MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM7 chromosome

Total Repeats: 47292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017856	CGA	2	6	253876	253881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129234
4502	NC_017856	AGCCAT	2	12	253967	253978	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387129234
4503	NC_017856	CT	3	6	253996	254001	0 %	50 %	0 %	50 %	387129234
4504	NC_017856	CAT	2	6	254042	254047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129234
4505	NC_017856	CTAAA	2	10	254078	254087	60 %	20 %	0 %	20 %	387129234
4506	NC_017856	A	6	6	254100	254105	100 %	0 %	0 %	0 %	387129234
4507	NC_017856	GAATC	2	10	254169	254178	40 %	20 %	20 %	20 %	387129234
4508	NC_017856	GGC	2	6	254207	254212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129234
4509	NC_017856	ATT	2	6	254361	254366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129234
4510	NC_017856	TTC	2	6	254379	254384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129234
4511	NC_017856	ATT	2	6	254391	254396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129234
4512	NC_017856	AAT	2	6	254402	254407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129234
4513	NC_017856	ATC	2	6	254586	254591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129234
4514	NC_017856	CGA	2	6	254659	254664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129234
4515	NC_017856	GTT	2	6	254693	254698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129234
4516	NC_017856	CGT	2	6	254781	254786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129234
4517	NC_017856	GC	3	6	254890	254895	0 %	0 %	50 %	50 %	387129235
4518	NC_017856	CTG	2	6	254956	254961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129235
4519	NC_017856	ATC	2	6	255127	255132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129235
4520	NC_017856	CGC	2	6	255146	255151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129235
4521	NC_017856	CACAGG	2	12	255163	255174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129235
4522	NC_017856	TTCG	2	8	255209	255216	0 %	50 %	25 %	25 %	387129235
4523	NC_017856	CAT	2	6	255217	255222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129235
4524	NC_017856	GCA	2	6	255227	255232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129235
4525	NC_017856	ACG	2	6	255406	255411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129235
4526	NC_017856	ATA	2	6	255440	255445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129235
4527	NC_017856	TTG	2	6	255492	255497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129235
4528	NC_017856	CAG	2	6	255532	255537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129235
4529	NC_017856	ACCC	2	8	255579	255586	25 %	0 %	0 %	75 %	387129235
4530	NC_017856	ATT	2	6	255601	255606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129235
4531	NC_017856	GC	3	6	255631	255636	0 %	0 %	50 %	50 %	387129235
4532	NC_017856	CGT	2	6	255756	255761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129235
4533	NC_017856	TATT	2	8	255762	255769	25 %	75 %	0 %	0 %	387129235
4534	NC_017856	CAA	2	6	255822	255827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129235
4535	NC_017856	TTG	2	6	255832	255837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129235
4536	NC_017856	ATCA	2	8	255853	255860	50 %	25 %	0 %	25 %	387129235
4537	NC_017856	CAG	2	6	255861	255866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129235
4538	NC_017856	A	6	6	255868	255873	100 %	0 %	0 %	0 %	387129235
4539	NC_017856	GTAA	2	8	255887	255894	50 %	25 %	25 %	0 %	387129235
4540	NC_017856	TTC	2	6	255898	255903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129235
4541	NC_017856	GAT	2	6	255927	255932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129235
4542	NC_017856	CCA	3	9	255939	255947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129235
4543	NC_017856	ATT	2	6	256012	256017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129235
4544	NC_017856	TAA	2	6	256048	256053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129235
4545	NC_017856	GATT	2	8	256085	256092	25 %	50 %	25 %	0 %	387129235
4546	NC_017856	ATCA	2	8	256204	256211	50 %	25 %	0 %	25 %	387129235
4547	NC_017856	TCT	2	6	256212	256217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129235
4548	NC_017856	ATC	2	6	256240	256245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129235
4549	NC_017856	ATT	2	6	256273	256278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129235
4550	NC_017856	TGC	2	6	256316	256321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129235
4551	NC_017856	CTGA	2	8	256330	256337	25 %	25 %	25 %	25 %	387129235
4552	NC_017856	TCAAT	2	10	256353	256362	40 %	40 %	0 %	20 %	387129235
4553	NC_017856	TTC	2	6	256399	256404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129235
4554	NC_017856	ATT	2	6	256435	256440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129235
4555	NC_017856	ACG	2	6	256483	256488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129235
4556	NC_017856	TGA	2	6	256489	256494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129235
4557	NC_017856	GCT	2	6	256543	256548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129235
4558	NC_017856	ACT	2	6	256564	256569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129235
4559	NC_017856	ACT	2	6	256582	256587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129235
4560	NC_017856	TTA	2	6	256613	256618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387129235
4561	NC_017856	GGT	2	6	256625	256630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129235
4562	NC_017856	TTTCGC	2	12	256728	256739	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387129235
4563	NC_017856	TTC	2	6	256762	256767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129235
4564	NC_017856	TCA	3	9	256796	256804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129235
4565	NC_017856	T	6	6	256865	256870	0 %	100 %	0 %	0 %	387129235
4566	NC_017856	GATG	2	8	256872	256879	25 %	25 %	50 %	0 %	387129235
