MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 100120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017524	GAG	2	6	227979	227984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996966
5002	NC_017524	GC	3	6	228027	228032	0 %	0 %	50 %	50 %	385996966
5003	NC_017524	CGG	2	6	228047	228052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966
5004	NC_017524	CAACGC	2	12	228054	228065	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385996966
5005	NC_017524	GTT	2	6	228101	228106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996966
5006	NC_017524	GAC	2	6	228114	228119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5007	NC_017524	AGG	2	6	228160	228165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996966
5008	NC_017524	TGC	2	6	228166	228171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5009	NC_017524	CGC	2	6	228210	228215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996966
5010	NC_017524	CGA	2	6	228287	228292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5011	NC_017524	GT	3	6	228381	228386	0 %	50 %	50 %	0 %	385996966
5012	NC_017524	GCA	2	6	228419	228424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5013	NC_017524	CACC	2	8	228456	228463	25 %	0 %	0 %	75 %	385996966
5014	NC_017524	CGC	2	6	228480	228485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996966
5015	NC_017524	CTG	2	6	228486	228491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5016	NC_017524	CTG	2	6	228522	228527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5017	NC_017524	TGG	2	6	228529	228534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5018	NC_017524	CTG	2	6	228555	228560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5019	NC_017524	CGC	2	6	228600	228605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996966
5020	NC_017524	TGG	2	6	228624	228629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5021	NC_017524	CGT	2	6	228737	228742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5022	NC_017524	GCCTGG	2	12	228760	228771	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385996966
5023	NC_017524	GAC	2	6	228783	228788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5024	NC_017524	CCG	2	6	228817	228822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996966
5025	NC_017524	GTG	2	6	228879	228884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5026	NC_017524	TGG	2	6	228901	228906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5027	NC_017524	GCT	2	6	228908	228913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5028	NC_017524	CAC	2	6	228947	228952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996966
5029	NC_017524	CGG	2	6	229011	229016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966
5030	NC_017524	CGG	2	6	229063	229068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966
5031	NC_017524	GAC	2	6	229134	229139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5032	NC_017524	GCT	2	6	229169	229174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5033	NC_017524	TAC	2	6	229182	229187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996966
5034	NC_017524	ACC	2	6	229218	229223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996966
5035	NC_017524	TCGG	2	8	229269	229276	0 %	25 %	50 %	25 %	385996966
5036	NC_017524	TGT	2	6	229309	229314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996966
5037	NC_017524	CGA	2	6	229346	229351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
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5039	NC_017524	GGC	2	6	229370	229375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966
5040	NC_017524	GCT	2	6	229391	229396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5041	NC_017524	CGT	2	6	229411	229416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5042	NC_017524	CGG	2	6	229420	229425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966
5043	NC_017524	GTG	2	6	229447	229452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5044	NC_017524	CCGG	2	8	229530	229537	0 %	0 %	50 %	50 %	385996966
5045	NC_017524	GGT	2	6	229544	229549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5046	NC_017524	TCG	2	6	229552	229557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5047	NC_017524	TGG	2	6	229594	229599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
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5049	NC_017524	GAT	2	6	229811	229816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996966
5050	NC_017524	CCG	2	6	229873	229878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996966
5051	NC_017524	CTG	3	9	229932	229940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5052	NC_017524	GTG	2	6	229980	229985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
5053	NC_017524	CACCCT	2	12	229994	230005	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	385996966
5054	NC_017524	GAC	2	6	230018	230023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5055	NC_017524	GCT	2	6	230127	230132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996966
5056	NC_017524	GGC	2	6	230156	230161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966
5057	NC_017524	GGT	2	6	230682	230687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996967
5058	NC_017524	GCGA	2	8	230689	230696	25 %	0 %	50 %	25 %	385996967
5059	NC_017524	GC	3	6	230754	230759	0 %	0 %	50 %	50 %	385996967
5060	NC_017524	CCA	2	6	230801	230806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996967
5061	NC_017524	GTC	3	9	230878	230886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996967
5062	NC_017524	CGA	2	6	230889	230894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996967
5063	NC_017524	GAT	2	6	230919	230924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996967
5064	NC_017524	GTT	2	6	230943	230948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996967
5065	NC_017524	TCG	2	6	230978	230983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996967
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5068	NC_017524	CCG	2	6	231071	231076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996967
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5070	NC_017524	GCC	2	6	231094	231099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996967
5071	NC_017524	TGC	2	6	231125	231130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996967
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5073	NC_017524	CGCA	2	8	231244	231251	25 %	0 %	25 %	50 %	385996967
5074	NC_017524	TGCGC	2	10	231264	231273	0 %	20 %	40 %	40 %	385996967
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5086	NC_017524	CG	3	6	231757	231762	0 %	0 %	50 %	50 %	385996968
5087	NC_017524	GCG	2	6	231767	231772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996968
5088	NC_017524	CCG	2	6	231827	231832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996968
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5090	NC_017524	CGC	2	6	231915	231920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996968
5091	NC_017524	CTG	3	9	231950	231958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996968
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5104	NC_017524	CGG	2	6	232434	232439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996969
5105	NC_017524	CG	3	6	232445	232450	0 %	0 %	50 %	50 %	385996969
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5110	NC_017524	CGT	2	6	232584	232589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996969
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5113	NC_017524	GAG	2	6	232798	232803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996969
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5120	NC_017524	GTG	2	6	233056	233061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996969
5121	NC_017524	GAG	2	6	233065	233070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996969
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5228	NC_017524	GAC	2	6	237249	237254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996972
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5232	NC_017524	GCGG	2	8	237394	237401	0 %	0 %	75 %	25 %	385996972
5233	NC_017524	GGC	2	6	237474	237479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996972
5234	NC_017524	GCG	2	6	237568	237573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996972
5235	NC_017524	GGCT	2	8	237610	237617	0 %	25 %	50 %	25 %	385996972
5236	NC_017524	CGCT	2	8	237642	237649	0 %	25 %	25 %	50 %	385996972
5237	NC_017524	CGG	2	6	237656	237661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996973
5238	NC_017524	GCC	2	6	237698	237703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996973
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5241	NC_017524	CTT	2	6	237944	237949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996973
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5244	NC_017524	GCTC	2	8	238088	238095	0 %	25 %	25 %	50 %	385996973
5245	NC_017524	GTT	2	6	238109	238114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996973
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5355	NC_017524	CGA	2	6	242829	242834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996976
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5358	NC_017524	G	6	6	242893	242898	0 %	0 %	100 %	0 %	385996976
5359	NC_017524	GCGG	2	8	242947	242954	0 %	0 %	75 %	25 %	385996976
5360	NC_017524	CGT	2	6	242958	242963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996976
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5363	NC_017524	TCG	2	6	243270	243275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996977
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5483	NC_017524	GAA	2	6	248192	248197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996980
5484	NC_017524	GCA	2	6	248239	248244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996980
5485	NC_017524	AGC	2	6	248313	248318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996980
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5499	NC_017524	GGGT	2	8	248927	248934	0 %	25 %	75 %	0 %	385996981
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