MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 77118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017026	GCT	2	6	163573	163578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3002	NC_017026	GTG	2	6	163643	163648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306069
3003	NC_017026	CAGG	2	8	163669	163676	25 %	0 %	50 %	25 %	383306069
3004	NC_017026	CAG	2	6	163684	163689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3005	NC_017026	GAG	2	6	163694	163699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306069
3006	NC_017026	CGA	2	6	163765	163770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3007	NC_017026	CGG	3	9	163775	163783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306069
3008	NC_017026	GCC	2	6	163798	163803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306069
3009	NC_017026	GAA	2	6	163822	163827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306069
3010	NC_017026	CAT	2	6	163837	163842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306069
3011	NC_017026	ATG	2	6	163910	163915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306069
3012	NC_017026	TGCG	2	8	163938	163945	0 %	25 %	50 %	25 %	383306069
3013	NC_017026	CGG	2	6	163957	163962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306069
3014	NC_017026	GCC	2	6	163983	163988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306069
3015	NC_017026	CCG	2	6	163994	163999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306069
3016	NC_017026	GGC	2	6	164023	164028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306069
3017	NC_017026	GCC	2	6	164055	164060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306069
3018	NC_017026	GGC	2	6	164088	164093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306069
3019	NC_017026	TGC	2	6	164181	164186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3020	NC_017026	GCA	2	6	164187	164192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3021	NC_017026	ACG	3	9	164196	164204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3022	NC_017026	CAT	2	6	164209	164214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306069
3023	NC_017026	CGA	2	6	164233	164238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3024	NC_017026	GCT	2	6	164239	164244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3025	NC_017026	GCT	2	6	164248	164253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3026	NC_017026	GCC	2	6	164255	164260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306069
3027	NC_017026	CGG	2	6	164274	164279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306069
3028	NC_017026	CTGGG	2	10	164285	164294	0 %	20 %	60 %	20 %	383306069
3029	NC_017026	GAG	2	6	164342	164347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306069
3030	NC_017026	CGG	2	6	164356	164361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306069
3031	NC_017026	GCG	2	6	164378	164383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306069
3032	NC_017026	TCG	2	6	164428	164433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3033	NC_017026	TGG	2	6	164605	164610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306069
3034	NC_017026	CGC	2	6	164618	164623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306069
3035	NC_017026	GATG	2	8	164653	164660	25 %	25 %	50 %	0 %	383306069
3036	NC_017026	TGC	2	6	164664	164669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3037	NC_017026	TGC	2	6	164676	164681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306069
3038	NC_017026	ACC	2	6	164699	164704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306069
3039	NC_017026	GAG	2	6	164733	164738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306069
3040	NC_017026	GTG	2	6	164768	164773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306069
3041	NC_017026	CGG	2	6	164853	164858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306070
3042	NC_017026	GCCGG	2	10	164878	164887	0 %	0 %	60 %	40 %	383306070
3043	NC_017026	CCGG	2	8	164963	164970	0 %	0 %	50 %	50 %	383306070
3044	NC_017026	CAC	2	6	164985	164990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306070
3045	NC_017026	TGC	2	6	165052	165057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306070
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3047	NC_017026	GAA	3	9	165141	165149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306070
3048	NC_017026	CAG	2	6	165153	165158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306070
3049	NC_017026	GAT	2	6	165189	165194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306070
3050	NC_017026	GCGT	2	8	165208	165215	0 %	25 %	50 %	25 %	383306070
3051	NC_017026	CGC	2	6	165251	165256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306070
3052	NC_017026	AGC	2	6	165320	165325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306070
3053	NC_017026	CGC	3	9	165454	165462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306071
3054	NC_017026	CGC	3	9	165493	165501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306071
3055	NC_017026	CG	3	6	165504	165509	0 %	0 %	50 %	50 %	383306071
3056	NC_017026	GCA	2	6	165526	165531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306071
3057	NC_017026	CGG	2	6	165564	165569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306071
3058	NC_017026	CAT	2	6	165571	165576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306071
3059	NC_017026	GCC	2	6	165582	165587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306071
3060	NC_017026	GAC	2	6	165619	165624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306071
