MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 96472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017523	TCG	2	6	25787	25792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993145
502	NC_017523	GCCCCT	2	12	25797	25808	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385993145
503	NC_017523	CGG	2	6	25903	25908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993145
504	NC_017523	CGA	2	6	25969	25974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993145
505	NC_017523	GAC	2	6	25987	25992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993145
506	NC_017523	ATG	2	6	26114	26119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993145
507	NC_017523	GCC	2	6	26171	26176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993145
508	NC_017523	GCA	2	6	26184	26189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993145
509	NC_017523	GC	3	6	26780	26785	0 %	0 %	50 %	50 %	385993146
510	NC_017523	CGC	2	6	26803	26808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993146
511	NC_017523	TTG	2	6	26809	26814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993146
512	NC_017523	CGG	2	6	26835	26840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
513	NC_017523	CGG	2	6	26877	26882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
514	NC_017523	GCA	2	6	26909	26914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993146
515	NC_017523	CTT	2	6	26940	26945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993146
516	NC_017523	GT	3	6	27014	27019	0 %	50 %	50 %	0 %	385993146
517	NC_017523	GTG	2	6	27059	27064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993146
518	NC_017523	GTC	2	6	27073	27078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993146
519	NC_017523	GCC	2	6	27086	27091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993146
520	NC_017523	AGC	2	6	27092	27097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993146
521	NC_017523	CGG	2	6	27165	27170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
522	NC_017523	CGG	2	6	27186	27191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
523	NC_017523	CGG	2	6	27219	27224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
524	NC_017523	CG	3	6	27248	27253	0 %	0 %	50 %	50 %	385993146
525	NC_017523	CGA	2	6	27264	27269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993146
526	NC_017523	CCA	2	6	27336	27341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993146
527	NC_017523	GCTC	2	8	27365	27372	0 %	25 %	25 %	50 %	385993146
528	NC_017523	CGG	2	6	27414	27419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
529	NC_017523	AGC	2	6	27500	27505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993146
530	NC_017523	TGA	2	6	27531	27536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993146
531	NC_017523	GCG	2	6	27560	27565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993146
532	NC_017523	CCAA	2	8	27582	27589	50 %	0 %	0 %	50 %	385993146
533	NC_017523	GCC	2	6	27604	27609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993146
534	NC_017523	CAGC	2	8	27648	27655	25 %	0 %	25 %	50 %	385993146
535	NC_017523	CCG	2	6	27659	27664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993146
536	NC_017523	CAC	2	6	27736	27741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993146
537	NC_017523	CA	3	6	28588	28593	50 %	0 %	0 %	50 %	385993147
538	NC_017523	GCC	2	6	28631	28636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993147
539	NC_017523	CGC	2	6	28661	28666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993147
540	NC_017523	CGC	2	6	28697	28702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993147
541	NC_017523	CCG	2	6	28727	28732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993147
542	NC_017523	GTC	2	6	28743	28748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993147
543	NC_017523	CGA	2	6	28837	28842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993147
544	NC_017523	TC	3	6	28868	28873	0 %	50 %	0 %	50 %	385993147
545	NC_017523	GCC	2	6	28908	28913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993147
546	NC_017523	CCGG	2	8	28954	28961	0 %	0 %	50 %	50 %	385993147
547	NC_017523	CG	3	6	28993	28998	0 %	0 %	50 %	50 %	385993147
548	NC_017523	GC	3	6	28999	29004	0 %	0 %	50 %	50 %	385993147
549	NC_017523	GTC	2	6	29060	29065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993147
550	NC_017523	TCGGCG	2	12	29095	29106	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385993147
551	NC_017523	CGA	2	6	29108	29113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993147
552	NC_017523	GC	3	6	29152	29157	0 %	0 %	50 %	50 %	385993147
553	NC_017523	TCG	2	6	29176	29181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993147
554	NC_017523	ACG	2	6	29200	29205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993147
555	NC_017523	GCA	2	6	29216	29221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993147
556	NC_017523	TCA	2	6	29256	29261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993148
557	NC_017523	CAC	2	6	29304	29309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993148
558	NC_017523	CTG	2	6	29323	29328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993148
559	NC_017523	GGC	2	6	29397	29402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993148
560	NC_017523	CTG	2	6	29411	29416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993148
561	NC_017523	TCA	2	6	29444	29449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993148
562	NC_017523	CGG	2	6	29479	29484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993148
563	NC_017523	CGA	2	6	29502	29507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993148
564	NC_017523	GCTC	2	8	29509	29516	0 %	25 %	25 %	50 %	385993148
565	NC_017523	ACC	2	6	29521	29526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993148
566	NC_017523	CGT	2	6	29569	29574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993148
567	NC_017523	GC	4	8	29586	29593	0 %	0 %	50 %	50 %	385993148
568	NC_017523	CGA	2	6	29617	29622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993148
