MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 77118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017026	ATG	2	6	612426	612431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306434
11002	NC_017026	AAG	2	6	612713	612718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306435
11003	NC_017026	CGA	2	6	612769	612774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306435
11004	NC_017026	CGT	2	6	612802	612807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306435
11005	NC_017026	CCG	2	6	612841	612846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306435
11006	NC_017026	GAG	2	6	612857	612862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306435
11007	NC_017026	CGG	2	6	612883	612888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306435
11008	NC_017026	CCGAT	2	10	612903	612912	20 %	20 %	20 %	40 %	383306435
11009	NC_017026	CGA	2	6	612919	612924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306435
11010	NC_017026	TGC	2	6	612939	612944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306435
11011	NC_017026	TCC	2	6	613125	613130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383306436
11012	NC_017026	GAA	2	6	613163	613168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383306436
11013	NC_017026	GCC	2	6	613179	613184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306436
11014	NC_017026	TCGAC	2	10	613267	613276	20 %	20 %	20 %	40 %	383306436
11015	NC_017026	GTC	2	6	613282	613287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306436
11016	NC_017026	CGG	2	6	613447	613452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306437
11017	NC_017026	TCG	2	6	613473	613478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
11018	NC_017026	CGG	2	6	613509	613514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306437
11019	NC_017026	GCG	2	6	613536	613541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306437
11020	NC_017026	GCC	3	9	613580	613588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306437
11021	NC_017026	GGC	2	6	613634	613639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306437
11022	NC_017026	TGGC	2	8	613657	613664	0 %	25 %	50 %	25 %	383306437
11023	NC_017026	TCG	2	6	613686	613691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
11024	NC_017026	CGG	2	6	613711	613716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306437
11025	NC_017026	TGA	5	15	613770	613784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306437
11026	NC_017026	CGA	2	6	613788	613793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306437
11027	NC_017026	GAGTTC	2	12	613820	613831	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383306437
11028	NC_017026	CCA	2	6	613854	613859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306437
11029	NC_017026	TCG	2	6	613860	613865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
11030	NC_017026	GCT	2	6	613900	613905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
11031	NC_017026	CATGG	2	10	613913	613922	20 %	20 %	40 %	20 %	383306437
11032	NC_017026	GC	3	6	613938	613943	0 %	0 %	50 %	50 %	383306437
11033	NC_017026	CTT	2	6	613951	613956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306437
11034	NC_017026	TCT	2	6	614001	614006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306437
11035	NC_017026	AGT	2	6	614023	614028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383306437
11036	NC_017026	CGC	2	6	614035	614040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306437
11037	NC_017026	CG	3	6	614075	614080	0 %	0 %	50 %	50 %	383306437
11038	NC_017026	GGT	2	6	614089	614094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306437
11039	NC_017026	TCT	2	6	614109	614114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306437
11040	NC_017026	TCG	2	6	614115	614120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
11041	NC_017026	GATCA	2	10	614222	614231	40 %	20 %	20 %	20 %	383306437
11042	NC_017026	CGT	2	6	614239	614244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
11043	NC_017026	CGC	2	6	614311	614316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306437
11044	NC_017026	AGG	2	6	614322	614327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306437
11045	NC_017026	GTG	2	6	614393	614398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306437
11046	NC_017026	CATGG	2	10	614416	614425	20 %	20 %	40 %	20 %	383306437
11047	NC_017026	TCG	2	6	614462	614467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
11048	NC_017026	CGC	2	6	614635	614640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306437
11049	NC_017026	GC	3	6	614639	614644	0 %	0 %	50 %	50 %	383306437
11050	NC_017026	CTG	2	6	614663	614668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306437
11051	NC_017026	CAC	2	6	614701	614706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383306437
11052	NC_017026	GTG	2	6	616651	616656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306438
11053	NC_017026	GGC	2	6	616697	616702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306438
11054	NC_017026	CGGCG	2	10	616728	616737	0 %	0 %	60 %	40 %	383306438
11055	NC_017026	GCC	3	9	616741	616749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306438
11056	NC_017026	TCG	2	6	616778	616783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306438
11057	NC_017026	ATCGC	2	10	616789	616798	20 %	20 %	20 %	40 %	383306438
11058	NC_017026	CCG	2	6	616820	616825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306438
11059	NC_017026	CGC	2	6	616833	616838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306438
11060	NC_017026	CTT	2	6	616890	616895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383306438
