MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 100120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017524	GCG	2	6	206105	206110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996946
4502	NC_017524	GC	3	6	206210	206215	0 %	0 %	50 %	50 %	385996946
4503	NC_017524	CCG	2	6	206286	206291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996946
4504	NC_017524	CCG	2	6	206312	206317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996946
4505	NC_017524	GCA	2	6	206368	206373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996946
4506	NC_017524	CGG	2	6	206412	206417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996946
4507	NC_017524	TGG	2	6	206442	206447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996946
4508	NC_017524	GAC	2	6	206495	206500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996946
4509	NC_017524	GGC	2	6	206574	206579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4510	NC_017524	CGG	2	6	206585	206590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4511	NC_017524	GGC	2	6	206631	206636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4512	NC_017524	CGG	2	6	206642	206647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4513	NC_017524	TCG	2	6	206696	206701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996947
4514	NC_017524	GCG	2	6	206703	206708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4515	NC_017524	GCG	2	6	206721	206726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4516	NC_017524	GGCT	2	8	206728	206735	0 %	25 %	50 %	25 %	385996947
4517	NC_017524	GCG	2	6	206746	206751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996947
4518	NC_017524	GCT	2	6	206754	206759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996947
4519	NC_017524	TTGCG	2	10	206795	206804	0 %	40 %	40 %	20 %	385996947
4520	NC_017524	CAAT	2	8	206821	206828	50 %	25 %	0 %	25 %	385996947
4521	NC_017524	CG	4	8	206829	206836	0 %	0 %	50 %	50 %	385996947
4522	NC_017524	TTGCG	2	10	206868	206877	0 %	40 %	40 %	20 %	385996947
4523	NC_017524	AGA	2	6	206921	206926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996947
4524	NC_017524	CGT	2	6	206963	206968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996947
4525	NC_017524	TCG	2	6	206984	206989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996947
4526	NC_017524	GC	3	6	207033	207038	0 %	0 %	50 %	50 %	385996947
4527	NC_017524	CAA	3	9	207051	207059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996947
4528	NC_017524	GTCG	2	8	207066	207073	0 %	25 %	50 %	25 %	385996947
4529	NC_017524	TGG	2	6	207080	207085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996947
4530	NC_017524	GGT	3	9	207212	207220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996948
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4532	NC_017524	CGGG	2	8	207282	207289	0 %	0 %	75 %	25 %	385996948
4533	NC_017524	TGC	2	6	207307	207312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996948
4534	NC_017524	GGC	2	6	207326	207331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996948
4535	NC_017524	GCC	2	6	207359	207364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996948
4536	NC_017524	GGT	2	6	207379	207384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996948
4537	NC_017524	GTT	3	9	207434	207442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996948
4538	NC_017524	CGA	2	6	207445	207450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996948
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4540	NC_017524	TGG	2	6	207556	207561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996948
4541	NC_017524	TGT	2	6	207631	207636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996948
4542	NC_017524	CGG	3	9	207697	207705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996948
4543	NC_017524	GGC	3	9	207713	207721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996948
4544	NC_017524	GGT	2	6	207758	207763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996948
4545	NC_017524	AATG	2	8	207771	207778	50 %	25 %	25 %	0 %	385996948
4546	NC_017524	CG	3	6	207795	207800	0 %	0 %	50 %	50 %	385996948
4547	NC_017524	CCGC	2	8	207908	207915	0 %	0 %	25 %	75 %	385996948
4548	NC_017524	TGT	2	6	208024	208029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996948
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4550	NC_017524	CG	3	6	208105	208110	0 %	0 %	50 %	50 %	385996948
4551	NC_017524	CGA	2	6	208124	208129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996948
4552	NC_017524	TGA	2	6	208141	208146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996948
4553	NC_017524	CGT	2	6	208181	208186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996949
4554	NC_017524	GCT	2	6	208210	208215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996949
4555	NC_017524	AGC	2	6	208345	208350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996949
4556	NC_017524	CCACG	2	10	208453	208462	20 %	0 %	20 %	60 %	385996949
4557	NC_017524	TGG	2	6	208596	208601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996949
4558	NC_017524	GGT	2	6	208639	208644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996949
4559	NC_017524	CAG	2	6	208702	208707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996949