569	NC_017523	ACG	2	6	29628	29633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993148
570	NC_017523	GGC	2	6	29640	29645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993148
571	NC_017523	TGCG	2	8	29648	29655	0 %	25 %	50 %	25 %	385993148
572	NC_017523	CGC	2	6	29745	29750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993148
573	NC_017523	CAC	2	6	29862	29867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993148
574	NC_017523	CCGG	2	8	29913	29920	0 %	0 %	50 %	50 %	385993148
575	NC_017523	CAA	2	6	29967	29972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993148
576	NC_017523	GTC	2	6	29977	29982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993148
577	NC_017523	CAA	2	6	30027	30032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993148
578	NC_017523	GGCAA	2	10	30160	30169	40 %	0 %	40 %	20 %	385993149
579	NC_017523	ACG	2	6	30171	30176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993149
580	NC_017523	GC	3	6	30219	30224	0 %	0 %	50 %	50 %	385993149
581	NC_017523	CGTC	2	8	30244	30251	0 %	25 %	25 %	50 %	385993149
582	NC_017523	CG	3	6	30281	30286	0 %	0 %	50 %	50 %	385993149
583	NC_017523	GGATCA	2	12	30292	30303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385993149
584	NC_017523	AGC	2	6	30360	30365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993149
585	NC_017523	GTC	2	6	30380	30385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993149
586	NC_017523	GCC	3	9	30386	30394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993149
587	NC_017523	CACG	2	8	30604	30611	25 %	0 %	25 %	50 %	385993150
588	NC_017523	ACCG	2	8	30685	30692	25 %	0 %	25 %	50 %	385993150
589	NC_017523	GGT	2	6	30703	30708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993150
590	NC_017523	CGC	2	6	30814	30819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993150
591	NC_017523	AGC	2	6	30841	30846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993150
592	NC_017523	GTC	2	6	30890	30895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993150
593	NC_017523	CGATC	2	10	30986	30995	20 %	20 %	20 %	40 %	385993150
594	NC_017523	CCGG	2	8	31004	31011	0 %	0 %	50 %	50 %	385993150
595	NC_017523	CG	3	6	31012	31017	0 %	0 %	50 %	50 %	385993150
596	NC_017523	GGT	2	6	31063	31068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993150
597	NC_017523	GCC	2	6	31112	31117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993150
598	NC_017523	GTCG	2	8	31180	31187	0 %	25 %	50 %	25 %	385993150
599	NC_017523	GCG	2	6	31194	31199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993150
600	NC_017523	CAG	2	6	31220	31225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993150
601	NC_017523	CCT	2	6	31258	31263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385993150
602	NC_017523	GCT	3	9	31270	31278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993150
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604	NC_017523	GC	3	6	31431	31436	0 %	0 %	50 %	50 %	385993150
605	NC_017523	CTG	2	6	31460	31465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993150
606	NC_017523	CGA	2	6	31501	31506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993150
607	NC_017523	AAG	2	6	31515	31520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993150
608	NC_017523	CGA	2	6	31573	31578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993150
609	NC_017523	CGA	2	6	31591	31596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993150
610	NC_017523	CGA	2	6	31638	31643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993150
611	NC_017523	CGC	2	6	31693	31698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993150
612	NC_017523	GGC	3	9	31708	31716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993150
613	NC_017523	CAA	2	6	31745	31750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993150
614	NC_017523	CCCG	2	8	31802	31809	0 %	0 %	25 %	75 %	385993150
615	NC_017523	GT	3	6	31830	31835	0 %	50 %	50 %	0 %	385993150
616	NC_017523	GCCCTT	2	12	31846	31857	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385993150
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618	NC_017523	CCG	2	6	32112	32117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993151
619	NC_017523	CGT	2	6	32136	32141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993151
620	NC_017523	ACG	2	6	32145	32150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993151
621	NC_017523	GCT	2	6	32215	32220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993151
622	NC_017523	CAG	2	6	32243	32248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993151
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624	NC_017523	CGAG	2	8	32314	32321	25 %	0 %	50 %	25 %	385993151
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626	NC_017523	GGC	2	6	32474	32479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993152
627	NC_017523	CCG	2	6	32524	32529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993152
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737	NC_017523	GCTG	2	8	38761	38768	0 %	25 %	50 %	25 %	385993158
738	NC_017523	TGG	2	6	38791	38796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993158
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744	NC_017523	TGGCC	2	10	39110	39119	0 %	20 %	40 %	40 %	385993158
745	NC_017523	CGC	3	9	39179	39187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993158
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749	NC_017523	CGC	2	6	39239	39244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993158
750	NC_017523	GCG	2	6	39277	39282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993158
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752	NC_017523	GAA	2	6	39314	39319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385993158
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999	NC_017523	CGC	2	6	51948	51953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993168
1000	NC_017523	GTC	2	6	52023	52028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993168

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