MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 100120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017524	GCC	2	6	24161	24166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
502	NC_017524	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	385996792
503	NC_017524	CGTAGT	2	12	24229	24240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385996792
504	NC_017524	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	385996792
505	NC_017524	GAG	2	6	24274	24279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996792
506	NC_017524	GCC	3	9	24326	24334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
507	NC_017524	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	385996792
508	NC_017524	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	385996792
509	NC_017524	CTC	2	6	24455	24460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385996792
510	NC_017524	CCG	2	6	24495	24500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
511	NC_017524	GCC	2	6	24512	24517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
512	NC_017524	GCC	2	6	24536	24541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
513	NC_017524	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	385996792
514	NC_017524	AGG	2	6	24605	24610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996792
515	NC_017524	GCG	2	6	24625	24630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996792
516	NC_017524	C	6	6	24636	24641	0 %	0 %	0 %	100 %	385996792
517	NC_017524	CCTGGT	2	12	24667	24678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996792
518	NC_017524	GCC	2	6	24821	24826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
519	NC_017524	C	6	6	24842	24847	0 %	0 %	0 %	100 %	385996792
520	NC_017524	CCA	2	6	24879	24884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996792
521	NC_017524	GTC	2	6	24914	24919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996792
522	NC_017524	TCG	2	6	24927	24932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996792
523	NC_017524	GCCCCT	2	12	24937	24948	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385996792
524	NC_017524	CGG	2	6	25043	25048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996792
525	NC_017524	CGA	2	6	25109	25114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996792
526	NC_017524	GAC	2	6	25127	25132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996792
527	NC_017524	ATG	2	6	25254	25259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996792
528	NC_017524	GCC	2	6	25311	25316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996792
529	NC_017524	GCA	2	6	25324	25329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996792
530	NC_017524	GC	3	6	25920	25925	0 %	0 %	50 %	50 %	385996793
531	NC_017524	CGC	2	6	25943	25948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996793
532	NC_017524	TTG	2	6	25949	25954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996793
533	NC_017524	CGG	2	6	25975	25980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996793
534	NC_017524	CGG	2	6	26017	26022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996793
535	NC_017524	GCA	2	6	26049	26054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996793
536	NC_017524	CTT	2	6	26080	26085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996793
537	NC_017524	GT	3	6	26154	26159	0 %	50 %	50 %	0 %	385996793
538	NC_017524	GTG	2	6	26199	26204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996793
539	NC_017524	GTC	2	6	26213	26218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996793
540	NC_017524	GCC	2	6	26226	26231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996793
541	NC_017524	AGC	2	6	26232	26237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996793
542	NC_017524	CGG	2	6	26305	26310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996793
543	NC_017524	CGG	2	6	26326	26331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996793
544	NC_017524	CGG	2	6	26359	26364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996793
545	NC_017524	CG	3	6	26388	26393	0 %	0 %	50 %	50 %	385996793
546	NC_017524	CGA	2	6	26404	26409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996793
547	NC_017524	CCA	2	6	26476	26481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996793
548	NC_017524	GCTC	2	8	26505	26512	0 %	25 %	25 %	50 %	385996793
549	NC_017524	CGG	2	6	26554	26559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996793
550	NC_017524	AGC	2	6	26640	26645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996793
551	NC_017524	TGA	2	6	26671	26676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996793
552	NC_017524	GCG	2	6	26700	26705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996793
553	NC_017524	CCAA	2	8	26722	26729	50 %	0 %	0 %	50 %	385996793
554	NC_017524	GCC	2	6	26744	26749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996793
555	NC_017524	CAGC	2	8	26788	26795	25 %	0 %	25 %	50 %	385996793
556	NC_017524	CCG	2	6	26799	26804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996793
557	NC_017524	CAC	2	6	26876	26881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996793
558	NC_017524	CAC	2	6	27065	27070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996794
559	NC_017524	CAG	2	6	27113	27118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996794
560	NC_017524	CGC	2	6	27154	27159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996794
561	NC_017524	GCA	2	6	27172	27177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996794
562	NC_017524	GCC	2	6	27218	27223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996794
563	NC_017524	GCT	2	6	27292	27297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996794
564	NC_017524	GCG	2	6	27369	27374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996794
565	NC_017524	CGT	2	6	27385	27390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996794
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567	NC_017524	GGC	2	6	27666	27671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996795
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569	NC_017524	GCC	2	6	27771	27776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996795
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572	NC_017524	CCG	2	6	27867	27872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996795
573	NC_017524	GTC	2	6	27883	27888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996795
574	NC_017524	CGA	2	6	27977	27982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996795
575	NC_017524	TC	3	6	28008	28013	0 %	50 %	0 %	50 %	385996795
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577	NC_017524	CCGG	2	8	28094	28101	0 %	0 %	50 %	50 %	385996795
578	NC_017524	CG	3	6	28133	28138	0 %	0 %	50 %	50 %	385996795
579	NC_017524	GC	3	6	28139	28144	0 %	0 %	50 %	50 %	385996795
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582	NC_017524	CGA	2	6	28248	28253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996795
583	NC_017524	GC	3	6	28292	28297	0 %	0 %	50 %	50 %	385996795
584	NC_017524	TCG	2	6	28316	28321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996795
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591	NC_017524	CTG	2	6	28552	28557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996796
592	NC_017524	TCA	2	6	28585	28590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996796
593	NC_017524	CGG	2	6	28620	28625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996796
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595	NC_017524	GCTC	2	8	28650	28657	0 %	25 %	25 %	50 %	385996796
596	NC_017524	ACC	2	6	28662	28667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996796
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599	NC_017524	CGA	2	6	28758	28763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996796
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602	NC_017524	TGCG	2	8	28789	28796	0 %	25 %	50 %	25 %	385996796
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604	NC_017524	CAC	2	6	29003	29008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996796
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609	NC_017524	GGCAA	2	10	29301	29310	40 %	0 %	40 %	20 %	385996797
610	NC_017524	ACG	2	6	29312	29317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996797
611	NC_017524	GC	3	6	29360	29365	0 %	0 %	50 %	50 %	385996797
612	NC_017524	CGTC	2	8	29385	29392	0 %	25 %	25 %	50 %	385996797
613	NC_017524	CG	3	6	29422	29427	0 %	0 %	50 %	50 %	385996797
614	NC_017524	GGATCA	2	12	29433	29444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385996797
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619	NC_017524	ACCG	2	8	29826	29833	25 %	0 %	25 %	50 %	385996798
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624	NC_017524	CGATC	2	10	30127	30136	20 %	20 %	20 %	40 %	385996798
625	NC_017524	CCGG	2	8	30145	30152	0 %	0 %	50 %	50 %	385996798
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