MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 100120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017524	TTG	2	6	181987	181992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996927
4002	NC_017524	CGC	2	6	182013	182018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996927
4003	NC_017524	CAG	2	6	182028	182033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996927
4004	NC_017524	ACG	2	6	182080	182085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996927
4005	NC_017524	GTG	2	6	182184	182189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996927
4006	NC_017524	CGGCC	2	10	182194	182203	0 %	0 %	40 %	60 %	385996927
4007	NC_017524	TGG	2	6	182255	182260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996927
4008	NC_017524	CTG	2	6	182382	182387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996927
4009	NC_017524	TGG	2	6	182389	182394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996927
4010	NC_017524	CCG	2	6	182450	182455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996927
4011	NC_017524	CCA	2	6	182466	182471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996927
4012	NC_017524	TGA	2	6	182483	182488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996927
4013	NC_017524	TGG	2	6	182513	182518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996927
4014	NC_017524	GCT	2	6	182538	182543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996927
4015	NC_017524	CCG	2	6	182549	182554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996927
4016	NC_017524	AGC	2	6	182593	182598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996927
4017	NC_017524	TGC	2	6	182620	182625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996927
4018	NC_017524	GCG	2	6	182671	182676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996927
4019	NC_017524	GCG	2	6	182729	182734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996927
4020	NC_017524	GAT	2	6	182820	182825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996927
4021	NC_017524	CGG	2	6	182826	182831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996927
4022	NC_017524	CG	3	6	182856	182861	0 %	0 %	50 %	50 %	385996927
4023	NC_017524	GTC	2	6	182868	182873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996927
4024	NC_017524	CGCAGA	2	12	183388	183399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4025	NC_017524	GGT	2	6	183413	183418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996928
4026	NC_017524	CGA	2	6	183434	183439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4027	NC_017524	ACG	2	6	183440	183445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4028	NC_017524	GTCGC	2	10	183468	183477	0 %	20 %	40 %	40 %	385996928
4029	NC_017524	GTG	2	6	183487	183492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996928
4030	NC_017524	GC	4	8	183524	183531	0 %	0 %	50 %	50 %	385996928
4031	NC_017524	GCC	2	6	183585	183590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996928
4032	NC_017524	CGT	2	6	183593	183598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4033	NC_017524	CGC	2	6	183610	183615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996928
4034	NC_017524	CGG	3	9	183619	183627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996928
4035	NC_017524	GC	3	6	183700	183705	0 %	0 %	50 %	50 %	385996928
4036	NC_017524	GTC	2	6	183782	183787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4037	NC_017524	TGC	2	6	183817	183822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4038	NC_017524	GAC	2	6	183860	183865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4039	NC_017524	GGC	2	6	183866	183871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996928
4040	NC_017524	GGTGCT	2	12	183893	183904	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385996928
4041	NC_017524	CGGCGT	2	12	183905	183916	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385996928
4042	NC_017524	GGCC	2	8	183917	183924	0 %	0 %	50 %	50 %	385996928
4043	NC_017524	GC	4	8	183955	183962	0 %	0 %	50 %	50 %	385996928
4044	NC_017524	CGA	3	9	184079	184087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4045	NC_017524	GC	3	6	184088	184093	0 %	0 %	50 %	50 %	385996928
4046	NC_017524	CAG	2	6	184095	184100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4047	NC_017524	GAA	2	6	184113	184118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996928
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4049	NC_017524	CAC	2	6	184145	184150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996928
4050	NC_017524	GCC	2	6	184165	184170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996928
4051	NC_017524	CCG	2	6	184189	184194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996928
4052	NC_017524	GTG	3	9	184224	184232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996928
4053	NC_017524	GGC	2	6	184251	184256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996928
4054	NC_017524	GTC	2	6	184287	184292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4055	NC_017524	ACG	2	6	184297	184302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4056	NC_017524	TTG	2	6	184392	184397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996928
4057	NC_017524	CGA	3	9	184427	184435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996928
4058	NC_017524	GT	3	6	184451	184456	0 %	50 %	50 %	0 %	385996928
4059	NC_017524	TTG	2	6	184491	184496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996929
4060	NC_017524	TCG	2	6	184528	184533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996929
4061	NC_017524	GC	3	6	184621	184626	0 %	0 %	50 %	50 %	385996929
4062	NC_017524	TGG	2	6	184627	184632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996929
4063	NC_017524	TCG	2	6	184681	184686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996929