4567	NC_017856	CGC	2	6	256894	256899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129235
4568	NC_017856	AAT	2	6	256912	256917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129235
4569	NC_017856	ACGC	2	8	256941	256948	25 %	0 %	25 %	50 %	387129235
4570	NC_017856	ATC	2	6	256991	256996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129235
4571	NC_017856	GTG	2	6	256997	257002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387129235
4572	NC_017856	TCCT	2	8	257017	257024	0 %	50 %	0 %	50 %	387129235
4573	NC_017856	CGT	3	9	257086	257094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129235
4574	NC_017856	CGC	2	6	257139	257144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129235
4575	NC_017856	ACC	2	6	257162	257167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129235
4576	NC_017856	TCA	2	6	257214	257219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129235
4577	NC_017856	GCTG	2	8	257298	257305	0 %	25 %	50 %	25 %	387129236
4578	NC_017856	TTC	2	6	257385	257390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129236
4579	NC_017856	TAAT	2	8	257408	257415	50 %	50 %	0 %	0 %	387129236
4580	NC_017856	GAT	2	6	257560	257565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129236
4581	NC_017856	TCC	2	6	257667	257672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387129237
4582	NC_017856	GCCA	2	8	257673	257680	25 %	0 %	25 %	50 %	387129237
4583	NC_017856	A	6	6	257697	257702	100 %	0 %	0 %	0 %	387129237
4584	NC_017856	GCC	2	6	257727	257732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129237
4585	NC_017856	ATA	2	6	257802	257807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129237
4586	NC_017856	CCGAT	2	10	257934	257943	20 %	20 %	20 %	40 %	387129237
4587	NC_017856	AT	3	6	257964	257969	50 %	50 %	0 %	0 %	387129237
4588	NC_017856	CAC	2	6	258020	258025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129237
4589	NC_017856	ATC	2	6	258079	258084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129237
4590	NC_017856	ATA	2	6	258151	258156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129237
4591	NC_017856	AAT	2	6	258196	258201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129237
4592	NC_017856	TC	3	6	258208	258213	0 %	50 %	0 %	50 %	387129237
4593	NC_017856	GCA	2	6	258220	258225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129237
4594	NC_017856	ACC	2	6	258307	258312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129237
4595	NC_017856	T	8	8	258396	258403	0 %	100 %	0 %	0 %	387129237
4596	NC_017856	ATG	2	6	258427	258432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387129237
4597	NC_017856	CCA	3	9	258461	258469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129237
4598	NC_017856	CAT	2	6	258494	258499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129237
4599	NC_017856	T	7	7	258504	258510	0 %	100 %	0 %	0 %	387129237
4600	NC_017856	ATTTG	2	10	258589	258598	20 %	60 %	20 %	0 %	387129237
4601	NC_017856	CG	3	6	258633	258638	0 %	0 %	50 %	50 %	387129237
4602	NC_017856	ACG	2	6	258741	258746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387129237
4603	NC_017856	T	6	6	258747	258752	0 %	100 %	0 %	0 %	387129237
4604	NC_017856	AAC	2	6	258961	258966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129238
4605	NC_017856	CAC	2	6	259038	259043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129238
4606	NC_017856	TCA	2	6	259067	259072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129238
4607	NC_017856	AC	3	6	259123	259128	50 %	0 %	0 %	50 %	387129238
4608	NC_017856	AT	3	6	259147	259152	50 %	50 %	0 %	0 %	387129238
4609	NC_017856	TAA	2	6	259174	259179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387129238
4610	NC_017856	TTC	3	9	259186	259194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387129238
4611	NC_017856	GCT	2	6	259199	259204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129238
4612	NC_017856	GC	3	6	259212	259217	0 %	0 %	50 %	50 %	387129238
4613	NC_017856	GTC	2	6	259230	259235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129238
4614	NC_017856	TTGT	2	8	259331	259338	0 %	75 %	25 %	0 %	387129238
4615	NC_017856	A	6	6	259350	259355	100 %	0 %	0 %	0 %	387129238
4616	NC_017856	CGC	2	6	259372	259377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387129238
4617	NC_017856	CGG	2	6	259392	259397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387129238
4618	NC_017856	CCA	2	6	259419	259424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129238
4619	NC_017856	AACG	2	8	259451	259458	50 %	0 %	25 %	25 %	387129238
4620	NC_017856	ATCA	2	8	259510	259517	50 %	25 %	0 %	25 %	387129238
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4622	NC_017856	CAAA	2	8	259584	259591	75 %	0 %	0 %	25 %	387129238
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4987	NC_017856	CCAT	2	8	280090	280097	25 %	25 %	0 %	50 %	387129258
4988	NC_017856	CCA	2	6	280124	280129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129258
4989	NC_017856	A	6	6	280222	280227	100 %	0 %	0 %	0 %	387129258
4990	NC_017856	TGCG	2	8	280246	280253	0 %	25 %	50 %	25 %	387129258
4991	NC_017856	CCT	2	6	280318	280323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387129258
4992	NC_017856	CAA	2	6	280379	280384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387129258
4993	NC_017856	TAAT	2	8	280406	280413	50 %	50 %	0 %	0 %	387129258
4994	NC_017856	ATAA	2	8	280447	280454	75 %	25 %	0 %	0 %	387129258
4995	NC_017856	CTG	2	6	280624	280629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387129259
4996	NC_017856	ACT	2	6	280640	280645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387129259
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4998	NC_017856	TGT	2	6	280793	280798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387129259
4999	NC_017856	ACC	2	6	280844	280849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387129259
5000	NC_017856	AGA	2	6	280870	280875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387129259

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