MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 100120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017524	GCCG	2	8	48704	48711	0 %	0 %	50 %	50 %	385996815
1003	NC_017524	AGC	2	6	48748	48753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996815
1004	NC_017524	AAG	2	6	48880	48885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996815
1005	NC_017524	CGG	2	6	48928	48933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996815
1006	NC_017524	G	6	6	48959	48964	0 %	0 %	100 %	0 %	385996815
1007	NC_017524	TGC	2	6	48967	48972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996815
1008	NC_017524	GT	3	6	49049	49054	0 %	50 %	50 %	0 %	385996816
1009	NC_017524	GC	3	6	49084	49089	0 %	0 %	50 %	50 %	385996816
1010	NC_017524	CGA	2	6	49124	49129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996816
1011	NC_017524	CGG	2	6	49169	49174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996816
1012	NC_017524	CGA	2	6	49197	49202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996816
1013	NC_017524	GCC	2	6	49203	49208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996816
1014	NC_017524	CGT	2	6	49244	49249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996816
1015	NC_017524	CGG	2	6	49321	49326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996816
1016	NC_017524	CGC	2	6	49340	49345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996816
1017	NC_017524	GCT	2	6	49454	49459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996816
1018	NC_017524	CGG	2	6	49460	49465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996816
1019	NC_017524	CGA	2	6	49505	49510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996816
1020	NC_017524	GCG	2	6	49649	49654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996816
1021	NC_017524	TCC	2	6	49666	49671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996816
1022	NC_017524	CGA	2	6	49730	49735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996816
1023	NC_017524	CCG	3	9	49765	49773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996816
1024	NC_017524	GCC	2	6	49800	49805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996816
1025	NC_017524	CAGCG	2	10	49807	49816	20 %	0 %	40 %	40 %	385996816
1026	NC_017524	CAGC	2	8	49889	49896	25 %	0 %	25 %	50 %	385996816
1027	NC_017524	TCG	2	6	49924	49929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996816
1028	NC_017524	GAT	2	6	50028	50033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996817
1029	NC_017524	GC	5	10	50048	50057	0 %	0 %	50 %	50 %	385996817
1030	NC_017524	GTC	2	6	50061	50066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996817
1031	NC_017524	GCT	2	6	50072	50077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996817
1032	NC_017524	CGGG	2	8	50078	50085	0 %	0 %	75 %	25 %	385996817
1033	NC_017524	TCA	2	6	50090	50095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996817
1034	NC_017524	CCG	2	6	50122	50127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996817
1035	NC_017524	GCC	2	6	50152	50157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996817
1036	NC_017524	GAT	2	6	50169	50174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996817
1037	NC_017524	GCCG	2	8	50178	50185	0 %	0 %	50 %	50 %	385996817
1038	NC_017524	TCG	2	6	50281	50286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996817
1039	NC_017524	TCT	2	6	50378	50383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996817
1040	NC_017524	GCC	2	6	50430	50435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996817
1041	NC_017524	CGC	2	6	50468	50473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996817
1042	NC_017524	GGTG	2	8	50501	50508	0 %	25 %	75 %	0 %	385996817
1043	NC_017524	TCG	2	6	50510	50515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996817
1044	NC_017524	TCA	2	6	50536	50541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996817
1045	NC_017524	CGA	2	6	50543	50548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996817
1046	NC_017524	CTT	2	6	50571	50576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996817
1047	NC_017524	TCC	2	6	50671	50676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996817
1048	NC_017524	CCT	2	6	50717	50722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996817
1049	NC_017524	GAC	2	6	50733	50738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996817
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1052	NC_017524	CTT	2	6	50904	50909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996817
1053	NC_017524	CGC	2	6	50925	50930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996817
1054	NC_017524	GTC	2	6	51000	51005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996817
1055	NC_017524	GTA	3	9	51012	51020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996817
1056	NC_017524	GCCGAC	2	12	51054	51065	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385996817
1057	NC_017524	CTCA	2	8	51117	51124	25 %	25 %	0 %	50 %	385996817
1058	NC_017524	CGG	2	6	51197	51202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996818
1059	NC_017524	TGC	2	6	51210	51215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996818
1060	NC_017524	CGCT	2	8	51256	51263	0 %	25 %	25 %	50 %	385996818
1061	NC_017524	CTG	2	6	51313	51318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996818
1062	NC_017524	GGC	2	6	51365	51370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996818
1063	NC_017524	GAA	2	6	51417	51422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996818
1064	NC_017524	CGT	2	6	51443	51448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996818
1065	NC_017524	TG	3	6	51458	51463	0 %	50 %	50 %	0 %	385996818
1066	NC_017524	CCA	2	6	51476	51481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996818
1067	NC_017524	CGT	2	6	51526	51531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996818
1068	NC_017524	CGC	2	6	51535	51540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996818
1069	NC_017524	GGC	2	6	51558	51563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996818
1070	NC_017524	CAG	2	6	51645	51650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996818
1071	NC_017524	CCG	2	6	51887	51892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996819
1072	NC_017524	ACAACG	3	18	51909	51926	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385996819
1073	NC_017524	GTG	2	6	51935	51940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996819
1074	NC_017524	CGA	2	6	51957	51962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996819
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1080	NC_017524	CAG	2	6	52243	52248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996819