11061	NC_017026	GCC	2	6	616901	616906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306438
11062	NC_017026	GTG	2	6	616947	616952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306438
11063	NC_017026	CGT	2	6	616976	616981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306438
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11066	NC_017026	CGT	2	6	617171	617176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306438
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11070	NC_017026	CGA	2	6	617245	617250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306439
11071	NC_017026	GCAGA	2	10	617252	617261	40 %	0 %	40 %	20 %	383306439
11072	NC_017026	GCG	2	6	617275	617280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306439
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11081	NC_017026	GAC	2	6	617496	617501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306439
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11083	NC_017026	GT	3	6	617608	617613	0 %	50 %	50 %	0 %	383306439
11084	NC_017026	ACA	2	6	617638	617643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383306439
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11087	NC_017026	CGG	2	6	617797	617802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306439
11088	NC_017026	GCTG	2	8	617819	617826	0 %	25 %	50 %	25 %	383306439
11089	NC_017026	GGT	2	6	617840	617845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306439
11090	NC_017026	GAG	3	9	617859	617867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383306439
11091	NC_017026	GTCGG	2	10	617870	617879	0 %	20 %	60 %	20 %	383306439
11092	NC_017026	CTG	2	6	617933	617938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306440
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11094	NC_017026	TG	3	6	617990	617995	0 %	50 %	50 %	0 %	383306440
11095	NC_017026	GGC	2	6	618028	618033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306440
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11098	NC_017026	GCCG	2	8	618058	618065	0 %	0 %	50 %	50 %	383306440
11099	NC_017026	CGT	2	6	618067	618072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306440
11100	NC_017026	CGG	2	6	618111	618116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306440
11101	NC_017026	ACG	2	6	618137	618142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306440
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11103	NC_017026	GCT	3	9	618202	618210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306440
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11105	NC_017026	CGC	2	6	618297	618302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306440
11106	NC_017026	CTGGGG	2	12	618464	618475	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383306440
11107	NC_017026	GTTCG	2	10	618496	618505	0 %	40 %	40 %	20 %	383306440
11108	NC_017026	GCTG	2	8	618528	618535	0 %	25 %	50 %	25 %	383306440
11109	NC_017026	CGG	2	6	618565	618570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306440
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11112	NC_017026	ACG	2	6	618618	618623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306440
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11114	NC_017026	TCA	2	6	620634	620639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383306441
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11476	NC_017026	CTGC	2	8	632788	632795	0 %	25 %	25 %	50 %	383306454
11477	NC_017026	TGG	2	6	632808	632813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306454
11478	NC_017026	GCCGG	2	10	632830	632839	0 %	0 %	60 %	40 %	383306454
11479	NC_017026	CGC	2	6	632878	632883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306454
11480	NC_017026	CGC	2	6	632890	632895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306454
11481	NC_017026	CTG	2	6	632903	632908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306454
11482	NC_017026	CCG	2	6	633001	633006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306454
11483	NC_017026	TGC	2	6	633102	633107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306454
11484	NC_017026	CCG	2	6	633135	633140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383306454
11485	NC_017026	CTG	2	6	633164	633169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306454
11486	NC_017026	CGG	2	6	633205	633210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306454
11487	NC_017026	TGG	2	6	633212	633217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306454
11488	NC_017026	ACGC	2	8	633229	633236	25 %	0 %	25 %	50 %	383306454
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11490	NC_017026	GAC	2	6	633368	633373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306454
11491	NC_017026	TGC	2	6	633392	633397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306454
11492	NC_017026	CG	3	6	633428	633433	0 %	0 %	50 %	50 %	383306454
11493	NC_017026	GCG	2	6	634935	634940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383306455
11494	NC_017026	GC	3	6	634955	634960	0 %	0 %	50 %	50 %	383306455
11495	NC_017026	TGG	3	9	634988	634996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383306455
11496	NC_017026	GTCG	2	8	635041	635048	0 %	25 %	50 %	25 %	383306455
11497	NC_017026	GGGT	2	8	635085	635092	0 %	25 %	75 %	0 %	383306455
11498	NC_017026	GCA	2	6	635119	635124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383306455
11499	NC_017026	TCG	2	6	635151	635156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306455
11500	NC_017026	GTC	2	6	635210	635215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383306455

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