3061	NC_017026	TGG	2	6	165642	165647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306071
3062	NC_017026	CGA	2	6	165673	165678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306071
3063	NC_017026	CGA	2	6	165750	165755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306071
3064	NC_017026	ATC	2	6	165764	165769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306071
3065	NC_017026	GTG	2	6	165790	165795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306071
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3067	NC_017026	GCGG	2	8	165832	165839	0 %	0 %	75 %	25 %	383306071
3068	NC_017026	GTG	2	6	165847	165852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306071
3069	NC_017026	CGA	2	6	165880	165885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306071
3070	NC_017026	CG	3	6	166025	166030	0 %	0 %	50 %	50 %	383306072
3071	NC_017026	CGA	2	6	166063	166068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306072
3072	NC_017026	CGA	2	6	166139	166144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306072
3073	NC_017026	CTA	2	6	166148	166153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306072
3074	NC_017026	TG	3	6	166155	166160	0 %	50 %	50 %	0 %	383306072
3075	NC_017026	TCCC	2	8	166187	166194	0 %	25 %	0 %	75 %	383306072
3076	NC_017026	CAG	2	6	166277	166282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306072
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3080	NC_017026	TGC	2	6	166393	166398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306072
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3083	NC_017026	TG	4	8	166435	166442	0 %	50 %	50 %	0 %	383306072
3084	NC_017026	CGG	3	9	166454	166462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306072
3085	NC_017026	GGTG	2	8	166553	166560	0 %	25 %	75 %	0 %	383306072
3086	NC_017026	CGA	2	6	166562	166567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306072
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3089	NC_017026	ATG	2	6	166638	166643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306072
3090	NC_017026	AAG	2	6	166651	166656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306072
3091	NC_017026	CGC	2	6	166667	166672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306072
3092	NC_017026	CGC	2	6	166690	166695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306072
3093	NC_017026	CGGTGC	2	12	166711	166722	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383306072
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3095	NC_017026	GTTGG	2	10	166850	166859	0 %	40 %	60 %	0 %	383306072
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3100	NC_017026	AT	3	6	167162	167167	50 %	50 %	0 %	0 %	383306073
3101	NC_017026	TCG	2	6	167278	167283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306073
3102	NC_017026	ACG	2	6	167284	167289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306073
3103	NC_017026	CGG	2	6	167317	167322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306073
3104	NC_017026	GCG	2	6	167325	167330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306073
3105	NC_017026	GAT	2	6	167449	167454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306074
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3107	NC_017026	AGC	2	6	167687	167692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306074
3108	NC_017026	TCG	2	6	167702	167707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306074
3109	NC_017026	GTC	2	6	167764	167769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306074
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3112	NC_017026	GGT	2	6	167840	167845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306075
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3114	NC_017026	CAG	2	6	167901	167906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306075
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3117	NC_017026	CGC	2	6	168005	168010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306075
3118	NC_017026	GCGTG	2	10	168016	168025	0 %	20 %	60 %	20 %	383306075
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3120	NC_017026	GCC	2	6	168075	168080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306075
3121	NC_017026	GAC	2	6	168081	168086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306075
3122	NC_017026	GCC	2	6	168120	168125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306075
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3237	NC_017026	CGG	3	9	174386	174394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306079
3238	NC_017026	GTC	2	6	174396	174401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306079
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3240	NC_017026	GTC	2	6	174450	174455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306079
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3481	NC_017026	GCC	2	6	184518	184523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306091
3482	NC_017026	CCG	2	6	184542	184547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306091
3483	NC_017026	GTG	3	9	184577	184585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306091
3484	NC_017026	GGC	2	6	184604	184609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306091
3485	NC_017026	GTC	2	6	184640	184645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306091
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3491	NC_017026	TCG	2	6	184881	184886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306092
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