4560	NC_017524	CGC	2	6	208803	208808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996950
4561	NC_017524	GCC	2	6	208831	208836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996950
4562	NC_017524	GAT	2	6	208861	208866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996950
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4564	NC_017524	GTT	2	6	208956	208961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996950
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4569	NC_017524	CCG	2	6	209051	209056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996950
4570	NC_017524	ACG	2	6	209068	209073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996950
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4589	NC_017524	ATC	2	6	209912	209917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996951
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4592	NC_017524	TTGG	2	8	209995	210002	0 %	50 %	50 %	0 %	385996951
4593	NC_017524	C	6	6	210074	210079	0 %	0 %	0 %	100 %	385996951
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4598	NC_017524	TGA	2	6	210285	210290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996951
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4601	NC_017524	GTT	2	6	210307	210312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996951
4602	NC_017524	ACC	2	6	210328	210333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996951
4603	NC_017524	AGC	2	6	210341	210346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996951
4604	NC_017524	CCG	3	9	210359	210367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996951
4605	NC_017524	TGG	3	9	210393	210401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996951
4606	NC_017524	CGG	2	6	210432	210437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996951
4607	NC_017524	CGGC	2	8	210444	210451	0 %	0 %	50 %	50 %	385996951
4608	NC_017524	GGT	2	6	210457	210462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996951
4609	NC_017524	GCG	2	6	210473	210478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996951
4610	NC_017524	CAGCA	2	10	210535	210544	40 %	0 %	20 %	40 %	385996951
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4618	NC_017524	CGCC	2	8	210964	210971	0 %	0 %	25 %	75 %	385996952
4619	NC_017524	CAC	2	6	211172	211177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996952
4620	NC_017524	GA	3	6	211213	211218	50 %	0 %	50 %	0 %	385996952
4621	NC_017524	CCA	2	6	211285	211290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996952
4622	NC_017524	CAC	2	6	211298	211303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996952
4623	NC_017524	TGC	2	6	211306	211311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996952
4624	NC_017524	AGC	2	6	211329	211334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996952
4625	NC_017524	GTA	2	6	211343	211348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996952
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4631	NC_017524	CGA	2	6	211652	211657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996952
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4729	NC_017524	GGC	2	6	215730	215735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996957
4730	NC_017524	GGC	2	6	215761	215766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996957
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4733	NC_017524	CGT	2	6	215949	215954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996957
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4735	NC_017524	CGA	3	9	216029	216037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996958
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4737	NC_017524	TTG	2	6	216168	216173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996958
4738	NC_017524	CCG	2	6	216241	216246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996958
4739	NC_017524	GC	3	6	216315	216320	0 %	0 %	50 %	50 %	385996958
4740	NC_017524	CAAT	2	8	216352	216359	50 %	25 %	0 %	25 %	385996958
4741	NC_017524	GC	3	6	216363	216368	0 %	0 %	50 %	50 %	385996958
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4985	NC_017524	ATGG	2	8	227417	227424	25 %	25 %	50 %	0 %	385996966
4986	NC_017524	GCA	2	6	227434	227439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
4987	NC_017524	TTG	2	6	227455	227460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996966
4988	NC_017524	GCCT	2	8	227469	227476	0 %	25 %	25 %	50 %	385996966
4989	NC_017524	CGGC	2	8	227490	227497	0 %	0 %	50 %	50 %	385996966
4990	NC_017524	CAG	2	6	227529	227534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996966
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4992	NC_017524	GCCG	2	8	227575	227582	0 %	0 %	50 %	50 %	385996966
4993	NC_017524	CCGGG	2	10	227702	227711	0 %	0 %	60 %	40 %	385996966
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4997	NC_017524	GGT	2	6	227811	227816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996966
4998	NC_017524	GCC	2	6	227923	227928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996966
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5000	NC_017524	GCG	2	6	227967	227972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996966

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