCA	2	6	56647	56652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129040
1066	NC_017856	TAA	2	6	56789	56794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129040
1067	NC_017856	GTA	2	6	56798	56803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129040
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1071	NC_017856	T	6	6	57102	57107	0 %	100 %	0 %	0 %	387129040
1072	NC_017856	GCT	2	6	57205	57210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129040
1073	NC_017856	GCT	2	6	57234	57239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129040
1074	NC_017856	TGCT	2	8	57243	57250	0 %	50 %	25 %	25 %	387129040
1075	NC_017856	CATAAA	2	12	57275	57286	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387129040
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1078	NC_017856	GCT	2	6	57431	57436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129040
1079	NC_017856	CTA	2	6	57502	57507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129040
1080	NC_017856	CAT	2	6	57641	57646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129040
1081	NC_017856	GCG	2	6	57649	57654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129040
1082	NC_017856	CAT	2	6	57731	57736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129040
1083	NC_017856	ACC	2	6	57752	57757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129040
1084	NC_017856	GAC	2	6	57917	57922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129040
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1086	NC_017856	CT	3	6	58011	58016	0 %	50 %	0 %	50 %	387129040
1087	NC_017856	TTGA	2	8	58032	58039	25 %	50 %	25 %	0 %	387129040
1088	NC_017856	ATG	2	6	58053	58058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129040
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1091	NC_017856	ACG	2	6	58200	58205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129040
1092	NC_017856	T	6	6	58223	58228	0 %	100 %	0 %	0 %	387129040
1093	NC_017856	A	7	7	58281	58287	100 %	0 %	0 %	0 %	387129040
1094	NC_017856	A	7	7	58291	58297	100 %	0 %	0 %	0 %	387129040
1095	NC_017856	AAC	2	6	58314	58319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129040
1096	NC_017856	TAAC	2	8	58346	58353	50 %	25 %	0 %	25 %	387129040
1097	NC_017856	GT	3	6	58434	58439	0 %	50 %	50 %	0 %	387129040
1098	NC_017856	TTGCT	2	10	58443	58452	0 %	60 %	20 %	20 %	387129040
1099	NC_017856	GCC	2	6	58532	58537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129041
1100	NC_017856	AAT	2	6	58619	58624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129041
1101	NC_017856	AAC	2	6	58707	58712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129041
1102	NC_017856	GTC	2	6	58725	58730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129041
1103	NC_017856	CTG	2	6	58749	58754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129041
1104	NC_017856	GCG	2	6	58771	58776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129041
1105	NC_017856	ACT	2	6	58895	58900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129041
1106	NC_017856	TGG	2	6	58920	58925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129041
1107	NC_017856	CGA	2	6	58999	59004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129041
1108	NC_017856	TCA	3	9	59007	59015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129041
1109	NC_017856	ATG	2	6	59028	59033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129041
1110	NC_017856	GCT	2	6	59073	59078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129041
1111	NC_017856	CAC	2	6	59176	59181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129041
1112	NC_017856	GTC	2	6	59226	59231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129041
1113	NC_017856	AGC	2	6	59283	59288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129041
1114	NC_017856	CGA	2	6	59301	59306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129041
1115	NC_017856	CTC	2	6	59317	59322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387129041
1116	NC_017856	T	6	6	59335	59340	0 %	100 %	0 %	0 %	387129041
1117	NC_017856	A	7	7	59370	59376	100 %	0 %	0 %	0 %	387129041
1118	NC_017856	TAA	2	6	59765	59770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129042
1119	NC_017856	ATG	2	6	59817	59822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129042
1120	NC_017856	AAT	2	6	59843	59848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129042
1121	NC_017856	AAAC	2	8	59887	59894	75 %	0 %	0 %	25 %	387129042
1122	NC_017856	GCC	2	6	59940	59945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129042
1123	NC_017856	ACAA	2	8	59976	59983	75 %	0 %	0 %	25 %	387129042
1124	NC_017856	ATG	2	6	60048	60053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129042
1125	NC_017856	TAA	2	6	60235	60240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129042
1126	NC_017856	TGC	2	6	60363	60368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129042
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1155	NC_017856	TGA	2	6	62181	62186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129043
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