MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 96472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017523	GCCG	2	8	167262	167269	0 %	0 %	50 %	50 %	385993254
3502	NC_017523	GCC	2	6	167295	167300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993254
3503	NC_017523	CCA	2	6	167333	167338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993254
3504	NC_017523	GC	3	6	167368	167373	0 %	0 %	50 %	50 %	385993254
3505	NC_017523	TCG	2	6	167401	167406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993254
3506	NC_017523	CCGCC	2	10	167462	167471	0 %	0 %	20 %	80 %	385993254
3507	NC_017523	CGT	2	6	167472	167477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993254
3508	NC_017523	CG	3	6	167500	167505	0 %	0 %	50 %	50 %	385993254
3509	NC_017523	GCC	2	6	167526	167531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993254
3510	NC_017523	AGA	2	6	167609	167614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993254
3511	NC_017523	CCG	2	6	167710	167715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993254
3512	NC_017523	AGC	2	6	167763	167768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993254
3513	NC_017523	CGG	2	6	168150	168155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993255
3514	NC_017523	CGC	2	6	168190	168195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993255
3515	NC_017523	ACT	2	6	168285	168290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993255
3516	NC_017523	CAA	2	6	168295	168300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993255
3517	NC_017523	GGT	2	6	168319	168324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993255
3518	NC_017523	CGC	2	6	168371	168376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993255
3519	NC_017523	GGC	2	6	168393	168398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993255
3520	NC_017523	GTC	2	6	168404	168409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993255
3521	NC_017523	CCA	2	6	168465	168470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993255
3522	NC_017523	ATG	2	6	168561	168566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993255
3523	NC_017523	GCC	2	6	168587	168592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993255
3524	NC_017523	TG	3	6	168636	168641	0 %	50 %	50 %	0 %	385993255
3525	NC_017523	CAG	2	6	168707	168712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993255
3526	NC_017523	GGC	2	6	168732	168737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993255
3527	NC_017523	CGA	2	6	168848	168853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993256
3528	NC_017523	CGG	2	6	168940	168945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993256
3529	NC_017523	GTC	2	6	169010	169015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993256
3530	NC_017523	CTT	2	6	169130	169135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993256
3531	NC_017523	CGA	2	6	169136	169141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993256
3532	NC_017523	GCC	2	6	169152	169157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993256
3533	NC_017523	GGT	2	6	169178	169183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993256
3534	NC_017523	CGG	2	6	169231	169236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993256
3535	NC_017523	TTC	2	6	169291	169296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993256
3536	NC_017523	CGA	2	6	169352	169357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993256
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3538	NC_017523	CTACC	2	10	169428	169437	20 %	20 %	0 %	60 %	385993256
3539	NC_017523	CGC	2	6	169448	169453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993256
3540	NC_017523	GCGA	2	8	169564	169571	25 %	0 %	50 %	25 %	385993256
3541	NC_017523	TGGC	2	8	169638	169645	0 %	25 %	50 %	25 %	385993256
3542	NC_017523	TGGC	2	8	169652	169659	0 %	25 %	50 %	25 %	385993256
3543	NC_017523	GAG	2	6	169683	169688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385993256
3544	NC_017523	CGA	2	6	169727	169732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993256
3545	NC_017523	CAC	2	6	169742	169747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993256
3546	NC_017523	TGC	2	6	169750	169755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993256
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3551	NC_017523	GGC	2	6	170027	170032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993257
3552	NC_017523	TCG	2	6	170059	170064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993257
3553	NC_017523	CTT	2	6	170099	170104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993257
3554	NC_017523	CGC	2	6	170129	170134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993257
3555	NC_017523	CCG	2	6	170200	170205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993257
3556	NC_017523	GATC	2	8	170222	170229	25 %	25 %	25 %	25 %	385993257
3557	NC_017523	ACG	2	6	170256	170261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993257
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3560	NC_017523	GCAC	2	8	170367	170374	25 %	0 %	25 %	50 %	385993257
3561	NC_017523	TACC	2	8	170403	170410	25 %	25 %	0 %	50 %	385993257
3562	NC_017523	GCG	2	6	170507	170512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993257
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3566	NC_017523	CGC	2	6	170885	170890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993258
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3573	NC_017523	CGC	2	6	171123	171128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993258
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3581	NC_017523	CGC	2	6	171417	171422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993258
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3591	NC_017523	GCG	2	6	171923	171928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993258
3592	NC_017523	GTC	2	6	171967	171972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993258
3593	NC_017523	TGA	2	6	171995	172000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993258
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3597	NC_017523	ATG	2	6	172162	172167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993258
3598	NC_017523	GGT	2	6	172213	172218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993258
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3601	NC_017523	CCCGA	2	10	172304	172313	20 %	0 %	20 %	60 %	385993258
3602	NC_017523	CCG	2	6	172333	172338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993258
3603	NC_017523	GC	3	6	172347	172352	0 %	0 %	50 %	50 %	385993258
3604	NC_017523	TCG	2	6	172481	172486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993259
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3606	NC_017523	CGT	2	6	172551	172556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993259
3607	NC_017523	GTC	2	6	172618	172623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993259
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3609	NC_017523	CAT	2	6	172698	172703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993259
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3612	NC_017523	GTG	2	6	172894	172899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993259
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3616	NC_017523	CGCTGG	2	12	172985	172996	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385993259
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3979	NC_017523	GC	3	6	188340	188345	0 %	0 %	50 %	50 %	385993272
3980	NC_017523	CGGCT	2	10	188356	188365	0 %	20 %	40 %	40 %	385993272
3981	NC_017523	TGC	2	6	188382	188387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993272
3982	NC_017523	GGC	2	6	188426	188431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993272
3983	NC_017523	TGG	2	6	188442	188447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993272
3984	NC_017523	ACG	3	9	188466	188474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993272
3985	NC_017523	TGC	2	6	188475	188480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993272
3986	NC_017523	CGT	2	6	188500	188505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993272
3987	NC_017523	GCA	2	6	188569	188574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993272
3988	NC_017523	CGC	2	6	188575	188580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993272
3989	NC_017523	GGCTG	2	10	188587	188596	0 %	20 %	60 %	20 %	385993272
3990	NC_017523	CGA	2	6	188652	188657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993272
3991	NC_017523	CGG	2	6	188662	188667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993272
3992	NC_017523	ACGGT	2	10	188733	188742	20 %	20 %	40 %	20 %	385993272
3993	NC_017523	ACA	2	6	188772	188777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993272
3994	NC_017523	TCG	2	6	188802	188807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993272
3995	NC_017523	CACCC	2	10	188855	188864	20 %	0 %	0 %	80 %	385993272
3996	NC_017523	GCCG	2	8	188921	188928	0 %	0 %	50 %	50 %	385993272
3997	NC_017523	ATTG	2	8	188965	188972	25 %	50 %	25 %	0 %	385993272
3998	NC_017523	GCC	2	6	188981	188986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993272
3999	NC_017523	C	7	7	189016	189022	0 %	0 %	0 %	100 %	385993272
4000	NC_017523	TGG	2	6	189045	189050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993272

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