4064	NC_017524	GGT	2	6	184688	184693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996929
4065	NC_017524	CGG	2	6	184715	184720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996929
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4069	NC_017524	CGA	2	6	184793	184798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996929
4070	NC_017524	CAT	2	6	184840	184845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996930
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4105	NC_017524	GCA	2	6	185803	185808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996930
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4107	NC_017524	GCCG	2	8	185879	185886	0 %	0 %	50 %	50 %	385996930
4108	NC_017524	TGC	2	6	185907	185912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996930
4109	NC_017524	GGCCGA	2	12	185914	185925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385996930
4110	NC_017524	ACG	2	6	185934	185939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996930
4111	NC_017524	GAC	2	6	185954	185959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996930
4112	NC_017524	ACG	2	6	185964	185969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996930
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4118	NC_017524	GC	3	6	186235	186240	0 %	0 %	50 %	50 %	385996930
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4120	NC_017524	GAG	2	6	186580	186585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996931
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4242	NC_017524	TGC	2	6	193793	193798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996936
4243	NC_017524	CAA	2	6	193800	193805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996936
4244	NC_017524	AGC	2	6	193835	193840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996936
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4246	NC_017524	AGC	2	6	193847	193852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996936
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4346	NC_017524	CGG	2	6	198545	198550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996941
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4351	NC_017524	GGC	2	6	198930	198935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996941
4352	NC_017524	ACC	2	6	198997	199002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996941
4353	NC_017524	GGC	3	9	199050	199058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996941
4354	NC_017524	CGG	2	6	199095	199100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996941
4355	NC_017524	G	6	6	199115	199120	0 %	0 %	100 %	0 %	385996941
4356	NC_017524	CGCT	2	8	199208	199215	0 %	25 %	25 %	50 %	385996941
4357	NC_017524	GCG	2	6	199219	199224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996941
4358	NC_017524	TTG	2	6	199291	199296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996941
4359	NC_017524	CCA	2	6	199313	199318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996941
4360	NC_017524	AATCGG	2	12	199329	199340	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385996941
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4362	NC_017524	GGC	2	6	199414	199419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996941
4363	NC_017524	GC	3	6	199418	199423	0 %	0 %	50 %	50 %	385996941
4364	NC_017524	G	6	6	199479	199484	0 %	0 %	100 %	0 %	385996941
4365	NC_017524	CGT	2	6	199667	199672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996942
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4469	NC_017524	CTC	2	6	204251	204256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996945
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4473	NC_017524	GCGG	2	8	204368	204375	0 %	0 %	75 %	25 %	385996945
4474	NC_017524	CGA	2	6	204416	204421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996945
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4479	NC_017524	GACCT	2	10	204807	204816	20 %	20 %	20 %	40 %	385996945
4480	NC_017524	GC	3	6	204869	204874	0 %	0 %	50 %	50 %	385996945
4481	NC_017524	AC	3	6	204928	204933	50 %	0 %	0 %	50 %	385996945
4482	NC_017524	GGC	2	6	204954	204959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996945
4483	NC_017524	TCG	2	6	205047	205052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996946
4484	NC_017524	TAC	2	6	205064	205069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996946
4485	NC_017524	TGG	2	6	205086	205091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996946
4486	NC_017524	TCC	2	6	205349	205354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996946
4487	NC_017524	TGC	2	6	205455	205460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996946
4488	NC_017524	CGA	2	6	205462	205467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996946
4489	NC_017524	GGTG	2	8	205480	205487	0 %	25 %	75 %	0 %	385996946
4490	NC_017524	TCG	2	6	205533	205538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996946
4491	NC_017524	CAT	2	6	205573	205578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996946
4492	NC_017524	GC	3	6	205640	205645	0 %	0 %	50 %	50 %	385996946
4493	NC_017524	GGC	2	6	205711	205716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996946
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4495	NC_017524	TTG	2	6	205838	205843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996946
4496	NC_017524	TCC	2	6	205848	205853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996946
4497	NC_017524	TGC	2	6	205900	205905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996946
4498	NC_017524	CCG	3	9	205937	205945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996946
4499	NC_017524	TTC	2	6	205959	205964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996946
4500	NC_017524	G	6	6	206061	206066	0 %	0 %	100 %	0 %	385996946

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