MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 chromosome

Total Repeats: 96472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017523	TCGAT	2	10	234827	234836	20 %	40 %	20 %	20 %	385993309
5002	NC_017523	GGC	2	6	234848	234853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993310
5003	NC_017523	TGG	2	6	234854	234859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993310
5004	NC_017523	CAC	2	6	234875	234880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993310
5005	NC_017523	CGC	2	6	234891	234896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993310
5006	NC_017523	TGG	2	6	234934	234939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993310
5007	NC_017523	TGC	2	6	234962	234967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993310
5008	NC_017523	TGG	2	6	234968	234973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993310
5009	NC_017523	CGT	2	6	235006	235011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993310
5010	NC_017523	CGA	3	9	235032	235040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993310
5011	NC_017523	GCC	2	6	235078	235083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993310
5012	NC_017523	CGG	3	9	235091	235099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993310
5013	NC_017523	GAC	2	6	235122	235127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993310
5014	NC_017523	GTG	2	6	235162	235167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993310
5015	NC_017523	GCC	2	6	235222	235227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993310
5016	NC_017523	GAT	2	6	235248	235253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993310
5017	NC_017523	GCGG	2	8	235267	235274	0 %	0 %	75 %	25 %	385993310
5018	NC_017523	GGC	2	6	235347	235352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993310
5019	NC_017523	GCG	2	6	235441	235446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993310
5020	NC_017523	GGCT	2	8	235483	235490	0 %	25 %	50 %	25 %	385993310
5021	NC_017523	CGCT	2	8	235515	235522	0 %	25 %	25 %	50 %	385993310
5022	NC_017523	CGG	2	6	235529	235534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993311
5023	NC_017523	GCC	2	6	235571	235576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993311
5024	NC_017523	ATC	2	6	235585	235590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993311
5025	NC_017523	GC	3	6	235726	235731	0 %	0 %	50 %	50 %	385993311
5026	NC_017523	CTT	2	6	235817	235822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385993311
5027	NC_017523	CGAA	2	8	235911	235918	50 %	0 %	25 %	25 %	385993311
5028	NC_017523	CCG	2	6	235944	235949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993311
5029	NC_017523	GCTC	2	8	235961	235968	0 %	25 %	25 %	50 %	385993311
5030	NC_017523	GTT	2	6	235982	235987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385993311
5031	NC_017523	GCG	2	6	235988	235993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993311
5032	NC_017523	CCT	2	6	236029	236034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385993312
5033	NC_017523	CGC	2	6	236064	236069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993312
5034	NC_017523	ACCA	2	8	236150	236157	50 %	0 %	0 %	50 %	385993312
5035	NC_017523	CCAT	2	8	236167	236174	25 %	25 %	0 %	50 %	385993312
5036	NC_017523	GCC	2	6	236176	236181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993312
5037	NC_017523	AGT	2	6	236197	236202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993312
5038	NC_017523	ATCC	2	8	236207	236214	25 %	25 %	0 %	50 %	385993312
5039	NC_017523	CAGC	2	8	236215	236222	25 %	0 %	25 %	50 %	385993312
5040	NC_017523	CGG	3	9	236227	236235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993312
5041	NC_017523	GCT	2	6	236285	236290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993312
5042	NC_017523	GTC	2	6	236382	236387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993312
5043	NC_017523	GCC	2	6	236401	236406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993312
5044	NC_017523	GCCC	2	8	236417	236424	0 %	0 %	25 %	75 %	385993312
5045	NC_017523	C	7	7	236437	236443	0 %	0 %	0 %	100 %	385993312
5046	NC_017523	GGT	2	6	236453	236458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385993312
5047	NC_017523	GCC	2	6	236667	236672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993312
5048	NC_017523	CGC	2	6	236711	236716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993312
5049	NC_017523	GTC	2	6	236723	236728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993312
5050	NC_017523	ACG	2	6	236739	236744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993312
5051	NC_017523	CGGT	2	8	236768	236775	0 %	25 %	50 %	25 %	385993312
5052	NC_017523	CGAC	2	8	236782	236789	25 %	0 %	25 %	50 %	385993312
5053	NC_017523	GCCA	2	8	236802	236809	25 %	0 %	25 %	50 %	385993312
