MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 100120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017524	GCG	2	6	570920	570925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997254
13002	NC_017524	GC	3	6	570927	570932	0 %	0 %	50 %	50 %	385997254
13003	NC_017524	CGAC	2	8	570998	571005	25 %	0 %	25 %	50 %	385997254
13004	NC_017524	TTC	2	6	571030	571035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385997254
13005	NC_017524	GGT	2	6	571044	571049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997254
13006	NC_017524	CCA	2	6	571088	571093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997254
13007	NC_017524	CGGTC	2	10	571101	571110	0 %	20 %	40 %	40 %	385997254
13008	NC_017524	GCC	2	6	571144	571149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997254
13009	NC_017524	GGCT	2	8	571150	571157	0 %	25 %	50 %	25 %	385997254
13010	NC_017524	GCC	2	6	571201	571206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997254
13011	NC_017524	CCA	2	6	571220	571225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997254
13012	NC_017524	GCGCTG	2	12	571231	571242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385997254
13013	NC_017524	CCG	2	6	571262	571267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997254
13014	NC_017524	GC	4	8	571285	571292	0 %	0 %	50 %	50 %	385997254
13015	NC_017524	ATG	2	6	571310	571315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997254
13016	NC_017524	AACCCG	2	12	571334	571345	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385997254
13017	NC_017524	TGT	2	6	571361	571366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997254
13018	NC_017524	C	6	6	571488	571493	0 %	0 %	0 %	100 %	385997255
13019	NC_017524	GCC	2	6	571609	571614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997255
13020	NC_017524	GCC	2	6	571652	571657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997255
13021	NC_017524	GTG	2	6	571661	571666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997255
13022	NC_017524	GGCA	2	8	571732	571739	25 %	0 %	50 %	25 %	385997255
13023	NC_017524	GTC	2	6	571742	571747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997255
13024	NC_017524	ACGAC	2	10	571803	571812	40 %	0 %	20 %	40 %	385997255
13025	NC_017524	CAC	2	6	571876	571881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997255
13026	NC_017524	ATT	2	6	571958	571963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385997255
13027	NC_017524	GCC	2	6	571991	571996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997255
13028	NC_017524	ACC	2	6	572018	572023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997255
13029	NC_017524	GGC	2	6	572039	572044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997255
13030	NC_017524	CGA	2	6	572059	572064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997255
13031	NC_017524	TAC	2	6	572102	572107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997255
13032	NC_017524	CGG	2	6	572109	572114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997255
13033	NC_017524	ACC	2	6	572117	572122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997255
13034	NC_017524	GTCGAC	2	12	572123	572134	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385997255
13035	NC_017524	GC	3	6	572175	572180	0 %	0 %	50 %	50 %	385997255
13036	NC_017524	GTC	3	9	572208	572216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997255
13037	NC_017524	GGT	2	6	572218	572223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997255
13038	NC_017524	TCG	2	6	572237	572242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997255
13039	NC_017524	GTC	2	6	572255	572260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997255
13040	NC_017524	TCA	2	6	572274	572279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997255
13041	NC_017524	GC	3	6	572315	572320	0 %	0 %	50 %	50 %	385997255
13042	NC_017524	CGT	2	6	572344	572349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997255
13043	NC_017524	GCC	2	6	572387	572392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997255
13044	NC_017524	CAA	2	6	572434	572439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385997255
13045	NC_017524	TAC	2	6	572540	572545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997255
13046	NC_017524	CGG	2	6	572676	572681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997255
13047	NC_017524	CGG	2	6	572688	572693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997255
13048	NC_017524	ACT	2	6	572762	572767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997255
13049	NC_017524	GGGT	2	8	572776	572783	0 %	25 %	75 %	0 %	385997255
13050	NC_017524	CGG	2	6	572888	572893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997256
13051	NC_017524	CTA	2	6	572894	572899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997256
13052	NC_017524	CG	3	6	572928	572933	0 %	0 %	50 %	50 %	385997256
13053	NC_017524	CAG	2	6	573018	573023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997256
13054	NC_017524	CGC	2	6	573026	573031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997256
13055	NC_017524	GC	3	6	573047	573052	0 %	0 %	50 %	50 %	385997256
13056	NC_017524	GCC	2	6	573084	573089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997256
13057	NC_017524	GGTGAC	2	12	573117	573128	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385997256
13058	NC_017524	GCA	2	6	573161	573166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997256
13059	NC_017524	GC	3	6	573167	573172	0 %	0 %	50 %	50 %	385997256
13060	NC_017524	CATC	2	8	573210	573217	25 %	25 %	0 %	50 %	385997256
13061	NC_017524	ATCGGC	2	12	573231	573242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385997256
13062	NC_017524	GTT	2	6	573273	573278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385997256
13063	NC_017524	GC	3	6	573302	573307	0 %	0 %	50 %	50 %	385997256
13064	NC_017524	CGG	2	6	573323	573328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997256
13065	NC_017524	CGT	2	6	573329	573334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997256
13066	NC_017524	CCG	2	6	573361	573366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997256
13067	NC_017524	GTC	2	6	573514	573519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997256
13068	NC_017524	GCC	2	6	573787	573792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997257
13069	NC_017524	CGTC	2	8	573822	573829	0 %	25 %	25 %	50 %	385997257
13070	NC_017524	CGGT	2	8	573855	573862	0 %	25 %	50 %	25 %	385997257
13071	NC_017524	CTG	2	6	573926	573931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
13072	NC_017524	CCT	2	6	573940	573945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385997257
13073	NC_017524	GCGG	2	8	573952	573959	0 %	0 %	75 %	25 %	385997257
13074	NC_017524	ACC	2	6	574055	574060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385997257
13075	NC_017524	GACCCC	2	12	574108	574119	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385997257