1081	NC_017524	CCG	2	6	52259	52264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996819
1082	NC_017524	CAC	2	6	52294	52299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996819
1083	NC_017524	CAG	2	6	52393	52398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996819
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1089	NC_017524	GT	3	6	52890	52895	0 %	50 %	50 %	0 %	385996820
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1093	NC_017524	CG	3	6	53044	53049	0 %	0 %	50 %	50 %	385996820
1094	NC_017524	CCG	2	6	53052	53057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996820
1095	NC_017524	CTG	2	6	53069	53074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996820
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1102	NC_017524	ACCA	2	8	53742	53749	50 %	0 %	0 %	50 %	385996821
1103	NC_017524	CG	3	6	53921	53926	0 %	0 %	50 %	50 %	385996821
1104	NC_017524	AAC	2	6	53937	53942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996821
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1107	NC_017524	CAG	2	6	53982	53987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996821
1108	NC_017524	CGA	2	6	54067	54072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996821
1109	NC_017524	TGC	2	6	54103	54108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996821
1110	NC_017524	CAT	2	6	54122	54127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996821
1111	NC_017524	CGG	2	6	54157	54162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996821
1112	NC_017524	AGC	2	6	54193	54198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996821
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1114	NC_017524	CGG	2	6	54237	54242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996821
1115	NC_017524	CGG	2	6	54259	54264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996821
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1119	NC_017524	GCC	2	6	54374	54379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996821
1120	NC_017524	CGA	2	6	54470	54475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996821
1121	NC_017524	TGG	2	6	54499	54504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996821
1122	NC_017524	CAC	3	9	54506	54514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996821
1123	NC_017524	GCG	2	6	54537	54542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996821
1124	NC_017524	GCC	2	6	54591	54596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996821
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1228	NC_017524	CAA	2	6	58937	58942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996825
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1230	NC_017524	CCGGCG	2	12	58980	58991	0 %	0 %	50 %	50 %	385996825
1231	NC_017524	CAG	2	6	58997	59002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996825
1232	NC_017524	GTTC	2	8	59044	59051	0 %	50 %	25 %	25 %	385996825
1233	NC_017524	GGC	3	9	59052	59060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996825
1234	NC_017524	GCG	2	6	59140	59145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996826
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1237	NC_017524	CG	4	8	59267	59274	0 %	0 %	50 %	50 %	385996826
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1242	NC_017524	TCG	2	6	59519	59524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996827
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1244	NC_017524	CCG	2	6	59559	59564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996827
1245	NC_017524	GGC	2	6	59616	59621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996827
1246	NC_017524	GTT	2	6	59679	59684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996827
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1248	NC_017524	TGC	2	6	59712	59717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996827
1249	NC_017524	AAG	2	6	59722	59727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996827
1250	NC_017524	TGCACC	2	12	59810	59821	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385996827
1251	NC_017524	CGT	2	6	59850	59855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996827
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1363	NC_017524	GC	3	6	64410	64415	0 %	0 %	50 %	50 %	385996831
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1371	NC_017524	CGA	2	6	64920	64925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996831
1372	NC_017524	GCT	2	6	65027	65032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996832
1373	NC_017524	CGGA	2	8	65033	65040	25 %	0 %	50 %	25 %	385996832
1374	NC_017524	ACC	2	6	65055	65060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996832
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1376	NC_017524	CCG	2	6	65089	65094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996832
1377	NC_017524	ACTTCA	2	12	65339	65350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996832
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1379	NC_017524	GTC	2	6	65632	65637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996833
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1392	NC_017524	CGA	2	6	66148	66153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996833
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1402	NC_017524	GCC	2	6	66963	66968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996834
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1479	NC_017524	GGCAA	2	10	70515	70524	40 %	0 %	40 %	20 %	385996835
1480	NC_017524	ACG	2	6	70572	70577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996835
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1482	NC_017524	GAC	2	6	70607	70612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996835
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1489	NC_017524	CGACC	2	10	70804	70813	20 %	0 %	20 %	60 %	385996835
1490	NC_017524	ACG	2	6	70815	70820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996835
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1495	NC_017524	GAT	2	6	71035	71040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996835
1496	NC_017524	CTG	2	6	71072	71077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996835
1497	NC_017524	CGG	2	6	71131	71136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996835
1498	NC_017524	GCGT	2	8	71226	71233	0 %	25 %	50 %	25 %	385996835
1499	NC_017524	CGGGT	2	10	71258	71267	0 %	20 %	60 %	20 %	385996835
1500	NC_017524	GGTCG	2	10	71318	71327	0 %	20 %	60 %	20 %	385996835

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