MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac chromosome

Total Repeats: 59334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017527	AGG	2	6	21000	21005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000735
502	NC_017527	TCA	2	6	21023	21028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000736
503	NC_017527	CGG	2	6	21077	21082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000736
504	NC_017527	GAC	2	6	21123	21128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000736
505	NC_017527	CCG	2	6	21178	21183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000736
506	NC_017527	CCA	2	6	21191	21196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000736
507	NC_017527	GGA	2	6	21210	21215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000736
508	NC_017527	GGC	2	6	21216	21221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000736
509	NC_017527	CCT	2	6	21266	21271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000736
510	NC_017527	GCA	2	6	21305	21310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000736
511	NC_017527	TCT	2	6	21413	21418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000736
512	NC_017527	G	6	6	21419	21424	0 %	0 %	100 %	0 %	386000736
513	NC_017527	CAC	2	6	21438	21443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000736
514	NC_017527	CGG	2	6	21449	21454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000736
515	NC_017527	CGG	2	6	21461	21466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000736
516	NC_017527	CCTCA	2	10	21471	21480	20 %	20 %	0 %	60 %	386000736
517	NC_017527	GAC	2	6	21513	21518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000736
518	NC_017527	CAC	2	6	21552	21557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000736
519	NC_017527	CTT	2	6	21570	21575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000736
520	NC_017527	GAC	2	6	21642	21647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000736
521	NC_017527	CCA	2	6	21656	21661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000736
522	NC_017527	GGGT	2	8	21724	21731	0 %	25 %	75 %	0 %	386000736
523	NC_017527	TCG	2	6	21803	21808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000736
524	NC_017527	CGT	2	6	21833	21838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000736
525	NC_017527	CAC	2	6	21876	21881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000736
526	NC_017527	GGGCC	2	10	21956	21965	0 %	0 %	60 %	40 %	386000736
527	NC_017527	GGC	3	9	21972	21980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000736
528	NC_017527	CCG	2	6	22076	22081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000736
529	NC_017527	CAG	2	6	22140	22145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000736
530	NC_017527	G	6	6	22325	22330	0 %	0 %	100 %	0 %	386000737
531	NC_017527	GAG	4	12	22332	22343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000737
532	NC_017527	GGT	2	6	22376	22381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000737
533	NC_017527	C	8	8	22430	22437	0 %	0 %	0 %	100 %	386000737
534	NC_017527	AGG	3	9	22438	22446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000737
535	NC_017527	AGG	3	9	22474	22482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000737
536	NC_017527	GAG	2	6	22495	22500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000737
537	NC_017527	CTC	2	6	22506	22511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000737
538	NC_017527	GAG	2	6	22584	22589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000737
539	NC_017527	GCC	2	6	22668	22673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000737
540	NC_017527	GAG	2	6	22722	22727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000737
541	NC_017527	GGC	2	6	22752	22757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000737
542	NC_017527	GGA	2	6	22781	22786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000737
543	NC_017527	GTA	2	6	22803	22808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000737
544	NC_017527	GAA	2	6	22830	22835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000737
545	NC_017527	CCA	2	6	22838	22843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000737
546	NC_017527	CGG	3	9	22858	22866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000737
547	NC_017527	GAT	2	6	22878	22883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000737
548	NC_017527	GAG	2	6	22935	22940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000737
549	NC_017527	GA	4	8	22966	22973	50 %	0 %	50 %	0 %	386000737
550	NC_017527	CCT	2	6	22985	22990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000737
551	NC_017527	CGG	2	6	22991	22996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000737
552	NC_017527	GGC	2	6	23106	23111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000737
553	NC_017527	TCC	2	6	23122	23127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000737
554	NC_017527	CGT	2	6	23144	23149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000737
555	NC_017527	CCCCG	2	10	23195	23204	0 %	0 %	20 %	80 %	386000737
556	NC_017527	CTC	2	6	23235	23240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000737
557	NC_017527	CGT	2	6	23249	23254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000737
558	NC_017527	ATC	2	6	23290	23295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386000737
559	NC_017527	CGG	3	9	23309	23317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386000737
560	NC_017527	ACC	2	6	23350	23355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000737
561	NC_017527	GAA	2	6	23375	23380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000737
562	NC_017527	GGA	2	6	23381	23386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000737
563	NC_017527	GAG	2	6	23400	23405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000737
564	NC_017527	GA	4	8	23409	23416	50 %	0 %	50 %	0 %	386000737
565	NC_017527	GAC	2	6	23578	23583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000738
566	NC_017527	TCC	2	6	23612	23617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000738
567	NC_017527	CGT	2	6	23640	23645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000738
568	NC_017527	GCC	2	6	23648	23653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000738
569	NC_017527	CTT	2	6	23698	23703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386000738
570	NC_017527	TGG	2	6	23712	23717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000738
571	NC_017527	ACC	2	6	23730	23735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386000738
572	NC_017527	GAC	2	6	23797	23802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000738
573	NC_017527	GAA	2	6	23812	23817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000738
574	NC_017527	GTA	2	6	23824	23829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000738
575	NC_017527	CCT	2	6	23862	23867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000738
576	NC_017527	TCG	2	6	23900	23905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000738
577	NC_017527	CT	3	6	23962	23967	0 %	50 %	0 %	50 %	386000738
578	NC_017527	GGA	2	6	23986	23991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000738
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582	NC_017527	GCC	2	6	24408	24413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000739
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584	NC_017527	CGA	2	6	24421	24426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000739
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588	NC_017527	GAC	2	6	24600	24605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000739
589	NC_017527	G	7	7	24632	24638	0 %	0 %	100 %	0 %	386000739
590	NC_017527	TCC	2	6	24729	24734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000739
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593	NC_017527	GA	3	6	24921	24926	50 %	0 %	50 %	0 %	386000739
594	NC_017527	AGA	2	6	24976	24981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386000739
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596	NC_017527	GCT	2	6	25027	25032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000739
597	NC_017527	TCG	2	6	25060	25065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000739
598	NC_017527	TCC	2	6	25087	25092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000739
599	NC_017527	ATCCAG	2	12	25155	25166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386000739
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608	NC_017527	TCG	2	6	25495	25500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386000739
609	NC_017527	CCCG	2	8	25515	25522	0 %	0 %	25 %	75 %	386000739
610	NC_017527	GAG	2	6	25601	25606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000739
611	NC_017527	TCC	2	6	25617	25622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000739
612	NC_017527	CCGGG	2	10	25649	25658	0 %	0 %	60 %	40 %	386000739
613	NC_017527	GGA	2	6	25754	25759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000739
614	NC_017527	GAGCTG	2	12	25770	25781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386000739
615	NC_017527	CGA	2	6	25805	25810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386000739
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619	NC_017527	GA	3	6	26246	26251	50 %	0 %	50 %	0 %	386000740
620	NC_017527	GAG	2	6	26381	26386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386000740
621	NC_017527	CTC	2	6	26387	26392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386000740
622	NC_017527	AAC	2	6	26402	26407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386000740
623	NC_017527	CCG	2	6	26415	26420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386000740
624	NC_017527	GGT	2	6	26470	26475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386000740
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626	NC_017527	TGA	2	6	26500	26505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386000740
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