13076	NC_017524	GGCGCC	2	12	574185	574196	0 %	0 %	50 %	50 %	385997257
13077	NC_017524	TGG	2	6	574222	574227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997257
13078	NC_017524	GCG	2	6	574381	574386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997257
13079	NC_017524	TCG	2	6	574400	574405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
13080	NC_017524	TGA	2	6	574449	574454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997257
13081	NC_017524	CGG	2	6	574528	574533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997257
13082	NC_017524	CGA	2	6	574561	574566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997257
13083	NC_017524	GCT	2	6	574577	574582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
13084	NC_017524	CCG	2	6	574585	574590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997257
13085	NC_017524	ATC	2	6	574598	574603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997257
13086	NC_017524	TGC	2	6	574659	574664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
13087	NC_017524	GCT	2	6	574699	574704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
13088	NC_017524	GCT	2	6	574741	574746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997257
13089	NC_017524	CGA	2	6	574765	574770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997257
13090	NC_017524	GTG	3	9	574772	574780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997257
13091	NC_017524	GGC	2	6	574828	574833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997257
13092	NC_017524	AGG	2	6	574899	574904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385997257
13093	NC_017524	GGCA	2	8	574909	574916	25 %	0 %	50 %	25 %	385997257
13094	NC_017524	GCG	2	6	574960	574965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997257
13095	NC_017524	GC	3	6	574971	574976	0 %	0 %	50 %	50 %	385997257
13096	NC_017524	GTCCG	2	10	575117	575126	0 %	20 %	40 %	40 %	385997258
13097	NC_017524	CG	3	6	575147	575152	0 %	0 %	50 %	50 %	385997258
13098	NC_017524	GCA	2	6	575185	575190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997258
13099	NC_017524	GAC	2	6	575191	575196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997258
13100	NC_017524	GCT	2	6	575211	575216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
13101	NC_017524	CGG	2	6	575262	575267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997258
13102	NC_017524	TGC	2	6	575282	575287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
13103	NC_017524	GGT	2	6	575364	575369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997258
13104	NC_017524	GTG	2	6	575401	575406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997258
13105	NC_017524	CCCA	2	8	575443	575450	25 %	0 %	0 %	75 %	385997258
13106	NC_017524	CGC	2	6	575463	575468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997258
13107	NC_017524	TGC	2	6	575474	575479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
13108	NC_017524	GC	3	6	575478	575483	0 %	0 %	50 %	50 %	385997258
13109	NC_017524	TAC	2	6	575506	575511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997258
13110	NC_017524	ACT	2	6	575528	575533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385997258
13111	NC_017524	GGCT	2	8	575551	575558	0 %	25 %	50 %	25 %	385997258
13112	NC_017524	GC	3	6	575560	575565	0 %	0 %	50 %	50 %	385997258
13113	NC_017524	CA	3	6	575597	575602	50 %	0 %	0 %	50 %	385997258
13114	NC_017524	GCC	2	6	575608	575613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997258
13115	NC_017524	GAA	2	6	575616	575621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385997258
13116	NC_017524	CGACGG	2	12	575634	575645	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385997258
13117	NC_017524	GCC	2	6	575652	575657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385997258
13118	NC_017524	AGC	2	6	575675	575680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997258
13119	NC_017524	GTC	2	6	575683	575688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
13120	NC_017524	CGA	2	6	575718	575723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997258
13121	NC_017524	GC	3	6	575823	575828	0 %	0 %	50 %	50 %	385997258
13122	NC_017524	GTG	2	6	575866	575871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997258
13123	NC_017524	TCG	2	6	575876	575881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
13124	NC_017524	TGC	2	6	575915	575920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997258
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13151	NC_017524	CTG	2	6	576744	576749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997259
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13157	NC_017524	GTC	2	6	576926	576931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997259
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13214	NC_017524	GGC	2	6	579693	579698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385997262
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13218	NC_017524	ACCG	2	8	579880	579887	25 %	0 %	25 %	50 %	385997262
13219	NC_017524	GCATCG	2	12	579890	579901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385997262
13220	NC_017524	TTC	2	6	579934	579939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385997262
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13222	NC_017524	GC	3	6	579952	579957	0 %	0 %	50 %	50 %	385997262
13223	NC_017524	ACG	2	6	580019	580024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997262
13224	NC_017524	ACG	3	9	580103	580111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997262
13225	NC_017524	TGA	2	6	580387	580392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385997263
13226	NC_017524	GT	3	6	580396	580401	0 %	50 %	50 %	0 %	385997263
13227	NC_017524	GGA	2	6	580409	580414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385997263
13228	NC_017524	GAG	2	6	580416	580421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385997263
13229	NC_017524	CTG	2	6	580446	580451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997263
13230	NC_017524	AGG	2	6	580456	580461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385997263
13231	NC_017524	GGT	2	6	580475	580480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997263
13232	NC_017524	TGC	2	6	580549	580554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997263
13233	NC_017524	GC	3	6	580589	580594	0 %	0 %	50 %	50 %	385997263
13234	NC_017524	GGT	2	6	580649	580654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385997263
13235	NC_017524	GAC	2	6	580674	580679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385997263
13236	NC_017524	CGCA	2	8	580715	580722	25 %	0 %	25 %	50 %	385997263
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13238	NC_017524	TGC	2	6	580732	580737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385997263
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