5054	NC_017523	ACC	2	6	236818	236823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993312
5055	NC_017523	ACCAGC	2	12	236859	236870	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385993312
5056	NC_017523	ACG	2	6	236874	236879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993312
5057	NC_017523	CACGC	2	10	236907	236916	20 %	0 %	20 %	60 %	385993312
5058	NC_017523	GCGAAC	2	12	236943	236954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993312
5059	NC_017523	GC	4	8	236999	237006	0 %	0 %	50 %	50 %	385993312
5060	NC_017523	TCGA	2	8	237147	237154	25 %	25 %	25 %	25 %	385993312
5061	NC_017523	GGC	3	9	237221	237229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993312
5062	NC_017523	CAG	2	6	237236	237241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993312
5063	NC_017523	TCA	2	6	237244	237249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993312
5064	NC_017523	CAA	2	6	237290	237295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385993312
5065	NC_017523	ACCAGC	2	12	237324	237335	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385993312
5066	NC_017523	GTC	2	6	237356	237361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993312
5067	NC_017523	CCG	2	6	237387	237392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993312
5068	NC_017523	GTC	2	6	237515	237520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993312
5069	NC_017523	ACG	2	6	237546	237551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993312
5070	NC_017523	GCG	2	6	237582	237587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993312
5071	NC_017523	CCG	2	6	237618	237623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993312
5072	NC_017523	GC	3	6	237658	237663	0 %	0 %	50 %	50 %	385993312
5073	NC_017523	GGCCGC	2	12	237680	237691	0 %	0 %	50 %	50 %	385993312
5074	NC_017523	GCA	2	6	237730	237735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385993312
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5078	NC_017523	CACC	2	8	237827	237834	25 %	0 %	0 %	75 %	385993312
5079	NC_017523	GCCG	2	8	237870	237877	0 %	0 %	50 %	50 %	385993312
5080	NC_017523	GCC	2	6	237909	237914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993312
5081	NC_017523	ACCGCG	2	12	237972	237983	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385993312
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5087	NC_017523	TGA	2	6	238273	238278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993312
5088	NC_017523	GCG	2	6	238314	238319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993312
5089	NC_017523	GCC	2	6	238407	238412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993312
5090	NC_017523	GC	3	6	238426	238431	0 %	0 %	50 %	50 %	385993312
5091	NC_017523	CCGGT	2	10	238577	238586	0 %	20 %	40 %	40 %	385993312
5092	NC_017523	TGGG	2	8	238599	238606	0 %	25 %	75 %	0 %	385993312
5093	NC_017523	TAGC	2	8	238683	238690	25 %	25 %	25 %	25 %	385993312
5094	NC_017523	G	6	6	238699	238704	0 %	0 %	100 %	0 %	385993312
5095	NC_017523	CCAGCG	2	12	238711	238722	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385993312
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5098	NC_017523	ACCA	2	8	238878	238885	50 %	0 %	0 %	50 %	385993312
5099	NC_017523	CAT	2	6	238916	238921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993312
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5103	NC_017523	CGGT	2	8	239288	239295	0 %	25 %	50 %	25 %	385993313
5104	NC_017523	ACCA	2	8	239341	239348	50 %	0 %	0 %	50 %	385993313
5105	NC_017523	TGA	2	6	239351	239356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385993313
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5107	NC_017523	GTCG	2	8	239388	239395	0 %	25 %	50 %	25 %	385993313
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5118	NC_017523	CG	3	6	239959	239964	0 %	0 %	50 %	50 %	385993314
5119	NC_017523	GGC	3	9	239965	239973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993314
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5243	NC_017523	ACC	2	6	245413	245418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385993317
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5481	NC_017523	TGC	2	6	255639	255644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385993325
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5483	NC_017523	GCC	2	6	255702	255707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385993325
5484	NC_017523	CG	3	6	255726	255731	0 %	0 %	50 %	50 %	385993325
5485	NC_017523	TCA	2	6	255763	255768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385993325
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5488	NC_017523	GGTC	2	8	255958	255965	0 %	25 %	50 %	25 %	385993325
5489	NC_017523	CGG	2	6	255993	255998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385993325
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